FISH

摘要： 中间偃麦草是小麦遗传改良的有用资源,育成了大量的小麦-中间偃麦草附加系、代换系及部分双二倍体.中4是小麦-中间偃麦草部分双二倍体,很方便与普通小麦杂交并被广泛用于小麦的遗传改良.014-459是中4与普通小麦杂交后代,具有一些特殊特性,材料014-459与一些普通小麦杂交,无论正反交,其F1表现为不育,而与另一些普通小麦的杂交F1表现为可育,此外,材料014-459粗蛋白和湿面筋含量很高.基于014-459的这些特性,猜测其可能具有中间偃麦草染色体片段,为此对014-459进行了细胞学鉴定.FISH和GISH以及PLUG标记分析用来分析材料014-459的染色体组成情况.连续的FISH和GISH试验证实小麦-中间偃麦草部分双二部体中4与小麦杂交后代品系014-459的1对小麦2A染色体被来自中间偃麦草的1对St染色体代换,PLUG标记分析证实这1对St染色体属于第6同源群,可能来自中间偃麦草的St染色体被代换进小麦中造成了材料014-459的一些特性.对品系014-459的分子细胞遗传学鉴定对促进中间偃麦草6St染色体在小麦中利用及小麦品质改良有积极作用.

摘要： We aimed to characterize NDM-5-producing Enterobacteriaceae from aquatic products in Guangzhou,China.A total of 196 intestinal samples of grass carp collected in 2019 were screened for carbapenemase genes.Characterization of bla_(NDM-5) positive isolates and plasmids was determined by antimicrobial susceptibility testing,conjugation experiments,Illumina HiSeq,and Nanopore sequencing.One Citrobacter freundii and six Escherichia coli strains recovered from seven intestinal samples were verified as bla_(NDM-5) carriers(3.57%,7/196).The bla_(NDM-5) genes were located on the lncX3(n=5),lncHI2(n=1),or lncHI2-lncF(n=1)plasmids.All bla_(NDM-5)-bearing plasmids were transferred by conjugation at frequencies of~10^(-4)-10^(-6).Based on sequence analysis,the lncHI2 plasmid pHNBYF33-1 was similar to other bla_(NDM-5)-carrying lncHI2 plasmids deposited in GenBank from Guangdong ducks.In all lncHI2 plasmids,bla_(NDM-5)was embedded in a novel transposon,Tn7057(IS3000-△ISAba125-IS5-△ISAba125-bla_(NDM-5)-bleMBL-trpF-tat-△dct-IS26-△umuD-△ISKox3-IS3000),which was identical to the genetic structure surrounding bla_(NDM-5)found in some IncX3 plasmids.The lncHI2-lncF hybrid plasmid pHNTH9F11-1 was formed by homologous recombination of the bla_(NDM-5)-carrying lncHI2 plasmid and a heavy-metal-resistant IncF plasmid through△Tn1721 To the best of our knowledge,this is the first report on the characterization of bla_(NDM-5)-bearing plasmids in fish in China.The lncHI2 plasmid pHNBYF33-1 may be transmitted from ducks,considering the common duck-fish freshwater aquaculture system in Guangdong.Tn7051 is likely responsible for the transfer of bla_(NDM-5) from lncX3 to lncHI2 plasmids in Enterobacteriaceae,resulting in the expansion of transmission vectors of bla_(NDM-5).

摘要： Hydrostatic pressure is one of the main factors limiting the vertical range of marine organisms.However,little is known about the level of hydrostatic pressure that shallow-water fish can tolerate or how they respond to this potential stress.Here,we applied high-hydrostatic pressure treatment to wild-type AB line zebrafish(Danio rerio)and analyzed transcriptome data following treatment.

摘要： Since the early 2000s, the popularity of zebrafish in in vivo drug screening has shown a substantial increase.The zebrafish has become an important screening tool covering a wide range of tissue-specific pathologies and diseases/disorders.Nowadays phenotype-based screening is favoured over target-based screening approaches。

摘要： 目的观察将荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)用于慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)诊断的效果及其与预后指标的关系。方法回顾性收集32例CLL患者的临床资料,分析FISH与常规染色体显带技术(CC)检出细胞遗传学异常、预后指标的关系。结果ISH阳性检出率明显高于CC,差异存在统计学意义(P<0.05)。研究结果证实,CD_(38)及可变重链免疫球蛋白(IgVH)在不同预后患者的染色体中存在明显的差异,CD_(3h)在高危组分布相对较多,而低危组中IgVH具有较高的分布。结论FISH技术对CLL染色体异常检出率较高,且与IgVH及CD_(38)分布存在一致性。

