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DNA探针

DNA探针的相关文献在1985年到2022年内共计701篇,主要集中在基础医学、内科学、临床医学 等领域,其中期刊论文530篇、会议论文11篇、专利文献45940篇;相关期刊276种,包括生物技术通报、微生物学报、中国防痨杂志等; 相关会议11种,包括第三届国际胸腔镜学术会暨中韩微创心脏外科论坛、全国细胞病理诊断及新进展学术论坛、第九届全国电分析化学学术会议等;DNA探针的相关文献由1586位作者贡献,包括李国辉、邵阳、庄玉辉等。

DNA探针—发文量

期刊论文>

论文:530 占比:1.14%

会议论文>

论文:11 占比:0.02%

专利文献>

论文:45940 占比:98.84%

总计:46481篇

DNA探针—发文趋势图

DNA探针

-研究学者

  • 李国辉
  • 邵阳
  • 庄玉辉
  • 刘克义
  • 吴雪琼
  • 黄炳成
  • 樊慧珍
  • 于化鹏
  • 刘毅
  • 吴国球
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  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 王智慧; 董雅坤; 池跃朋; 邸红芹; 梁亚充; 谢兰品
    • 摘要: 目的 评价荧光PCR探针熔解曲线法(简称"探针熔解曲线法")检测老年肺结核患者MTB临床分离株对一线抗结核药品耐药性的应用价值.方法 回顾性搜集2018年9月至2020年10月河北省胸科医院收治的159例年龄≥65岁的老年肺结核患者作为研究对象.所有患者肺结核诊断明确,具有影像学检查阳性体征、BACTEC MGIT 960(简称"MGIT 960")培养阳性、对硝基苯甲酸(PNB)鉴别培养基生长试验初步菌种鉴定为结核分枝杆菌(MTB).采用MGIT 960药物敏感性试验(简称"药敏试验")和探针熔解曲线法检测MTB临床分离株对利福平、异烟肼、乙胺丁醇及链霉素的耐药及突变情况.以MGIT 960药敏试验结果为参照标准,评价探针熔解曲线法的检测效能,并对两种药敏试验检测结果不一致的菌株进行耐药基因突变位点测序.结果 以MGIT 960药敏试验结果为标准,探针熔解曲线法检测MTB对利福平、异烟肼、乙胺丁醇及链霉素的敏感度分别为98.31%(58/59)、96.72%(59/61)、87.50%(35/40)及81.40%(35/43);特异度分别为97.00%(97/100)、95.92%(94/98)、81.51%(97/119)及80.17%(93/116);符合率分别为97.48%(155/159)、96.23%(153/159)、83.02%(132/159)及80.50%(128/159),Kappa值分别为0.973、0.974、0.751、0.785.两种检测方法检测MTB对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素耐药性不一致的菌株分别有4、6、27、31株,其中,探针熔解曲线法检测为耐药的菌株分别有3、4、22、23株,且经耐药基因测序均发现耐药突变位点.结论 探针熔解曲线法可快速检测出MTB耐药突变,且敏感度高、特异度强,与MGIT 960药敏试验结果一致性良好,可作为老年肺结核患者早期制定抗结核方案的依据.
    • 于佳佳; 张旭霞; 张雨晴; 任卫聪; 姚丛; 李传友; 刘毅; 唐神结
    • 摘要: 目的建立一种聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)联合CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas13a识别靶基因核酸序列对结核分枝杆菌脱氧核糖核酸(Mycobacterium tuberculosis deoxyribonucleic acid,MTB DNA)进行检测的方法。方法将MTB保守序列IS6110片段插入pMD^(TM)19-Tsimple Vector克隆载体,构建含待检测靶序列的模拟MTB质粒。同时针对待检测靶序列MTB保守序列IS6110设计可以检测MTB DNA的3条不同的特异性规律成簇间隔短回文重复序列RNA(CRISPR RNA,crRNA)探针(IS6110-lcrRNA、IS6110-2crRNA、IS6110-3crRNA),引导CRISPR-Cas13a识别转录产物。将筛选出的特异性crRNA、不同待检测标本的PCR扩增转录产物、Cas13a、crRNA和Background RNA等按比例混合构建PCR-CRISPR反应体系。