LAMP

摘要： A database system,known as the large PMT characterization and instrumentation database system(LPMT-CIDS),was designed and implemented for the Jiangmen Underground Neutrino Observatory(JUNO).The system is based on a Linux+Apache+MySQL+PHP(LAMP)server and focuses on modularization and architecture separation.It covers all the testing stages for the 20-inch photomultiplier tubes(PMTs)at JUNO and provides its users with data storage,analysis,and visualization services.Based on the successful use of the system in the 20-inch PMT testing program,its design approach and construction elements can be extended to other projects.

摘要： 鸭细小病毒(Duck parvovirus,MDPV)是细小病毒科依赖病毒属成员。为建立鸭细小病毒(MDPV)快速、便捷、准确、灵敏度高的实时荧光LAMP检测方法,针对鸭细小病毒基因组中相对保守的特异区域设计LAMP引物组,用灭活后的病毒血清样本直接扩增,筛选出一套最优引物组并做特异性和灵敏度实验。结果表明,该引物组特异性扩增鸭细小病毒,对相似的其他病毒和衣原体检测结果为阴性;将模板10倍比例稀释后检测结果限线性范围达6个数量级,检测下限为2 copies,证明该技术方法可应用于鸭细小病毒现场快速检测。

摘要： 鸭腺病毒3型(DAdV-3)是我国鸭群中出现的一种新型腺病毒,属于腺病毒科禽腺病毒属成员。为建立DAdV-3的快速检测方法,本研究根据DAdV-3的fiber2基因,设计特异性的LAMP检测引物,构建重组质粒标准品pT-DAdV-3,经各反应条件优化,建立了DAdV-3 LAMP快速检测方法。结果显示,建立的LAMP检测方法最佳反应条件为64°C40 min;该方法仅对DAdV-3呈阳性反应,与番鸭细小病毒、鸭圆环病毒、鸭源减蛋综合征病毒等其他常见鸭源传染病病原均无交叉反应,特异性强。该方法对重组质粒标准品的最低检测限为50拷贝/μL;利用本研究建立的LAMP方法、前期建立的PCR方法和基于MGB探针的荧光定量PCR方法对临床收集的66份鸭组织病料样品进行检测,结果显示阳性率分别为13.63%(9/66)、13.63%(9/66)和15.15%(10/66);且LAMP检测的阳性样品经PCR方法检测和荧光定量PCR方法检测均为阳性,符合率为100%。本研究首次建立了检测DAdV-3的LAMP方法,该方法快速敏感、特异性强,为该病的流行病学调查提供技术支撑。

摘要： 流行性脑脊髓膜炎(简称流脑)是由脑膜炎奈瑟菌(Nm)引起的一种急性呼吸道传染病。快速、准确、灵敏的实验室检测方法可为流脑临床诊断和流行病学监测研究提供可靠的手段和依据。随着生物技术的发展,基于不同技术原理的快速检测方法被开发并应用于流脑实验室检测,显著提高了不同层级实验室Nm检测率和灵敏度,减少了流脑早期诊断所需的时间。本文就目前国内外流脑实验室快速和分子诊断的研究进展作一综述,以期为后续流脑的预防和控制奠定一定基础。

摘要： 采用基于LAMP技术核酸检测平台可以实现比传统PCR检测平台时间更短,成本更低,更有利于广泛的基层推广使用。用于LAMP技术的核酸浊度检测仪,采用了基于STM32F407微处理器和TMP116数字温度传感器的温度精确控制电路,描述了基于S1336-44BK光电池的高精度光电检测设计,给出了硬件电路设计及软件实例。实验结果表明,该方法能够快速实现新型冠状病毒的扩增及结果判定,具有较高的灵敏度及准确的结果。