摘要： 目的:探讨β-TubulinⅢ、MGMT在女性乳腺浸润性导管癌组织中的表达及临床意义。方法:收集我院女性乳腺浸润性导管癌组织标本191例,采用免疫组织化学法检测β-TubulinⅢ、MGMT在乳腺癌组织中的表达情况。乳腺癌分子分型采用免疫组化及FISH检测确定。结果:女性乳腺浸润性导管癌组织中β-TubulinⅢ的阳性表达率为72.3%(138/191),与乳腺癌组织学分级、脉管侵犯及分子分型相关,其差异具有统计学意义(P<0.05)。MGMT的阳性表达率为74.3%(142/191),与乳腺癌组织学分级和分子分型相关,其差异具有统计学意义(P<0.05)。β-TubulinⅢ、MGMT共同阳性表达与乳腺癌组织学分级及分子分型具有相关性(P<0.05)。Spearman相关分析显示β-TubulinⅢ和MGMT两者在女性乳腺浸润性导管癌组织中表达呈正相关(r=0.252)。结论:β-TubulinⅢ和MGMT与乳腺癌的发生具有一定的相关性。

摘要： 目的探讨唾液腺Warthin瘤样黏液表皮样癌(Warthin-like mucoepidermoid carcinoma,WT-MEC)的临床病理特点、诊断与鉴别诊断。方法收集3例WT-MEC的临床资料,行HE、免疫组化、PAS/D-PAS染色,应用FISH断裂探针检测MAML2(11q21)基因重排,并复习相关文献。结果镜检:肿瘤细胞呈囊状、乳头状或实性结节分布,周围淋巴细胞浸润,局部伴淋巴滤泡结构形成,间质可见嗜酸性粒细胞;部分囊腔衬覆双层扁平上皮,部分区域上皮增生为多层或实性结节;瘤细胞由中间细胞、黏液细胞和表皮样细胞组成,呈圆形或椭圆形,泡状核,核分裂象不易见,无坏死。免疫表型:肿瘤细胞EMA、p63、CK5/6及CAM5.2均呈阳性;特殊染色:PAS/D-PAS染色呈阳性。FISH检测:3例肿瘤均检出MAML2基因易位。结论WT-MEC的组织学形态易与Warthin瘤发生的鳞状上皮化生和(或)黏液腺化生等病变混淆,细致的形态学观察和MAML2基因易位检测有助于作出正确诊断。

摘要： Chedrinae fish,which belong to Danionidae,have important ornamental,economic,and scientific value.At present,however,their mitogenomic features are unclear and their phylogenetic relationships remain controversial.In this study,we presented five new Chedrinae mitochondrial genomes(mitogenomes)and analyzed the conserved and variable mitogenomic characteristics of 17 Chedrinae fish.The gene composition and arrangement and secondary structure of transfer RNAs(tRNAs)were highly conserved among the Chedrinae mitogenomes.However,the length of the control region and base composition were variable.Interestingly,the mitogenome of Barilius barila was unusual,with lower A+T content in the first codon of protein-coding genes(PCGs)(47.32%versus average of 54.47%)and distinct pattern of codons per thousand codons(CDspT).Three Chedrinae fish had a long tandem repeat(>291 bp)in the 5'-end of the control region,which may increase their adaptability.In addition,tRNALys had notably larger DHU and TΨC loops than other tRNAs.The phylogenetic trees of the Chedrinae fish suggested that the Barilius genus was not a monophyletic group but could be divided into two main groups based on significant differences in A+T content.This study provides insights into the mitogenomic features and phylogenetic implications of Chedrinae fish,which should benefit their systematics and conservation.

摘要： Fish is rich in essential nutrients but can remain a potential source of food poisoning. A study was, therefore, carried out with the general objective of highlighting the probable biological and chemical dangers associated with the consumption of fish and freshwater fruits from the Guéssabo river. The present study was conducted on 50 carp fish, 50 mackerel fish, 50 frogs and 50 mollusks caught in the Guéssabo River. Microorganisms were enumerated by conventional tests and heavy metals were investigated by Inductively Coupled Plasma Optical Emission Spectrometry. The enumeration showed high levels of thermotolerant Coliforms (2.5 × 104), Enterobacteriaceae (3.4 × 104), S. aureus (2.3 × 103) and Yeast/Molds (2.1 × 104), in all samples the standards were not in conformity with the required standards. High levels of Al (7230 μg/kg) and Cd (21.57 μg/kg) were observed in carp fish and these values are above the standard. In conclusion, the fish caught in the Guéssabo River could be a health risk factor for the consumer.

