医学信息学应用

摘要： 随着全球人口老龄化的加剧,脑卒中已成为60岁以上人群中仅次于恶性肿瘤的第二大死亡原因.大型医学数据库通过系统集成医学数据,提供流行病学资料,从研究假设转化为指导临床实践的循证医学证据,广泛应用于临床医学研究.本文重点介绍世界范围内不同脑卒中数据库的特点,阐述其在脑卒中中的应用及研究进展,以及人工智能技术在数据库建设中的应用,以期促进脑卒中数据库的建设并开展高质量的脑卒中临床研究.

摘要： 医疗数据结构混杂、特征高维,传统数据仓储策略已难以满足大数据分析需求.以数据中产生模型的算法为主要研究内容的机器学习,迅即成为计算机模拟人类学习过程中智能数据分析技术的创新源泉.本文对机器学习的发展及其现处的医疗大数据背景作以简介,着重介绍其在检验医学图像识别、报告自动审核、中文医学语言处理及计算机辅助诊断中的应用,并思考其对检验医学发展带来的机遇与挑战.

摘要： Tuberculosis is a chronic respiratory infectious disease which seriously endangers human health and threatens human life.It is of great significance to do a good job of education on tuberculosis knowledge and behavior intervention for the public to reduce the incidence of new tuberculosis and to reduce the spread of tuberculosis.Through the literature review,we found that mobile communication technology can break through the limitation of traditional medical services in time and space,strengthen the information communication between medical staffs and patients and reduce the patients in emergency and hospitalization,so as to reduce the overall cost of treatment,relieve the psychological pressure of patients and improve the treatment compliance of patients.Therefore,mobile medical treatment can play an important role in the clinical treatment of tuberculosis patients.The purpose of this paper is to introduce the development of mobile medical treatment and its application in tuberculosis management and health promotion,providing reference for tuberculosis prevention and control workers.%肺结核是一种严重危害人类健康、威胁人类生命的慢性呼吸道传染病.做好公众结核病知识教育和行为干预对减少新发肺结核患者、降低肺结核的传染率具有重要意义.通过查阅与复习文献,发现移动医疗突破了传统医疗服务在时间和空间上的限制,加强了医务人员之间和医患之间的信息沟通,有效减少了患者急诊和住院的概率,从而降低了总体治疗费用、减轻了患者的心理压力、提高了患者的治疗依从性.因此,移动医疗可在肺结核患者的临床治疗过程中发挥重要作用.作者介绍了移动医疗的发展及其在肺结核患者管理和健康促进中的应用,为结核病防控工作者提供借鉴.

摘要： 互联网+医疗的新时代正在兴起,互联网技术逐步应用于结核病防控领域,为结核病移动医疗提供了坚实的技术支撑.多项研究说明,应用固话视频电话技术、电脑设备网络视频技术、网站平台、公共信息资源库、手机短信或语音技术、应用程序(application,APP)、全球定位系统(global positioning system,GPS)、电子药盒技术、临床实验室信息系统(laboratory information system,LIS)、地理信息系统(geographic information system,GIS)、医院信息系统(hospital information system,HIS)等互联网技术于结核病“防、治、管”各项工作,对于实现医疗资源合理分配、提高医务人员工作效率、优化患者诊疗服务等方面发挥了积极的作用.作者梳理了国内外结核病防控领域互联网技术应用相关研究的文献报道,并且进行了相关的阐述,以便为我国互联网+结核病防控研究提供参考.

摘要： 互联网＋医疗的新时代正在兴起，互联网技术逐步应用于结核病防控领域，为结核病移动医疗提供了坚实的技术支撑。多项研究说明，应用固话视频电话技术、电脑设备网络视频技术、网站平台、公共信息资源库、手机短信或语音技术、应用程序（application，APP）、全球定位系统（global positioning system,GPS）、电子药盒技术、临床实验室信息系统（laboratory information system, LIS）、地理信息系统（geographic information system,GIS）、医院信息系统（hospital information system, HIS）等互联网技术于结核病“防、治、管”各项工作，对于实现医疗资源合理分配、提高医务人员工作效率、优化患者诊疗服务等方面发挥了积极的作用。作者梳理了国内外结核病防控领域互联网技术应用相关研究的文献报道，并且进行了相关的阐述，以便为我国互联网＋结核病防控研究提供参考。

摘要： 一种利用生物信息学方法构建的抗菌肽及其应用。本发明提供了一种新型的抗菌肽，利用小偃麦SN6306的转录组数据结合生物信息学方法获得了抗菌肽基因，通过转化大肠杆菌表达目的蛋白，通过PDA平皿法、小麦叶片涂抹等方法分别验证这个抗菌肽的抗真菌活性。该抗菌肽可以用于制备抗禾谷镰刀菌、抗小麦白粉病的抑制剂，是一种具有潜在利用价值巨大的抗真菌的抑制剂的原料。本专利提供的抗菌肽可以代替传统化学农药，防治小麦及其他作物的真菌病害。