摘要： 环介导等温扩增技术(LAMP)具备特异性好、灵敏度高、方便快捷的特点,目前已经广泛用于医学诊断、食品安全检测、植物病虫害检测等基因芯片领域。为植物病毒病的早期预防提供技术支撑,介绍了LAMP技术的原理、特性、在植物病毒检测中的应用以及该技术在植物病害检测中的发展前景。

摘要： 建立一种检测PCV3的LAMP方法,为现场快速诊断提供技术支持。根据PCV3全基因序列,设计了4条特异性引物,通过反应成分和反应条件的优化,建立了检测PCV3的LAMP方法,经过灵敏度试验、特异性试验、重复性试验和临床样品检测对比试验,确定该方法的实用性。结果表明,该方法检测的极限为10 copies/μL的质粒模板,与PRV、PPV、PCV-2、猪大肠杆菌、猪沙门菌DNA无交叉反应,重复性良好。应用该方法检测84份组织病料或血清,PCV3阳性率为15.5%,常规PCR方法阳性率为13.1%,两种检测方法符合率为97.6%(82/84)。LAMP方法比常规PCR方法检出率更高,可用于PCV3的现场快速诊断。

摘要： 布鲁氏菌病是由布鲁氏菌感染引起的一种公认的世界性人兽共患病,随着分子生物学检测方法的不断发展完善,多种快速、特异、敏感的检测方法被应用于布鲁氏菌的诊断和分型。现介绍常用的布鲁氏菌的聚合酶链式反应(PCR)、实时荧光定量PCR(qPCR)、TaqMan荧光定量PCR、TaqMan MGB荧光定量PCR、单核苷酸多态性分型(SNP)、重组酶聚合酶链反应(RPA)、环介导等温扩增(LAMP)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)、基于CRISPR/Cas的快速检测方法等检测分型方法,旨为布鲁氏菌核酸检测提供依据。

摘要： 本文在数字化背景下,针对Python程序设计课中缺乏多元化的教学方式和有弹性的评价方法等问题,以OBE理念为导向,采用Linux系统,Apache集群为Web服务器,PHP为基础语言,MySQL为数据存储(Store)容器,构建分布式Online Judge平台,使其成为“混合式”教学模式的重要一环,提升学生学习Python的兴趣和编程能力,提高人才培养质量。

摘要： 目的建立少棘巨蜈蚣的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)的方法,以实现对市场蜈蚣药材真伪的快速检测。方法针对少棘巨蜈蚣COI序列设计专属性LAMP引物;考察恒温条件下最佳反应时间;通过对DNA模板的梯度稀释,确定LAMP反应对蜈蚣药材的最低检测浓度;对少棘巨蜈蚣及其伪品进行LAMP扩增反应,以考察LAMP引物对少棘巨蜈蚣的特异性。结果筛选得到了一套特异性较好可用于检测少棘巨蜈蚣的LAMP引物,LAMP反应最佳反应时间为30 min,皮克级别的DNA就能被显著检出。结论LAMP反应对于少棘巨蜈蚣的检测显示了良好的特异性,使用简便,有用于指导市场流通过程中蜈蚣药材的快速检测的潜力。

摘要： 目前鸡传染性贫血的诊断方法有ELTSA, DNA探针、常规PCR,Real-time PCR等，环介导等温扩增技术(Loop-Mediated IsothermalAmplification, LAMP)是由日本Notomi等在2000年开发的一种新颖的恒温核酸扩增方法，其特点是针对靶基因的6个区域设计4种特异引物和一种具有链置换活性的DNA聚合酶，在恒温条件下高效扩增核酸，具有高特异性、快速灵敏、高效、操作简便等特点。本文介绍了鸡传染性贫血病LAMP检测方法的建立实验的材料和方法，并对其结果进行了分析。指出：LAMP方法是一种便携、特异性强、灵敏度高的检测方法，其产物的检测方法比较多，可通过肉眼观测其混浊度的变化，也可通过加入稀释后的SYBR Green Ⅰ染料来观察产物的颜色变化，还可以通过凝胶电泳来检测其产物。如果对LAMP方法进行进一步完善、优化和推广，该技术将会在鸡传染性贫血病的诊断与预防有更广泛的应用。

