代谢网络

摘要： 作为虫草属的模式种,蛹虫草是目前虫草类真菌中研究和应用最为广泛的物种之一.随着基因组序列的公布,蛹虫草组学水平的研究近年来取得了明显的进展.本文从基因组、线粒体基因组、甲基化组、转录组、蛋白质组、代谢网络等角度对蛹虫草组学水平的研究现状进行综述,期望对进一步推动蛹虫草的深入研究提供帮助.

摘要： 代谢是生物体内所发生的用于维持生命活动的一系列有序化学反应的总称,是一切生命活动的核心和基础。从生物体利用的营养物质的不同可将代谢分为糖、脂以及氨基酸的代谢。从代谢通路的特点可分为合成简单小分子或将小分子继续合成生物大分子的合成代谢、将各类生物分子降解以产生能量的分解代谢以及清除生物体产生的有毒废物的清除代谢。不同营养物质以及代谢通路互相关联,构成了复杂的代谢网络。为报道代谢生物学领域取得的最新研究成果及发展动态,《生物技术通报》编辑部将组织出版“代谢生物学”专题,欢迎相关领域的专家学者为本刊撰稿,展示代谢生物学研究的最新发展趋势。

摘要： 为了探究采前连续光照光质对水培生菜(Lactuca sativa L.)产量和品质的影响,研究了不同红(R)蓝(B)光质比例(1R:4B、1R:2B、1R:1B、2R:1B和4R:1B)对水培生菜生长、光合特性、抗坏血酸(ascorbic acid,AsA)含量和AsA代谢关键酶活性的影响。结果表明:与连续光照前相比,不同比例LED红蓝光连续光照后,生菜地上部鲜重的增幅为38.82%~77.65%,2R:1B处理下的地上部鲜重最大达到30.23 g;根鲜重的增幅为27.43%~73.14%,4R:1B处理下的根鲜重最大为3.03 g。红光比例越高,生菜的叶面积、SPAD和可溶性糖含量越高,硝酸盐含量的变化不显著。与其他处理相比,1R:4B的连续光照处理后,生菜的净光合速率、蒸腾速率、胞间CO_(2)浓度和气孔导度达到最大。提高采前连续光照中的蓝光比例可显著提高生菜AsA含量和单脱氢抗坏血酸还原酶(MDHAR)的酶活性,1R:4B处理下叶片AsA的含量最高达到3.22 mg·g^(-1),1R:4B处理下的生菜叶片MDHAR酶活性显著增加了0.81 U·mg^(-1) FW。综上,降低采前连续光照的蓝光比例,可显著提高生菜的产量和可溶性糖等的含量,而提高采前连续光照蓝光比例可显著提高AsA的含量,这是因为采前连续光照蓝光比例的升高提高了MDHAR的活性。

摘要： 目的 基因组规模代谢网络模型(genome?scale metabolic model,GEM)是当前癌症代谢研究常用的一种分析工具,高质量的癌症代谢网络有助于人们了解癌症内部的代谢特征.泛癌代谢分析需要为多种癌症构造代谢网络模型,然而传统的直接基于癌症基因表达或蛋白质数据进行的网络重构方法,无法避免引入癌症所在组织的代谢特征,从而影响探寻疾病本身的代谢特点.为了削弱组织代谢特征对研究的影响,更加准确地提取癌症相对正常组织细胞在代谢层面上发生的变化,提出一种基于差异代谢网络的泛癌代谢分析方法.方法 以癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中17种癌症作为分析对象,通过分析癌症及癌旁组织的基因表达数据,采用基因芯片线性模型(linear models for microarray analysis,Limma)工具包分别提取这17种癌症的差异表达基因,并将人类全基因组规模代谢网络Recon3D作为背景 网络,结合代谢网络重构算法FASTCORE为每种癌症构建差异代谢网络.最后联合多种癌症网络利用流量平衡分析(flux balance analysis,FBA)方法进行基因敲除以及毒性测试,分析癌症代谢共性,发现潜在药物治疗靶点.结果 得到了每种癌症的差异表达基因、差异代谢网络模型,以及潜在的药物靶点,通过联合所有癌症进行分析,最后得到了7个潜在的泛癌药物靶点,其中包括CRLS1、CTH、PTDSS1、SLC6A14、SGMS1、PKM以及PLD2.7个药物靶标中已经有5个用于不同的癌症治疗策略中,而其余结果代表了潜在的药物靶点.结论 本文提出的差异代谢网络模型可以有效削弱组织代谢特征对癌症本身特征的干扰,有助于泛癌代谢分析.