利用荧光定量PCR仪对含有MTB DNA不同稀释浓度的质粒模板、标准菌株H37Rv及6种非结核分枝杆菌进行检测。通过测定的相对荧光强度值分析检测的敏感度及特异度,最终建立基于MTB CRISPR-Cas13a系统的PCR-CRISPR检测方法。结果选择相对荧光强度值最大的IS6110-lcrRNA[相对荧光强度值为197680.64(98364.94,304271.25)]作为后续MTB DNA检测的crRNA探针。PCR-CRISPR检测最低拷贝数为10^(1)拷贝/μl的质粒和10^(0)拷贝/μl的H37Rv扩增产物的相对荧光强度值[分别为38655.34(31975.51,45410.32)和17691.50(17612.36,17793.29)]明显高于阴性对照[29989.48(29435.72,30263.20)和13725.83(13652.43,13804.95)](Z=-6.713、-9.448;P值均<0.001),显示敏感度较好;阴性对照[37635.57(37168.74,38199.20)]和戈登分枝杆菌[39351.83(38903.70,39769.53)]、胞内分枝杆菌[39191.30(39018.51,39434.95)]、堪萨斯分枝杆菌[25172.20(24586.95,26046.45)]、脓肿分枝杆菌[37328.03(36959.01,37546.78)]、鸟分枝杆菌[37942.29(37455.63,38401.13)]、偶发分枝杆菌[29491.19(29148.63,30058.62)]等6种非结核分枝杆菌的相对荧光强度值均明显低于10^(6)拷贝/μl的MTE DNA质粒的相对荧光强度值[89204.07(66253.60,108819.13)](Z值均9.448,P值均<0.001),显示特异度良好。结论首次成功建立并验证了针对MTB的PCR-CRISPR检测技术,具有敏感度及特异度高、稳定性好、成本低等特点,有望进一步用于临床样本的检测。
    • 王智慧; 董雅坤; 池跃朋; 邸红芹; 梁亚充; 谢兰品
    • 摘要: 目的 评价荧光PCR探针熔解曲线法(简称"探针熔解曲线法")检测老年肺结核患者MTB临床分离株对一线抗结核药品耐药性的应用价值.方法 回顾性搜集2018年9月至2020年10月河北省胸科医院收治的159例年龄≥65岁的老年肺结核患者作为研究对象.所有患者肺结核诊断明确,具有影像学检查阳性体征、BACTEC MGIT 960(简称"MGIT 960")培养阳性、对硝基苯甲酸(PNB)鉴别培养基生长试验初步菌种鉴定为结核分枝杆菌(MTB).采用MGIT 960药物敏感性试验(简称"药敏试验")和探针熔解曲线法检测MTB临床分离株对利福平、异烟肼、乙胺丁醇及链霉素的耐药及突变情况.以MGIT 960药敏试验结果为参照标准,评价探针熔解曲线法的检测效能,并对两种药敏试验检测结果不一致的菌株进行耐药基因突变位点测序.结果 以MGIT 960药敏试验结果为标准,探针熔解曲线法检测MTB对利福平、异烟肼、乙胺丁醇及链霉素的敏感度分别为98.31%(58/59)、96.72%(59/61)、87.50%(35/40)及81.40%(35/43);特异度分别为97.00%(97/100)、95.92%(94/98)、81.51%(97/119)及80.17%(93/116);符合率分别为97.48%(155/159)、96.23%(153/159)、83.02%(132/159)及80.50%(128/159),Kappa值分别为0.973、0.974、0.751、0.785.两种检测方法检测MTB对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素耐药性不一致的菌株分别有4、6、27、31株,其中,探针熔解曲线法检测为耐药的菌株分别有3、4、22、23株,且经耐药基因测序均发现耐药突变位点.结论 探针熔解曲线法可快速检测出MTB耐药突变,且敏感度高、特异度强,与MGIT 960药敏试验结果一致性良好,可作为老年肺结核患者早期制定抗结核方案的依据.
    • 徐东芳; 王超; 包训迪; 王庆
