靶蛋白

摘要： 目的采用“多成分药学团-多靶点-多通路”网络药理学方法分析补中益气方调控头颈鳞癌的主要活性成分。方法在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN数据库(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)中,以“毒理药物动力学”(ADME)的口服生物利用度(OB),药物相似性(DL)以及药物半衰期(HL)为参数,筛选补中益气方组分黄芪、白术、陈皮、升麻、柴胡、人参、甘草、当归的药效团活性成分。采用PharmMapper服务器预测药效团模型的高度差异化靶蛋白和靶蛋白交叉验证的方法构建化合物-靶点网、蛋白互作(PPI)网。最后使用cytoscape插件ClueGO+CluePedia进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的生物多通路富集分析。结果补中益气方中有184种活性成分,其中18个靶蛋白的显著富集47条,GO和KEGG富集功能的通路有73条。排名前五位的关键靶点蛋白包括AKT1、TNF、IL1B、PTGS2、ESR1。主要通路涉及:PI3K-AKT、Toll-NF-κB、T细胞受体信号通路、细胞凋亡与增殖通路、TNF信号通路。PPI蛋白互作主要涉及:BAX,APAF1和FAS等细胞凋亡相关基因。结论本研究结果初步验证了补中益气方药理作用的分子机制,进一步深入揭示补中益气方的有效活性成分有可能通过调控PI3K-AKt信号通路抑制凋亡途径从而抑制头皮鳞癌细胞增殖。为深入研究补中益气方的活性成分和作用分子机制研究提供前沿新思路。

摘要： 已使用基因靶向抑制和突变工具阐明了许多潜在的新农药靶标位点,这些靶标被认为是不成药靶点。生物界的一些生物体利用毒肽来抵御或杀死天敌,农业化学工业已在田间应用一些肽类似物(草铵膦和双丙氨膦)。而药物学家一直在使用三维靶蛋白结构来发现和合成与上述的靶标表面紧密结合并抑制其活性的短肽。

摘要： 结节性硬化症(tuberous sclerosis complex,TSC)是一种罕见的儿童期发病的常染色体显性遗传性神经皮肤综合征,主要由TSC1和/或TSC2基因突变所致,引起哺乳动物雷帕霉素复合体靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)通路异常激活,从而出现大脑、心脏、肾脏、皮肤等多系统器官损害。TSC相关癫痫是该病最常见的神经系统表现,发病率约85~90%,其中63%会进展为难治性癫痫[1-2]。目前,大麻二酚(cannabidiol,CBD)正逐步应用于TSC相关癫痫的治疗,具有良好的抗惊厥发作效用和安全性,有助于降低难治性癫痫的发作频率[3]。本文就CBD在TSC相关癫痫中的研究进展进行综述。

摘要： 泛素—蛋白酶体系统(Ubiquitin-proteasome system,UPS)调节蛋白质的稳定性,在细胞内稳态中起着重要作用[1]。UPS参与许多生理过程,如细胞分化、凋亡、自噬、血管生成以及DNA修复和抗原提呈过程等[2-3]。泛素通过与不同的酶形成共轭级联复合物,进而与靶蛋白连接并启动特异性降解。泛素—蛋白酶体系统包括E1泛素激活酶、E2泛素活化酶和E3泛素连接酶[4]。

摘要： 目的:通过网络药理学方法分析石斛(Herba Dendrobii)在治疗2型糖尿病(T2DM)中的作用及相关分子机制。方法:通过检索有机小分子生物活性数据库(Pubchem)等数据库获取石斛已知活性成分及靶蛋白;利用人类基因数据库(GeneCards)获取T2DM相关疾病基因;运用Cytoscape 3.8.0软件分别构建“石斛活性成分-靶蛋白”相互作用网络和“石斛靶蛋白-T2DM基因”蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析网络拓扑结构;采用OmicShare网站进行石斛治疗T2DM靶点京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析和基因本体(GO)富集分析。结果:筛选获得石斛15个活性成分及其对应的57个靶蛋白,其中主要活性成分为木犀草素、芹菜素等,关键蛋白为雌激素受体α(ESR1)、酪蛋白激酶2α(CSNK2A1)等。GO富集结果提示石斛涉及代谢过程、对内源性刺激反应等生物学过程;参与酶结合、蛋白结合、转录因子结合等分子功能的调节。KEGG通路富集结果暗示,石斛可能通过作用于叉头框O(FOXO)、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGEs-RAGE)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)等信号通路,调节细胞炎症反应、氧化应激和胰岛素抵抗等,治疗T2DM。结论:石斛治疗T2DM涉及多个靶点和信号通路,可能通过抗氧化应激、抑制炎症反应和胰岛素抵抗等过程进行干预。

