代谢途径

摘要： 为获得更丰富的烟嘧磺隆降解菌资源,以合肥某烟嘧磺隆生产厂活性污泥为研究对象,从中分离并筛选得到一株能以葡萄糖为唯一碳源、烟嘧磺隆为唯一氮源生长的菌株,根据其表型特征、16S rRNA序列相似性、DNA-DNA杂交值(DDH)和平均核苷酸一致性(ANI)的分析结果,将其鉴定为Chryseobacterium lacus LAM-M5。该菌株可在7 d内将初始浓度为50 mg/L的烟嘧磺隆降解92.39%。利用液相色谱-质谱联用(LC-MS)对菌株LAM-M5与烟嘧磺隆混合培养后的代谢产物进行检测与鉴定,共有5种主要物质被检测到,根据烟嘧磺隆的化学结构式和中间代谢产物特征,初步推测出菌株Chryseobacterium sp.LAM-M5降解烟嘧磺隆的可能降解途径。利用高效液相色谱(HPLC)对接菌后降解体系内代谢产生的酸类物质进行分离与鉴定,结果表明产物主要为L-苹果酸。推测菌株LAM-M5受高浓度烟嘧磺隆胁迫,利用葡萄糖产生L-苹果酸,通过降低环境 pH使烟嘧磺隆发生水解,从而解除其胁迫。通过对菌株全基因组信息进行分析,预测了7种可能与烟嘧磺隆降解相关的基因。结果表明,菌株LAM-M5 具有较强的烟嘧磺隆降解能力,在烟嘧磺隆污染环境的生物修复上具有较好的应用潜力。

摘要： 多环芳烃(PAHs)是一种广泛存在于环境中的持久性有机污染物,具有致癌、致畸、致突变等特性。由于石油工业与含盐环境关系密切,PAHs难以在盐环境中的去除。在高盐/中高盐环境下,普通PAHs降解菌的降解效果较差,而嗜盐菌具有耐盐性的优势,故被认为是去除盐环境中多环芳烃污染的重要微生物。通过在高盐/中高盐环境下对耐盐/嗜盐菌高效降解PAHs的研究,重点对其菌属来源、降解途径及功能基因进行了综述,以期为高盐/中高盐环境下PAHs的降解提供理论和数据支撑。

摘要： 以常规大曲(B)和强化大曲(F)为对象,应用多相检测技术研究其贮存过程中微生物群落和代谢组分的变化。结果表明,贮存过程中2类大曲的糖化力和B曲的发酵力增高,而B曲的酯化力和液化力降低。2类大曲其余的理化性质、挥发性组分含量和微生物群落的α-多样性指数增减交替变化,且F曲的挥发性含量增高,种类增多。B曲和F曲的最适贮存周期分别是60~90和90~120 d。F曲细菌群落的α-多样性指数高于B曲的,真菌的则相反。B曲的优势菌Weissella与Pichia、Rhizomucor负相关,F曲中优势菌Bacillus与多数真菌属正相关。大曲中的挥发性物质与Bacillus、Thermomyces、Thermoascus、Rhizomucor、Saccharopolyspora和Pichia密切相关。Bacillus licheniformis强化增强了碳水化合物代谢能力,从而使四甲基吡嗪和2,3-丁二醇合成含量增高。研究结果为系统科学地判定大曲最佳贮存期奠定了基础。

摘要： 在反刍动物饲粮中添加一定量的单宁可有效抑制瘤胃蛋白降解酶,增加过瘤胃蛋白含量,调节反刍动物氮代谢,同时影响溶纤维丁酸弧菌、栖瘤胃普雷沃氏菌等肠道菌群丰度,提高动物对饲粮碳、氮的利用率,增加经济效益。然而,饲粮中单宁的不同来源及添加剂量对反刍动物氮代谢、溶纤维丁酸弧菌和栖瘤胃普雷沃氏菌的影响不同。因此,本文主要论述了不同种类及来源的单宁对反刍动物瘤胃氮代谢、溶纤维丁酸弧菌和栖瘤胃普雷沃氏菌的影响,以期为单宁在反刍动物生产中提高饲料利用率、减轻养殖对环境造成影响等方面的研究和应用提供理论依据。

