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扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析

         

摘要

[目的]松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明.[方法]通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异.[结果]参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣv)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因.相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因.推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用.GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在LⅣ中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃.[结论]以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致.

著录项

  • 来源
    《生物安全学报》 |2017年第2期|111-121|共11页
  • 作者单位

    山西农业大学林学院,山西太谷030801;

    中国科学院动物研究所,农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室,北京100101;

    中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193;

    山西农业大学林学院,山西太谷030801;

    中国科学院动物研究所,农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室,北京100101;

    山西农业大学林学院,山西太谷030801;

    中国科学院动物研究所,农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室,北京100101;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    松材线虫; 扩散型虫态; 数字基因表达谱; 差异表达基因;

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