胜红蓟上一种与双生病毒伴随的重组β卫星分子的鉴定

摘要

双生病毒是一类在全球范围内危害严重的单链环状DNA病毒.本研究从2017年采自云南的胜红蓟样品中(YN2017)获得了一条菜豆金色花叶病毒属病毒和一条β卫星的全基因组序列.该双生病毒的全长序列与烟草曲茎病毒的相似性最高,为99.60％,确定为烟草曲茎病毒的分离物.YN2017 β卫星与中国胜红蓟黄脉β卫星的同源性最高,为90.8％.进一步分析发现,该β卫星的卫星保守区域(SCR)至富含腺嘌呤区(A-rich区)之间约1 kb的序列与中国胜红蓟黄脉β卫星相应序列的相似性高达97.2％;其包含的A-rich区上游与SCR之间约300 bp的序列与中国胜红蓟黄脉β卫星相应序列的相似性仅为70.2％,而与烟草曲茎β卫星相应序列的相似性最高,为97.3％.重组分析发现,所分离的β卫星是由中国胜红蓟黄脉β卫星和烟草曲茎β卫星重组产生.这是首次在中国发现由不同的β卫星重组产生的β卫星分子.