摘要： 为明确不同有机物浓度(50~150mg/L)和竹炭同时存在下厌氧氨氧化颗粒污泥系统的脱氮除碳功能菌群结构及代谢途径差异,采用宏基因组测序技术对其微生物分布规律和碳氮代谢基因表达进行了研究.结果表明,当COD浓度为50,150mg/L,添加竹炭显著提升了厌氧氨氧化菌(AnAOB)的相对丰度,Candidatus_Kuenenia的相对丰度分别由2.0%和2.9%增加至1.8%和4.5%.与只添加有机物的对照组相比,添加竹炭的处理组显著改变了微生物群落结构,在炭存在下异化硝酸盐还原为铵(DNRA)细菌丰度下降,反硝化菌属和碳代谢相关菌属丰度增加,说明竹炭的投加有助于维持厌氧氨氧化、反硝化和DNRA3个氮代谢途径群落结构的稳定.微生物共现网络分析表明,不同脱氮菌群的协同作用提高了总氮(TN)的去除率,竹炭可以通过Halomonas的富集提高Candidatus_Brocadia和Candidatus_Jettenia的抗逆性.通过KEGG数据库注释表明,有机物存在条件下竹炭提升了厌氧氨氧化颗粒污泥系统的碳氮代谢效能,尤其促进了糖酵解途径(EMP)与三羧酸循环(TCA cycle)的衔接.

摘要： 耐高温是酵母在工业生产中的重要特性之一。近年来,人们对耐高温酵母的应用研究日益重视并取得较大的进展,但其耐高温分子机制尚未明确。目前的研究结果表明,酵母耐高温机制涉及代谢网络调控、信号转导途径及多基因/蛋白共同作用等方面。本文从代谢途径、基因表达、酶活特性和蛋白质相互作用等4个方面综述当前酵母耐高温分子机制的研究进展,为酵母耐热性能的基因工程定向改造提供理论依据。

摘要： 目的分析脑卒中的代谢组学研究现状。方法收集国内外文献,分析脑卒中(缺血性、出血性)及中药治疗脑卒中后的代谢组学变化。结果与结论代谢组学从糖代谢、氨基酸代谢、脂代谢、叶酸循环代谢等途径研究脑卒中后的代谢变化,发现新的生物标志物和代谢物通路,有助于进一步阐明中医药治疗脑卒中的的作用机制和确切靶点,丰富中医药内涵。目前的研究以缺血性脑卒中为主,出血性脑卒中的相关研究较缺乏;且主要集中于筛选差异性代谢物,未对差异性代谢物的特异性和敏感性进行深入研究。需进一步验证代谢物相关通路,开展中医药防治脑出血相关代谢组学研究。

摘要： 本文针对新疆传统发酵剂开菲尔粒中微生物对多环芳烃类化合物苯并(α)芘的作用机制这一问题,研究50 mg/L苯并(α)芘胁迫作用下,开菲尔粒微生物在发酵乳中代谢产物发生的特征性变化。采用非靶向代谢组学技术,结合主成分分析和偏小二乘判别分析方法,确认了苯乙酸、苯酚、原儿茶酸、邻苯二甲酸二异丙酯、邻苯二甲酸等为中间代谢特征产物,在KEGG数据库共注释到56条代谢途径,其中富集代谢产物较多、显著性高、与氨基酸代谢有关的关键通路有3条,中间代谢物质在脱氢酶、双加氧酶、脱氢异构酶等一系列酶的作用下将苯环裂解,因此推断开菲尔粒中存在微生物菌株可能通过“萘途径”“邻苯二甲酸途径”“苯丙氨酸途径”3条代谢途径对苯并(α)芘进行降解。研究可以为微生物对苯并(α)芘的作用机制提供一定的理论基础,可以为降低苯丙(a)芘对人体的危害提出可能的生物防治策略,为开菲尔发酵乳制品在食品工业中的合理开发应用提供研究依据。