摘要： 研究背景及思路疟疾每年全球范围内导致超过40万人死亡,同时带来约27亿美元的经济损失。疟疾的主要传播媒介是按蚊。按蚊必须吸食至少一种脊椎动物的血液才能启动自身的卵子发生途径。按蚊吸血后数小时内,血液淋巴中的氨基酸水平显著升高,进而激活雷帕霉素靶点(the target of rapamycin,TOR)信号通路。TOR蛋白激活下游靶蛋白S6激酶(S6K),使其磷酸化,经过一系列信号分子,最终刺激蛋白质翻译并启动按蚊卵子发育并产卵。

摘要： 医药临床首个用于AML分化治疗的CDK2选择性降解剂的发现清华大学饶燏教授和浙江大学应美丹教授等合作,在CDK2降解剂设计与应用方面取得突破。相关成果发表于Nature Chemical Biology。周期蛋白依赖性激酶(CDK)是一组丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,CDK2敲降可诱导AML(白血病)细胞产生分化。PROTAC技术是一种利用小分子诱导靶蛋白泛素化,利用泛素化蛋白酶体途径实现靶向蛋白敲降的技术。科学家开发了一类CDK2选择性降解剂,并初步研究了该分子的安全性和有效性。同时,他们将这项新的发现应用于AML分化治疗领域,为AML治疗提供了一种潜在的高效、低毒的新型治疗方案。除AML治疗外,该类降解剂或可在CDK2相关的其他疾病治疗领域也发挥重要功能。

摘要： 目的 采用网络药理学的方法对活血化湿汤治疗肝癌的作用靶点进行预测,探讨其关联的分子作用机制和潜在的信号通路.方法 通过DisGeNET,OMIM,HPO,genecards筛出肝癌相关的靶点,同时通过BATMAN数据库收集活血化湿汤所有药物的已知靶点;将肝癌靶点蛋白和活血化湿汤预测的靶蛋白映射,获取活血化湿汤-肝癌相关靶蛋白.导入STRING 数据库中,构建"蛋白-蛋白"相互作用网络,然后取其中可信度较高(＞0.9)的蛋白部分(活血化湿汤-肝癌靶点网络)进行拓扑分析,筛选活血化湿汤治疗肝癌的核心靶点;通过对核心靶点进行生物功能和通路富集分析,预测活血化湿汤治疗肝癌作用的生物过程以及关键信号通路.结果 筛出1111个肝癌相关的靶点,活血化湿汤靶点2012个;将活血化湿汤与肝癌靶点蛋白进行映射筛选,得到302个活血化湿汤-肝癌相关靶点蛋白.将302个活血化湿汤-肝癌相关靶蛋白导入STRING 数据库中,构建"蛋白-蛋白"相互作用网络,取其中可信度较高(＞0.9)的蛋白部分(活血化湿汤-肝癌靶点网络)进行拓扑分析和通路富集分析,筛选活血化湿汤治疗肝癌的核心靶点和通路.结论 活血化湿汤治疗肝癌主要与癌症通路、PI3K-Akt信号通路、癌症糖蛋白、人类乳头瘤病毒感染、MAPK信号通路、乙型肝炎通路、癌症小分子RNA、HTLV-I感染途径、肝细胞癌通路、FoxO信号通路、Ras信号通路、HIF-1信号通路等途径密切相关.其作用核心蛋白域为蛋白激酶域、核激素受体类域超家族、酪氨酸蛋白激酶催化域、Serine/threon蛋白激酶、细胞色素P450超家族、AAA + atp酶域、agc -激酶、BLC2家族、TGF-β蛋白、ABC跨膜转运蛋白超家族等,靶蛋白为STAT3、TP53、PIK3CA、MAPK1、PIK3R1、AKT1、EP300、MAPK3、JUN、CREBBP等,以上可作为活血化湿汤治疗肝癌后续实验设计的相关研究思路.

摘要： 利用生物信息学方法预测蟾酥中代表性化合物蟾毒灵的效应机制。采用分子对接方法，搜索潜在对接的靶蛋白，与蟾毒灵已报道的药理活性进行比较，并对部分高分值靶蛋白进行单独对接确证。结果发现计算机搜索的靶蛋白与蟾毒灵药理活性具有较好相关性，其中二氢叶酸还原酶、PARP可能是蟾毒灵发挥抗肿瘤、抗炎活性的两个效应靶点。本研究为深入分析蟾毒灵效应机制提供效应靶点的先期预测。

摘要： 作者应用T7噬菌体展示克隆体系在人脑cDNA噬菌体展示库中筛选环孢素A的靶蛋白,亲环素A-环孢素A复合物能够抑制钙调神经磷酸酶的活性从而产生免疫抑制作用,而被用于临床医学.

