重组体

摘要： 目的 对上海市2013年新发现的男男性行为(MSM)人群未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)感染现况进行调查,为上海市老年人群医疗保障措施及艾滋病防治对策提供参考.方法 知情同意前提下,对新发现HIV感染者进行个案流行病学调查并采集血样,进行反转录-聚合酶链反应扩增、DNA测序与亚型鉴定.将52例≥50岁年龄组与591例＜50岁年龄组人群做相应对比,揭示该人群人口学、行为学及基因亚型的分布特征.结果 ≥50岁MSM人群亚型分析结果以CRF01_AE为主,占48.1％ (25/52),其次为CRF07_BC占26.9％(14/52),B亚型占11.5％ (6/52),CRF08_BC占3.8％ (2/52),01B亚型为9.6％ (5/52).CRF01_AE在≥50岁年龄组中的比例(48.1％)明显低于＜50岁年龄组的63.8％(x2=11.18,P＜0.05),并且在病程进展及死亡等方面差异有统计学意义,提示在≥50岁年龄组可能更容易进展到艾滋病期.结论 上海市≥50岁MSM人群感染者以上海本地户籍为主,虽然基因亚型也以CRF01 _AE亚型为主,但基因亚型呈多样性.应重视该人群亚型的发展和演变,有针对性地加强本地户籍≥50岁男性艾滋病宣传、高危行为干预,制定科学并有针对性的艾滋病防治策略.

摘要： 目的 克隆HBV临床分离株全长基因组,构建真核表达复制载体,为研究HBV的耐药机制提供基础.方法 从乙型肝炎患者血清中提取HBV DNA,PCR扩增HBV全长基因组,经SapI酶切后,克隆入pHY106载体,测序分析序列,然后用lipofectamine 2000将重组载体转染Huh7细胞,3d后收集培养上清液,ELISA检测HBsAg、HBeAg水平;Real-time PCR检测细胞培养上清液中HBV含量;Southern印迹检测细胞内HBV复制中间体.结果 获得5株HBV临床分离株均为野生型,其中基因B型3株,基因C型2株.成功构建5株HBV临床分离株的复制型质粒,在转染Huh7细胞的上清液中检测到HBsAg、HBeAg及HBV DNA,细胞内检测到HBV复制中间体.结论 成功克隆并构建了HBV 临床分离株复制型质粒,这种复制型质粒将在HBV临床分离株的耐药机制和药物敏感性等方面研究中发挥重要作用.

摘要： 正1998年,海归生物化学博士彭先生创立了深圳市赛百诺基因技术有限公司(以下简称"赛百诺公司"),成为国内基因治疗领域的开拓者,中国第一家基因治疗专业公司。1998年至2003年,赛百诺公司启动了"病毒载体与人体肿瘤抑制基因的重组体及其应用"项目开发,先后有"重组人p53腺病毒注射液"、"病毒载体与人肿瘤抑制基因的重组体及其应用"、

摘要： 转基因即转基因技术（Genetically Modified，简称GM），是指运用科学手段，从某种生物体基因组中提取所需要的目的基因，或者人工合成指定序列的基因片段，将其转入另一种生物中。使与另一种生物的基因组进行重组．再从重组体中进行数代的人工选育，从而获得具有特定的遗传性状个体的技术。该技术可以使重组生物增加人们所期望的新性状，培育出新品种。转基因技术的理论基础来源于分子生物学。人们常说的“遗传工程”、“基因工程”、“遗传转化”均为转基因的同义词。

摘要： The founder sequence reconstruction problem tries to infer the ancestral gene information from the offspring one. The Maxi mum Fragment Length problem (MFL) is an effective mathematical model for reconstructing founder sequences. Roli et al. presented a constructive heuristic algorithm to solve the MFL model. This algorithm computes the founder sequences according to the proportions of 0 entries and 1 entries, and introduces random number when the proportions of 0 and 1 entries are equal. The introduction of random information produces uncertain solutions. Aiming at this problem, in this paper, an effective improved algorithm I-R-Heric is proposed. The algorithm makes full use of the relativity between the proportion of 0 and 1 entries in the column of recombinant matrix and that of founder matrix and some other heuristic information to limit the random value effectively. Experimental results indicate that I-R-Heric can solve the MFL problem efficiently and effectively, and get much fewer breakpoints and longer fragment average length than the algorithm presented by Roli et al. In addition, when the number of recombinants and SNP sites grows large, I-R-Heric is still able to find satisfied solution to this problem very quickly. Hence it is feasible in realistic applications.%创建者序列重建问题即根据后代基因信息推断其祖先基因信息,最大片断长度问题(the Maximum Fragment Length problem,MFL)模型是求解该问题的有效模型.Roli提出一种求解MFL模型的构造性启发式算法,该算法通过0、1取值比例来确定创建者序列的取值,且通过引入随机信息来解决0、1等比例的情形,导致求解方案的不确定性.针对该问题,提出一种有效的改进算法I-R-Heric,该算法充分利用重组体和创建者矩阵的列向0、1取值比例的相关性等启发式信息,对随机取值问题做出有效限定.实验结果显示,I-R-Heric算法能快速有效地求解MFL问题,并能获得较改进前算法更少的断点个数和更长的片段平均长度.此外,在重组体序列规模较大的情况下,I-R-Heric仍具有较高的执行效率,有很好的实用价值.

