计算生物学
计算生物学的相关文献在1991年到2022年内共计392篇,主要集中在肿瘤学、基础医学、内科学
等领域,其中期刊论文386篇、会议论文5篇、专利文献730372篇;相关期刊174种,包括生物学教学、中华临床医师杂志(电子版)、国际呼吸杂志等;
相关会议5种,包括中华医学会急诊医学分会第十六次全国急诊医学学术年会、中国数学力学物理学高新技术交叉研究学会第十二届学术年会、第八届北京生命科学领域学术年会等;计算生物学的相关文献由1397位作者贡献,包括王斌、余波、刘泽媛等。
计算生物学—发文量
专利文献>
论文:730372篇
占比:99.95%
总计:730763篇
计算生物学
-研究学者
- 王斌
- 余波
- 刘泽媛
- 卢学春
- 张倩文
- 王爽
- 祝颖
- 何杰
- 刘伟
- 刘婷
- 刘杨
- 刘炜
- 向晓辉
- 彭谨
- 李海
- 杨波
- 毛骏
- 江华
- 田字彬
- 田领章
- 程娜
- 胡仁明
- 赵东升
- 郑文岭
- 马文丽
- 万梅
- 于力
- 付玉荣
- 伊正君
- 伦永志
- 伯晓晨
- 余觅
- 余鹏
- 倪铭
- 刘丽宏
- 刘家明
- 刘林
- 刘欢
- 吴建新
- 吴曙霞
- 吴汉伟
- 周志远
- 唐永平
- 唐爱发
- 夏万松
- 夏英
- 姜宏
- 孔宪琛
- 孙娜
- 孙建
-
-
李荣;
柳宇;
徐淦伟
-
-
摘要:
目的:探究MECOM在卵巢癌中的表达情况及临床意义。方法:收集Oncomine、GEPIA数据库中关于MECOM的数据信息,并对数据库中的资料进行二次分析;运用cBioportal、Coexpedia、STRING数据库分析MECOM在卵巢癌中的突变、共表达及互作蛋白情况;利用Kaplan-Meier Plotter分析卵巢癌患者MECOM mRNA的表达水平与患者预后的关系。结果:Oncomine数据库中对不同类型肿瘤有关MECOM基因的研究共353项,差异有统计学意义的有99项(高表达33项,低表达66项),其中对卵巢癌研究有10项,均显示MECOM高表达;这一结果在GEPIA数据库中也得到证实。突变分析结果显示卵巢癌患者中有30%的患者MECOM基因发生突变,突变类型包括错义突变、融合突变和截断突变。共表达分析发现了275个与其共表达的基因;蛋白互作分析发现MECOM蛋白可能与NR2E1、MTA1、HDAC1、TP53、PPARG、EZH2、JUN、MBD3、HDAC2和CTBP1蛋白有相互作用。MECOM mRNA高表达组卵巢癌患者总生存期低于低表达组(P=0.013)。结论:MECOM基因在卵巢癌中高表达,且其翻译的蛋白通过和多种蛋白相互作用发挥生物学效应,其mRNA表达水平与卵巢癌患者生存预后相关,有望为卵巢癌分子靶向治疗提供新思路。
-
-
王志强;
宫彩霞;
李振彬
-
-
摘要:
目的通过对强直性脊柱炎(AS)不同病理阶段的生物信息学进行分析,筛选出有潜在治疗作用的中药有效成分。方法从GeneCards数据库检索获得AS炎症损伤阶段和结构性损伤阶段靶点,STRING平台构建蛋白质相互作用网络,用Cytoscape软件对网络进行可视化处理并用cytoHubba插件进行拓扑分析,筛选出核心靶点。对MCODE插件分析获得的分值较高的靶点进行GO和KEGG通路富集分析,获得AS涉及的生物学功能和信号通路。根据核心靶点,在中药系统药理数据库与分析平台获取可作用于核心靶点的中药有效成分,并以口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18为条件进行筛选。最后,用Discovery Studio软件对筛选得到的中药有效成分和目前指南推荐药物的作用靶点进行分子对接验证。结果在GeneCards数据库检索获得AS炎症损伤阶段靶点103个、结构性损伤阶段靶点109个。网络分析筛选出炎症损伤阶段核心靶点为IL6、TNF、IL10、CSF2、IL17A、IL1B、CXCL8、IFNG、TLR4、IL18,结构性损伤阶段核心靶点为IL6、GAPDH、VEGFA、INS、CXCL8、CCL2、STAT3、TNF、IL1B、PTGS2,涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、类风湿关节炎、炎性肠病、疟疾、Chagas病、IL17、Th17细胞分化等信号通路。在中药系统药理数据库与分析平台筛选到的潜在中药有效成分包括槲皮素、表没食子儿茶素没食子酸酯、汉黄芩素、漆黄素和雷公藤甲素。分子对接结果显示这些中药有效成分均可与目前指南推荐药物的靶点稳定对接。结论本研究初步筛选出一些对AS有潜在治疗作用的中药有效成分,为进一步研究提供了新的思路和参考。