摘要： Throughout history,cavefish have been of passionate interest to many people.Today,scientists have found cavefish useful and fascinating subjects for scientific study.Cavefish are an emerging model system for solving many different biological topics and for human disease research.

摘要： 诊断微生物学的最终目的是迅速,灵敏鉴定自然界的细菌.基于培养的方法耗时,而且经常会遇到不能培养的细菌.近些年,分子技术,如PCR产物杂交或测序已用于微生物的所有领域进行灵敏检测,细菌的鉴定也成为可能.但是,这些方法不能提供微生物的形态学,数量,空间分布或细胞环境.相比之下,FISH与分子遗传学结合,进行微观信息的显示.可进行自然界微小环境个体微生物细胞的显色和鉴定.1989年,Delong第一次用荧光标记的寡核苷酸检测一个微生物细胞.与放射性探针相比,荧光染色更为安全,结果更好,不需增加步骤.而且,荧光探针发射不同波长, 这样一个杂交步骤可检测到几个目的序列.过去十年,FISH以敏感,迅速,作为一个强有力的工具用于微生物学系统发育学、形态学、诊断和环境研究.本文对fish直接检测环境微生物技术进行了探讨.

摘要： 本研究目的为建立FISH(fluorescence in situ hybridization)之采样及杂交流程,以利探讨连续批分式生物膜接触滤材程序(sequencing batch biofilm reactor,SBBR)中之微生物量变化情形.探讨杂交流程时,于杂交缓冲液中添加20℅或30℅formamide,可使本研究所使用之Alc、Cory、Aci及Eub338等四支寡核酸探针之杂交时间缩短至3小时.在此条件下,杂交温度为45°C时,可得明显萤光信号.同时,纯菌菌抹片制作时先以PBS(1X)清洗3次再进行固定,可减少杂交背景,使杂交结果更为清晰.而利用直接将采样玻片插入SBBR系统滤材中采集之生物膜玻片,以Eub338探针在上述条件下进行杂交,亦呈现明显之放光反应,显示此插入式采集生物膜样品方法可行.

摘要： 本研究目的为建立FISH(fluorescence in situ hybridization)之采样及杂交流程,以利探讨连续批分式生物膜接触滤材程序(sequencing batch biofilm reactor,SBBR)中之微生物量变化情形.探讨杂交流程时,于杂交缓冲液中添加20℅或30℅formamide,可使本研究所使用之Alc、Cory、Aci及Eub338等四支寡核酸探针之杂交时间缩短至3小时.在此条件下,杂交温度为45°C时,可得明显萤光信号.同时,纯菌菌抹片制作时先以PBS(1X)清洗3次再进行固定,可减少杂交背景,使杂交结果更为清晰.而利用直接将采样玻片插入SBBR系统滤材中采集之生物膜玻片,以Eub338探针在上述条件下进行杂交,亦呈现明显之放光反应,显示此插入式采集生物膜样品方法可行.

摘要： 本研究目的为建立FISH(fluorescence in situ hybridization)之采样及杂交流程,以利探讨连续批分式生物膜接触滤材程序(sequencing batch biofilm reactor,SBBR)中之微生物量变化情形.探讨杂交流程时,于杂交缓冲液中添加20℅或30℅formamide,可使本研究所使用之Alc、Cory、Aci及Eub338等四支寡核酸探针之杂交时间缩短至3小时.在此条件下,杂交温度为45°C时,可得明显萤光信号.同时,纯菌菌抹片制作时先以PBS(1X)清洗3次再进行固定,可减少杂交背景,使杂交结果更为清晰.而利用直接将采样玻片插入SBBR系统滤材中采集之生物膜玻片,以Eub338探针在上述条件下进行杂交,亦呈现明显之放光反应,显示此插入式采集生物膜样品方法可行.

摘要： 本研究目的为建立FISH(fluorescence in situ hybridization)之采样及杂交流程,以利探讨连续批分式生物膜接触滤材程序(sequencing batch biofilm reactor,SBBR)中之微生物量变化情形.探讨杂交流程时,于杂交缓冲液中添加20℅或30℅formamide,可使本研究所使用之Alc、Cory、Aci及Eub338等四支寡核酸探针之杂交时间缩短至3小时.在此条件下,杂交温度为45°C时,可得明显萤光信号.同时,纯菌菌抹片制作时先以PBS(1X)清洗3次再进行固定,可减少杂交背景,使杂交结果更为清晰.而利用直接将采样玻片插入SBBR系统滤材中采集之生物膜玻片,以Eub338探针在上述条件下进行杂交,亦呈现明显之放光反应,显示此插入式采集生物膜样品方法可行.