摘要： 目的 了解合肥地区HIV/AIDS未治疗人群基因亚型和原发性耐药情况.方法 应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 pol区聚合酶基因,经DNA测序后进行系统进化树分析和耐药性分析.结果 收集79例合肥地区HIV/AIDS未治疗者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列65例,基因分型以CRF01-AE重组亚型最多39例(60.0％);其次依次是CRF07-BC 21例(32.3％)、B亚型4例(6.2％)和CRF08-BC1例(1.5％).1例蛋白酶抑制剂(PIs)主要耐药基因突变,2例反转录酶抑制剂(RTIs)耐药基因突变.总耐药突变率为4.6％(3/65).结论 当前合肥市主要的HIV-1流行亚型是CRF01-AE和CRF07-BC,HIV原发性耐药的发生率在国内处于较低水平.

摘要： 最小创建者集合问题(the Minimum Founder Set problem,MFS)是求解重组体的嵌合体结构或创建者集合的有效模型,提出一种求解访问题的构造性启发式算法H-MFS.在嵌合体中的最小片断长度须不小于L的模型约束下,各重组体的前L列之间及最后L列之间均不能出现断点.基于这个思想,该算法将创建者序列的基因位点分成三个部分分别构建.采用两组真实的生物数据对算法进行测试分析:1.Kreitman的果蝇乙醇脱氢酶数据；2.国际人类基因组单体型图计划发布的CEU种群样本.实验结果显示,该算法能快速有效地求解MFS问题,并且当重组体的SNP位点个数取值较大时,H-MFS仍具有较高的执行效率,有很好的实用价值.%The minimum founder set problem (MFS) is an effective computation model for constructing the mosaic patter or founder set from a set of recombinant sequences. In this paper, a practical constructive heuristic algorithm H-MFS is presented for solving the problem. Based on the intuition that there can not be any breakpoints among the fust (resp. the last) L columns under the constraints that the minimum fragment length of the mosaic must not less than L. H-MFS partitions the sites of founders into three parts and reconstructs them respectively.Experiments were conducted by using two sets of real biological data; L Kreitman' ADH data..2. the CEU population sample released by the International HapMap Project. The results indicate that H-MFS can solve the minimum founder set problem fast and effectively. Furthermore, when the number of recombinants and SNP sites grows large, H-MFS is still able to find satisfied solution to this problem very quickly. Hence it is practical in realistic applications.

摘要： 利用最大片断长度MFL(MaximumFragmentLengthproblem)模型研究创建者序列重建问题的算法.首先提出一种求解该模型的启发式算法HF,该算法采用向前探测技术确定列值,并充分利用重组体列向0、1取值比例,以及该比例与创建者矩阵的列向0、1取值比例的相关性等启发式信息.其次,通过引入基于HF算法的遗传算子,提出一种重建创建者序列的单亲遗传算法PGMFL.实验结果表明,在相同的时间约束内,PGMFL算法能获得较其他算法更少的断点个数和更长的片段平均长度,是求解创建者序列重建问题的一种有效方法.%10.3969/j.issn.1000-386x.2012.10.020