摘要： 研究蜂蜜接合酵母LGL-1在高糖胁迫下的代谢特性及代谢流变化。采用高效液相色谱等方法测定蜂蜜接合酵母LGL-1在葡萄糖质量浓度100 g/L和400 g/L条件下积累的代谢产物(酒精、海藻糖、甘油、苹果酸、α-酮戊二酸、柠檬酸及乳酸),通过构建代谢矩阵方程组,采用Matlab软件和归一法分析关键节点的代谢流分布情况。结果表明,蜂蜜接合酵母LGL-1高糖胁迫时的碳流量偏向流入海藻糖、甘油、乙醇和TCA循环的代谢支路,与常规培养相比,海藻糖、甘油和TCA循环的通量分别增加了50.00%,17.73%和4.79%,高糖培养与常规培养的乙醇代谢通量接近。在高糖胁迫条件下蜂蜜接合酵母LGL-1积累的海藻糖、甘油以及TCA循环的通量变化也反映海藻糖、甘油以及TCA循环对酵母细胞的重要保护功能。

摘要： 生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用.利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系.通过对代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA和FVA方法分析敲除反应后的代谢网络的流量分布,以及该反应的敲除对其余反应的影响,并找到代谢网络中对整个系统有影响的反应,进一步验证其网络理论和模型方法的可行性.

摘要： 多环芳烃(Polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是一种具有致癌、致畸、致突变的持久性有机污染物.本文在分析国内外主要水体沉积物中PAHs污染状况的基础上,综述了近几年有关厌氧水体沉积物中微生物以硝酸盐、Fe(Ⅲ)以及硫酸盐为电子受体进行呼吸耦合PAHs降解的研究概况.此外,还总结了基于微生物的PAHs降解基因组、蛋白质组、代谢组以及菌群水平上互作网络的研究进展,以期为进一步加速PAHs污染水体沉积物原位生物修复提供科学理论参考.

摘要： 生物化学中各种物质的代谢通路纵横交错,构成复杂的代谢网络,是生物化学教学的重点和难点内容.以物质代谢网络中的葡萄糖有氧分解途径为代谢的主干道,分析其组成和功能要点及与其它支路代谢途径的联系,以达到理清物质代谢网络的复杂关系,在课堂教学中突出重点和分散难点的目的.

摘要： To solve the problem that the variable searching scope is too large for solving all optimal feasible solutions by the mixed integer linear programming(MILP)algorithm,we proposed an improved MILP algo-rithm incorporating the flux variability analysis(FVA).Using 1,3-propanediol(1,3-PDO)fermentated from glycerol by Klebsiella pneumoniae as a research subj ect,and the maximum yield of 1 ,3-PDO as an optimized tar-get,we obtained all feasible metabolic pathways under different oxygen consumptions by the improved MILP al-gorithm.In addition,we determined the optimal metabolic pathway with the minimum ATP total consumption through analysis of ATP total consumption.%针对混合整数线性规划(MILP)算法求解所有最优可行解时变量搜索范围过大的问题,提出了用通量可变性分析(FVA)改进MILP算法;并以克雷伯氏杆菌发酵甘油产1 ,3-丙二醇(1 ,3-PDO)为研究对象,以1 ,3-PDO产率最大为优化目标,利用改进 MILP算法得到不同氧气消耗下所有可行代谢路径;进一步通过 ATP 消耗总量分析,确定 ATP消耗最小的最优代谢路径.

摘要： 一碳化合物(甲醇或甲烷)高值化转化是当前生物工程领域的重要研究热点.甲基营养菌是一类以甲醇为碳源和能源生长的革兰氏阴性菌,随着基因组测序的开展和各类组学技术的发展,以扭脱甲基杆菌为代表的甲基营养菌的中心代谢网络途径和相关功能基因逐渐明晰.近年来,甲基营养菌中包括基因过表达、基因敲除整合等遗传操作工具的完善以及各种基因调控元件的开发,为甲基营养菌的底盘改造和异源途径优化表达提供了重要基础,国内外的研究推动了甲醇转化成多种高附加值产品.此外,人们渴望利用传统基因工程菌作为底盘构建合成型甲基菌,以期更高效实现甲醇催化转化.本文中,笔者综述了目前甲基营养菌,尤其是扭脱甲基杆菌的代谢网络特点、代谢工程改造策略与应用以及构建合成型甲基细菌这3个方面的研究进展,以期为甲基微生物催化转化的研究提供借鉴.

