限制性片段长度

摘要： 报告1例采用染色体核型分析及单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)检测对产前影像学检查提示胎儿无脑回畸形、双侧脑室增宽、室间隔缺损及生长受限的患儿进行遗传病因分析情况。SNP-array检测结果显示胎儿在17号染色体17p13.3p13.2区段存在4.3 Mb片段缺失,包含Miller-Dieker综合征疾病区域,经对父母验证后提示该片段缺失为新发变异,说明联合影像学及SNParray检测进行胎儿出生缺陷筛查与诊断具有重要意义。

摘要： 目的 探讨纤维蛋白原(Fibrinogen,Fg)Bβ链-1689T/G及HinfⅠA/C基因多态性与胃癌的相关性.方法 收集经病理确诊的胃癌患者151例为胃癌组,与胃癌组年龄、性别匹配的健康体检者151例为对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测FgBβ链-1689以及HinfⅠ位点基因型,采用相对危险变化值比(OR)及95％CI分析FgBβ链多态性位点与胃癌患病风险的相关性.结果 胃癌组FgBβ链-1689 T/G位点TT、TG、GG基因型分布及T/G等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),FgBβ链-HinfIA/C位点AA、AC、CC基因型分布及A/C等位基因频率与对照组比较差异具有统计学意义(P0.05);FgBβ链-1689T/G、HinfIA/C位点间形成的T?A单倍体型在胃癌组的频率高于对照组(P<0.05),T?C单倍体型的频率胃癌组低于对照组(P<0.05);FgBβ链-HinfIA/C位点AC基因型与胃癌的相对危险度分析,其比值比(OR)及95％置信区间(CI)分别为1.888,1.105～3.224.结论 FgBβ链HinfⅠA/C的AC基因型可能增加胃癌的发病风险,C等位基因可能是胃癌发病的致病基因;T?A单倍体型可能增加胃癌的发病风险,T?C单倍体型可能降低胃癌的发病风险.

摘要： 目的探讨纤维蛋白原(Fibrinogen,Fg)Bβ链-1689T/G及HinfⅠA/C基因多态性与胃癌的相关性。方法收集经病理确诊的胃癌患者151例为胃癌组,与胃癌组年龄、性别匹配的健康体检者151例为对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测FgBβ链-1689以及HinfⅠ位点基因型,采用相对危险变化值比(OR)及95%CI分析FgBβ链多态性位点与胃癌患病风险的相关性。结果胃癌组FgBβ链-1689 T/G位点TT、TG、GG基因型分布及T/G等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),FgBβ链-HinfIA/C位点AA、AC、CC基因型分布及A/C等位基因频率与对照组比较差异具有统计学意义(P0.05);FgBβ链-1689T/G、HinfIA/C位点间形成的T*A单倍体型在胃癌组的频率高于对照组(P<0.05),T*C单倍体型的频率胃癌组低于对照组(P<0.05);FgBβ链-HinfIA/C位点AC基因型与胃癌的相对危险度分析,其比值比(OR)及95%置信区间(CI)分别为1.888,1.105~3.224。结论FgBβ链HinfⅠA/C的AC基因型可能增加胃癌的发病风险,C等位基因可能是胃癌发病的致病基因;T*A单倍体型可能增加胃癌的发病风险,T*C单倍体型可能降低胃癌的发病风险。

摘要： 目的:探讨hTERT基因SNP rs2853676位点与非贲门胃癌遗传易感性的关系.方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测134例非贲门胃癌组和147例正常对照组hTERT基因rs2853676位点的基因多态性.并用非条件性Logistic回归计算比值比(OR)及其95％可信区间(CI),以评估等位基因、基因型与非贲门胃癌发病风险的关系.结果:hTERT基因SNP rs2853676基因型GG、GA、AA在非贲门胃癌组和正常对照组的频率分别为27.6％;57.5％;14.9％和25.2％.;46.9％;27.9％;携带AA型基因的患者罹患非贲门胃癌的风险显著增加(OR=2.050,95％CI=1.102-4.138).结论:hTERT基因SNP rs2853676与非贲门胃癌发病风险关联.