摘要： 本文通过对未经抗病毒治疗患者的人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株进行检测,了解上海地区HIV-1的亚型分布及原发耐药基因变异现状.对118例未经治疗的HIV感染者标本中HIV蛋白酶全长和部分反转录酶基因进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,经DNA测序后,进行系统进化树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与斯坦福耐药数据库比对,了解耐药突变位点.使用斯坦福REGA HIV亚型分型工具和美国国立生物技术信息中心(NCBI)HIV亚型分析工具分析,获得118例患者的HIV基因序列,基因分型分别为CRF01_AE重组体57例(48.3%)、B亚型36例(30.5%)、CRF07_BC 15例 (12.7%)、CRF08_BC 7例(5.9%)、C亚型2例(1.7%),亚型间或重组体间二重重组体(B/CRF01_AE)1例(0.8%).蛋白酶抑制剂(PI)和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率达54.2%(64/118),其中2例(1.7%)发生PI耐药,基因突变位点:M46L、Q58E.5例(4.1%)对反转录酶抑制剂产生耐药,其中对核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)的耐药率分别为3例(2.4%)和5例(4.1%).基因突变位点:NRTI为M41L、D67N、T69I/N/S、K70L、L74V、V75L、V118I、M184V、L210W/F/M/S和T215F;NNRTI为V90I、L100V、K103R/N、V106M/P/I/G、E138G/A、V179E/D/T、Y181C、G190A、H221Y、F227L、K238S和Y318F.结果提示,上海地区HIV毒株以CRF01_AE重组亚型为主,且发现新的重组体,可能出现新重组体流行趋势.PI和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率较高,且存在高度原发耐药毒株,应加强HIV-1耐药基因变异监测,科学、合理地给予抗病毒治疗.%The present paper aims to better understand the genetic diversity and drug resistance-associated mutations of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) strains isolated from 118 drug-naive individuals in Shanghai. pol gene from the patients was amplified by nest reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) and nucleotide sequencing. REGA HIV-1 Subtyping Tool and National Center for Biotechnology Information (NCBI) HIV Subtyping Tool were used to identify the subtypes of obtained sequences. Drug-resistance-associated mutations in protease and reverse transeriptase regions were analyzed with Stanford University HIV Drug Resistance Database. The results showed that CRF01_AE predominated in Shanghai with 48.3％, followed by subtype B (30.5％), CRF07_BC (12.7％), CRF08_BC (5.9％), and C (1.7％). In addition, an inter-subtype and inter-CRF recombinant B/CRF01_AE (0.8％) strain was detected. Protease inhibitor-associated primary resistance mutations were found in two (1.7％) cases: M46L and Q58E. The mutations conferring primary resistance to nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) and non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) were detected in three (2.4％) and five (4.1％) cases, respectively (NRTI: M41L, D67N, T691/N/S, K7OL, L74V, V75L, Vll8I, MI84V, L210W/F/M/S, and T215F;NNRTI: V901, L100V, K103R/N, V106M/P/I/G, E138G/A, V179E/D/T, Y181C, G190A, H221Y, F227L, K238S, and Y318F). This study reveals that CRF01_AE predominates in Shanghai. Antiretroviral drug resistance among untreated HIV-l-infected individuals is 5. 9％. More attention should be paid to the monitoring of HIV-1 drug resistance mutations. Furthermore, drug resistance should be determined in patients with acquired immunedeficiency syndrome (AIDS) before starting antiretroviral therapy.

摘要： 2011年5月以来，德国首先暴发了产志贺毒素大肠杆菌（Shigatoxin-producing Escherichia coli，STEC）O141：H4引起的人类疾病，并波及欧洲、北美等16个国家，发病总人数超过4000人，死亡50人。本次暴发的STEC O104：H4是肠聚集性大肠杆菌（Entero．aggregative Escherichiacoli，EAgg EC）和肠溶血性大肠杆菌（Entrohemorrhagic Escherichiacoli，EHEC）的重组体。

摘要： 本发明涉及抑肽酶同系物、及其核酸编码、结合核酸和其它转化细胞的载体，以及获得抑肽酶同系物的方法。

摘要： 本发明涉及抑肽酶同系物、及其核酸编码、结合核酸和其它转化细胞的载体，以及获得抑肽酶同系物的方法。

摘要： 本文描述了用于检测低频率出现的与逆转录酶和/或蛋白酶有关的一种或多种HIV序列变体的方法，所述方法包括以下步骤：(a)从HIV样品群的多种RNA分子中产生cDNA物类；(b)由cDNA物类扩增多种第一扩增子，其中各第一扩增子用能够从HIV分化体产生扩增子的核酸引物对扩增，所述HIV分化体包含分化体A、分化体B、分化体C、分化体D、分化体F和分化体G；(c)克隆扩增第一扩增子的扩增拷贝以产生多种第二扩增子；(d)测定第二扩增子的核酸序列组成；和(e)检测第二扩增子的核酸序列组成中的一种或多种序列变体。