摘要： 本研究目的为建立FISH(fluorescence in situ hybridization)之采样及杂交流程,以利探讨连续批分式生物膜接触滤材程序(sequencing batch biofilm reactor,SBBR)中之微生物量变化情形.探讨杂交流程时,于杂交缓冲液中添加20℅或30℅formamide,可使本研究所使用之Alc、Cory、Aci及Eub338等四支寡核酸探针之杂交时间缩短至3小时.在此条件下,杂交温度为45°C时,可得明显萤光信号.同时,纯菌菌抹片制作时先以PBS(1X)清洗3次再进行固定,可减少杂交背景,使杂交结果更为清晰.而利用直接将采样玻片插入SBBR系统滤材中采集之生物膜玻片,以Eub338探针在上述条件下进行杂交,亦呈现明显之放光反应,显示此插入式采集生物膜样品方法可行.

摘要： 本发明涉及一种反义RNA ch‑MYC‑AS1FISH检测试剂盒的制备及其应用，属于分子生物学领域。引物组由序列为SEQ ID NO.1‑20所示的20条引物组，反义RNA ch‑MYC‑AS1的FISH检测试剂盒，包括FISH探针、杂交液和染色液；FISH探针序列如SEQ ID NO.1‑20示；共定位分析实验显示ch‑MYC‑AS1与HuR蛋白在细胞核中存在共定位现象。本研究发明不仅提供了ch‑MYC‑AS1 FISH检测手段，也为ch‑MYC‑AS1作用机制研究提供了方法基础。

摘要： 本发明涉及一种主动脉夹层FISH检测用探针及试剂盒，包括用于检测has‑miR‑4769‑3P、has‑miR‑636、has‑miR‑142‑3p、has‑miR‑425‑3p和has‑miR‑191‑3p的FISH荧光探针，其核苷酸序列依次如SEQ ID No.1‑5所示。本发明的试剂盒可用于大动脉夹层分子诊断、辅助大动脉夹层病因学诊断、区分夹层和非夹层组织用于手术和病理判断病变范围。

摘要： 本发明提供了一种三基因联合检测的FISH探针组合及其应用，所述三基因联合检测的FISH探针组合同时检测MYC基因、BCL‑2基因和BCL‑6基因的易位情况，其中，检测MYC基因的探针、检测BCL‑2基因的探针和检测BCL‑6基因的探针的荧光素标记方式均不同，所述荧光素标记方式包括使用红色荧光素标记、使用绿色荧光素标记或同时使用红色荧光素和绿色荧光素标记中的任意一种。本发明通过对探针的标记方式进行改进，实现了在单个样本上对三组探针同时进行判读，操作更加简单，提升了检测的效率及通量；准确性、灵敏性及特异性均良好，且降低了检测成本，具有实际应用的价值。

摘要： 本发明公开了一种快速检测RET基因重排探针、FISH试剂盒以及方法。本发明所获得的快速检测RET基因重排探针，包括dcas9蛋白和sgRNA，dcas9蛋白由绿色或者红色荧光染料标记，sgRNA分为第一组sgRNA和第二组sgRNA，第一组sgRNA包括21条sgRNA，第一组sgRNA在RET基因上的靶向位点序列如序列表SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.21所示，第二组sgRNA包括21条sgRNA，第二组sgRNA在RET基因上的靶向位点序列如序列表SEQ ID NO.22‑SEQ ID NO.42所示。本发明提供的快速检测RET基因重排FISH试剂盒采用dCas9介导的FISH技术利用CRISPR系统进行DNA快速杂交，具有检测时间短（约1小时），准确性高，特异性好、假阳性低、操作条件温和（室温和37°C，可更好地维持细胞形态和DNA结构）、操作简便灵活、成本低等优点。

摘要： 本发明公开了一种快速检测ROS1基因重排探针、FISH试剂盒以及方法。本发明所获得的快速检测ROS1基因重排探针，包括dcas9蛋白和sgRNA，dcas9蛋白由绿色或者红色荧光染料标记，sgRNA分为第一组sgRNA和第二组sgRNA，第一组sgRNA包括17条sgRNA，第一组sgRNA在ROS1基因上的靶向位点序列如序列表SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.17所示，第二组sgRNA包括17条sgRNA，第二组sgRNA在ROS1基因上的靶向位点序列如序列表SEQ ID NO.18‑SEQ ID NO.34所示。本发明提供的快速检测ROS1基因重排FISH试剂盒采用dCas9介导的FISH技术利用CRISPR系统进行DNA快速杂交，具有检测时间短（约1小时），准确性高，特异性好、假阳性低、操作条件温和（室温和37°C，可更好地维持细胞形态和DNA结构）、操作简便灵活、成本低等优点。