摘要： 目的：利用反向分子对接方法预测丹参酮抗血小板可能的作用靶点及作用机制.方法：以丹参酮ⅡB为代表,采用Autodock Vina软件,把丹参酮ⅡB与抗血小板的靶蛋白进行反向对接.利用Discovery Studio Visualizer4软件对丹参酮ⅡB与靶蛋白的作用模式进行了分析.结果：丹参酮ⅡB能与GPⅡb/Ⅲa很好地结合,且丹参酮ⅡB的结合能明显优于原有配体RUC-2(IC50为96nM).结论：GPⅡb/Ⅲa可能是丹参酮抗血小板的潜在靶点.

摘要： 利用高通量测序技术构建牛病毒性腹泻病毒BVDV感染和未感染的MDBK细胞microRNAs的表达谱。利用生物信息学软件分析差异表达的microRNAs.Hoechst染色、流式细胞仪检测和caspase酶活性检测分析miR-1249的靶蛋白。WB、荧光素酶报告基因检测系统验证miR-1249的靶蛋白。结果显示,BVDV感染的细胞与正常细胞相比,差异表达的microRNA共28个,其中26个microRNA表达量显著上调,2个microRNA表达量显著下调。BVDV感染MDBK细胞后,miR-1249表达上调,其促进MDBK细胞的凋亡。凋亡相关miR-1249的靶蛋白为Faim2,miR-1249通过靶向Faim2基因调节BVDV感染。miR-1249通过抑制死亡受体凋亡通路中Faim2蛋白的表达促进细胞凋亡,为从提高宿主自身抗病毒能力角度出发,研究抗BVDV转基因育种材料提供新的思路。

摘要： 将Gln(谷氨酰胺)和Gly(甘氨酸)合成为甘氨酸谷氨酰胺二肽(GlyGln，简称甘谷二肽)既解决了Gln溶解度过低又能避免供给过多的生糖氨基酸。目前GIyGIn己开始应用于临床，主要应用于肠道疾病的治疗，如肠瘘、短肠综合征等，但尚未见GlyGln对于烧伤后心肌损害保护的报道。rn 甘氨酸和谷氨酰胺具有信号调控作用，但对烧伤后心肌细胞信号调控作用的研究未见报道。为此，本文研究了甘谷二肽对严重烧伤所致大鼠心肌功能损害的疗效并初步探讨其信号机制，以期为烧伤病人的治疗提供理论依据。

摘要： 目的:构建局灶性脑缺血模型大鼠脑基底节蛋白质组差异表达图谱,探讨针刺对局灶性脑缺血大鼠基底节蛋白质组表达的影响.方法:选用40只Wistar大鼠,随机分为4组,每组10只,分别为正常组、假手术组、模型组和针刺组.模型组和针刺组采用颈内动脉插入线栓法建立大脑中动脉阻塞模型.针刺组选醒脑开窍针法主穴内关、人中穴进行针刺.各组大鼠在规定时间快速断头取脑,提取脑基底节蛋白质,进行双向电泳(第一向固相pH等电聚焦电泳,第二向垂直平板SDS-PAGE).考马斯亮蓝R-350染色后,扫描至Dell工作站中,ImageMaster 2D Elite v3.01软件对2-DE图谱进行蛋白质点匹配率及差异表达分析,寻找差异表达蛋白质点,以MALDI-TOF-MS技术结合数据库检索进行蛋白质鉴定.结果:经过对比分析,找到质和/或量有明显改变的15个点.其中,在模型组表达上调经醒脑开窍针刺法治疗后下调的2个点;治疗后进一步上调有3个点.在模型组下调经法治疗后上调有4个.在模型组有变化治疗后未发生明显变化有4个.在模型组无变化经治疗后出现变化的有2个.结论:以蛋白质组学技术发现了一系列与脑缺血性损伤相关的蛋白,并确定了醒脑开窍针刺法治疗脑缺血的部分靶蛋白,有助于深入研究脑缺血性损伤病理机制及针刺作用机制.

摘要： 与传统的以碱基互补为特异性识别原理的DNA传感器相比,适体传感器则主要依据核酸分子特定的空间构像与靶蛋白实现特异性结合.与免疫传感器中的抗体识别分子相比,适体具有制备合成简单、易于修饰和保存等特点,因此近年来以适体为传感识别分子的适体传感器研究得到了广泛关注.