-
-
刘靖;
刘明学;
杨振宇;
苏毅;
纪延辉;
覃宇冰;
黄文倩;
何朝升;
黄桂珍;
杨国柱;
胡增隆
-
-
摘要:
目的对先天性肾盂输尿管连接部(ureteropelvic junction,UPJ)狭窄患儿狭窄段输尿管组织与邻近正常输尿管组织进行比较蛋白质组学研究,探索先天性UPJ狭窄的可能病因及发病机制。方法以厦门大学附属第一医院收治的30例先天性UPJ狭窄并在本院行Anderson-Hynes术的患儿为研究对象,标本离体后立即取狭窄段输尿管组织(A组,n=30)及与狭窄段远端邻近的正常输尿管组织(B组,n=30)。采用基于串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)标记的高通量蛋白质组相对定量方法对两组中的差异蛋白进行高通量筛选,随后对筛选出的差异蛋白进行平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)的靶向蛋白质组学定量验证,利用生物信息学方法对差异蛋白进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释的富集分析,并对蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行分析。结果两组标本共鉴定出蛋白质6093种,包含差异蛋白160种,其中表达上调的65种,表达下调的95种。进行PRM相对定量分析的9种目标蛋白中,碳酸酐酶1等7种蛋白质在A组与B组的蛋白含量比值,在PRM和TMT的定量结果中均小于1;磷脂酰肌醇蛋白聚糖-6和具有多重剪接的RNA结合蛋白在A组与B组的蛋白含量比值,在PRM和TMT的定量结果中均大于1。GO功能富集分析发现,两组中差异表达蛋白质在体液免疫反应、抗微生物体液反应、对真菌的反应、对真菌的防御反应和对细菌的防御反应等生物学过程的GO功能富集度具有高的显著性水平(P<0.05)。KEGG通路富集分析结果表明,氮代谢、PPAR信号通路等20条信号通路富集度具有高的显著性水平(P<0.05)。在PPI网络中,连接度最高的蛋白质是:中性粒细胞弹性蛋白酶(连接度为9)和组织蛋白酶抑制素抗菌肽(连接度为8)。结论比较蛋白质组学研究结果提示,先天性UPJ狭窄的发病与微生物感染相关,这为进一步研究先天性UPJ狭窄的病因及发病机制提供了参考。
-
-
解宇威;
刘鹏;
徐翔宇;
高瑞谦;
高雨菲;
刘奎;
李坤;
朱呈瞻;
曹景玉
-
-
摘要:
目的探究肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中糖酵解相关基因与肝细胞癌发生发展及预后的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC的RNA表达数据和临床信息。首先采用基因富集分析预测正常组织和肿瘤组织中基因富集的相关通路,筛选HCC中糖酵解相关基因,然后构建糖酵解相关基因的预后模型,获取预后相关糖酵解基因。对基因进行风险评分,利用R语言根据临床特征分组后进行生存分析。使用cBioPortal数据库,分析预后模型中基因的突变情况。最后使用RT-qPCR验证预后模型中基因在HCC的表达。结果基因富集分析显示,正常样本和肿瘤样本的基因显著富集于糖酵解通路。Cox回归分析筛选出了3个与预后相关的糖酵解基因(B3GAT3、NDC1、KIF20A),ROC曲线AUC值显示预后相关的糖酵解基因能预测HCC患者的临床预后,生存分析显示基因高表达组患者的总体生存率比低表达组患者更差(P<0.001)。cBioPortal数据库分析B3GAT3发生扩增、深度缺失和错义突变的概率为1.1%,NDC1发生扩增和错义突变的概率为0.6%,KIF20A发生扩增和错义突变的概率为0.8%。RT-qPCR结果显示B3GAT3、NDC1、KIF20A在HCC组织中均为高表达。结论糖酵解相关基因B3GAT3、NDC1、KIF20A与HCC的预后相关,为后续进一步探究其在HCC中的作用机制提供了依据。
