沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列分析与基因分型

摘要

目的探讨沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列基因分型和VS1-VS2基因突变率。方法巢式PCR扩增omp1基因的VS1-VS2序列,自动测序仪测序,运用DNAstar软件进行临床菌株与标准菌株序列的比对。结果99株临床标本分离株扩增出约453 bp大小的VS1-VS2片段。与标准株比对,除3株测序出现双峰无法确定基因型外,96株菌株分为9个型,以F型29株（30.2%）、E型22株（22.9%）、J型19株（19.8%）、D型12侏（12.5%）和H型8株（8.3%）为主。序列分析发现7株存在VS1区碱基的突变或插入,多为有义突变,突变率为7.3%,多见于D、E、F和H型。结论沙眼衣原体omp1基因序列分析在分子流行病学上具有一定意义。