多种方法获得坛紫菜高质量的核DNA

摘要

在本研究中，发现了一种可以降低质体和线粒体DNA的污染的方法。通过qPCR技术和质粒文库的构建，均可以证明处理方法的显著性。把CTAB法提取的细胞总DNA和利用细胞核分离方法获得的核DNA相比，通过核分离的方法可以减少质体和线粒体的污染。从qPCR的结果来看，CTAB法分离得到的质体:线粒体:核的拷贝数是325∶190∶1，细胞核分离的方法分离得到的质体:线粒体:核的拷贝数是244∶134∶1，从质粒文库的测序结果来看，细胞核的含量从32%提高到了71%。坛紫菜叶片经过黑暗和抗生素的处理，质体:线粒体:核的比例是134:217:1，核DNA占了总DNA的88%。本研究的目的是为了探索一种有效的方法来获得高质量的核DNA。高质量的核DNA的制备，不仅可以促进坛紫菜基因相关的工作，但也可以大大减少测序的成本，并提高测序精确度。