分子标志物

摘要： 目的基于生物信息学方法筛选与宫颈癌免疫相关的分子标志物。方法从基因表达汇编(GEO)数据库获取24例正常宫颈组织和28例宫颈癌组织数据。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取306例宫颈癌组织和3例正常宫颈组织数据。通过R软件ESTIMATE算法对数据集进行免疫、基质评分,分析评分与宫颈癌预后的关系。根据免疫评分筛选出差异表达基因(DEGs),并通过韦恩图显示其上调、下调情况,取两数据库所得交集。对关键基因进行GO富集分析、KEGG通路分析和基因集富集分析(GSEA)。构建蛋白质互作(PPI)网络。应用GEPIA2和UALCAN在线网站分析关键基因的表达水平并验证其与患者生存预后的关联性。结果基于TCGA数据库数据分析,高免疫评分组患者的生存情况优于低免疫评分组(log-rank检验:χ^(2)=4.400,P=0.035)。基于TCGA数据库数据,根据免疫评分高低进行筛选,共获得了1063个DEGs,其中包括640个上调基因和423个下调基因。基于GEO数据库数据共筛选出1903个DEGs,包括了1698个上调基因和205个下调基因。取两者交集最终得到7个下调基因和100个上调基因。针对该107个DEGs进行富集分析,GO富集分析提示DEGs参与了免疫调节的生物学功能。KEGG通路分析和GSEA结果提示DEGs主要富集于细胞因子受体的相互作用信号通路和细胞黏附分子通路。通过PPI网络进一步筛选到13个关键基因(节点数≥8),免疫细胞相关分析发现其与B细胞、T细胞等免疫细胞存在显著相关性(P<0.05)。生存分析结果显示,在这13个基因中,只有SELL和CXCL9与宫颈癌患者生存预后相关(P<0.05)。GEPIA2和UALCAN在线网站分析结果显示,CXCL9在宫颈癌组织中呈高表达(P<0.05)。但仅UALCAN的分析结果显示CXCL9高表达组的生存预后优于低表达组(P<0.05)。结论宫颈癌DEGs参与免疫调节过程。CXCL9在宫颈癌中高表达,与宫颈癌患者预后相关,有可能成为宫颈癌患者的潜在治疗靶标。

摘要： 脊索瘤起源于胚胎发育过程中残留的脊索组织,是一种较罕见的低度恶性骨肿瘤,占恶性骨肿瘤的1%~4%[1]。病因不明确,有文献[2]报道,原癌基因Brachyury、新的分子标志物i ASPP、SMARCB1及信号通路PI3K/AKT等与脊索瘤的发生有关;邝磊等[3]认为RNA腺苷脱氨酶1的过度表达可能通过介导A-I RNA编辑影响miR-10a和miR-125a的成熟和表达,参与脊索瘤发生中的细胞异常增殖调控。

摘要： 目的探究乳腺浸润性导管癌中分子标志物表达与病理诊断结果。方法回顾性分析凤冈县人民医院2015年1月—2020年12月收治的60例乳腺浸润性导管癌患者临床资料,并收集其病理组织标本,以免疫组化法检测其样本中分子标志物[雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人表皮生长因子受体(HER-2)、Ki-67]水平,并分析分子标志物与患者病理诊断之间的关系。结果年龄、组织学分级、TNM分级、肿瘤大小、是否存在腋窝淋巴结转移、腋窝转移淋巴结大小、是否复发,ER、PR阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05);组织学Ⅲ级HER-2阳性占比较Ⅰ~Ⅱ级高(60.87%vs 27.03%),存在腋窝淋巴结转移HER-2阳性占比较无腋窝淋巴结转移高(72.22%vs 26.19%),复发患者HER-2阳性较无复发转移高(75.00%vs 34.62%),差异有统计学意义(χ^(2)=6.769、11.124、4.712,P<0.05);TNM分期中Ⅲ~Ⅳ级Ki-67分级占比较Ⅰ~Ⅱ高(76.00%vs 40.00%),复发转移患者Ki-67阳性较无复发转移高(87.50%vs 50.00%),差异有统计学意义(χ^(2)=7.636、3.939,P<0.05)。结论ER、PR对乳腺浸润性导管癌病理诊断结果及预后无明显影响,HER-2、Ki-67对肿瘤组织学分期、TNM分期、是否存在腋窝淋巴结转移有影响。

摘要： 肺癌在我国的死亡增长幅度及危害程度居恶性肿瘤之首,其高死亡率和它的早期诊断治疗呈负相关,而传统肺癌诊断方法对于肺癌的临床诊治现状作用有限。目前,质谱检测已广泛用于寻找肺癌患者潜在诊断标志物的研究中。本文主要对质谱检测的肺癌标志物及其适用样本进行综述。

