miR-497的生物信息学分析及其在肺腺癌中表达的验证

摘要

目的:对hsa-miR-497进行靶基因和功能生物信息学分析预测,为后续深入研究其生物学功能和调控机制提供实验理论指导,并对其在肺腺癌中的表达进行初步验证.方法:利用PubMed检索miR-497相关文章,通过miRBase在线工具分析miR-497碱基序列、染色体定位等信息.应用Targetscan及miRDB两种预测工具对miR-497进行靶基因预测取其交集,应用R中clusterProfiler包进行靶基因功能富集及信号转导通路富集分析.最后应用RT-PCR定量检测miR-497在新鲜肺腺癌及癌旁组织中的表达.结果:miR-497在多物种间具有高度的保守性,功能富集分析预测的结果显示miR-497调控的靶基因集合功能主要富集于输尿管芽生长、穿膜受体蛋白激酶、肽结合、分支形态发生和膜筏等过程(P<0.05).KEGG生物通路显著富集于调控干细胞多能性、癌、Wnt及Rap1信号通路等(P<0.001).miR-497在肺腺癌组织中表达明显低于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05).结论:miR-497通过靶基因调控多个生物学过程及疾病通路,尤其在肿瘤方向的生物学功能值得进一步研究,miR-497在肺腺癌中低表达为研究肺腺癌的发生及发展及治疗提供了新的方向.