摘要： 本发明提供一种新型的人Wnt5a‑NL核酸重组体及其制备方法与应用。本发明的人Wnt5a‑NL核酸重组体是将如SEQ ID NO:1所示的人Wnt5a蛋白截短体编码基因构建到真核表达载体上得到的重组质粒。实验表明，人Wnt5a‑NL核酸重组体注射小鼠能够抑制炎症和骨破坏，可开发用于治疗类风湿关节炎等疾病。本发明提供的核酸重组体属于治疗性质粒，可为类风湿关节炎等疾病提供一种新的治疗途径和思路。该核酸重组体治疗效果良好，且制备简单、成本低廉、稳定性好、贮存方便，适于规模化生产。

摘要： 本发明提供了含有编码狂犬病病毒抗原的插入DNA顺序的重组腺病毒DNA顺序和结合该DNA顺序的重组体腺病毒。;本发明还提供了含有有效量的重组体腺病毒和药物上可接受的赋形剂的疫苗和使哺乳动物对由狂犬病病毒诱发的疾病产生免疫能力的方法，包括将病毒或疫苗施用于哺乳动物。

摘要： 本发明涉及一种融合基因，其包含GnRH基因序列和p53基因序列，以及任选的介于GnRH基因序列与p53基因序列之间的缺氧诱导因子的氧依赖性蛋白降解结构域(ODD)的基因序列。本发明还涉及一种重组融合蛋白，和所述融合基因的表达型重组体、由其获得的工程菌，以及所述表达型重组体和融合蛋白的制药用途。根据本发明可以有效地提高p53的抗肿瘤作用。

摘要： 本发明公开了一种携带TMVP1和HSV‑TK的溶瘤腺病毒重组体、其构建方法及应用，属于医学基因工程技术领域。本发明是在人类5型腺病毒基因的E1A保守序列2区缺失第920nt‑946nt区域的27个碱基，再在Hexon高变区5的第19641nt‑19655nt区域插入编码肿瘤靶向肽TMVP1的基因序列，同时缺失E3区位于ADP基因第29477nt‑29714nt区域，构成缺失区，再在所述缺失区插入编码HSV‑TK基因的全长编码序列并引入Cla1酶切位点。本发明还公开了上述溶瘤腺病毒重组体的构建方法及应用。本发明的携带TMVP1和HSV‑TK的溶瘤腺病毒重组体兼具理想的靶向作用和强效杀伤作用。

摘要： 本发明公开了一种携带TMVP1和tBid的溶瘤腺病毒重组体、其构建方法及应用，属于医学基因工程技术领域。本发明是在人类5型腺病毒基因的E1A保守序列2区缺失第920nt‑946nt区27个碱基，再在Hexon高变区5的第19641nt‑19655nt区域插入编码肿瘤靶向肽TMVP1的基因序列，同时缺失E3区位于ADP基因第29477nt‑29714nt区域，构成缺失区，再在所述缺失区插入线粒体凋亡肽tBid的基因序列并引入Cla1酶切位点。本发明还公开了上述溶瘤腺病毒重组体的构建方法及应用。本发明的携带TMVP1和tBid的溶瘤腺病毒重组体兼具理想的靶向作用和强效杀伤作用。

摘要： 本发明公开了一种携带TMTP1和tBid的溶瘤腺病毒重组体、其构建方法及应用，属于医学基因工程技术领域。本发明是在人类5型腺病毒基因的E1A保守序列2区缺失第920nt‑946nt区27个碱基，再在Hexon高变区5的第19641nt‑19655nt区域插入编码肿瘤靶向肽TMTP1的基因序列，同时缺失E3区位于ADP基因第29477nt‑29714nt区域，构成缺失区，再在所述缺失区插入线粒体凋亡肽tBid的基因序列并引入Cla1酶切位点。本发明还公开了上述溶瘤腺病毒重组体的构建方法及应用。本发明的携带TMTP1和tBid的溶瘤腺病毒重组体兼具理想的靶向作用和强效杀伤作用。

摘要： 本发明公开了一种携带TMTP1和HSV‑TK的溶瘤腺病毒重组体、其构建方法及应用，属于医学基因工程技术领域。本发明是在人类5型腺病毒基因的E1A保守序列2区缺失第920‑946nt区域的27个碱基，再在Hexon高变区5的第19641‑19655nt区域插入编码肿瘤靶向肽TMTP1的基因序列，同时缺失E3区位于ADP基因第29477‑29714nt区域，构成缺失区，再在所述缺失区插入编码HSV‑TK基因的全长编码序列并引入Cla1酶切位点。本发明还公开了上述溶瘤腺病毒重组体的构建方法及应用。本发明的携带TMTP1和HSV‑TK的溶瘤腺病毒重组体兼具理想的靶向作用和强效杀伤作用。