摘要： 目前鸡传染性贫血的诊断方法有ELTSA, DNA探针、常规PCR,Real-time PCR等，环介导等温扩增技术(Loop-Mediated IsothermalAmplification, LAMP)是由日本Notomi等在2000年开发的一种新颖的恒温核酸扩增方法，其特点是针对靶基因的6个区域设计4种特异引物和一种具有链置换活性的DNA聚合酶，在恒温条件下高效扩增核酸，具有高特异性、快速灵敏、高效、操作简便等特点。本文介绍了鸡传染性贫血病LAMP检测方法的建立实验的材料和方法，并对其结果进行了分析。指出：LAMP方法是一种便携、特异性强、灵敏度高的检测方法，其产物的检测方法比较多，可通过肉眼观测其混浊度的变化，也可通过加入稀释后的SYBR Green Ⅰ染料来观察产物的颜色变化，还可以通过凝胶电泳来检测其产物。如果对LAMP方法进行进一步完善、优化和推广，该技术将会在鸡传染性贫血病的诊断与预防有更广泛的应用。

摘要： 目前鸡传染性贫血的诊断方法有ELTSA, DNA探针、常规PCR,Real-time PCR等，环介导等温扩增技术(Loop-Mediated IsothermalAmplification, LAMP)是由日本Notomi等在2000年开发的一种新颖的恒温核酸扩增方法，其特点是针对靶基因的6个区域设计4种特异引物和一种具有链置换活性的DNA聚合酶，在恒温条件下高效扩增核酸，具有高特异性、快速灵敏、高效、操作简便等特点。本文介绍了鸡传染性贫血病LAMP检测方法的建立实验的材料和方法，并对其结果进行了分析。指出：LAMP方法是一种便携、特异性强、灵敏度高的检测方法，其产物的检测方法比较多，可通过肉眼观测其混浊度的变化，也可通过加入稀释后的SYBR Green Ⅰ染料来观察产物的颜色变化，还可以通过凝胶电泳来检测其产物。如果对LAMP方法进行进一步完善、优化和推广，该技术将会在鸡传染性贫血病的诊断与预防有更广泛的应用。

摘要： LAMP)检测技术是近年来新兴的检测技术,具有特异、灵敏、快速的特点.为了对禽流感建立快速实用分子生物学检测技术,我们借助新兴的环介导等温扩增技术,建立了禽流感病毒通用型灵敏、特异、快速的分子生物学检测方法 体外等温扩增检测方法.通过对Genbank已报道的多个亚型的禽流感病毒的HA基因进行序列分析比较,设计了6条针对禽流感M基因的8个位点的特异性LAMP简并引物,建立了从核酸抽提到RT-LAMP检测共需要115min的快速检测技术.该方法灵敏,检测灵敏性与实时荧光RT-PCR相当;特异,对其他引发家禽呼吸道病的病毒检测均为阴性;简单,不需要复杂的仪器,只要常规水浴锅在65°C即可进行,通过加入染料后目测可以实现对扩增结果的判断.该方法是适合基层和现场检测的快速灵敏实用的分子生物学检测方法.

摘要： LAMP)检测技术是近年来新兴的检测技术,具有特异、灵敏、快速的特点.为了对禽流感建立快速实用分子生物学检测技术,我们借助新兴的环介导等温扩增技术,建立了禽流感病毒通用型灵敏、特异、快速的分子生物学检测方法 体外等温扩增检测方法.通过对Genbank已报道的多个亚型的禽流感病毒的HA基因进行序列分析比较,设计了6条针对禽流感M基因的8个位点的特异性LAMP简并引物,建立了从核酸抽提到RT-LAMP检测共需要115min的快速检测技术.该方法灵敏,检测灵敏性与实时荧光RT-PCR相当;特异,对其他引发家禽呼吸道病的病毒检测均为阴性;简单,不需要复杂的仪器,只要常规水浴锅在65°C即可进行,通过加入染料后目测可以实现对扩增结果的判断.该方法是适合基层和现场检测的快速灵敏实用的分子生物学检测方法.

