沙眼衣原体15个血清型omp1基因的VS1和VS2区序列分析

摘要

目的比较分析沙眼衣原体15个血清型omp1基因VS1和VS2序列的同源性和变异性。方法巢式PCR扩增VS1-VS2基因，自动测序仪测定核苷酸序列，DNAstar生物软件进行比对分析。结果15个血清型沙眼衣原体扩增出大小453bp的VS1-VS2基因。VS1区域序列比对显示血清群B和中间群的VS1核苷酸序列相对保守，而血清群C各型VS1区域表现出较大的核苷酸变异，型间显示1～9个核苷酸替换，且发生在中心区域。血清型VS2序列较VS1存在更多的变异，血清群B中各血清型间均存在2～19个核苷酸的改变，血清群C表现为4～8个核苷酸差异，中间群的F和G型之间存在6个核苷酸差异。结论阐明VS1和VS2区核苷酸的多态性，为下一步进行该蛋白表达和构建寡核苷酸型特异性探针奠定了基础。