高通量测序分析比较不同保存温度下牦牛酸奶细菌多样性

摘要

为了比较甘南牧区不同保存温度下牦牛酸奶细菌群落结构和多样性,采用Illumina NovaSeq高通量测序技术,对4种不同保存温度下甘南牧区牦牛酸奶细菌的16S rRNA V3-V4区基因序列进行测序,并对测序结果进行操作分类单元(OTU)聚类、α多样性和β多样性等分析.结果表明,4种不同保存温度下甘南牧区牦牛酸奶细菌多样性无显著差异(P>0.05),各分类水平细菌群落组成基本相同,仅组成比例存在一定差异.优势细菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其平均相对丰度分别>75.87％、7.20％和3.52％,优势细菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和链球菌属(Streptococcus),其平均相对丰度分别>61.82％和11.88％.