摘要： 目的基于网络药理学探讨畲药小香勾治疗痛风性关节炎的作用机制。方法采用Pubchem数据库检索小香勾活性化合物的三维结构信息,并将结构文件上传至Pharmmapper数据库进行药效团模型靶点预测。通过GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank、PharmGBK数据库将疾病靶点与药效团模型靶点取交集,获得小香勾治疗痛风性关节炎的潜在作用靶点。利用Cytoscape软件及STRING数据库进行“药物-靶点”的可视化网络拓扑分析和PPI网络图谱的绘制,并筛选出药物作用的核心靶点。利用DAVID数据库对潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共得到小香勾6个活性化合物的50个潜在作用靶点。GO功能富集分析共得到181个条目,其中细胞组成20条(11.0%),分子功能43条(23.8%),生物过程118条(65.2%)。KEGG提示小香勾主要通过能量代谢途径、花生四烯酸代谢、亚油酸代谢、蛋白聚糖途径等通路发挥抗炎镇痛的功效,涉及的核心蛋白包括:MAPK1、SRC、MMP9、PTGS2、MAPK14、MMP3、NOS2、ADAM17、PPARG、PLAU。结论初步阐明小香勾可能通过影响代谢途径相关靶点和生物过程发挥治疗痛风性关节炎的作用,为下一步进行科学验证提供了基本方向。

摘要： 黄水芽胞杆菌(Bacillus aquiflavi)3H-10分离自浓香型白酒的黄水,是我国四川省宜宾地区首株酿酒微生物新种菌株,具有较好的产蛋白酶活力且菌种安全性风险较低,在白酒发酵过程中具有潜在应用价值。为了进一步挖掘该菌株的抗逆性潜力,从乙醇、酸、碱、NaCl和温度等方面对菌株开展特性研究,并从基因层面探究其抗逆性潜在机制。结果表明,菌株可在4%乙醇环境生长,对乙醇具有一定耐受性,推测菌株对乙醇的耐受性是其与环境适应性进化的结果。基因分析发现,菌株含有数量较多的热休克蛋白编码基因,使菌株在乙醇胁迫环境中能够产生应激反应,减弱乙醇对细胞的毒害作用;菌株基因组中含有完整的乙醇代谢途径,可将乙醇依次氧化生成乙醛和乙酸,后者进入柠檬酸循环,最终生成二氧化碳和水。因此,丰富的热休克蛋白与完整的乙醇代谢途径是菌株耐受乙醇的主要原因。

摘要： 分析黄色花石斛兰盛开期花瓣中的类胡萝卜素种类和含量,推定石斛属类胡萝卜素合成途径,为探讨黄色花石斛的呈色机理和黄色花育种提供参考.以花色为黄色的鼓槌石斛、密花石斛和球花石斛的盛开期花瓣和唇瓣为试验材料,采用英国皇家园艺学会比色卡进行花色描述,利用合相色谱串联三重四极杆质谱仪(UPC2-MS/MS)进行类胡萝卜素定性、定量分析,推测石斛属类胡萝卜素代谢途径.3种石斛属植物花瓣和唇瓣色系可分为白色系和淡黄-明黄-金黄色系,花瓣和唇瓣中共鉴定出8个类胡萝卜素组分,分别是β-胡萝卜素、α-隐黄质、β-隐黄质、紫黄质、叶黄紊、花药黄质、玉米黄质和叶黄素酯.定量分析显示球花石斛白色花瓣中类胡萝卜素含量极少,总量约为52.26μg/g,随着黄色加深,类胡萝卜素总量逐渐增加,球花石斛金黄色唇瓣中的类胡萝卜素总量最高,达到3810.89μg/g.密花石斛淡黄色花瓣中以叶黄素为主;球花石斛和密花石斛金黄色唇瓣中主要是α-隐黄素、叶黄素和叶黄素酯;明黄色鼓槌石斛花瓣中以玉米黄质、花药黄质和叶黄素为主.α-胡萝卜素及其衍生物是淡黄色和金黄色石斛花瓣中的主要类胡萝卜素成分,而β-胡萝卜素及其衍生物是明黄色石斛花瓣的主要类胡萝卜素成分.结合类胡萝卜素代谢途径,推测通过调控LCYE基因的表达,可能实现黄色花石斛的花色定向改良.