摘要： 本发明公开了一种基因组学及生物信息学的微生物组学在线分析平台架构，包括：底层支撑层，包括生物信息分析模块和云平台支撑模块，生物信息分析模块用于利用云平台支撑模块针对16S、ITS、18S以及微生物宏基因组测序进行个性化分析，与数据以及功能层、交互层交互，最后通过交互层以交互界面的形式对用户呈现，云平台支撑模块包含云平台所需的软硬件条件；数据以及功能层，用于向底层支撑层提供用户数据和系统数据；交互层，用于将生物信息分析模块的分析结果以交互界面的形式对用户呈现，本发明可解决传统高通量测序科研服务模式的弊端，使得无生物信息基础的科研工作者也可根据需要自主选择参数、一键生成分析结果、图形完全动态，便于实时解析。

摘要： 一种供个人确定其共享、隐私和数据访问首选项以及生物信息学数据披露条件的系统、方法和设备，包括网络上的全基因组序列数据。通过与隐私首选项存储库和策略存储库的结合，用于表达关于访问此类信息的法律和制度准则，私有访问局可以令这种隐私要求得到处理，同时通过适当授权的当事人或应用程序，广泛共享这些数据。通过使用与这种数据元素同时发生的各种形式的元数据、加密和全局唯一ID，可以查询到所述数据的离散段；在允许的情况下，根据与直观用户界面相关联并通过直观用户界面进行动态控制的相关隐私法律、制度策略和个人的首选项，发现、访问、分析、查看、与其他健康数据和联系资料相关和/或导出。

摘要： 基因组或蛋白质组数据被编码为包括生物信息学字符集(20)的字符的基因组或蛋白质组字符串。基因组或蛋白质组数据的每一个碱基或肽通过生物信息学字符集的单个字符来表示，以及生物信息学字符集的每个字符编码(I)碱基或肽以及(II)与该碱基或肽相关联的至少一个注释的数据值。该基因组或蛋白质组数据通过使用映射到生物信息学字符集的生物信息学字体(40)显示基因组或蛋白质组字符串来被显示。至少一个字符串函数可在基因组或蛋白质组字符串上执行以生成更新的基因组或蛋白质组字符串，其中至少一个碱基或肽由编码了至少一个附加的或修改的注释的数据的单个字符表示，该字符由执行的字符串操作生成。

摘要： 本发明公开了一种利用生物信息学筛选疾病标志物的方法及其应用。目前筛选疾病标志物的方法大部分都是各种高通量测序，成分较高，本发明通过生物信息学分析方法筛选到了与疫病相关的标志物，尤其与瘢痕疙瘩相关的基因和mRNA，可信度非常高，为疾病基因水平的研究提供了重要的生物分析方法和靶标。

摘要： 一种利用生物信息学方法构建的抗菌肽及其应用。本发明提供了一种新型的抗菌肽，利用小偃麦SN6306的转录组数据结合生物信息学方法获得了抗菌肽基因，通过转化大肠杆菌表达目的蛋白，通过PDA平皿法、小麦叶片涂抹等方法分别验证这个抗菌肽的抗真菌活性。该抗菌肽可以用于制备抗禾谷镰刀菌、抗小麦白粉病的抑制剂，是一种具有潜在利用价值巨大的抗真菌的抑制剂的原料。本专利提供的抗菌肽可以代替传统化学农药，防治小麦及其他作物的真菌病害。

摘要： 本发明公开了一种应用于生物信息学中类别不平衡分类方法，首先利用有效的聚类融合方法对数据集进行多次聚类，产生多个聚类结果，称为聚类成员，并将各个聚类成员的簇标记进行匹配，接着计算各样本的“聚类一致性系数”，根据样本“聚类一致性系数”的高低找出处于少数类边界区域的样本和处于多数类中心区域的样本，并分别对少数类边界区域和多数类中心区域的样本进行过抽样和欠抽样处理，最后，利用传统的分类学习方法对重抽样后的数据集进行分类学习，生成相应的分类模型，能够有效发现少数类边界区域和多数类中心区域的样本，有针对性地进行过抽样和欠抽样处理，避免出现分类器过于拟合或丢失多数类中重要信息等现象。

摘要： 本发明公开了一种无创产前生物信息学检测系统及其方法和应用，所述方法包括以下步骤：1)提取孕妇外周血cfDNA进行全基因组测序，得到原始的下机数据；2)自动监控程序监控原始数据下机，自动完成分析流程的投递任务；3)自动完成下机数据拆分任务，fastq原始数据质控，参考基因组比对与质控。本发明的方法能自动完成从数据下机监控到自动分析再到给出检测结果的整个过程，中间无需人员进行操作，减少人为因素引入的误差，减少数据分析的复杂性，使其更适合投入生产使用。

摘要： 本发明公开了一种在高性能集群系统中安装生物信息学类应用程序的方法，包括：载入生物信息学类应用程序的环境变量；根据当前安装平台的系统类型和网络配置选择对应的数学库；利用环境变量和数学库，安装生物信息学类应用程序。通过本发明所提供在高性能集群系统中安装生物信息学类应用程序的方法提高了安装高性能集群系统中安装生物信息学类应用程序的效率。

摘要： 本发明是快速鉴定番木瓜抗白粉病基因；涉及到植物比较基因组学，遗传学和生物信息学等学科知识，属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为：1）番木瓜全基因组序列的下载及MLO型基因的采集；2）MLO型基因的鉴定；3）MLO型基因系统发育关系；4）MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了番木瓜白粉病基因挖掘周期，有利于白粉病基因的快速鉴定；通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记（SNP、SCAR等），还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择，准确性高；结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制，缩短育种年限，提高育种效率；为阐述番木瓜抗白粉病分子机制奠定了基础。