摘要： 硒是大多数生物所必需的微量元素,对维持氧化还原稳态平衡具有重要作用,并与许多重大疾病有着密切联系.一直以来,关于硒的研究工作主要集中于硒代谢机制和硒蛋白功能.近年来快速增长的各类组学数据为硒相关的生物信息学研究工作提供了重要条件与机遇.主要介绍了当前利用生物信息学的理论和方法研究硒的代谢通路、功能和进化等领域的最新进展.通过这些研究,一方面发现了大量新的硒蛋白基因,并确定了众多物种的硒蛋白质组;另一方面揭示了新的硒代谢通路及相关新基因,完善了硒代谢网络.在此基础上,通过比较基因组学分析,深入探讨了硒代谢通路、不同硒蛋白家族乃至硒蛋白质组的分布与进化规律,以期为进一步认识硒研究领域中的重要问题和未来的发展方向提供支持.

摘要： 1,2-丙二醇是一种重要的平台化合物,由于其广泛的应用性成为研究热点.研究采用便宜易得的甘油作为碳源,在大肠杆菌中构建一条由磷酸二羟基丙酮生产1,2-丙二醇的异源代谢途径,通过敲除竞争支路醋酸的代谢途径,增强上游寸油到磷酸二羟丙酮的代谢通路,增加碳代谢流量及还原力,达到平衡代谢网络中还原力和能量的目的.最终构建的8株工陧菌中,敲除菌株AtpiA得到了最好的发酵结果,1,2-丙二醇的产量达到1.3g/L,产率为0.21g/g甘油.

摘要： 花香是花卉的一个重要的观赏品质,它在吸引昆虫授粉和繁育等方面具有重要的作用,并且具有节律性释放特性,但是对于植物如何有效地控制花香代谢网络来高效地吸引传粉者还不清楚.百合是世界重要的观赏植物,目前生产上主栽的东方百合、OT系百合和麝香百合品种均具有节律性挥发香气的特征.本研究采用能节律性挥发强烈香味的'西伯利亚'百合花瓣为材料,进行了转录组测序和挥发量高时间点(白天16:00)和低时间点(晚上24:00)的表达谱分析,通过Trinity软件拼接共获得29,837条高质量的Unigenes.上调基因(白天16:00)主要集中在萜类骨架合成、苯基苯丙烷代谢、糖和淀粉代谢,而下调基因(夜晚24:00)主要富集在α-亚麻酸代谢、糖和淀粉代谢.通过BLASTX比如Unigenes得到了36条与花香、节律、糖代谢相关的调控基因.通过荧光定量PCR分析4个相关基因在60h内表达量的节律变化.结果显示在白天节律钟相关基因FKF1和GI是上调基因,但CK2β1、CK2β2是下调基因,并且糖和淀粉代谢以及α-亚麻酸代谢基因是下调基因,但是在夜晚结果相反.这些数据将会对于百合花香节律变化和昼夜节律研究提供帮助.

摘要： 作为一种非传统型酵母，树干毕赤酵母因其宽广的碳源代谢能力而成为纤维素乙醇的潜在生产菌。为了更好的从系统层次理解从数据库中下载己公布的S.stipitis全基因组序列，采用自行编写的基于Matlab的程序，通过比较基因组学(Blastp)和KAAS的研究方法，整合生化数据库和文献组学的数据，构建具有基因-蛋白质-反应(gene-protein-reaction)关联的基因组规模代谢网络模型iTL885。所构建的模型包括1240个反应、870个代谢物和885个基因，分布在4个亚细胞系统。注释具有代谢功能的基因占全部基因的13.2%。借助这一模型，深入解析了树干毕赤酵母的生理特性:(1)注释获得了49个糖转运子，阐释了S.StipitiS高效利用不同碳源的分子机制；(2)获得了以葡萄糖为碳源时的最小基因集合(110个必需基因和158个必需生化反应)；(3)结合不同碳源(葡萄糖和木糖)的转录组数据，解析了制约乙醇和琥珀酸高效合成的限速步骤；(4)模拟了利用木糖发酵生长乙醇和乳酸，鉴定了潜在的基因敲除靶点来提高目的产物的产量。本研究所构建的S.stipitis的代谢网络模型不仅在一定程度上阐述生理代谢特点，指导代谢工程改造等，更为系统整合分析蛋白质组、转录组、代谢组和文献组等各种组学数据提供了有效的平台。