摘要： Objective:To investigate the relationship oflRF5 polymorphism and allergic rhinitis.Methods:Three independent single nucleotide polymorphisms (SNP) were analyzed.The genotype and allele frequencies were detected in 110 allergic rhinitis patients and 101 health controls by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP).Results:No statistically significant difference was detected between allergic rhinitis and controls (all P-value ＞ 0.05).Conclusion:No association was observed between 1RF5 and allergic rhinitis in Singapore Chinese population.%目的:探讨变应性鼻炎与干扰素调节因子5(IRFS)的单核苷酸多态性(SNP)的相关性.方法:采用聚合酶链(PCR)和限制性片段长度多态性(RFL P)方法在新加坡华人中检测110例变应性鼻炎患者及101健康对照组IRF5位点上的3个单核苷酸多态性(rs4728142,rs11770589,rs2280714)计算基因型和等位基因频率.结果:IRF5基因的3个位点的基因型和等位基因频率在变应性鼻组和对照组间差异无统计学意义.结论:新加坡华人IRF5 rs4728142,rsl1770589,rs2280714多态性与变应性鼻炎无明显相关性.

摘要： 目的探讨砷代谢相关酶三价砷甲基转移酶[arsenic（＋3oxidationstate）methyltransferase，AS3MT]单核苷酸多态性与地方性砷中毒患病风险的关系。方法采用聚合酶链反应一限制性酶切片段多态性一单链构象多态性（PCR—RFLP—SSCP）技术对79名砷中毒患者和110名正常健康人群外周血中AS3MT基因第8内含子和第9外显子的突变情况进行初筛，并进一步对异常带型进行直接DNA测序，以确定突变位点及类型。对AS3MT基因多态性进行单因素分析和多因素非条件Logistic回归分析。结果病例组AS3MT基因第8内含子上9149位碱基（AS3MT_9149）A—C突变的发生率（19．O％，15／79）低于对照组（23．6％，26／110），病例组AS3MT基因第9外显子上287位密码子（AS3MT-287）ATG—AC／TG突变的发生率（10．1％，8／79）低于对照组（11．8％，13／110），但差异均无统计学意义（P均〉0．05）。在多因素分析中调整年龄、性别等因素后，AS3MT基因多态性与地方性砷中毒发病仍无统计学意义[AS3MT-9149：比值比（OR）=0．59，95％可信区间（C／）为O．26—1．31，P=0．195；AS3Mn287：OR=0．85，95％C／为0．32—2．30，P=0．751]。结论AS3MT-9149和AS3MT-287多态性与地方性砷中毒易感性无显著关系。出现这种情况的原因可能与分析的样本量较小，或者是有关的多态性位点在AS3MT基因其他的外显子或非编码区上有关。

摘要： 目的：研究结核分枝杆菌假设蛋白Rv0341编码基因iniB的多态性，确认其保守性，分析依赖利福平结核分枝杆菌(依R菌)在利福平(R)培养管中Rv0341高表达的可能原因。方法：用大肠杆菌做为阴性对照，提取依R菌(14株)、耐R菌(23株)、R敏感的结核分枝杆菌(12株)、结核分枝杆菌标准株H37Rv及BCG(共51株)的细菌基因组DNA，利用PCR自基因组DNA中扩增iniB基因，通过ApaI／EcoRV、Kpn I／Sma I双酶切，琼脂糖凝胶电泳检测其带型，对iniB基因进行限制性片段长度多态性分析并测序。结果：实验组中iniB基因的酶切图谱完全相同，测序结果亦证实iniB基因无突变。结论：iniB基因在对R依赖、耐药和敏感等不同类型的结核分枝杆菌中是相对保守的；依R菌在Rv0341蛋白表达方面的差异可能是RNA转录差异或利福平诱导的结果。