    • 摘要: 目的 应用线性探针技术(LiPA)检测结核病的耐药情况.方法 连续纳入安徽省胸科医院2018年9—12月结核病疑似病人479例,同时用LiPA和传统BACTECTM MGIT 960快速液体法(以下简称为"MGIT 960法")进行结核分枝杆菌复合群(MTBC)检测和利福平、异烟肼药敏试验,评价其检测效能.结果 以MGIT 960法为标准,LiPA检出MTBC的灵敏度、特异度分别为96.82%和97.45%,两者差异无统计学意义(χ2=0.64,P=0.424);检测利福平耐药的灵敏度、特异度为95.18%和96.34%,检测异烟肼耐药的灵敏度、特异度为81.61%和95.72%,两者均差异无统计学意义(利福平:χ2=0.36,P=0.549;异烟肼:χ2=2.04,P=0.152).此外,LiPA检测利福平耐药株突变率最高的是S531L位点,占62.791%(54/86),异烟肼耐药株突变率最高的是单独KatG基因突变,占84.810%(67/79).结论 以MGIT 960法为标准,线性探针技术诊断耐药结核病具有灵敏度高、特异度强、快速准确的特点,能为耐药结核病的早期发现和治疗提供诊断依据.
    • 杨映晖; 伍定辉; 苏伟明; 董春萍; 姚向阳
    • 摘要: 目的 探讨基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值.方法 收集2017年6月至2018年6月厦门大学附属第一医院肺科门诊及住院的933例疑似肺结核患者初诊时采集的同一份晨痰标本,同时进行基因芯片法、GeneXpert MTB/RIF(简称"GeneXpert")和BACTEC MGIT 960液体培养及其比例法药物敏感性试验(简称"MGIT 960及其比例法药敏试验")3种方法进行结核分枝杆菌及其耐药性检测,对检测结果进行对比分析.结果 933例患者的痰标本中,基因芯片法检测出阳性484例,GeneXpert检测出阳性462例,MGIT 960培养出阳性411例.三种检测方法均为阳性的标本有395例,采用Excel表通过完全随机的方式抽取232例进行耐药性检测,以比例法药敏试验结果为参考标准,基因芯片法检测出异烟肼耐药的敏感度为86.67%(26/30),特异度为96.53%(195/202),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.798(0.682~0.914);检测出利福平耐药的敏感度为93.75%(30/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为96.55%(224/232),Kappa值为0.862(0.768~0.956);GeneXpert检测出利福平耐药的敏感度为84.38%(27/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.803(0.691~0.915);基因芯片法与GeneXpert对利福平耐药检测的一致性为96.12%(223/232),Kappa值为0.847(0.749~0.945).Kappa值均大于0.75,具有良好的一致性.结论 以MGIT 960及其比例法药敏试验结果为标准,基因芯片法敏感度、特异度和一致性高,与GeneXpert也具有良好的一致性,有助于结核病的早期诊断及防控.
    • 李爱芳; 崔晓利; 康磊; 雷静; 党丽云; 杨翰
    • 摘要: 搜集全部2017年9月至2019年8月西安市胸科医院确诊的结核病住院患者546例作为研究对象,评价荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)探针熔解曲线法(简称“熔解曲线法”)检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性的临床应用价值.收集患者痰标本,每份标本量均不少于2 ml.经菌种鉴定,最终纳入531例(株)为研究对象.每例患者采用同一标本进行BACTEC MGIT 960液体培养药物敏感性试验(简称“MGIT 960药敏试验”)和熔解曲线法耐药基因检测,对MGIT 960药敏试验和熔解曲线法检测利福平、异烟肼耐药性结果不一致者采用基因芯片法耐药基因检测对熔解曲线法结果进行验证.以MGIT 960药敏试验检测结果为参考标准,熔解曲线法检测肺结核患者痰标本MTB对链霉素耐药性的敏感度、特异度、符合率和Kappa值分别为86.67%(39/45)、99.38% (483/486)、98.31% (522/531)和0.887;检测肺结核患者痰标本MTB对异烟肼耐药性的敏感度、特异度、符合率和Kappa值分别为69.23% (54/78)、98.68% (447/453)、94.35% (501/531)和0.751;检测肺结核患者痰标本MTB对利福平耐药性的敏感度、特异度、符合率和Kappa值分别为87.50% (42/48)、96.89%(468/483)、96.05% (510/531)和0.778;检测肺结核患者痰标本MTB对乙胺丁醇耐药性的敏感度、特异度、符合率和Kappa值分别为50.00% (9/18)、98.83% (507/513)、97.18% (516/531)和0.531.