棘孢木霉分泌蛋白和效应子的预测及分析

摘要

棘孢木霉(Trichoderma asperellum)作为一种生防菌,在植物病害的防控中具备较高的开发以及利用价值.根据棘孢木霉CBS 433.97菌株全基因组测序获得的12557个蛋白序列,利用SignalP、TargetP、TMHMM、WoLF PSORT和big-PI Predictor生物信息学软件和预测程序依次进行筛选,最终获得485个具有典型特征的分泌蛋白序列.进一步将485个分泌蛋白与碳水化合物活性酶数据库进行比对、半胱氨酸含量分析、与病原物-寄主互作数据库比对终获得137个蛋白;进一步筛选<300氨基酸的小分子蛋白作为候选效应蛋白,最终获得15个蛋白,其中1个为碳水化合物结合模块家族蛋白,1个为碳水化合物酯酶蛋白,其余13个均为假定蛋白.研究结果为进一步研究棘孢木霉基因的作用机理及其后续的改造利用提供了一定的参考.