摘要： 目的:研究结核分枝杆菌假设蛋白Rv0341编码基因iniB的多态性，确认其保守性，分析依赖利福平结核分枝杆菌(依R菌)在利福平(R)培养管中Rv0341高表达的可能原因。方法：用大肠杆菌做为阴性对照，提取依R菌(14株)、耐R菌(23株)、R敏感的结核分枝杆菌(12株)、结核分枝杆菌标准株H377Rv及BCG(共51株)的细菌基因组DNA，利用PCR自基因组DNA中扩增iniB基因，通过ApaI／EcoRV、Kpn Ⅰ／Sma Ⅰ双酶切，琼脂糖凝胶电泳检测其带型，对iniB基因进行限制性片段长度多态性分析并测序。结果：实验组中iniB基因的酶切图谱完全相同，测序结果亦证实iniB基因无突变。结论：iniB基因在对R依赖、耐药和敏感等不同类型的结核分枝杆菌中是相对保守的；依R菌在Rv0341蛋白表达方面的差异可能是RNA转录差异或利福平诱导的结果。

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 燕麦属(Avena L.)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae)在全世界约29个种,含有6种染色体组组成类型(A、C、AB、AC、CC和AACCDD).燕麦属不同倍性以及不同基因组构成的物种是栽培燕麦产量、品质和抗性改良的重要基因库.但是,相似的形态和重叠的地理分布使燕麦属部分物种的分类与鉴定存在困难;染色体组构成和倍性差异更增加了分类鉴定的复杂性,这种情况阻碍了对这些燕麦物种优异遗传资源的有效利用.此外,由于缺乏明确的二倍体供体物种,燕麦属异源多倍体的起源一直存在争议.本文采用PCR-RFLP技术对燕麦属25个种的35个居群以及1个外类群共36份材料细胞质基因组DNA片段进行遗传变异分析.这14个细胞质引物中,除trnD-T,atpA-atp9,rps14-cob,trnS-trnfM这4个引物不能得到理想的扩增产物外,其余标记均能得到一条清晰产物,且扩增产物直接电泳均无多态性.利用BsuRI,HpaII,Hin6I,HinfI,TaqI,HindIIIi,BamHI这7种限制性内切酶对10个标记的扩增产物酶切消化后,在70种标记/酶组合中,共有3个标记(占30％)的5种标记*酶组合(7.14％)能检测到多态性.在所有70种标记/酶组合中,共检测到144条酶切片段,其中13条(占12.4％)具有多态性.细胞质STS标记揭示了燕麦种间的遗传相似系数(GS),所有材料的GS变化范围为0.7059～1,平均值为0.9227.利用细胞质STS标记的遗传距离系数,采用UPGMA法构建了36份燕麦种间的遗传关系聚类图.结果表明:利用10个细胞质STS标记的70种标记/酶组合可以对燕麦的一些种进行区分,并可在燕麦染色体组起源问题上提供相关信息.

摘要： 香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,简称FOC)引起的毁灭性病害,尖孢镰刀菌古巴专化型有4个生理小种,目前已经证明在国内存在1号和4号生理小种,不同的香蕉枯萎病菌生理小种侵染的香蕉品种以及为害程度不同,其中1号和4号小种为害比较大,而4号小种几乎能为害所有的香蕉品种.本研究的供试菌株是来自国内外包含全部4个生理小种在内的8个香蕉枯萎病菌菌株,主要研究了这8个菌株在酯酶同工酶电泳图谱以及ITS-RFLP之间的差异,旨在寻找影响不同生理小种致病性差异的内在因素.结果表明在酯酶同工酶电泳的水平上，不同的生理小种有一定的差异，国内外同一小种的菌株差距也很大。在分子水平上，用ITS引物扩增片段大小，片段核苷酸序列差距不大，用限制酶酶切ITS片段各个菌株并没有表现出差异性。