摘要： LAMP)检测技术是近年来新兴的检测技术,具有特异、灵敏、快速的特点.为了对禽流感建立快速实用分子生物学检测技术,我们借助新兴的环介导等温扩增技术,建立了禽流感病毒通用型灵敏、特异、快速的分子生物学检测方法 体外等温扩增检测方法.通过对Genbank已报道的多个亚型的禽流感病毒的HA基因进行序列分析比较,设计了6条针对禽流感M基因的8个位点的特异性LAMP简并引物,建立了从核酸抽提到RT-LAMP检测共需要115min的快速检测技术.该方法灵敏,检测灵敏性与实时荧光RT-PCR相当;特异,对其他引发家禽呼吸道病的病毒检测均为阴性;简单,不需要复杂的仪器,只要常规水浴锅在65°C即可进行,通过加入染料后目测可以实现对扩增结果的判断.该方法是适合基层和现场检测的快速灵敏实用的分子生物学检测方法.

摘要： LAMP)检测技术是近年来新兴的检测技术,具有特异、灵敏、快速的特点.为了对禽流感建立快速实用分子生物学检测技术,我们借助新兴的环介导等温扩增技术,建立了禽流感病毒通用型灵敏、特异、快速的分子生物学检测方法 体外等温扩增检测方法.通过对Genbank已报道的多个亚型的禽流感病毒的HA基因进行序列分析比较,设计了6条针对禽流感M基因的8个位点的特异性LAMP简并引物,建立了从核酸抽提到RT-LAMP检测共需要115min的快速检测技术.该方法灵敏,检测灵敏性与实时荧光RT-PCR相当;特异,对其他引发家禽呼吸道病的病毒检测均为阴性;简单,不需要复杂的仪器,只要常规水浴锅在65°C即可进行,通过加入染料后目测可以实现对扩增结果的判断.该方法是适合基层和现场检测的快速灵敏实用的分子生物学检测方法.

摘要： 本发明公开了一种小麦白粉菌的LAMP检测引物组合及其LAMP检测试剂盒和LAMP方法，属于生物技术领域。该LAMP引物组合由正向外引物F3，反向外引物B3，正向内引物FIP，反向内引物BIP组成。本发明的检测方法可同时检测所有小麦白粉菌，并可区分其他近源白粉菌，特异性强、准确性高、操作简便、实用性好、实现了等温扩增，可用于小麦白粉菌的高灵敏度快速检测，易于大规模推广。

摘要： 本发明公开了一种掘氏疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增，同时还为掘氏疫霉菌的检测提供了新的技术平台，可用于掘氏疫霉菌的高灵敏度快速检测，同时在病害侵染初期鉴定出病原物，能够对田间土壤中的掘氏疫霉菌进行检测。本发明对掘氏疫霉菌引起的疫病防治和对减少农药盲目使用，降低生产成本，减少农药的环境污染也具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种棕榈疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3、正向环引物LF和反向环引物LB组成；各引物序列具体如下：FIP：5′‑CTCACTTCAACAGCCCCGCC‑GAAGTGTGCTGCGTCGTG‑3′；BIP：5′‑TCGGCTAAAGTGACGGCTTTGA‑CAACCTGCAACCACCGAA‑3′；F3：5′‑GCGGAAGGGACTACACCT‑3′；B3：5′‑AACAACAACACCGAGGCC‑3′；LF：5′‑ ACAGAGCAAGAAGCGAATTAGAG‑3′；LB：5′‑GCTGCGAGTGGTTTGTGACT‑3′。

