印度-太平洋石鲈亚科鱼类DNA条形码及分子系统进化研究

摘要

为探讨DNA条形码基因COⅠ序列在石鲈亚科鱼类物种鉴定的有效性,本研究分析了印度-太平洋区域的石鲈亚科7个属29种鱼类91个个体长度为651bp的COⅠ基因序列,利用MEGA5.0计算石鲈亚科种内与种间的遗传距离,并基于最大简约法与最大似然法构建了其分子系统进化关系.结果显示:石鲈亚科鱼类种间遗传距离在0.021-0.240之间,平均遗传距离0.184;种内遗传距离0.000-0.009之间,平均0.004.其中种间平均遗传距离(0.184)显著大于种内平均遗传距离(0.004),种间遗传距离是种内的46倍.同时,各物种间遗传距离均大于Hebert推荐区分物种的最小种间遗传距离0.02(2％).基于COⅠ序列构建的系统进化树,同一物种不同个体间均能聚成独立的单系,表明COⅠ基因可作为石鲈亚科物种准确鉴定的有效条形码基因.同时,系统进化树上,石鲈属是非单系类群,主要形成5个分支,而不同分支的种类与其地理分布存在一定的相关性,与近年部分分子系统地理学的研究观点一致.