目的分析小鼠蛛网膜下腔出血（SAH）后早期大脑皮层环状RNA（circRNA）及mRNA的表达谱,探讨circRNA在SAH后早期脑损伤（EBI）中的潜在作用。方法 18只C57BL/6J雄性小鼠按随机数字表法分为假手术组及SAH组（n=9）,后者采用颈动脉内穿刺法构建SAH模型。SAH后24h提取小鼠大脑皮层总RNA,构建cDNA文库,采用HiSeqTM2500 User Guide测序;将所有转录本比对到小鼠基因组,分别得到circRNA及mRNA的表达谱;筛选出显著差异表达的circRNA及mRNA,进行GO富集、KEGG通路分析及circRNA靶微小RNA（miRNA）预测;运用逆转录-实时定量PCR（RT-qPCR）技术对测序结果进行验证。结果在小鼠SAH后早期大脑皮层中,显著差异表达的circRNA共26种,其中6种上调,20种下调;显著差异表达的mRNA共804种,其中396种上调,408种下调。生物信息技术分析提示显著差异表达的mRNA涉及神经突触可塑性调节、炎症与免疫反应等多种生物学途径,部分显著差异表达的circRNA可结合不同的miRNA。随机挑选的4条circRNA（circFoxj3、circSetbp1、circArpp21、circ2010111I01Rik）的变化趋势经RT-qPCR技术验证与测序结果一致。结论小鼠SAH后早期大脑皮层circRNA的表达谱已发生变化,显著差异表达的circRNA广泛参与调控SAH后EBI的病理过程,其或许可成为SAH诊治及预后判断的新靶点。
展开▼