摘要： 本发明公开了一种恶疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成；各引物序列具体如下：FIP：5′‑ TCTGGGCACAACCGCAAAAA‑TTTGCGAGCTCCAGATTTCC‑3′；BIP：5′‑ AATCCGTACGATCGAGCTGGAC‑ACACGCCACGTCTGCT‑3′；F3：5′‑ TTCTGCGCTAGGCGACC‑3′；B3：5′‑CACACAAGTGGACCGTTAG‑3′；LB：5′‑ GGAAAGACCATCAAGCTCCAGAT ‑3′。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增，同时还为恶疫霉菌的检测提供了新的技术平台，可用于恶疫霉菌的高灵敏度快速检测，同时在病害侵染初期鉴定出病原物，能够对田间土壤中的恶疫霉菌进行检测。本发明对恶疫霉菌引起的疫病防治和对减少农药盲目使用，降低生产成本，减少农药的环境污染也具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种致病疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增，同时还为致病疫霉菌的检测提供了新的技术平台，可用于致病疫霉菌的高灵敏度快速检测，同时在病害侵染初期鉴定出病原物，能够对田间土壤中的病原物进行检测，本发明对马铃薯、番茄的晚疫病防治和对减少农药盲目使用，降低生产成本，减少农药的环境污染也具有重要意义。

摘要： 一种羊副结核分支杆菌的LAMP检测引物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法，检测引物包括正向外引物F3、反向外引物B3、正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向环引物LF。试剂盒包括Tris·HCl，KCl，(NH4)2SO4，Tween20，甜菜碱，MgSO4，dNTP each，Bst DNA polymerase，钙黄绿素指示剂，LAMP检测引物。利用LAMP试剂盒进行LAMP；观察LAMP反应溶液颜色变化，绿色表示检测为阳性，橙色表示检测为阴性。优点是：具有简便、快速、准确、廉价、可视等优点，可用于畜牧业生产单位筛查和检测羊副结核分支杆菌，对羊副结核病的净化与控制具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种小麦白粉菌的LAMP检测引物组合及其LAMP检测试剂盒和LAMP方法，属于生物技术领域。该LAMP引物组合由正向外引物F3，反向外引物B3，正向内引物FIP，反向内引物BIP组成。本发明的检测方法可同时检测所有小麦白粉菌，并可区分其他近源白粉菌，特异性强、准确性高、操作简便、实用性好、实现了等温扩增，可用于小麦白粉菌的高灵敏度快速检测，易于大规模推广。

摘要： 本发明公开了一种冬生疫霉的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法，该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增，同时还为冬生疫霉的检测提供了新的技术平台，可用于冬生疫霉的高灵敏度快速检测，同时能够对人工接种发病组织验证中，只有发病组织提取的DNA样本经过LAMP反应出现天蓝色阳性反应，而设置的阴性对照及健康组织中提取的DNA样本经反应后没有颜色变化，显示该LAMP体系反应明显、准确、且特异性、灵敏度及稳定性较高。

摘要： 本发明公开了一种丁香疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该环介导等温扩增检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增，同时还为检疫性疫霉菌的检测提供了新的技术平台，可用于丁香疫霉的高灵敏度快速检测，同时在病害侵染初期鉴定出病原物，能够对出入境水果样品中的丁香疫霉进行检测。本发明对丁香疫霉引起的疫病和对减少农药盲目使用，降低生产成本，减少农药的环境污染也具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种检测A型单端孢霉烯族毒素的LAMP引物组合和LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP引物组合由正向外引物F3，反向外引物B3，正向内引物FIP，反向内引物BIP和反向环引物LB组成。本发明的检测方法可同时检测所有A型单端孢霉烯族毒素，并且特异性强、准确性高、操作简便、实用性好、实现了等温扩增，可用于A型单端孢霉烯族毒素的高灵敏度快速检测，易于大规模推广。