摘要： 香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,简称FOC)引起的毁灭性病害,尖孢镰刀菌古巴专化型有4个生理小种,目前已经证明在国内存在1号和4号生理小种,不同的香蕉枯萎病菌生理小种侵染的香蕉品种以及为害程度不同,其中1号和4号小种为害比较大,而4号小种几乎能为害所有的香蕉品种.本研究的供试菌株是来自国内外包含全部4个生理小种在内的8个香蕉枯萎病菌菌株,主要研究了这8个菌株在酯酶同工酶电泳图谱以及ITS-RFLP之间的差异,旨在寻找影响不同生理小种致病性差异的内在因素.结果表明在酯酶同工酶电泳的水平上，不同的生理小种有一定的差异，国内外同一小种的菌株差距也很大。在分子水平上，用ITS引物扩增片段大小，片段核苷酸序列差距不大，用限制酶酶切ITS片段各个菌株并没有表现出差异性。

摘要： 本发明公开了一种用于限制片段长度多态性研究的家蚕DNA抽提方法，以家蚕个体为研究对象，解剖后取后部丝腺；加入液氮后经充分研磨后，充分酶解后，用酚进行抽提后，用正丁醇浓缩后用乙醇进行沉淀；RNase处理后，经酚、氯仿抽提后，用正丁醇浓缩后用乙醇进行沉淀。严格控制实验环节，每头家蚕可抽提高纯度DNA(OD260/280＞1.9)200μg，可用于200次RFLP检测。该发明解决了目前以家蚕为材料的RFLP研究DNA纯度不高和抽提的DNA量过少的问题。

摘要： 本发明公开了一种利用扩增DNA片段长度多态性测定短链RNA的方法，属于分子生物技术领域，包括以下步骤：首先利用至少两种与待测短链RNA相比无天然同源序列的合成小RNA作为测定的内标，将这些合成小RNA以不同分子数混合，形成动态小RNA标准分子梯度；再以等量的所述动态小RNA标准与所述待测短链RNA混合，经由RNA反转录、cDNA加尾、PCR同步扩增及PCR产物DNA长度多态性片段的荧光定量分析，测得所述待测短链RNA扩增产生的DNA片段荧光强度在所述动态小RNA标准荧光强度梯度上的相对比例，本方法可以实现对短链RNA尤其是miRNA的绝对定量，且具有高特异性、高灵敏度、结果客观、重复性好，可在100-106拷贝数范围内准确定量，也适用于RNA粗提物。

摘要： 一种检测核酸片段长度的方法，包括：将待检测核酸稀释至预定浓度；分别取等量体积的核酸与梯度倍数用量的磁珠结合；通过磁力装置吸附结合了核酸的磁珠，并去除上清；使用等量体积的洗脱缓冲液回溶磁珠上结合的核酸，并检测回溶核酸浓度；计算核酸与磁珠结合前后的浓度差异，并形成浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的曲线关系；将曲线关系与标准品曲线进行比对得到待检测核酸的片段长度，其中标准品曲线包括预定浓度的不同片段长度的核酸标准品与梯度倍数用量的磁珠结合前后的浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的对应关系。本发明的方法基于同种磁珠不同浓度倍数对核酸片段偏向性筛选的特性，结合数据分析对核酸片段的长度进行简易高效的检测。

摘要： 一种基于动态片段长度的群体蛋白质结构预测方法，针对每个目标构象，从当前种群中随机选择一半构象个体建立子种群，并根据能量值对种群进行排序，并排名靠前的构象中随机选择一个构象来指导变异；在变异过程中，设计多个片段长度，并根据每个片段长度的在前期的成功率计算其被选择的概率，然后根据轮盘赌的方式基于选择概率选择一个片段长度进行片段交换，实现变异过程。本发明提供一种预测精度和搜索效率均较高的基于动态片段长度的群体蛋白质结构预测方法。

