人体肠道病毒组的研究进展

摘要

人体肠道微生物包括细菌、真菌、古细菌和病毒等,肠道病毒组的基因组约占肠道微生物总DNA的5.8%,病毒的数量在所有肠道微生物中排名第二,且多样性高。受高比例细菌基因组的影响,很难直接从宏基因组数据中深入分析肠道病毒组。随着病毒样颗粒(VLPs)富集技术的出现以及高通量测序技术的迅速发展,近年来对肠道病毒组的研究越来越多。基于VLPs,发现真核病毒、植物相关病毒和噬菌体是肠道病毒组的主要组成部分,而且未知病毒序列占比高达81%~93%。现阶段病毒组富集扩增方法主要有超速离心、单引物扩增和多重置换扩增等。疾病特异性研究表明,炎症性肠病、酒精性肝病和2型糖尿病等与饮食及肠道病毒组改变相关。本综述回顾了近十年对人类肠道病毒组的研究,总结归纳了目前肠道病毒组的构成、研究方法及与人体健康的相关性,探讨了未来肠道病毒组的研究方向,力求为后续的研究提供新思路。