摘要： 顶复门原虫可引起人类和动物的多种疾病,由于寄生虫对现有药物耐药性的不断增加,对于新药的研发势在必行.通过对寄生虫代谢的研究,是研发新型抗寄生虫药物的重要途径之一.近年来,r-氨基丁酸代谢途径(GABA shunt)作为一种新颖代谢途径在顶复门原虫上被发现,本文简要介绍其在顶复门原虫代谢中生物学功能的研究进展.

摘要： 茶树重要的次级代谢产物主要有多酚类物质、芳香类物质及茶氨酸等,这些次级代谢产物影响着茶叶色泽、香气、滋味等感官品质的形成.本研究通过荧光定量PCR分析了4个茶树品种中多酚类物质代谢和萜类香气物质代谢途径关键酶基因的表达差异,旨在研究茶树特征代谢物在不同茶树品种间的遗传关系.

摘要： 本文综述了国内外三嗪类除草剂污染微生物降解研究现状,主要从微生物降解种质资源,基因水平转移,代谢途径与基因、降解蛋白功能进化进行了阐述.并探讨了微生降解菌株、固定化菌剂和酶制剂在三嗪类环境污染修复上的应用及其未来研究趋势.

摘要： 合成生物学致力于人工创建可编程、功能导向的生物系统,为药品、精细化工品、生物燃料、生物材料等重大产品的高效制造提供了全新的解决方案.酶作为人工代谢途径的核心催化元件,对于实现人工代谢途径高效运行具有至关重要的作用.本实验室致力于利用蛋白质工程原理,发展酶分子进化新策略,对代谢途径中的关键酶分子进行人工设计与进化,获得具有高催化活性、高特异性、高稳定性的催化元件,从而实现对人工代谢途径的精准、定向调控与优化.

摘要： 甜菜碱广泛分布于自然界,在许多微生物(包括细菌、古细菌和真菌)中都有发现.由于其特殊功能,许多微生物利用甜菜碱作为功能性化学物质并且已经演化出与甜菜碱生物合成和分解相关的代谢途径.甜菜碱的主要作用是防止微生物细胞受干旱、渗透胁迫和温度胁迫的影响,并且在微生物甲基代谢中也发挥作用.综述了微生物中甜菜碱的生物合成、转运、分解代谢和功能,并总结了甜菜碱在微生物发酵中的应用案例.甜菜碱独特的生物相容性及生理活性将使其在生物技术领域具有广阔的应用前景.

摘要： 随着农药的不断开发和利用,农药残留物对生态环境的影响也日益受到人们的重视.杀菌剂是使用较广的一种农药.本文将介绍杀真菌剂代谢数据库系统的建立策略、方法和技术.建立该数据库系统的研究内容主要包括:数据收集及规范化处理、数据结构设计和代谢反应获取方法.农药研究者可以利用化合物结构、CAS号等信息作为提问信息,从该数据库系统获得对应杀真菌剂的代谢途径及代谢产物信息.

摘要： 茶园病虫害严重,导致农药使用量逐渐增加,造成了茶叶中存在一定的农药残留污染.对于具有手性中心的内吸性杀虫剂乙酰甲胺磷施用于茶树后,不仅在植物体内残留,还会被代谢为高毒代谢物甲胺磷.因此研究其在茶树中的吸收代谢机理,对于茶叶病虫害防治和安全性评价均有重要意义.本文利用离体叶片和茶悬浮细胞2种体外系统研究了乙酰甲胺磷手性对映体在茶树中的吸收、转运和代谢机制,结果表明,乙酰甲胺磷手性对映体可以通过茎部吸收并转移至顶芽,同时在茎段和叶片部位均可检测到代谢物甲胺磷;且悬浮细胞对乙酰甲胺磷手性对映体有良好代谢能力,并通过QTOF对其代谢物进行了筛查及鉴定,得到乙酰甲胺磷代谢物为2种.

