分子标记辅助育种

摘要： 葡萄是具有重要经济价值的果树之一,其遗传育种学广受研究者关注。由于葡萄童期长、遗传杂合度高,传统杂交育种选育新品种通常耗时长、效率低。因此,通过构建葡萄遗传连锁图谱、对数量性状位点(quantitative traits locus,QTL)进行定位能够解析葡萄杂交群体中分子标记与表型之间的关系,更有针对性地选择育种亲本并对后代杂交群体进行早期鉴定,开展分子标记辅助育种(marker-assisted selection,MAS),加快育种进程。随着分子生物学和基因组测序技术的发展,自2000年开展了基因定位研究后,越来越多的QTL得到了解析。本文对近20年来发现的葡萄抗霜霉病、抗白粉病、抗根瘤蚜、浆果大小、无核、果皮颜色等重要基因的QTL定位情况进行了综述,重点介绍了葡萄色泽性状相关Myb基因定位及其在MAS中的应用,以期挖掘葡萄种质资源中与抗性、品质性状形成和调控相关的关键基因,推动葡萄定向分子设计育种进程,以及提升我国葡萄育种水平。

摘要： 类胡萝卜素是园艺植物中广泛存在的次生代谢物和色素物质,在植物生长发育和观赏价值中发挥重要作用。同时它也是高价值的天然活性物质,对人体健康有益。因此,类胡萝卜素的代谢调控一直是园艺植物的研究热点。类胡萝卜素组分和含量的差异是造成园艺植物色泽和营养成分多样性的重要原因之一,解析优质性状形成的分子机制是进行定向改良的前提和基础。目前,植物类胡萝卜素代谢途径已明确,大量研究表明代谢通路上基因的启动子和编码区变异是造成类胡萝卜素代谢多样性的关键因素之一。本文对园艺植物类胡萝卜素变异遗传机制的研究策略、启动子和编码区的变异类型及变异对类胡萝卜素代谢的影响进行综述,为园艺植物类胡萝卜素的定向改良提供理论依据。

摘要： 水稻稻瘟病是水稻的重要病害之一,给我国甚至全世界的水稻安全生产带来了巨大隐患。选育优质抗稻瘟病恢复系,进而培育稻瘟病水稻杂交组合,是选育抗稻温病品种的有效途径之一。本研究以双抗77009为抗性基因Pigm-1的供体亲本,以感病恢复系R20为受体亲本,通过杂交和连续回交方法,并利用分子标记辅助选择技术,定向改良优质水稻恢复系R20的稻瘟病抗性,得到4个R20的抗病改良系。室内接菌和田间自然诱发鉴定结果表明,R20-1、R20-2、R20-3和R20-4改良系均表现为抗稻瘟病;遗传背景恢复分析显示,这4个改良系基本恢复受体亲本的背景;农艺性状分析表明,R20-1、R20-2、R20-3与受体亲本R20的株高、穗长、有效穗、每穗颖花数、结实率、粒长、粒宽和千粒重等性状相比,没有显著差异,而R20-4的粒长和千粒重与R20相比显著增加。本研究利用分子标记辅助技术改良了恢复系R20稻瘟病抗性,而且改良系R20-4在抗病的同时产量得到了提高,为抗稻瘟病基因Pigm-1的分子育种研究提供了参考依据。

摘要： 分子标记辅助育种是一种便捷、高效的育种技术,其打破了传统的育种方式,能够精确、快速地改良目标性状进而选育出优良品种.通过对分子标记辅助育种的论文发表和专利申请情况进行深入分析,总结了分子标记辅助育种的总体发展趋势与重点研发领域,并对比各个国家的发展现状及不同机构的研发能力,以了解目前该技术的研究方向及应用领域,并对分子标记辅助育种的发展前景作出展望.

摘要： 利用已克隆的Pigm基因的核酸序列在基因功能区设计新引物,鉴定到不育系材料FD1712的功能区序列差异,开发了基于PCR的新的插入/缺失(insert-deletion,InDel)标记,标记与基因功能紧密连锁.通过扩增和电泳检测,表明引物扩增稳定;通过稻瘟病菌的接种鉴定,表明新开发的标记能有效鉴别稻瘟病抗性,可用于分子标记辅助育种.

摘要： 利用已经克隆的ZmCCT基因的核酸序列,在基因功能区设计新引物,鉴定到针对安徽丰大种业股份有限公司玉米骨干自交系0908的功能区序列差异,开发了基于PCR的新的插入/缺失(insert-deletion,InDel)标记,标记与基因功能紧密连锁.通过扩增、电泳检测和接种鉴定,结果表明,新开发的标记能有效地鉴别玉米茎腐病抗性,可用于分子标记辅助育种.