-
-
叶乃郗;
何杰;
李小燕;
余觅;
张维;
孙建
-
-
摘要:
目的利用肿瘤相关数据库探讨DNA聚合酶εB亚基(POLE2)基因在肺腺癌中的表达及其对生存预后的影响。方法使用GEPIA数据库和Oncomine数据库分析不同肺腺癌数据集中POLE2 mRNA的表达情况,利用Kaplan-Meier Plotter进行POLE2表达水平与肺腺癌病人总生存期的相关性分析。利用cBioPortal数据库和LinkedOmics数据库分析肺腺癌组织中的POLE2表达相关基因。利用Enrichr数据库和STRING数据库对POLE2表达相关基因进行富集分析,利用TIMER数据库了解POLE2与免疫细胞的关系。结果与正常肺组织比较,肺腺癌组织中POLE2 mRNA水平呈高表达(|log_(2)FC|=0.5,P<0.01)。高表达POLE2的肺腺癌病人总生存期更短(χ^(2)=9.134,P<0.01)。与POLE2表达相关基因共37个。GO分析显示,POLE2表达相关基因主要富集在DNA聚合酶的激活、DNA的复制、DNA的修复等生物学过程。KEGG通路分析显示,POLE2表达相关基因主要参与了碱基切除修复、DNA复制、核苷酸切除修复等信号通路。蛋白相互作用分析显示,PRIM2、POLA1、POLA2、CDC45等基因与POLE2有潜在的或密切的相互作用。POLE2基因在肺腺癌免疫微环境中与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞均无明显相关性。结论POLE2在肺腺癌组织中呈高表达,且其表达水平与肿瘤预后具有相关性,POLE2在肺腺癌中的高表达预示病人预后不良。
-
-
孙东旭;
朱文静;
金志朋;
刘华元;
朱朋程;
史光军
-
-
摘要:
目的 基于细胞周期调控相关基因构建新的肝癌预后模型,为预测肝癌的预后及肿瘤治疗提供新的思路和方向。方法 肝癌病人的mRNA表达谱和临床数据收集于TCGA肿瘤数据库、GEO基因表达数据库和ICGC肿瘤基因数据库。通过R软件分析筛选肝癌的差异表达基因,并通过通路与基因功能富集(PPEA)方法确定与细胞周期相关的基因集。使用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier曲线联合确定与肝癌预后相关的细胞周期调控基因,使用Lasso Cox回归模型构建和验证肝癌预后模型。最后使用3对临床样本进行二代测序验证基因表达水平。结果 通过差异筛选和基因富集分析以及单因素Cox回归分析,找到24个细胞周期调控基因与肝癌病人预后相关(HR>1,FDR1,P<0.001)。临床样本测序结果验证显示,大部分肝癌细胞周期调控预后基因在肝癌组织中存在显著高表达。结论 本研究构建了细胞周期调控相关基因的肝癌病人预后模型,为肝癌病人的预后预测和治疗提供新的思路和分子治疗靶点。
-
-
陈晓霞;
刘向荣;
李建蓉;
李致远;
张桓虎;
路晓庆
-
-
摘要:
目的筛选与雌激素受体(ER)α结合力最好的中药成分并验证其抗胃腺癌效果。方法通过生物信息学比较雌激素受体基因与胃腺癌中的相关性并评估雌激素受体1基因表达量与胃腺癌患者预后的关系。借助分子对接对比20种中药成分与ER-α结合性能,采用噻唑兰(MTT)实验验证甘草素抗胃腺癌效果并通过抗体封堵实验验证甘草素的作用靶标蛋白。结果ESR1在肿瘤组织比正常组织中表达低,是影响患者首次进展生存期的独立因素。20种黄酮类物质中与ER-α对接能力最好的为甘草素。与空白对照相比,300μmol/L、500μmol/L、1000μmol/L甘草素组胃癌细胞抑制率均升高[分别为18.0±4.8、16.9±2.5、54.1±4.7;均P<0.05],甘草素+ER抗体组与甘草素组相比,胃癌细胞抑制率降低[分别为31.3±0.7、46.2±0.3;P<0.05]。结论甘草素与ER-α对接能力最强,可激活ER-α抑制胃腺癌进展,有望成为胃腺癌治疗的新药物。