摘要： 代谢工程技术是构建微生物细胞工厂的重要方法.过去20年,代谢工程技术在生产高附加值生物活性物质和大宗商业化学品等方面被广泛应用,极大地推动了医药、能源、环境等行业的技术变革和高速发展.近些年来,随着合成生物学、分子生物学以及计算机科学等相关学科技术的发展,代谢工程在代谢网络分析、提高菌株性能、途径酶的共定位表达等方面呈现许多新的发展,本文对这些技术方法的研究和应用进行了概述.

摘要： 目的：研究目的本研究通过中药配伍探讨DMY对TP所致ICR小鼠急性肝损伤的减毒作用及相关保护机制. 方法：雷公藤甲素模型组腹腔注射1.0mg/kg建立小鼠急性肝损伤模型.建立LC-MS/MS法测定各组小鼠肝脏组织中的16种胆汁酸含量,通过检测血清指标ALT、AST和ALP的活性,肝生化指标GSH、GSH-PX、SOD、CAT和MDA的含量,HE染色观察肝组织的病理改变,以及采用Western blot检测肝组织中Nrf2的表达,实时定量PCR检测肝组织中的MRP2、GCLC、HO-1、NQO1mRNA表达水平. 结果：采用SIMCA-P12.0软件的主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)对胆汁酸结果进行数据处理,结合SPSS17.0统计学软件进行分析,TLCA、HDCA、GCA和GLCA四种胆汁酸为DMY干预TP后下调这四种胆汁酸含量起到保护作用的生物标志物.同时与TP中毒模型组比较,低剂量、高剂量的DMY保护组(144.4mg/kg和722.2mg/kg)血清ALT、AST和ALP活性明显降低,肝组织中的GSH、GSH-PX、SOD和CAT明显升高,而MDA明显下降,组间比较具有显著性差异,肝组织病理改变也明显减轻.此外DMY保护组能显著诱导肝组织中的Nrf2转位入核,其下游靶基因表达水平也显著升高. 结论：DMY对TP所致的急性肝损伤有保护作用,其机制与激活Nrf2通路减轻TP所致急性肝损伤的氧化应激作用有关.

摘要： 微生物的代谢特性非常复杂,每种细胞内都存在着成百上千种不同的代谢途径,每个代谢途径都有底物、中间代谢物和产物,所有代谢途径又通过共享代谢物交叉、串连在一起,形成一个极为复杂的代谢网络。随着遗传组成的不同或者环境条件的改变,微生物的代谢网络会相应发生调节和变化。传统的发酵方法难以实现最优的工业过程。因此,代谢工程已经发展成为一种最有力的工具去优化微生物发酵的工业过程。本研究在实验室通过对这些代谢途径的调节，已经在PHA的产生和1,3丙二醇的产生上取得了巨大效果。同时这些调控的选择也会提高其他生物基化学品的产量。例如，乳酸，唬拍酸等等。这些方面的研究结果也将进行讨论。

摘要： 人类基因组计划的实施推动了大肠杆菌基因组测序的完成,为大肠杆菌突变菌株的构建和代谢研究提供了遗传学基础。1991年Bailey系统阐述了代谢工程的概念后,利用代谢工程的原理研究、改进和拓展细胞的代谢特征已经成为生物研究领域的热点之一。代谢流分析提供了代谢网络中的流量分配信息,可以了解到各个支路的流量分配关系,有助于分析目的产物流向中的瓶颈所在,计算最大理论产量等。根据物料平衡,利用代谢反应的化学计量关系可以计算代谢流分布通量。本文使用代谢流分析的方法考察了大肠杆菌野生型菌株W3110以及乳酸脱氢酶(ldhA)单基因缺陷菌株ALS786的中心代谢途径(central metaboli pathways:CMPs),来考察单基因ldhA缺陷对大肠杆菌中心代谢流分布的影响。对比计算结果发现ldhA基因的缺陷使得流向乳酸生成途径的代谢通量减为0,乙酸生成支路的通量减少了78.8%,而进入TCA 途径的代谢通量相比对照菌株W3110增加了4.6倍。同时参照菌株W3110的发酵液中没有丁二酸而在ladhA单基因缺陷菌株ALS786的发酵液中检测到了丁二酸的积累。