摘要： 茶园病虫害严重,导致农药使用量逐渐增加,造成了茶叶中存在一定的农药残留污染.对于具有手性中心的内吸性杀虫剂乙酰甲胺磷施用于茶树后,不仅在植物体内残留,还会被代谢为高毒代谢物甲胺磷.因此研究其在茶树中的吸收代谢机理,对于茶叶病虫害防治和安全性评价均有重要意义.本文利用离体叶片和茶悬浮细胞2种体外系统研究了乙酰甲胺磷手性对映体在茶树中的吸收、转运和代谢机制,结果表明,乙酰甲胺磷手性对映体可以通过茎部吸收并转移至顶芽,同时在茎段和叶片部位均可检测到代谢物甲胺磷;且悬浮细胞对乙酰甲胺磷手性对映体有良好代谢能力,并通过QTOF对其代谢物进行了筛查及鉴定,得到乙酰甲胺磷代谢物为2种.

摘要： 茶园病虫害严重,导致农药使用量逐渐增加,造成了茶叶中存在一定的农药残留污染.对于具有手性中心的内吸性杀虫剂乙酰甲胺磷施用于茶树后,不仅在植物体内残留,还会被代谢为高毒代谢物甲胺磷.因此研究其在茶树中的吸收代谢机理,对于茶叶病虫害防治和安全性评价均有重要意义.本文利用离体叶片和茶悬浮细胞2种体外系统研究了乙酰甲胺磷手性对映体在茶树中的吸收、转运和代谢机制,结果表明,乙酰甲胺磷手性对映体可以通过茎部吸收并转移至顶芽,同时在茎段和叶片部位均可检测到代谢物甲胺磷;且悬浮细胞对乙酰甲胺磷手性对映体有良好代谢能力,并通过QTOF对其代谢物进行了筛查及鉴定,得到乙酰甲胺磷代谢物为2种.

摘要： 本公开涉及通过提供调节肠道微生物群系以改善健康、营养和生长性能的饲料添加剂来饲养动物的方法。本公开进一步涉及调节动物的胃肠道中存在的代谢物的方法。此类调节包括例如调节所述代谢物的水平。

摘要： 本发明涉及代谢动力学评价方法，具体是一种人群使用口含烟产品时经口腔途径、消化道途径吸收的烟碱代谢动力学评价方法，该方法能够检测不同类型口含烟中烟碱在人体内经口腔途径、消化道途径吸收的药代动力学曲线，包括经口腔吸收受试组和经消化道吸收受试组，在规定时间使用口含烟，并在相应时间点采集受试者血样，通过HPLC‑MS检测分析不同样本中烟碱、可替宁及反3‑羟基可替宁等烟碱代谢物，获得人体中不同途径口含烟烟碱代谢动力学曲线特征。该方法可较好反映口含烟使用者经口腔黏膜和消化道的烟碱吸收和代谢情况，为后期口含烟动物模型与人群实际情况一致性评价奠定了基础，为行业口含烟产品烟碱递送的调控和评价提供有效的技术手段。

摘要： 本发明公开了一种用于代谢稳态同位素非稳态下获取胞内中心碳代谢途径代谢通量的方法，包括批培养模块、恒化培养模块、取样模块、处理与分析样品模块；当所述批培养模块中的OUR和CER同时出现下降时转入所述恒化培养模块；所述恒化培养模块中具体包括：流加不含同位素标记底物的营养液，同时开启排废，进行恒化培养，直至使微生物细胞处于代谢稳态时，切换成流加含同位素标记底物的营养液，保持培养条件不变；当所述同位素标记底物流入反应器内时开始快速、连续取样，同时进入所述取样模块。本发明的方法在短时间内获得一系列发酵液样品，进而处理、分析样品得到精确的胞内代谢物同位素丰度数据，对计算代谢通量起着至关重要的作用。