摘要： 本发明公开了一种用于限制片段长度多态性研究的家蚕DNA抽提方法，以家蚕个体为研究对象，解剖后取后部丝腺；加入液氮后经充分研磨后，充分酶解后，用酚进行抽提后，用正丁醇浓缩后用乙醇进行沉淀；RNase处理后，经酚、氯仿抽提后，用正丁醇浓缩后用乙醇进行沉淀。严格控制实验环节，每头家蚕可抽提高纯度DNA(OD260/280＞1.9)200μg，可用于200次RFLP检测。该发明解决了目前以家蚕为材料的RFLP研究DNA纯度不高和抽提的DNA量过少的问题。

摘要： 本发明公开了一种基于片段长度多态性PCR的中药桃仁的鉴定方法，具体包括以下步骤：(1)准备好所需的原材料以及反应试剂；(2)提取步骤(1)中原材料的基因组DNA；(3)将基因组DNA、引物1、引物2、水和反应试剂构成PCR反应体系，在梯度PCR仪上，进行预变性、变性、退火、延伸、再延伸四个步骤循环若干次；(4)引物设计与筛选：从GeneBank数据库中搜集原材料基原植物或/和同属近缘种基原植物的叶绿体petA‑psbJ序列；进行序列比对后设计片段长度多态性PCR引物；将设计好的引物经过步骤(3)PCR扩增后，依据种间特异性、种内通用性原则筛选出鉴定引物；(5)PCR鉴定：经过筛选得出PCR鉴定引物为TR1和TR2；(6)PCR产物的纯化、克隆与测序。

摘要： 本发明的一种固相介质选择性提取短片段长度DNA的方法，将利用硅烷偶联试剂在表面同时修饰氨基和羧基的固相介质和不同片段长度的DNA分子混合。通过对固相介质进行表面修饰，使介质随着pH值的变化具备电荷反转特性，通过加入一定浓度的盐溶液使得不同片段DNA具有的电荷量不同，从而通过静电相互作用选择性吸附特定长度片段的DNA分子，达到高效提取，选择性提取的目的。本发明的优点在于：对DNA具有高的吸附效率和脱附效率,总提取效率高于95%，并且能够选择性分别提取不同片段长度的DNA分子，特别是小片段DNA分子，选择性分离效率高于90%，所用试剂简单经济,操作快速便捷。

摘要： 本发明公开了一种利用扩增DNA片段长度多态性测定短链RNA的方法，属于分子生物技术领域，包括以下步骤：首先利用至少两种与待测短链RNA相比无天然同源序列的合成小RNA作为测定的内标，将这些合成小RNA以不同分子数混合，形成动态小RNA标准分子梯度；再以等量的所述动态小RNA标准与所述待测短链RNA混合，经由RNA反转录、cDNA加尾、PCR同步扩增及PCR产物DNA长度多态性片段的荧光定量分析，测得所述待测短链RNA扩增产生的DNA片段荧光强度在所述动态小RNA标准荧光强度梯度上的相对比例，本方法可以实现对短链RNA尤其是miRNA的绝对定量，且具有高特异性、高灵敏度、结果客观、重复性好，可在100-106拷贝数范围内准确定量，也适用于RNA粗提物。

摘要： 本发明涉及的是一种生物技术领域的高通量扩增片段长度多态性检测方法，用两种荧光素分别标记高频内切酶和低频内切酶选择性引物，再结合测序仪进行检测，实现同时检测3类可能的酶切产物。所述的3类可能的酶切产物，是指：采用两个内切酶即识别4碱基序列的高频内切酶和识别6碱基序列的低频内切酶同时或先后切割基因组DNA或cDNA，根据片段两端的酶切位点序列，产生3类可能的片段，即高频－高频片段、高频－低频片段和低频－低频片段。本发明比只标记低频酶引物的荧光AFLP方法通量提高了约780％，所以，检测成本也将降低到原来的9.1％。

摘要： 本发明涉及一种快速导出末端限制性片段长度多态数据的方法，包含有以下几个步骤：第一步、统计分析原始T‑RFLP数据;第二步、数据的导出和保存;第三步、数据的R统计语言进行数据合并和计算。与常规的利用Genemapper软件处理数据相比较，本方法更加快速，可以实现批量处理与导出数据，减少人工挑选图谱的误差。