-
-
刘玲玲;
王国佐;
李子滢;
李晟;
陈彦霖;
林霞;
黄娟;
秦莉花
-
-
摘要:
目的基于生物信息学技术分析老年自发性脑出血的相关通路及关键基因。方法2021年9—10月,从基因表达数据库(GEO)下载GSE24265数据集,从其中选取4个血肿周围区域样本作为实验组,相应的4个对侧灰质样本作为对照组。采用R软件及相关安装包进行数据预处理、差异基因的筛选和GO功能、KEGG通路富集分析及基因集富集分析(GSEA),采用STRING数据库对差异基因制作蛋白质互作网络(PPI),采用MCOD、cytoHubba插件进行关键基因的筛选,利用韦恩图在线工具确定老年自发性脑出血的关键基因。结果箱式图分析结果显示,各个样本中位数基本在一个水平线上,提示样本间归一化程度好;主成分分析(PCA)散点图和统一流形逼近与投影(UMAP)图分析结果显示,各组的样本基本分开,提示后续差异分析有意义的结果可能会较多。两组样本数据比较共有415个差异基因,其中高表达53个、低表达362个。GO功能富集分析共得到226条有明显差异的GO条目,包括145条生物过程(BP)条目、44条细胞组成(CC)条目、37条分子功能(MF)条目,差异基因介导的BP主要富集于化学突触传递的调节、突触信号转导的调控、神经元投射发育的调节等,CC主要富集于突触膜、突触后密度蛋白、谷氨酸能突触等,MF主要富集于阳离子通道活性调控、门控通道活性调控、钙离子跨膜转运蛋白活性调控等。KEGG通路富集分析结果显示,差异基因主要富集于轴突导向信号通路、催产素信号通路、肥厚型心肌病等17条通路。GSEA结果显示,共有734个基因集,其中显著富集的基因集共有364个,包括人体补体系统、无意义介导的衰变、流感病毒感染等。最终筛选出老年自发性脑出血的关键基因为RPS6、RPL8、FAU、RPL35、RPS5、RPS19、RPLP1。结论与老年自发性脑出血发病机制有关的信号通路包括轴突导向信号通路、催产素信号通路、肥厚型心肌病等;其关键基因为RPS6、RPL8、FAU、RPL35、RPS5、RPS19、RPLP1。
-
-
李雪丽;
曹彩霞;
宋洁;
冯文静;
钟丽娜;
杨学成
-
-
摘要:
目的 运用生物信息学方法分析筛选嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(PCPG)核心差异表达基因(DEGs)。方法 通过基因表达综合数据库(GEO)获取GSE60458微阵列芯片数据,应用在线NetworkAnalyst 3.0系统鉴定DEGs, KOBAS v3.0平台分析预测DEGs的作用通路,STRING v11.0工具绘制核心DEGs蛋白质相互作用网络图,GEPIA2平台验证核心DEGs表达水平。结果 从GSE60458芯片中共获得1 903个DEGs,其中表达上调基因864个,表达下调基因1 039个。GO分析共富集1 593条通路,KEGG通路分析共富集145条通路。10个核心DEGs(CYP11A1、CYP11B1、CYP11B2、CYP17A1、HSD3B2、HSD3B1、STAR、SULT2A1、NR4A1、EGR4)主要参与甾类激素的生物合成过程。与Normal组相比较,PCPG组病人CYP11A1、CYP11B1、CYP11B2、CYP17A1、HSD3B2、STAR和SULT2A1等7个核心DEGs的表达水平显著下调(P<0.05),而HSD3B1、NR4A1和EGR4等3个核心DEGs表达水平无明显变化。结论 本研究筛选出的核心DEGs可能影响甾类激素的生物合成,参与调控PCPG的发生发展。
-
-
刘婷;
张红;
万亿;
李晓宇;
任明翰;
王斌;
田字彬
-
-
摘要:
目的基于生物信息学方法筛选肿瘤微环境(TME)中与胃癌进展和预后相关的潜在关键基因。方法通过对TCGA数据库中胃癌及癌旁正常组织样本的转录组RNA-Seq数据进行生物信息学分析,筛选出在TME中与胃癌患者生存和预后密切相关的基因。通过R语言软件计算胃癌组织样本中基质成份及免疫成份比例,获得基质评分和免疫评分,并分析患者生存率、临床病理特征与基质评分、免疫评分的相关性;采用R语言软件分析获得胃癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因(DEGs),并进行KEGG和GO富集分析;通过构建蛋白质相互作用网络(PPI)及利用单因素COX回归分析进一步筛选出显著DEGs;对显著DEGs进行样本配对分析,获得关键DEGs;对关键DEGs进行患者生存率及其与临床病理特征相关性分析;再对关键DEGs进行基因集富集分析(GSEA);最后通过CIBERSORT计算方法获得肿瘤浸润性免疫细胞(TICs)的类型,并对TICs类型和比例与关键DEGs的表达水平进行相关性分析。结果基质和免疫评分与患者生存率的相关性分析显示,高基质评分与患者生存率呈负相关,与胃癌grade分级、Stage分期、TNM分期的T分期显著相关(P<0.05);对通过R语言软件初步筛选出的1305个DEGs进行KEGG富集分析显示,这些DEGs主要参与了免疫应答过程,GO富集分析显示大部分DEGs主要参与免疫应答过程;对分析获得的显著DEGs进行样本配对分析,获得F13A1、MCEMP1两个关键DEGs,对关键DEGs的患者生存率及其与临床病理特征相关性分析显示,F13A1、MCEMP1高表达与患者生存率呈负相关,与胃癌患者的临床病理特征grade分级、Stage分期、TNM分期的T、N分期呈正相关(P<0.05);关键DEGs的GSEA结果表明,F13A1、MCEMP1高表达主要集中在免疫相关通路;关键DEGs与TICs的相关性分析表明,F13A1的高表达与8种TICs存在显著相关性(P<0.05),MCEMP1的高表达与14种TICs存在显著相关性(P<0.05)。结论F13A1、MCEMP1可能是胃癌TME中与TICs密切相关并影响胃癌进展和预后的潜在关键基因,可以为胃癌的防治提供新的靶点。
-
-
LU Zuokun;
卢作焜;
ZHANG Aili;
张爱莉
- 《河南省农产品加工与贮藏工程学会第四次学术年会》
| 2017年
-
摘要:
纤维素是自然界中分布最广、含量最多的一种多糖有机物.纤维素酶可以特异性降解纤维素产生生物燃料,是未来生物能源发展的重要方向之一.野生型纤维素酶通常存在热穗定低、终端产物抑制、酶解效率低、生产成本高等问题.通过蛋白质工程和计算生物学的方法对纤维素酶的各个结构域(催化结构域、碳化合物结合模块、Linker等)进行分子改造,是开发高效纤维素酶的重要手段.本文对纤维素酶各个结构域在蛋白质工程学方面取得的最新进展作了综述.近期研究的发展方向,一是更多地利用计算生物学的方法来研究酶特性,然后在实验中进行验证;二是利用蛋白质工程手段开发纤维素酶辅助蛋白,提升酶降解纤维素的能力.
-
-
彭谨;
蒋忠林;
江华;
蔡斌;
孙明伟;
曾俊
- 《中华医学会急诊医学分会第十六次全国急诊医学学术年会》
| 2013年
-
摘要:
目的:应用系统生物学方法 ,研发一种基于转录组表达谱的基因网络可视化工具,以直观显示急性心肌梗塞后早期的转录组和代谢调控的整体变化.方法:在美国国立卫生研究中心(NCBI)GEO数据库下载编号为GDS2331的一个急性心肌梗塞后大鼠心脏左心室的基因芯片表达文件,其平台编号为GPL83.筛选实验时间在15min,60min,4h,12h,24和48h的假手术和急性心肌梗塞模型亚组数据,利用Mathwork bioinformatics toolbox工具包将数据转化为计算机可读的结构体.利用模式识别算法剔除表达背景噪声;最后获得心肌梗塞建模后表达模式扰动最明显的基因谱.利用K-mean算法对这些基因进行分类,并进行基因本体分析(gene ontology,GO).进而将有关通路标定在京都基因和基因组百科数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)中,形成基因组-表达谱系统分析.