摘要： 神经系统肿瘤是一类起源于中枢神经实质细胞的良、恶性病,好发于颅内与椎管,胶质细胞瘤是其中最主要的恶性肿瘤。2021年第五版世界卫生组织(WHO)中枢神经系统(CNS)肿瘤分类(WHO CNS 5)在WHO CNS 4的基础上,进一步强调了综合诊断与分层报告的意义,明确了关键分子特征肿瘤精确分类的必要性,重新定义了部分肿瘤分子亚型如弥漫性星形细胞瘤(伴MYB或MYGBL1改变),弥漫性半球胶质瘤(H3 G34突变型)等,新增了一些分子标志物,实质性推进了分子信息在临床诊断与治疗中的应用。影像学作为无创评估神经系统肿瘤的重要手段也面临新的挑战和命题。

摘要： 骨膜蛋白(periostin,POSTN)是一种在骨组织中发现的分泌型细胞外基质蛋白,在进化中保守,易于通过患者血液、尿液和组织间液等体液样品检测,在体内多种组织中表达,其表达水平与多种疾病发生发展密切相关,有望成为一种有潜力的疾病早期诊断的分子标志物。该文系统综述了POSTN表达水平与心肌梗死、血管钙化、骨代谢相关疾病、慢性肾病与各种癌症发生发展的关系,探讨其作用与机制,为基于POSTN的疾病早期诊断试剂盒与药物研发提供科学依据。

摘要： 目的 通过甲基化芯片筛选颈动脉内中膜增厚相关基因的异常甲基化位点,探讨颈动脉增厚人群的遗传基础,预期筛选新型表观遗传标志物。方法选取2016年5月-2016年7月于上海市奉贤区青村镇体检者28例,所有研究对象均进行问卷调查和体检且完成颈总动脉内中膜厚度(common carotid artery intima-media thickness,CCA-IMT)超声检测,根据CCA-IMT厚度分为颈动脉内中膜增厚组和对照组,同时收集研究对象一般资料,进行体格检查及生化指标检测,收集静脉血冻存备用。利用Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChip (850K芯片)对8例颈动脉增厚患者和8例健康对照的外周血全基因组甲基化水平进行检测,利用数据库GO分析(Gene Ontology Analysis,GO)、京都基因与基因组百科全书通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行生物信息学分析,筛选DNA甲基化水平显著变化的基因CpG位点,并对目的区域进行焦磷酸测序验证,以期筛选出颈动脉内中膜增厚相关的DNA甲基化分子标志物。结果通过芯片数据筛选及GO/KEGG pathway功能富集分析,差异甲基化位点共19073个,具有甲基化差异的基因共311个(|Δβ|> 0.2,P<0.05),涉及生物过程的674个功能条目,分子功能的111个功能条目,细胞组分的131个功能条目。经焦磷酸测序验证,与颈动脉内中膜相关的候选基因溶酶体氨基酸载体蛋白(human member 9 of the solute carrier family,SLC38A9)、前蛋白转化酶枯草溶菌素2 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 2,PCSK2)启动子区的CpG岛在颈动脉内中膜增厚患者较健康对照组甲基化程度显著降低(P<0.05)。结论上海农村地区颈动脉内中膜增厚人群与健康人群相比外周血全基因组呈现显著低甲基化,SLC38A9启动子区的cg00279662以及PCSK2启动子区的cg1 1048863可能是影响颈动脉内中膜厚度的DNA甲基化分子标志物。

摘要： 目的:探讨SPAG6在鼻咽癌(NPC)中的表达及其对NPC细胞增殖的影响。方法:使用GEO数据库比较SPAG6在NPC和正常鼻咽上皮组织(NNE)中的转录表达水平,分别采用RT-qPCR法和免疫组织化学染色法检测SPAG6 mRNA及蛋白表达水平。利用甲基转移酶抑制剂5-aza-dC处理NPC细胞后检测SPAG6 mRNA相对表达量。CCK-8法检测SPAG6对NPC细胞增殖的影响。结果:SPAG6 mRNA表达在NPC中明显下调(P<0.05)。NPC组织中SPAG6启动子区甲基化程度高于正常鼻咽组织(P<0.05),5-aza-dC可明显恢复SPAG6在NPC细胞中的转录表达水平(P<0.05)。过表达SPAG6明显抑制NPC细胞增殖能力(P<0.05)。结论:SPAG6在NPC中因DNA高甲基化而转录失活并促进NPC细胞增殖。