摘要： 本研究拟以人NF-KB p65亚基DNA结合域为靶蛋白，利用酵母双杂交技术自16肽的随机肽库中筛选与其发生特异性相互作用的多肽，为研制具有拮抗NF-KB转录活性及其介导的基因表达的高效抗炎多肽药物奠定基础。

摘要： 本发明涉及真核细胞或生物体中的靶向基因组编辑。更具体地，本发明涉及用于在真核细胞或生物体中切割靶DNA的组合物及其用途，所述组合物包含特异于靶DNA的向导RNA和Cas蛋白质编码核酸或Cas蛋白质。

摘要： 本发明提供了单链、多肽融合蛋白，其包含：非细胞毒性蛋白酶或其片段，该蛋白酶或蛋白酶片段能切割靶细胞的胞吐融合器的蛋白；寻靶部分，其能结合到靶细胞上的结合位点，该结合位点能经历内吞作用而被导入到靶细胞内的内体中；蛋白酶切割位点，在该位点上融合蛋白可被蛋白酶切割，其中蛋白酶切割位点位于非细胞毒性蛋白酶或其片段与寻靶部分之间；以及转运结构域，其能转运蛋白酶或蛋白酶片段从胞内体内部穿过胞内体膜，并进入靶细胞的胞质溶胶。

摘要： 本发明涉及真核细胞或生物体中的靶向基因组编辑。更具体地，本发明涉及用于在真核细胞或生物体中切割靶DNA的组合物及其用途，所述组合物包含特异于靶DNA的向导RNA和Cas蛋白质编码核酸或Cas蛋白质。

摘要： 本发明涉及真核细胞或生物体中的靶向基因组编辑。更具体地，本发明涉及用于在真核细胞或生物体中切割靶DNA的组合物及其用途，所述组合物包含特异于靶DNA的向导RNA和Cas蛋白质编码核酸或Cas蛋白质。

摘要： 本发明提供了单链、多肽融合蛋白，其包含：非细胞毒性蛋白酶或其片段，该蛋白酶或蛋白酶片段能切割靶细胞的胞吐融合器的蛋白；寻靶部分，其能结合到靶细胞上的结合位点，该结合位点能经历内吞作用而被导入到靶细胞内的内体中；蛋白酶切割位点，在该位点上融合蛋白可被蛋白酶切割，其中蛋白酶切割位点位于非细胞毒性蛋白酶或其片段与寻靶部分之间；以及转运结构域，其能转运蛋白酶或蛋白酶片段从胞内体内部穿过胞内体膜，并进入靶细胞的胞质溶胶。

摘要： 本申请涉及描绘肿瘤类型生物标志模式和特征集的基因靶和基因表达的蛋白靶。本文提供了用于鉴定个体用的治疗剂的方法和系统，诸如之前未鉴定用于治疗个体的治疗剂。所述治疗剂可通过分子概况分析来鉴定，诸如确定个体生物样品的生物标志模式或特征集。

摘要： 提供了用于检测和分析核酸的方法和试剂。该方法采用邻近延伸测定用来检测感兴趣的靶核酸，例如靶RNA。另外，该方法可与用于检测蛋白的蛋白邻近延伸测定一起用于多重测定。

摘要： 本发明涉及大量制备含有靶蛋白的外来体的方法，能够用于制备所述外来体的外来体制备用载体，由所述方法制备的含有靶蛋白的外来体及利用制得的外来体将靶蛋白传递至细胞质的方法。利用本发明提供的制备含有靶蛋白的外来体的方法，能够以高收率制备含有靶蛋白的外来体，从而能够在利用外来体来治疗疾病方面广泛地使用。

摘要： 本公开涉及一种筛选跨膜靶蛋白适配体的GAIN‑LOSS细胞SELEX方法及跨膜靶蛋白适配体及其应用，该方法包括以下步骤：S1.采用具有跨膜靶蛋白的表达的初始细胞系构建所述跨膜靶蛋白过表达的GAIN正选细胞系和所述跨膜靶蛋白敲除的LOSS反选细胞系；S2.将所述GAIN正选细胞系作为目标靶分子，将所述LOSS反选细胞系作为消减靶分子进行GAIN‑LOSS细胞SELEX筛选。该方法能够有效地在活细胞状态下针对各种跨膜靶蛋白筛选出具有高特异性和亲和力的活性适配体。

摘要： 本发明涉及大量制备含有靶蛋白的外来体的方法，能够用于制备所述外来体的外来体制备用载体，由所述方法制备的含有靶蛋白的外来体及利用制得的外来体将靶蛋白传递至细胞质的方法。利用本发明提供的制备含有靶蛋白的外来体的方法，能够以高收率制备含有靶蛋白的外来体，从而能够在利用外来体来治疗疾病方面广泛地使用。