在熔解曲线法检测结果为耐药而MGIT 960药敏试验为敏感的30例患者中,熔解曲线法检测结果显示:对异烟肼耐药的6例均为hatG315位密码子突变;对利福平耐药的15例中,mpB507-512、ropB521-528、mpB529-533位密码子突变分别为3例、3例、9例;对链霉素耐药的3例均为rrs 513-517位点突变;对乙胺丁醇耐药的6例均为embB 306位密码子突变.基因芯片法耐药基因检测结果显示:对异烟肼耐药的6例中katG 315 (AGC→ACC)突变和katG 315(AGC→AAC)突变各3例;对利福平耐药的15例中,ropB基因511位CTG→CCG突变、526位CAC→TAC突变和531位TCG→TGG突变各3例、3例、9例,与熔解曲线法检测结果一致.可见,荧光PCR探针熔解曲线法对链霉素、异烟肼、利福平、乙胺丁醇耐药性突变位点检测具有较好的检测效能,可用于临床上对一线抗结核药品耐药情况的快速筛查.
    • 于佳佳; 张旭霞; 张雨晴; 任卫聪; 姚丛; 李传友; 刘毅; 唐神结
    • 摘要: 目的 建立一种聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)联合CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas13a识别靶基因核酸序列对结核分枝杆菌脱氧核糖核酸(Mycobacterium tuberculosis deoxyribonucleic acid,MTB DNA)进行检测的方法.方法 将MTB保守序列IS6110片段插入pMDTM 19-Tsimple Vector克隆载体,构建含待检测靶序列的模拟MTB质粒.同时针对待检测靶序列MTB保守序列IS6110设计可以检测MTB DNA的3条不同的特异性规律成簇间隔短回文重复序列RNA(CRISPR RNA,crRNA)探针(IS6110-1crRNA、IS6110-2crRNA、IS6110-3crRNA),引导CRISPR-Cas1 3a识别转录产物.将筛选出的特异性crRNA、不同待检测标本的PCR扩增转录产物、Cas13a、crRNA和Background RNA等按比例混合构建PCR-CRISPR反应体系.利用荧光定量PCR仪对含有MTB DNA不同稀释浓度的质粒模板、标准菌株H37Rv及6种非结核分枝杆菌进行检测.通过测定的相对荧光强度值分析检测的敏感度及特异度,最终建立基于MTBCRISPR-Cas13a系统的PCR-CRISPR检测方法.结果 选择相对荧光强度值最大的IS6110-1 crRNA[相对荧光强度值为197 680.64(98 364.94,304 271.25)]作为后续MTB DNA检测的crRNA探针.PCR-CRISPR检测最低拷贝数为101拷贝/μl的质粒和100拷贝/μl的H37Rv扩增产物的相对荧光强度值[分别为38 655.34(31 975.51,45 410.32)和17 691.50(17 612.36,17 793.29)]明显高于阴性对照[29 989.48(29 435.72,30 263.20)和13 725.83(13 652.43,13 804.95)](Z=-6.713、-9.448;P值均<0.001),显示敏感度较好;阴性对照[37 635.57(37 168.74,38 199.20)]和戈登分枝杆菌[39 351.83(38 903.70,39 769.53)]、胞内分枝杆菌[39 191.30(39 018.51,39 434.95)]、堪萨斯分枝杆菌[25 172.20 (24 586.95,26 046.45)]、脓肿分枝杆菌[37 328.03 (36 959.01,37 546.78)]、鸟分枝杆菌[37 942.29(37 455.63,38 401.13)]、偶发分枝杆菌[29 491.19(29 148.63,30 058.62)]等6种非结核分枝杆菌的相对荧光强度值均明显低于106拷贝/μl的MTB DNA质粒的相对荧光强度值[89 204.07(66 253.60,108 819.13)](Z值均=-9.448,P值均<0.001),显示特异度良好.结论 首次成功建立并验证了针对MTB的PCR-CRISPR检测技术,具有敏感度及特异度高、稳定性好、成本低等特点,有望进一步用于临床样本的检测.
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