摘要： 作为一种新疗法,免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitor,ICI)为肿瘤的治疗带来了巨大革新。在消化道肿瘤中,少部分患者对ICI有显著的临床获益,但大部分患者仍无法获益。如何找到预测疗效的分子标志物,精准定位治疗敏感人群是消化道肿瘤免疫治疗的研究热点。本综述全面汇总了消化道肿瘤ICI治疗的相关研究,从基因组学、蛋白组学与转录组学、表观遗传组学等不同层面阐述对疗效产生显著影响的分子标志物。

摘要： 目的探讨exosomal microRNA在儿童Wilms瘤(WT)诊断中的作用。方法选取30例儿童WT患儿为观察组,以30例同期健康体检儿童为对照组。采用差速离心法提取2组患儿尿液中外泌体(exosome);采用荧光定量PCR检测exosome中特异性表达的microRNA;以miRNA-21相对表达量绘制ROC曲线。结果观察组miRNA-21相对表达量为2.92高于对照组的0.65,差异有统计学意义(P<0.001)。观察组miRNA-21在儿童WT诊断效能中曲线下面积AUC值为0.95(95%CI=0.903~0.996);当miRNA-21相对表达量的截断值为0.75时,诊断灵敏度为82.1%,特异度为94.1%。结论exosomal microRNA作为分子标志物在儿童WT中表达异常,可获得较高的诊断灵敏度及特异度,以辅助临床诊断。

摘要： 文中对肿瘤细胞外囊泡分子标志物筛查策略进行介绍，并指出EVs在临床诊断应用中的问题：缺乏快速、简便适用于临床诊断的EVs纯化方法；缺乏器官或疾病特异性的EVs表面标志；无法区分不同功能的EVs亚群；无法对EVs检测的方法进行标准化。

摘要： microRNA是一类长约22nt的单链小RNA,由细胞内源产生的发卡(hairpin)结构转录本加工而来，包括pri-miRNA、pre-miRNA、miRNA。

摘要： 目的：通过Western Blot技术对显著性差异蛋白进行进一步的临床验证,为艾滋病无症状期中医热毒蕴结证具有诊断意义的蛋白分子标志物研究提供实验依据. 方法：本研究基于前期使用iTRAQ技术研究基础上,采用蛋白质印记法(Western Blot)技术分别对采集的AIDS无症状期中医热毒蕴结证患者和健康对照组血清标本进行差异蛋白检测,运用image J软件分析灰度值,然后将每种抗体中的正常组的相对灰度值和病人组的相对灰度值导入GraphPad Prism5软件中,得出mean+/-SD的图表. 结果：C5蛋白在艾滋病无症状期中医热毒蕴结证用药前表达下调,差异有统计学意义(P＜0.05);同前期使用iTRAQ技术筛选出的蛋白质的结果一致. 结论：获得的无症状期中医热毒蕴结证特征性表达蛋白C5,为建立艾滋病中医证候诊断模式、艾滋病辩证规范与辩证方法奠定基础.

摘要： Cochlin蛋白是基因Coch的表达产物,前期研究发现Coch基因在肝细胞肝癌组织中表达升高.本实验通过ELISA法分析肝细胞肝癌患者血清中Cochlin表达情况,通过研究150例肝细胞肝癌与40例健康人血清发现,肝细胞肝癌患者血清中Cochlin平均浓度7ng/μl,健康人血清中Cochlin浓度4ng/μl,p<0.05.通过相关性分析发现，肝细胞肝癌患者血清中Cochlin浓度与CA-199浓度相关，（偏相关，control：肿瘤大小，相关系数0.49，p<0.01）。通过logestic回归分析发现Cochlin浓度升高是肝功能Child分级增加的危险因素。血清中Cochlin蛋白有望成为肝细胞肝癌早期诊断的分子标志物。

摘要： 目的：探究黏附斑激酶在子宫内膜异位症(内异症)细胞分子的表达及其意义.rn 方法：利用免疫组化Elivision检测正常子宫内膜和内异症患者异位子宫内膜及在位子宫内膜中黏附斑激酶的表达情况.rn 结果：(1)FAK的表达率在在位子宫内膜中为73.33％、在异位子宫内膜中为93.33％、在正常子宫内膜中为35.00％,异位子宫内膜与正常子宫内膜的FAK阳性表达相比,差异有统计学意义(P＜0.01);异位子宫内膜与在位子宫内膜的FAK阳性表达相比,差异有统计学意义(P＜0.05);在位子宫内膜与正常子宫内膜的FAK阳性表达相比,差异有统计学意义(P＜0.05).(2)FAK表达水平与内异症临床分期有关,差异有统计学意义(P＜0.05).rn 结论：FAK在内异症患者异位子宫内膜及在位子宫内膜组织中高表达,且与临床分期有关,提示FAK可能成为内异症潜在的分子标志物或治疗靶点.

