肾综合征出血热患者流产胎儿分离毒株84FLi的全基因序列分析

摘要

目的 克隆和测定汉滩病毒疫苗生产株 84FLi的全基因组序列 ,了解其分子基础。方法 采用逆转录聚合酶链反应 （RT PCR） ,分节段扩增 84FLi株L、M和S基因片段的cDNA ,直接用PCR产物或克隆入pMD18 T载体后进行测序。结果 84FLi株L、M、S 3个片段的全基因组序列为6 5 33,36 16和 16 88个核苷酸 ,分别编码 2 15 1,1135 ,4 2 9个氨基酸。A、C、G、T 4种核苷酸分别为 3830 ,2 0 5 0 ,2 5 10和 344 7个 ,GC含量为 38 5 2 % ,AT含量为 6 1 4 8%。序列同源性分析表明 84FLi株与分离自广州的RG9株和分离自安徽的Chen4株高度同源。S片段核苷酸的同源性 99 6 %。与HTNV的国际标准毒株 76 118的 3个片段核苷酸同源性分别为 83 7%、84 0 %和 87 2 % ,氨基酸同源性分别为97 5 %、96 0 %和 97 9%。结论 84FLi株属于汉滩型病毒 ,并与分离自国内的汉滩病毒同源性较高 ,与中国株Chen4株和RG9株属于同一个亚型