摘要： [目的]本文基于茄亲本及F2材料高通量测序数据,开发茄果皮着色光敏性相关dCAPS标记,为标记辅助选择及果皮着色光敏性基因定位提供理论依据。[方法]以果皮着色光敏感茄品种‘蓝山禾线’和光不敏感茄品种‘145’及其60个F2单株为材料,通过高通量简化基因组测序技术和群体分离分析法(BSA)相结合,在候选区间内设计dCAPS引物,开发多态性共显性标记,并使用192个F2单株和123个茄品种对标记进行验证。[结果]茄果皮着色光敏性为单基因控制的显性遗传。根据BSA-seq和关联分析,当置信度为0.99时,在第10号染色体上鉴定出3个候选区段87.080~88.090 Mb、91.475~92.475 Mb、92.785~93.785 Mb,总长度为3.01 Mb。在候选区段开发了1个可用于区分果皮着色光敏感和光不敏感茄的dCAPS-9标记,该标记在192个F2单株和123个茄品种中的表型对应度分别达到98.4%和91.9%。[结论]dCAPS-9在分离群体及品种鉴定中具有较高的准确性,对于茄果皮着色光敏性标记辅助选择具有重要意义。

摘要： 吉粳816是吉林省农业科学院水稻研究所培育出的粳稻新品种,综合性状好、高产、抗逆、米质优良具香味.该品种是通过分子标记辅助选择与模块化综合测试体系,对变异后代的表观、产量、品质及抗逆等性状进行精准测试与评价,结合穿梭育种与高压选择选育而成.2018年通过吉林省品种审定委员会审定,审定编号为“吉审稻20180043”.本文介绍了吉粳816的选育过程、特征特性及栽培技术要点.

摘要： 以蒙古冰草(Agropyron mongolicum var.mongolicum)DNA为模板,利用单因素与正交试验设计相结合的方法,对影响冰草SSR-PCR体系的dNTP浓度、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度和Taq DNA聚合酶用量5个因素进行优化.结果 表明,冰草SSR-PCR的最佳体系为:dNTP浓度250μmol·L-1、Mg2+浓度2.25 mmol·L-1、引物浓度0.60μmol·L-1、模板DNA浓度40 ng·μL-1和Taq DNA聚合酶用量0.75 U,其余为ddH2O,反应总体积为20μL.本研究筛选出适于冰草SSR-PCR的最佳反应体系,可提高冰草SSR扩增条带的清晰度和可靠性,这为后续深入开展冰草的遗传作图、重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础.

摘要： 为了在周口地区大豆遗传背景的基础上筛选出有效的高蛋白基因分子标记,选用高蛋白大豆周豆25号和高油周豆18号作为亲本杂交构建F2分离群体,选择144对SSR引物,运用BSA方法进行大豆高蛋白基因SSR分子标记筛选,并利用Mapmaker/Exp V3.0软件构建分子连锁图谱和定位分析.结果 表明,在亲本间具有多态性引物32对;这32对引物在高、低蛋白基因池间有4对引物(satt182、satt419、satt239、satt598)表现多态性,但这4对引物与蛋白相关的标记不连锁,其中,引物satt 182贡献率最高(3.1％).利用标记satt 182对来自河南、北京等地的50份高蛋白大豆材料进行检测,验证分子标记辅助育种方法的有效性,结果显示,50份大豆材料中检测出38份与相应的特异性条带相同,检测符合度为76.0％,检测结果有效性较高、准确性较好.

摘要： 大豆是植物蛋白质和食用油的主要来源,发展一张高密度的大豆遗传连锁图谱,对其数量性状座位的精细定位、分子标记辅助育种、图位法基因的克隆、豆科作物间的比较基因组学研究以及大豆全基因组序列测序的完成都具有非常重要的意义.本文以大豆经典遗传连锁图谱、RFLP和SSR标记为主构建的分子遗传连锁图谱的先后发展顺序,对近二十年来国内外在大豆遗传连锁图谱的研究作一详细综述。

摘要： 利用来自亚洲棉渐渗的陆地棉优质新品系(0-153和0-212,纤维强度和早熟性都很突出)与陆地棉转基因抗虫新品系(9708和6177)为材料,构建9708×0-153(组合1)和6177×0-212(组合2)F2及F2:3分离群体,在遗传分析的基础上通过分子标记筛选多环境表现稳定的新的主效QTL,从而为进一步研究纤维品质性状基因的相互作用及分子标记辅助育种利用奠定基础,从而尽快提高我国棉花品种的纤维品质水平,满足纺织工业的发展和人民生活水平的提高的需要.