摘要： 原发性肝癌放疗疗效差异与肿瘤的放疗抗拒密切相关,目前研究认为多种基因及分子通路参与调控原发性肝癌对放疗的抗拒,对原发性肝癌放疗抗拒分子标志物的研究可预测放疗敏感性,对放疗抗拒的逆转研究有重要意义.

摘要： 原发性支气管肺癌(以下简称肺癌)是全球常见的恶性肿瘤之一.据GLOBOCAN2012显示,全球肺癌新发病例为182万,占全部恶性肿瘤的12.9％;肺癌死亡病例为159万,占全部恶性肿瘤的19.4％[1].在中国,肺癌的发病率和死亡率居恶性肿瘤之首,2015年肺癌的发病例数达73万,死亡例数达61万[2].吸烟、大气污染、石棉、饮食、烹饪油烟、空气污染等多种因素与肺癌的发病有关.吸烟可以使肺癌的发生风险增加3倍以上,是肺癌的重要危险因素之一.本文将对吸烟与肺癌的研究进展进行综述.

摘要： 原发性支气管肺癌(以下简称肺癌)是全球常见的恶性肿瘤之一.据GLOBOCAN2012显示,全球肺癌新发病例为182万,占全部恶性肿瘤的12.9％;肺癌死亡病例为159万,占全部恶性肿瘤的19.4％[1].在中国,肺癌的发病率和死亡率居恶性肿瘤之首,2015年肺癌的发病例数达73万,死亡例数达61万[2].吸烟、大气污染、石棉、饮食、烹饪油烟、空气污染等多种因素与肺癌的发病有关.吸烟可以使肺癌的发生风险增加3倍以上,是肺癌的重要危险因素之一.本文将对吸烟与肺癌的研究进展进行综述.

摘要： 原发性支气管肺癌(以下简称肺癌)是全球常见的恶性肿瘤之一.据GLOBOCAN2012显示,全球肺癌新发病例为182万,占全部恶性肿瘤的12.9％;肺癌死亡病例为159万,占全部恶性肿瘤的19.4％[1].在中国,肺癌的发病率和死亡率居恶性肿瘤之首,2015年肺癌的发病例数达73万,死亡例数达61万[2].吸烟、大气污染、石棉、饮食、烹饪油烟、空气污染等多种因素与肺癌的发病有关.吸烟可以使肺癌的发生风险增加3倍以上,是肺癌的重要危险因素之一.本文将对吸烟与肺癌的研究进展进行综述.

摘要： 原发性支气管肺癌(以下简称肺癌)是全球常见的恶性肿瘤之一.据GLOBOCAN2012显示,全球肺癌新发病例为182万,占全部恶性肿瘤的12.9％;肺癌死亡病例为159万,占全部恶性肿瘤的19.4％[1].在中国,肺癌的发病率和死亡率居恶性肿瘤之首,2015年肺癌的发病例数达73万,死亡例数达61万[2].吸烟、大气污染、石棉、饮食、烹饪油烟、空气污染等多种因素与肺癌的发病有关.吸烟可以使肺癌的发生风险增加3倍以上,是肺癌的重要危险因素之一.本文将对吸烟与肺癌的研究进展进行综述.

摘要： 本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。

摘要： 使用非线性函数计算炎症标志物，所述非线性函数包括与红细胞聚集相关的参数和另一个与红细胞密度相关的参数作为变量。基于从血液样本测量的透射光强度‑时间曲线计算与红细胞聚集相关的参数。从血液样本测量与红细胞密度相关的参数。

摘要： 生物标志物检测方法包括以下步骤：基于从多个参考活体的每一个获得的参考活体数据中的多个因子项目数据来准备参考数据集(ST1)；将从目标活体获得的目标活体数据中的多个因子项目数据添加到参考数据集以生成目标数据集(ST2)；在参考数据集中的多个因子项目之间求出第一相关系数(ST3)；在目标数据集中的多个因子项目之间求出第二相关系数(ST4)；求出作为第一相关系数和第二相关系数的差分的差分相关系数(ST5)；对于多个因子项目中的每一个基于差分相关系数求出指标(ST6)；基于指标选择生物标志物(ST7)。