摘要： 性(温、凉、寒、热、平属性)味(苦、辣、酸、甜、成五味)理论在中华食文化中占据核心地位,指导中国人繁衍生息三千年.中国人似乎只讲究"色、香、味"而忽视了营养,其实非也,经过十几年的不懈努力,基本上解决了温凉寒热平不同属性本质,五味与营养及其代谢的关系是什么,而且用现代科学技术解释了"阴阳"属性和"五味"及其定量化问题,特别是对中国辉煌的农耕饮食文化和中医药传承和发展,通过系统的动物或人体实验评价,重新修订主要食谱的阴阳及温凉寒热平属性具有重要的作用.这不仅为中国的食品科学、中医药学找到了实验和科学依据,也可以为提高人类的生活质量、为人类健康、延年益寿和科学饮食做出贡献.

摘要： 一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法，属于分析技术领域。包括步骤：1)对生物样品中的代谢物组进行分析，数据预处理后得到代谢组学数据矩阵；2)构造代谢物‑代谢通路二部图；3)将代谢组学数据矩阵进行代谢物关联网络建模，得到实验组和对照组之间的差异网络；4)计算差异网络在二部图上的富集度；5)基于两组样本间的差异代谢物网络，结合通路数据库的信息，对通路按重要性进行排序，识别潜在扰动通路；6)对潜在扰动通路进行显著性检验，获得显著扰动的代谢通路。利用差异网络的相关理论分析生物机体不同生理状态之间的差异，所筛选出与实验组相关的受扰动代谢通路更为可靠，为理解生物机体背后的发生机制提供新的研究思路。

摘要： 本发明公开了一种基于分子结构关联网络的规模化代谢组定性方法。首先，收集开源代谢组数据库中的内源性代谢物，基于代谢物分子结构相似性构建代谢组水平分子结构关联网络；其次，对生物样本提取物进行非靶向代谢组学分析，并构建保留时间预测模型；进一步通过少量结构确证的代谢物作为种子代谢物，基于网络相邻代谢物与种子代谢物有相似MS2这一前提，对代谢物进行定性。本发明方法不依赖于大规模实验MS2数据库，即可真正实现代谢组规模的快速定性，且定性结果更可靠。

摘要： 本发明公开了一种基于二维异质网络的代谢物‑蛋白质相互作用预测方法，该方法包括：代谢物‑蛋白质二维异质网络构建；代谢物‑蛋白质多维度相关性特征计算；基于随机森林算法的代谢物‑蛋白质相互作用预测模型构建；代谢物与蛋白质相互作用预测的步骤。本发明基于建立的预测模型能够可靠预测出潜在的代谢物‑蛋白质相互作用。

摘要： 本发明属医学技术领域，涉及基于基因芯片数据和代谢网络测定癌症关键代谢酶的方法。本发明方法包括建立基因共表达网络、划分共表达网络为模块、共表达网络性质和模块的癌症特异性计算和建立酶网络、预测关键酶和代谢物。本发明方法可预测对于癌症代谢的关建酶，作为癌症治疗的药物候选靶点；每一个预测的癌症关键酶基因可对应到所涉及反应的代谢物，作为每种癌症的关键代谢物预测结果，该代谢物也可作为候选的药物设计基础代谢物；本方法能明显缩小实验搜寻的范围并加快靶点寻找进程，节约时间及费用，可用于筛选癌症及其他与代谢重调相关的复杂疾病的药物靶点，具有推广价值。