摘要： 采用多年多点田间试验和不同遗传模型的QTL分析方法,较为系统地深入研究陆地棉杂种一代、二代优势的表现,以及它们之间的内在联系,探讨了杂种二代利用和杂种优势预测的可能性;结合F2:3、重组自交系F6:8及F6:9的遗传分析及QTLs定位,从基因组基因平均水平和分子水平上揭示杂种优势形成的遗传基础,为棉花杂交种育种提供理论依据,并为分子标记辅助育种奠定基础.

摘要： 以两个陆地棉品种中棉所36×TM-1的207个F2单株为作图群体,筛选出73个多态性引物,25个SSR标记、35个RAPD标记和13个SRAP标记,构建了第一张以研究短季棉为主的包含43个标记,标记间的最小遗传距离为¨.8cM,最大遗传距离为48.9cM,总长1174.0cM的遗传连锁图谱,覆盖棉花基因组总长度的23.48％.检测到与短季棉早熟性状相关的12个QTLs,其中有8个QTLs呈簇分布在LG1连锁群上,找到对表型变异的贡献率在30％以上与全生育期、霜前花率和开花期有关的QTL各1个.以研究短季棉为主的遗传连锁图谱的构建及相关QTLs的呈簇分布在所查文献中均未见报道,为短季棉早熟性分子标记辅助育种奠定坚实基础.

摘要： 随着人类社会的发展,人口持续增长和耕地面积下降是不可逆转的趋势,向广阔的水域索取食物的"蓝色革命"已愈来愈被全世界所重视.然而,随着水产养殖规模扩大、年数增加,病害问题已严重困扰着许多重要种类养殖业的发展、且不可避免地将影响所有新开发养殖种类;养殖经济价值高的肉食性种类(对虾、肉食性鱼类等)消耗了大量较低值鱼类,导致养殖业发展不仅没有减轻对天然水生生物的捕捞压力、起到保护野生渔业资源作用,甚至起到相反的破坏作用.为了养殖业提高效益和持续长久地发展,需要培育生长快、抗病力与抗逆性强、饲料转化率高、品质好的优良品种.本文讨论：一、经济性状分子标记对于水产生物育种的重要性，二、获得经济性状分子标记的途径，三、水产动物基因组作图和QTL分析研究的现状，四、分子标记辅助选育技术的应用及展望，五、加速我国分子标记育种研究的建议。

摘要： 小麦黄矮病、白粉病、土传病毒病是小麦的重要病害,蚜虫则是小麦最重要虫害.通过生物技术,培育抗黄矮病、白粉病、土传病毒病及蚜虫的小麦新品种,是防治这些病虫害的最经济有效的方法之一.生物技术课题组经十多年工作,已将偃麦草3个不同的黄矮病抗性基因导入小麦,明确了其抗性基因分别位于中间偃麦草的7X、2Ai-2和Ag.pulcherrimum偃麦草的1AP染色体上.综合应用生物技术已将L1携带的黄矮病抗性基因Bdv2转移到小麦7DL上,育成了易为小麦育种计划利用的小片段易位系HW642、YW443、YW243等,找到了与黄矮病抗性共分离的RFLP标记psr680、psr687和wg380、RAPD标记,建立了SCAR标记SC-W37和SC-RA01,并已应用于分子标记辅助育种.将2Ai-2和1Ap染色体导入普通小麦,育成了抗黄矮病的异附加系和代换系.筛选到小表合成种M53,携带一个新的白粉病抗性基因.利用他人建立的抗白粉病基因pm4、pm13、pm21的特PCR标记,开展了兼抗黄矮、白粉病的聚合育种.开展小麦抗十传病毒病等转基因研究,筛选出优良的转基因受体扬麦158等.采用基因枪共转化法将小麦黄花叶毒病复制酶基因pUbiNIb8和土传花叶病毒外壳蛋白基因pEmuCPI导入扬麦158.分子检测结果表明目的基因已整合到小麦基因组中,在T代已选出4个高抗小麦黄花叶病扬麦158转基因株系.通过基因枪介导法获得了转雪花莲凝集素(GNA)基因小麦,已获得转基因京411T代抗蚜株系,经分子检测证明GNA已整合到小麦基因组中,抗蚜试验表明转基因小麦能降低麦蚜繁殖力.小麦农秆菌转基因体系的研究,优化了参数,转化效率达到1.5﹪左右,已将GCE、Bc1-wt、IAP和Rev-6等4种功能基因导入小麦,目前正在进行功能鉴定.开展小麦抗黄矮病基因的克隆工作,构建了抗病易位系的基因组TCA文库和普通cDNA文库,从TAC文库中筛选到候选抗病基因克隆,从普通cDNA文库中筛选到2个与抗病、抗逆相关的具开放阅读框的全长cDNA序列.