摘要： 本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。

摘要： 本发明公开一种从蜂花粉提取物中筛选出特征标志物的方法及特征标志物在鉴定蜂花粉中的应用，属于蜂花粉技术领域。该从蜂花粉提取物中筛选出特征标志物的方法，包括：S1、采用高效液相色谱串联高分辨质谱技术对蜂花粉提取物进行分析得到相关图谱数据；S2、将图谱数据进行处理获得峰对应的数据；S3、筛选峰对应的数据去除p＞0.05以及无二维质谱的数据得到数据集；S4、将数据集进行多元统计分析获得差异化合物；S5、分析差异化合物与抑制酪氨酸酶活性的相关性，筛选出特征标志物。本发明还包括特征标志物在鉴定蜂花粉中的应用。本发明筛选出的特征标志物可准确快速地判断待测蜂花粉是否具有优异的美白功效。

摘要： 本发明提供一种IgAN肠道菌群标志物、IgAN代谢物标志物及其应用。该gAN肠道菌群标志物，包括链球菌属(Streptococcus)、肠球菌属(Enterococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)中的至少一种。发明人通过收集IgAN患者与正常人群的粪便样本，由粪便样本中的微生物出发，筛选出其中与IgAN相关性较高的肠道微生物，利用这一类或几类肠道微生物作为生物标志物，可以有效确定受试者是否有IgAN的患病风险，或对IgAN患者的治疗方案的效果做出一定的判断。

摘要： 本发明公开了血清分子标志物组合作为肺癌诊断和疗效监测标志物的应用，属于免疫检测领域，通过Luminex蛋白芯片诊断技术对十一种血清中蛋白（OPN,SAA,CRP,CEA,CYFRA21.1,MIF,AGP,HGF,E‑selectin,GRO和NSE）进行含量的测定。八种血清蛋白分子标志物为OPN，SAA，CRP，CYFRA21.1，CEA，NSE，AGP和HGF。这八种血清蛋白分子标志物对非小细胞肺癌（NSCLC）和小细胞肺癌（SCLC）的发生有显著的促进作用；由OPN、CEA和另一蛋白（CRP，SAA，CYFAR21.1或NSE）组成的三蛋白检测组合对NSCLC有极好的诊断潜力；相对于现有技术，本发明的有益效果为：检测肺癌患者血清的多种蛋白分子标志物的含量，通过多种蛋白分子标志物的配合比较分析，可用于肺癌诊断和疗效监测。

摘要： 本发明涉及一种神经管畸形产前无创诊断分子标志物，包括6个miRNA（miR‑144、miR‑142‑3p、miR‑720、miR‑1275、miR‑575和miR‑765）和12个蛋白质（前蛋白转化酶枯草溶菌素9、铜蓝蛋白、白血病抑制因子、14‑3‑3、对氧磷酶、血浆a‑球蛋白抑制因子H4、血清S蛋白、糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D1、胎球蛋白A、淀粉样蛋白P、血浆a‑球蛋白抑制因子H2和血小板因子4）。还包括该分子标志物的应用。

摘要： 本发明公开了血清分子标志物组合作为肺癌诊断和疗效监测标志物的应用，属于免疫检测领域，通过Luminex蛋白芯片诊断技术对十一种血清中蛋白（OPN,SAA,CRP,CEA,CYFRA21.1,MIF,AGP,HGF,E‑selectin,GRO和NSE）进行含量的测定。八种血清蛋白分子标志物为OPN，SAA，CRP，CYFRA21.1，CEA，NSE，AGP和HGF。这八种血清蛋白分子标志物对非小细胞肺癌（NSCLC）和小细胞肺癌（SCLC）的发生有显著的促进作用；由OPN、CEA和另一蛋白（CRP，SAA，CYFAR21.1或NSE）组成的三蛋白检测组合对NSCLC有极好的诊断潜力；相对于现有技术，本发明的有益效果为：检测肺癌患者血清的多种蛋白分子标志物的含量，通过多种蛋白分子标志物的配合比较分析，可用于肺癌诊断和疗效监测。

摘要： 本发明涉及一种神经管畸形产前无创诊断分子标志物，包括6个miRNA（miR-144、miR-142-3p、miR-720、miR-1275、miR-575和miR-765）和12个蛋白质（前蛋白转化酶枯草溶菌素9、铜蓝蛋白、白血病抑制因子、14-3-3、对氧磷酶、血浆a-球蛋白抑制因子H4、血清S 蛋白、糖基化磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D1、胎球蛋白A、淀粉样蛋白P、血浆a-球蛋白抑制因子H2和血小板因子4）。还包括该分子标志物的应用。