声明
摘要
第一章 绪论
1.1 课题研究背景
1.1.1 生物信息学的形成与发展
1.1.2 生物信息数据库建设
1.1.3 蛋白质相互作用网络
1.2 课题研究意义
1.3 论文的主要研究内容
1.4 论文的结构
第二章 蛋白质功能预测算法相关研究
2.1 蛋白质功能预测计算方法概述
2.2 基于网络的功能预测方法
2.2.1 基于局部信息的算法
2.2.2 基于全局优化的算法
2.2.3 基于模块的算法
2.3 蛋白质相互作用网络聚类算法
2.4 蛋白质功能分类体系
2.5 本章小结
第三章 基于蛋白质结构域组合相似性的功能预测
3.1 蛋白质结构域简介
3.2 基于结构域上下文相似性的算法
3.3 结构域组合相似性定义
3.4 实验结果
3.4.1 评价方法
3.4.2 测试数据
3.4.3 结果分析
3.5 本章小结
第四章 基于网络聚类算法的蛋白质功能预测
4.1 直接基于聚类分析的功能预测
4.1.1 聚类算法实例
4.1.2 功能预测结果
4.2 基于聚类复合物与结构域组合相似性的功能预测算法
4.2.1 算法思路
4.2.2 算法描述
4.3 实验结果
4.4 本章小结
第五章 总结与展望
5.1 论文研究贡献与创新点
5.2 研究展望
参考文献
致谢
攻读硕士学位期间主要研究成果