摘要： 综述了分子标记和基因工程技术在荔枝育种上的应用进展。已有研究者利用分子标记技术进行荔枝品种鉴定、分类、种质问遗传多样性及亲缘关系分析,遗传连锁图谱的构建,与优良性状相关的分子标记鉴定。及杂种后代检测;克隆了部分荔枝基因,建立了遗传转化体系。这些研究为荔枝分子育种提供了基础。

摘要： 综述了分子标记和基因工程技术在荔枝育种上的应用进展。已有研究者利用分子标记技术进行荔枝品种鉴定、分类、种质问遗传多样性及亲缘关系分析,遗传连锁图谱的构建,与优良性状相关的分子标记鉴定。及杂种后代检测;克隆了部分荔枝基因,建立了遗传转化体系。这些研究为荔枝分子育种提供了基础。

摘要： 综述了分子标记和基因工程技术在荔枝育种上的应用进展。已有研究者利用分子标记技术进行荔枝品种鉴定、分类、种质问遗传多样性及亲缘关系分析,遗传连锁图谱的构建,与优良性状相关的分子标记鉴定。及杂种后代检测;克隆了部分荔枝基因,建立了遗传转化体系。这些研究为荔枝分子育种提供了基础。

摘要： 用携带HMW-GS14+15的小偃6号作为轮回亲本,携带HMW-GS5+10的法国优质面包小麦品系707作为供体亲本,在回交后代的BC、BC、BC、BCF代其它农艺性状选择的基础上,利用1对特异引物逐代检测出携带优质Dx5基因的单株进行回交和自交.BC代中随机检测的58个单株的Dx5基因分布符合1对等位基因的遗传分离比例1:1;BC代小麦相同3个单株3个不同生长季节Dx5基因检测的结果完全一致,检测结果非常稳定;已将优质Dx5基因导入BCF后代的部分单株内;携带Dx5基因的株系XN89-7-3微量SDS沉淀值为18.8ml,比小偃6号提高了23.68％;蛋白质电泳筛选出了6个聚合多种优质亚基且编码基因纯合的单株,微量SDS沉淀值为19.9ml,比小偃6号提高了30.92％;选择农艺性状与轮回亲本相似并具有Dx5基因特异扩增产物的单株进行回交或自交,可加快回交转育的进度.实践证明,回交转育与分子标记辅助选育相结合的育种方法是快速定向聚合多种优质HMW-GS基因的有效方法之一.

摘要： 本发明公开了与位于玉米种子耐储性相关主效QTL区段紧密连锁的分子标记及其应用；所述分子标记与位于玉米第10号染色体Bin10.03区域内玉米种子耐储性相关主效QTL区段cQTL‑10紧密连锁，该分子标记为phi050和umc1648。本发明通过定位玉米种子耐储性的1个主效QTL区段，该区段包含包含2个QTL qRVI‑10和qRSVI‑10，分别影响相对活力指数和相对简易活力指数，发现了与玉米种子耐储性紧密连锁的2个SSR分子标记phi050和umc1648，本发明所提供的SSR分子标记可应用于提高玉米种子耐储能力的分子辅助育种。

摘要： 本发明是一种稻瘟病抗病基因Pi-ta辅助育种的InDel分子标记，该分子标记的核苷酸序列为SEQ？ID？NO.1。本发明还公开了一种PCR扩增稻瘟病抗病基因Pi-ta辅助育种的InDel分子标记的扩增引物；以及稻瘟病抗性基因Pi-ta辅助育种的InDel分子标记在Pi-ta抗性位点的基因分型或者Pi-ta基因的辅助选择育种中的用途，本发明还公开了稻瘟病抗病基因Pi-ta辅助育种的InDel分子标记的功能标记方法。本发明具有操作简便、节约成本的优点，尤其适合于育种中的大规模Pi-ta抗性基因鉴定及标记辅助选择育种，适于推广应用。

