GeneXpert MTB/RIF阳性RNA聚合酶β亚基基因突变的结核病患者中利福平耐药决定区突变特征研究

摘要

目的:通过分析GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)阳性RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因突变的结核病患者中rpoB基因探针的突变分布与频率,阐述利福平耐药决定区的突变特征。方法:连续纳入2019年6月至2020年6月就诊于首都医科大学附属北京胸科医院的Xpert检测阳性且rpoB基因突变的682例结核病患者,其中肺结核618例,肺外结核64例。收集患者临床检测标本,其中痰液465份,支气管肺泡灌洗液153份,脓液37份,胸腔积液19份,便标本7份,脑脊液1份。分析所有Xpert阳性标本中结核分枝杆菌(MTB)的半定量结果及rpoB基因探针的突变分布情况。结果:682份标本中,MTB含量半定量水平为高占6.45%(44/682),中占25.07%(171/682),低占25.51%(174/682),极低占42.96%(293/682)。肺外结核标本中MTB含量半定量极低水平高于肺结核标本[分别为64.06%(41/64)和40.78%(252/618)],差异有统计学意义(χ^(2)=12.83,P<0.001)。标本涂阳率在MTB含量半定量水平为高、中、低和极低水平的标本中分别为84.62%(33/39),64.02%(105/164),27.27%(42/154)和7.84%(20/255)。rpoB基因单探针突变率为92.82%(633/682),双探针突变率为6.89%(47/682),三探针突变率为0.29%(2/682)。单探针突变的标本中,突变率最高的为探针E(74.34%,507/682),其次为探针D(8.80%,60/682);双探针突变的标本中,突变率最高的为探针D+E(4.25%,29/682),其次为探针A+B(1.76%,12/682);2例三探针突变均为探针A+D+E。结论:Xpert阳性rpoB基因突变MTB中以单探针突变为主,在肺结核和肺外结核中最常见的突变探针均为探针E和探针D。