甘蓝自交系SRK基因的序列分析

摘要

利用SRK基因特异引物PK1/PK4(ClassI型)和KIM/KD7(ClassII型)对6个甘蓝自交系材料进行PCR扩增，克隆测序，通过生物信息学初步鉴定供试甘蓝材料的S单元型。Blast比对表明，10Q611长为1096bp的克隆片段与Brassicaoleracea S-15 SRK gone的序列相似性达到99%，仅在下游引物的简并区存在1个碱基的差异，表明甘蓝材料10Q611的S单元型是S15。10Q210、10Q211、10Q212、10Q232和10Q242这5个材料的克隆片段长度为1043bp，通过BlastX比对结合与SRK2、SRK5基因外显子序列的差异位点，推测甘蓝材料10Q210和10Q212的S单元型为S2；10Q211、10Q232和10Q242的S单元型为S5。