摘要： 本发明公开了与位于玉米种子耐储性相关主效QTL区段紧密连锁的分子标记及其应用；所述分子标记与位于玉米第10号染色体Bin10.03区域内玉米种子耐储性相关主效QTL区段cQTL‑10紧密连锁，该分子标记为phi050和umc1648。本发明通过定位玉米种子耐储性的1个主效QTL区段，该区段包含包含2个QTL qRVI‑10和qRSVI‑10，分别影响相对活力指数和相对简易活力指数，发现了与玉米种子耐储性紧密连锁的2个SSR分子标记phi050和umc1648，本发明所提供的SSR分子标记可应用于提高玉米种子耐储能力的分子辅助育种。

摘要： 本发明提供了检测SNP分子标记的试剂在山羊RBP4基因分型和/或山羊分子标记辅助育种中的应用，属于分子标记检测技术领域，根据Ensembl数据库最新版本RBP4的注释(ENSCHIG00000023599)，所述SNP分子标记位于山羊26号染色体的第36491960位碱基，该位置为RBP4基因的5’调控区，该处碱基为G或C。所述SNP分子标记与山羊产羔数具有显著的相关性；通过对山羊RBP4基因型进行选择，将具有高产羔数性状的CC型和较高产羔数的GC型个体选留下来，淘汰产羔数较低的GG型个体，从而提高山羊的繁殖力，对山羊大规模分子育种具有潜在的应用价值。

摘要： 本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种湖羊体长性状相关SNPs分子标记g.43756 G＞A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。其中，AA型个体的体长显著高于GA型个体，GG型个体与GA，AA型个体相比差异不显著。通过本发明提供的分子标记及其引物对和试剂盒，采用相关检测方法，能够筛选出湖羊的体长性状，起到辅助育种作用。

摘要： 本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种湖羊体长性状相关SNPs分子标记g.43917 G＞A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。其中，AA型个体的体长显著高于GA型个体，GG型个体与GA，AA型个体相比差异不显著。通过本发明提供的分子标记及其引物对和试剂盒，采用相关检测方法，能够筛选出湖羊的体长性状，起到辅助育种作用。

摘要： 本发明公开了一种与饭豆抗豆象QTL位点紧密连锁的分子标记及其在小豆抗豆象分子标记辅助育种中的应用。本发明通过“饭豆F021×白红2号”杂交，结合幼胚拯救，形成稳定的RIL作图群体，利用经筛选出来的264个多态性标记，构建了一个包含11个连锁群、总长268.2cM、密度适中的遗传连锁图谱，借助该遗传连图谱定位了一个饭豆抗豆象QTL位点(LOD值大于4)，命名为UmBr1，位于第2连锁群Achr7‑43～Achr7‑71标记区间内，标记间的遗传距离为0.7cM，表型变异解释率为12.3％、加性效应为‑0.165。同时，还筛选得到与该QTL位点连锁的两个SSR分子标记为Achr7‑43和Achr7‑71，通过利用这2个SSR分子标记检测该QTL位点，在苗期就可以进行抗豆象材料的筛选，能够大大提高筛选效率，节约生产成本，加快育种进程。

摘要： 本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种湖羊体高性状相关SNPs分子标记g.43815 G＞A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。一种与湖羊体高性状显著相关的SNPs分子标记，该分子标记定位为g.43815 G＞A；其中AA型个体的体高显著高于GG型个体，GA型个体与GG，AA型个体相比差异不显著。通过本发明提供的分子标记及其引物对和试剂盒，采用相关检测方法，能够筛选出湖羊的体高性状，起到辅助育种作用。

摘要： 本发明属于湖羊分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种湖羊体长性状相关SNPs分子标记g.43851 G＞A、引物对、试剂盒及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。其中，AA型个体的体长显著高于GA型个体，GG型个体与GA，AA型个体相比差异不显著。通过本发明提供的分子标记及其引物对和试剂盒，采用相关检测方法，能够筛选出湖羊的体长性状，起到辅助育种作用。

摘要： 本发明公开了与豇豆抗豆象QTL位点紧密连锁的分子标记及其在豇豆抗豆象分子标记辅助育种中的应用。本发明通过中豇1号(感豆象)和Pant‑lobia‑1(抗豆象)杂交形成RIL群体，利用182对多态性SSR标记构建遗传连锁图谱。并结合RIL群体各株系抗豆象表型鉴定结果，利用完备区间作图法进行抗豆象QTL定位分析。在遗传连锁图谱第1连锁群检测到一个抗豆象QTL位点，命名vubr1‑1，该QTL位点贡献率为7.16％。与该QTL连锁的2个SSR标记分别为XD11‑44和HAAS_VR_2274，标记间遗传距离为2.90cM。本发明所获得的抗豆象QTL分子标记可用于豇豆抗豆象苗期筛选，对于提高育种效率具有重要的理论和实践指导意义。