摘要： 本发明涉及生化代谢分析领域，具体而言就是依据苯丙（烯）酸类、香豆素类和黄酮类（统称为苯丙烷类）代谢物在体内合成过程中具有前后对应关系，因此其含量变化有相关性，通过定量检测这些代谢物含量变化，分析苯丙烷类化合物在有机体内的代谢趋势。本发明使用液相色谱‑电喷雾电离‑质谱联用技术建立了103个苯丙烷类（包括62个同分异构体）代谢物定性鉴定和定量分析方法，并在银杏、大豆等有机体中进行了分析应用。本发明的目的是通过建立灵敏度高、定性准确、操作简单的检测方法，分析苯丙烷类代谢途径的变化趋势，为研究生物代谢过程提供新思路新方法。

摘要： 本发明提供了一种不同产地玉米的代谢产物及其代谢途径分析方法，包括如下步骤：步骤一，不同产地玉米代谢产物的提取；步骤二，不同产地玉米代谢产物的衍生化；步骤三，代谢产物分离和鉴定；步骤四，三种不同产地玉米差异代谢产物分析；步骤五，差异代谢产物的代谢途径分析，步骤六，玉米代谢产物中未知代谢产物结构的推断。通过对代谢物的分析和鉴定，共检测到112种代谢物，其中62种被准确鉴定，包括糖类及其衍生物，脂肪酸及其衍生物，有机酸和中间体，以及5种未知化合物。通过比较发现JY88存在3种差异代谢产物，HN18有11种差异代谢产物，DM9有10种差异代谢产物。本发明分析方法简单，容易操作，效果显著，准确度高。

摘要： 本发明涉及的一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法，收集正常人和干眼病患者眼泪样本；对样本进行UHPLC‑Q‑TOF‑MS检测，得到原始代谢指纹图谱，对测到的代谢物进行鉴定，得到正常人和干眼病患者眼泪样本的代谢物数据，将正常人和干眼病患者眼泪样本的代谢物数据，通过中位数归一化法进行数据标准化后，借助有监督模式识别的偏最小二乘判别分析法结合T检验法筛选出差异的代谢物。本发明的有益效果在于：本发明干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法是通过收集正常人和干眼病患者眼泪样本，反映正常人和干眼病患者眼泪样本的眼泪中的代谢物变化情况，能够对判断干眼病是否治疗提供有效的参考。

摘要： 本公开涉及用于鉴定复杂生物样品中的代谢途径和代谢物的方法和装置。具体而言，本公开涉及一种使用各种统计工具(诸如过度表示和富集分析)来提高代谢组学(诸如在非靶向代谢组学数据)中代谢物鉴定的置信度的方法和装置。

摘要： 本发明涉及包括至少一种抗感染活性化合物作为活性成分与至少一种脂代谢抑制剂的组合制剂,所述抗感染活性化合物抑制2－C－甲基赤藓糖－4代谢途径。该组合制剂可用于感染过程、特别是人和动物中的感染过程,而且还可用作植物中的除草剂。其表明,与对单个组分的耐药性增强相比,大大降低了对本发明的组合制剂的耐药性增强。

摘要： 本发明公开了麦角硫因合成基因在谷氨酸棒杆菌中重建麦角硫因代谢途径中的应用及其方法，麦角硫因合成基因包括Egt1和Egt2，对Egt1和Egt2基因进行密码子优化，优化后Egt1的核酸序列如SEQ ID NO.1所示，Egt2的核酸序列如SEQ ID NO.2所示；然后以高产组氨酸的谷氨酸棒杆菌为出发菌株，将Egt1和Egt2转入谷氨酸棒杆菌中，实现以葡萄糖为碳源的从头合成麦角硫因。

摘要： 本发明公开了一种通过生物代谢途径排出体内毒素的精华露，包括以下材料：水80‑90重量份，玫瑰提取液0.1‑0.2重量份，大蒜提取液2‑4重量份，桉树提取液0.1‑0.2重量份，银杏提取液3‑5重量份，月见草提取液3‑5重量份，雪莲花提取液1‑3重量份，积雪草提取液2‑8重量份，丁二醇1‑4重量份，透明质酸0.1‑0.2重量份，丙烯酸聚合物0.15‑0.25重量份，本发明涉及护肤品技术领域。该通过生物代谢途径排出体内毒素的精华露，解决了现有的精华露对于肌肤保健效果差，不便促进肌肤自我修复的问题。