摘要： 本发明公开了一种基于FISH杂交的野牡丹属植物染色体制片方法，涉及细胞遗传学技术领域，所述染色体制片方法具体包括以下步骤：(1)取样；(2)固定；(3)低渗；(4)酶解；(5)制片。采用本发明染色体制片方法获得的野牡丹属植物染色体制片，具有分裂相多，细胞壁解离彻底，染色体分散较好，背景干净、清晰的优点，方便进行野牡丹属植物染色体的核型分析研究及后续野牡丹属植物的FISH杂交研究，为野牡丹属植物种质资源开发利用与细胞学和分子细胞学研究奠定基础，且本发明中的固定液不仅可将有丝分裂的细胞停留在早中期，而且无需进行预处理，减少预处理液对细胞的毒害作用，将预处理和固定结合在一起，有效提高制片效率。

摘要： 本发明涉及医药生物技术领域，尤其涉及肿瘤细胞PD‑L1PD‑L2免疫荧光+FISH检测试剂盒，包括Buffer‑Ⅰ、Buffer‑Ⅱ、Buffer‑Ⅲ、封闭液、PD‑1/PD‑L1抗体、CD45抗体、二抗、抗体稀释液、DAPI、阳性对照片、10×CF2固定液、探针、甲酰胺工作液、20×SSC以及BSA溶液，其使用方法包括以下步骤：S1、血液及其他体液的取样：对于血液取样而言，采用EDTA、枸橼酸钠、草酸钾/氟化钠、肝素、ACD抗凝的5mL真空采血管，采血完毕后立即颠倒混匀8次；对于其他体液而言，将临床抽取的胸腹水、脑脊液、灌洗液即注入含有抗凝剂的瓶内并摇匀，且体液体积＞10ml。本发明取材方便，有助于对体液中循环肿瘤细胞进行表型分析，可有效反应PD‑L1的表达、转移表达、检测。

摘要： 本发明公开了一种FISH前处理设备液路系统，其包括试剂选择模块、进排液模块及废液收集模块，所述试剂选择模块、进排液模块及废液收集模块通过管路顺次连接；所述试剂选择模块，包含有至少一个试剂供应单元，每一个所述试剂供应单元包含一个试剂容器和一个试剂阀；所述进排液模块，包含有至少一个反应单元；所述废液收集模块，包含有至少一个废液桶。本发明的FISH前处理设备液路系统，能在同一时间将不同的试剂注入或排出反应槽,达到提高液路系统运行效率提高液路可靠性的目的，避免了因人员操作水平不一、缺少标准化操作、实验随机性较大的弊端，进而减少了实验差异，使检测操作符合可追溯的GLP实验要求。

摘要： 本发明公开了一种π‑FISH+核酸探针组、原位杂交方法及其应用，所述π‑FISH+核酸探针组包括一级π型靶标探针、二级探针、三级探针、四级π型探针和信号探针。本发明设计的π‑FISH+核酸探针组克服了传统荧光原位杂交信号放大能力低、背景噪音大、只能检测长核酸序列等缺点，具有信号放大能力强、特异性高、效率高、背景噪音低等优点；本发明可以检测大于16个碱基的DNA或RNA核酸分子，可实现对长、短核酸序列定性、定量和定位的检测；另外，本发明设计的π‑FISH+核酸探针组可以精准地检测前列腺癌抗雄激素治疗耐药标志物雄激素受体剪接变体7(ARV7)，指导患者临床治疗，具有巨大的临床应用潜力。

摘要： 本发明涉及一种华山新麦草染色体特异ND‑FISH探针及其应用、试剂盒，属于分子遗传学技术领域。本发明的华山新麦草染色体特异ND‑FISH探针，核苷酸序列为5’‑CAATGGGCCTCTACTATAGGGTGTTAGGCTCACACTAGAGAA‑3’，5’端标记有荧光基团。本发明的华山新麦草染色体特异ND‑FISH探针通过非变性荧光原位杂交可以在四个小时内高效区分小麦与华山新麦草染色体，能极大提高小麦‑华山新麦草衍生后代的筛选效率，降低实验成本，为利用近缘种华山新麦草改良小麦育种，拓宽小麦遗传多样性奠定基础。