摘要： 一种基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法：分别获取目的菌湿实验数据和高质量基因组尺度代谢网络模型；根据湿实验数据进行模拟条件设定；模拟实验菌的生长状态获得代谢通量分布，模拟优化工程菌的生长状态获得代谢通量分布；将两种代谢通量分布进行比较，确定两者之间的反应通量分布的不同；根据比较结果以及基因组尺度代谢网络模型中的基因-反应对应关系，得到相应的基因预测结果，从而确定将实验菌改造成优化工程菌所需进行的代谢工程改造，进而制定相应的湿实验策略。本发明可应用于任何具有基因组尺度代谢网络的物种，以及模拟预测网络模型计算能力范围内的任何产品，特别对于基因序列尚不明确的代谢工程菌具有很好的指导意义。

摘要： 本发明属医学技术领域，涉及基于基因芯片数据和代谢网络测定癌症关键代谢酶的方法。本发明方法包括建立基因共表达网络、划分共表达网络为模块、共表达网络性质和模块的癌症特异性计算和建立酶网络、预测关键酶和代谢物。本发明方法可预测对于癌症代谢的关建酶，作为癌症治疗的药物候选靶点；每一个预测的癌症关键酶基因可对应到所涉及反应的代谢物，作为每种癌症的关键代谢物预测结果，该代谢物也可作为候选的药物设计基础代谢物；本方法能明显缩小实验搜寻的范围并加快靶点寻找进程，节约时间及费用，可用于筛选癌症及其他与代谢重调相关的复杂疾病的药物靶点，具有推广价值。

摘要： 一种基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法：分别获取目的菌湿实验数据和高质量基因组尺度代谢网络模型；根据湿实验数据进行模拟条件设定；模拟实验菌的生长状态获得代谢通量分布，模拟优化工程菌的生长状态获得代谢通量分布；将两种代谢通量分布进行比较，确定两者之间的反应通量分布的不同；根据比较结果以及基因组尺度代谢网络模型中的基因-反应对应关系，得到相应的基因预测结果，从而确定将实验菌改造成优化工程菌所需进行的代谢工程改造，进而制定相应的湿实验策略。本发明可应用于任何具有基因组尺度代谢网络的物种，以及模拟预测网络模型计算能力范围内的任何产品，特别对于基因序列尚不明确的代谢工程菌具有很好的指导意义。

摘要： 本发明公开了一种酶约束代谢网络模型的高灵敏度参数的确定及其优化方法，先通过灵敏度分析方法，对模型中的参数根据对比生长速率预测结果的贡献从高到低排序，选择贡献较高的参数进行优化，再使用自适应变异策略的差分进化算法进行参数优化，它可以自适应的选择变异策略从而提高优化效率，从数据库中获取不同生长条件下的比生长速率数据并随即从中挑选出部分训练集，最后通过通量变异性和相平面分析方法，对优化后的模型得出性能评估的结果；所述的高灵敏度参数，是酶的周转数kcat参数。

摘要： 本发明公开了一种基于原子团追踪的代谢网络分支路径排序方法。1.通过分支合并基于原子团追踪得到的线性路径生成分支路径；2.通过提取63个已知代谢网络的高频反应段构建原始反应段词典；3.计算出高频反应段的信息熵与互信息；4.筛选出信息熵与互信息高于既定阈值的反应段作为关键反应段，并把关键反应段及其左右信息熵与互信息值存入关键反应段词典；5.计算关键反应段词典中的反应段评分；6.将反应段评分与化合物相似度、反应热力学自由能、原子团转移信息一起作为分支路径的排序权重对分支路径进行排序。本发明的方法有效提高了找到的代谢路径恢复已知路径的准确度并且返回由起始化合物到目标化合物的具有生化相关性的分支代谢路径。

摘要： 本发明公开了一种基于GUI界面的基因组代谢网络模型构建分析系统，其包括搭建酶约束模型模块、搭建热力学约束模型模块、整合转录调控网络模块和模型代谢流分析模块，本发明基于GUI界面的基因组代谢网络模型构建分析系统基于matlabGUI，开发了基因组代谢网络模型多约束的搭建和模型分析的可视化软件系统，使得用户无需下载和修改源代码，只需要点击软件中的按钮，根据弹窗提示，输入要求的参数或文件，就可方便快捷地搭建模型，并且软件提供了模型分析工具，用户可以对搭建的模型进行分析验证。同时，经过生长实验，基因敲除，通量变异性分析等验证，证明模型预测精度有效提高。