毛乳头细胞凝聚性生长差异表达基因的筛选及HSPC016全长克隆的生物信息学分析

摘要

目的筛选与毛乳头细胞(DPC)凝聚性生长相关的基因表达,全长克隆凝聚性生长相关基因HSPC016并进行生物信息学分析.方法应用抑制性消减杂交技术,构建DPC凝聚性生长与非凝聚性生长的cDNA消减文库,克隆鉴定凝聚性生长特异表达基因.应用RACE技术,克隆DPC凝聚性状态下HSPC016全长表达序列,使用生物信息学手段分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能.结果成功构建了DPC凝聚性生长差异表达cDNA文库,筛选出DPC与细胞同源凝集、生长调控、分化发育及信号转导相关的基因,其中包括HSPC016.HSPC016全长cDNA 为400 bp,染色体定位于3q21.31;HSPC016蛋白为64aa, 结构域属于PD053992家族,与T2FA基因功能域同源.结论 DPC凝聚性生长的差异表达cDNA文库为进一步筛选并克隆DPC凝聚性生长相关基因奠定了基础,也为宏观分析多基因协同参与DPC生长调控和功能发挥提供了依据.HSPC016的生物信息学分析显示此基因与DPC基因转录调节有关.