结果:共有1400个基因被筛选出来。在损伤后的前48小时,这些基因的变化模式可归为16类。根据可以获:得Gene Ontology的分析发现:在生物学过程上,心肌梗塞后早期调控发生改变主要和发育基因相关,其中主要包括蛋白激酶日信号传导途径,中枢神经系统发育途径,以及cytochalasin B调控相关途径。在分子功能上,这些功能主要和磷酸化,肌动蛋白的结合以及核酸的配对解离有关。在细胞成分上,主要和细胞内外膜相结构之间的联系,高尔基复合体,出胞作用,以及细胞骨架特别是dynactin complex等结构有关。KEGG作图标记可显示在分子调控传导路径当中,受到影响的基因很可能通过该传导通路的上下游分子进行调控。如以肌动蛋白为核心的细胞骨架信息传导途径的调控中,GF RTKVav/tiam Rac MLCK Myosin整个调控途径中的分子都有相同的调控模式。结论:利用系统生物学技术可以实现急性心肌梗塞后基因表达波动模式的可视化描述。这些模式可以反映了基因表达在不懂时间点质和量上的表达差异。结合Geneontology的基因语义功能学上的研究和基于KEGG的作图法是一种有力的联合分析工具,前者可以直观的展示扰动的基因在功能上的共同点,后者可以显示在特定细胞网络中哪些基因受到了影响。
-
-
- 《中国数学力学物理学高新技术交叉研究学会第十二届学术年会》
| 2008年
-
摘要:
细胞色素酶P450是一种非常重要的药物代谢酶,代谢降解大约百分之四十到五十的药物分子,并且显示了基因多态性。本文通过现在分子模拟技术,模拟了CYP2C9,CYP2C19和CYP2D6与药物分子的相互作用,发现了这三种CYP450酶代谢药物的关键氨基酸.我们得到的这些结果,为深入研究CYP450酶与药物的相互作用奠定了基础,为个性化药物计和研究提供了理论基础.
-
-
- 《第八届北京生命科学领域学术年会》
| 2008年
-
摘要:
随着蛋白质组学和质谱技术的发展,临床质谱分析技术已在恶性肿瘤早期诊断等方面显示了良好的应用前景,因此,如何管理好和利用好基于临床样本的海量质谱数据具有重要意义.为此,我们开发了一个完整的集临床信息与质谱数据为一体的综合性管理及分析系统BioSunMS,不仅支持多种质谱数据格式,而且还集成了分类和聚类等多种统计学方法,最终为基于质谱数据的临床诊断、疾病分型、生物标志物发现和个性化治疗等研究提供了有力的技术支持.
-
-
- 《第八届北京生命科学领域学术年会》
| 2008年
-
摘要:
随着蛋白质组学和质谱技术的发展,临床质谱分析技术已在恶性肿瘤早期诊断等方面显示了良好的应用前景,因此,如何管理好和利用好基于临床样本的海量质谱数据具有重要意义.为此,我们开发了一个完整的集临床信息与质谱数据为一体的综合性管理及分析系统BioSunMS,不仅支持多种质谱数据格式,而且还集成了分类和聚类等多种统计学方法,最终为基于质谱数据的临床诊断、疾病分型、生物标志物发现和个性化治疗等研究提供了有力的技术支持.
-
-
- 《第八届北京生命科学领域学术年会》
| 2008年
-
摘要:
随着蛋白质组学和质谱技术的发展,临床质谱分析技术已在恶性肿瘤早期诊断等方面显示了良好的应用前景,因此,如何管理好和利用好基于临床样本的海量质谱数据具有重要意义.为此,我们开发了一个完整的集临床信息与质谱数据为一体的综合性管理及分析系统BioSunMS,不仅支持多种质谱数据格式,而且还集成了分类和聚类等多种统计学方法,最终为基于质谱数据的临床诊断、疾病分型、生物标志物发现和个性化治疗等研究提供了有力的技术支持.
-
-
- 《第八届北京生命科学领域学术年会》
| 2008年
-
摘要:
随着蛋白质组学和质谱技术的发展,临床质谱分析技术已在恶性肿瘤早期诊断等方面显示了良好的应用前景,因此,如何管理好和利用好基于临床样本的海量质谱数据具有重要意义.为此,我们开发了一个完整的集临床信息与质谱数据为一体的综合性管理及分析系统BioSunMS,不仅支持多种质谱数据格式,而且还集成了分类和聚类等多种统计学方法,最终为基于质谱数据的临床诊断、疾病分型、生物标志物发现和个性化治疗等研究提供了有力的技术支持.
-
-
-