黑鲷(Acanthopagrus schlegeli)肿瘤坏死因子αcDNA的克隆及特征分析

摘要

采用同源克隆的方法,从黑鲷中获得肿瘤坏死因子(TNF α)全长cDNA序列.该序列含1288个核苷酸,可编码253个氨基酸的TNF前体蛋白.它是一种跨膜蛋白,无糖基化位点和信号肽结构.黑鲷TNF α与其它鱼类的TNF α的相似性很高,占据进化上独立的分支;与哺乳类TNF α和TNF β源于共同的祖先.基因结构分析显示,该基因含有TNF家族profile和TNF家族的标签序列;在参与TNF α基因二硫键形成的两个半胱氨酸和TNF α三聚体形成的位点高度保守;空间结构模拟显示,它与哺乳类TNF α的空间结构相似,都是由两个β折叠片组成,每个折叠片包含5个反向平行的β链.表达研究结果表明,黑鲷TNF α在检测的各个组织中均为组成型表达,表现为在刺激与非刺激鱼体中,都可以检测到黑鲷TNF α的表达,但是其表达水平在不同组织中有很大差异.黑鲷TNF α在头肾、脾脏和鳃的表达量较高,而在心脏、肝脏、血液、肾脏和大脑中表达量较低.