蛋白质功能

摘要： 蛋白质相互作用网络的构建可以为探究茶树生长过程中的关键蛋白并预测其功能提供理论参考。以贵州都匀地区福鼎大白茶为研究对象,利用三代Nanopore测序技术和同源比对方法构建福鼎大白茶根、茎、叶差异基因蛋白质相互作用网络,通过网络进一步预测关键蛋白及其功能。结果表明,叶与根、叶与茎、茎与根和根茎叶差异基因蛋白质相互作用网络中的关键蛋白分别为53、39、42和53个,并且预测出了关键蛋白的功能,如TEA003744的功能可能为腺苷酸激酶活性、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性和ATP结合,参与光合作用和蛋白质磷酸化过程;TEA026776可能为发育蛋白,参与细胞分化过程和蛋白质磷酸化过程,还具有ATP结合活性和蛋白激酶活性;TEA019056的功能可能为ATP结合、GTP结合和GTP酶活性,参与过氧化物酶体组织的组成和蛋白质磷酸化等。随后预测出4个网络中打分最高功能模块的功能,并进行拓扑属性分析、功能模块分析、集群注释和聚类分析。研究结果可为鉴定蛋白质的功能、寻找关键蛋白及选育优良品种等提供理论依据。

摘要： 蛋白质是生命的物质基础,通过与不同生物分子间的相互作用在生物体内执行着各项重要工作,其功能与结构直接相关。因此,解析蛋白质及其复合物高阶结构对于深入理解蛋白质功能、生理现象及药物研发具有重要意义。过去的60余年,随着X-射线晶体衍射(X-ray)、核磁共振(NMR)以及冷冻电镜(cryoEM)等技术的出现和不断发展,蛋白质结构解析取得了长足发展。

摘要： 结合新型冠状病毒在人体细胞内的生命活动,从构成冠状病毒的重要物质、冠状病毒RNA复制聚合酶的催化作用、冠状病毒S蛋白的传递信息作用与E蛋白的离子运输作用等方面深度理解蛋白质的功能,帮助学生树立生命观念和增强社会责任感。

摘要： 创建用于精准医疗的纳米级计算机,长期以来一直是许多科学家和医疗机构的梦想。现在,美国宾夕法尼亚州立大学研究人员首次研制出一种纳米“计算机”,可控制参与细胞运动和癌症转移的特定蛋白质的功能。这项发表在2021年7月16日《自然·通讯》上的研究,为构建用于癌症和其他疾病的复杂设备铺平了道路。宾夕法尼亚州立大学医学院尼古莱·多霍利安教授及其同事创造了一个类似晶体管的“逻辑门”,可执行计算操作,由多个输入控制一个输出。

摘要： 创建用于精准医疗的纳米级计算机,长期以来一直是许多科学家和医疗机构的梦想。现在,美国宾夕法尼亚州立大学研究人员首次研制出一种纳米“计算机”,可控制参与细胞运动和癌症转移的特定蛋白质的功能。这项发表在《自然·通讯》上的研究,为构建用于癌症和其他疾病的复杂设备铺平了道路。

摘要： 创新能力的培养已成为高等教育教学改革的重要内容,创新能力也是新世纪高素质人才必备能力之一.课堂教学是培养高校学生创新能力的重要环节,教师应把对学生创新意识与创新能力的激发和培养融入教学设计中去.“生物化学”是生物类专业的一门专业基础课,学习课程时,学生专业知识的积累与创新能力的培养同等重要.“蛋白质结构与功能的关系”是其知识体系中的一个重要知识点,本文围绕学生创新能力培养这一目标,从教学目标、教学理念、教学重难点、教学方法、教学过程等几个部分对这一节段的教学进行重新设计,并在教学设计中利用人类相关疾病及其背后人、物、事,设置系列启发式问题,以及引入学科前沿成果等系列策略来激发和培养学生的创新意识与能力.

摘要： 灰盖鬼伞在25°C以及12 h光照/12 h黑暗的环境下形成子实体.子实体最初在黑暗环境下通过大量生产菌丝分支形成初级菌丝结.光照信号触发初级菌丝结开始形成紧密的二级菌丝结.在随后原基发育的5d中,菌盖和菌柄开始按照不同的光调控模式从这些菌丝结中分化,然后在第6天成熟.为了了解菌盖和菌柄组织形成时复杂的细胞过程,提取了原基各期的蛋白质组进行MS/MS质谱分析.结果显示,在不同的样本中检测到大约1672～2663个至少具有2个肽的蛋白,其中1401个蛋白是所有样本共有的,其中包含已知的涉及原基发育的蛋白.

摘要： UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分.UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息.UniProtKB知识库分Swiss-Prot和TrEMBL两个子库.Swiss-Prot子库中50多万条序列均由人工审阅和注释,而TrEMBL子库中1.4亿多条序列是由核酸序列数据库EMBL中的蛋白质编码序列翻译所得,并由计算机根据一定规则进行注释.UniParc归档库将存放于不同数据库中的同一个蛋白质归并到一个记录中以避免冗余,并赋予序列唯一性特定标识符.UniRef参考序列集按相似性程度将UniProtKB和UniParc中的序列分为UniRef100、UniRef90和UniRef50三个数据集.UniProt网站为用户提供了高效实用的高级检索系统和大量帮助文档.UniProt数据库每4周发布新版的同时也发布统计报表,用户可通过统计报表了解该数据库的数据量及更新情况、数据类别和物种分布等基本信息,查看常规注释信息、序列特征注释信息和数据库交叉链接等统计数据.UniProt是目前国际上序列数据最完整、注释信息最丰富的非冗余蛋白质序列数据库,自本世纪初创建以来,为生命科学领域提供了宝贵资源.

摘要： 2019年5月8日,北京大学陈鹏课题组与王初课题组发展了一种在活体细胞或动物内瞬时激活蛋白质的普适性新技术,具体成果以长文形式在Nature上在线发表题为Time-resolved protein activation by proximaldecaging in living systems文章。在复杂的生命体系中原位研究蛋白质功能具有重要的科学意义,但目前适用此类研究的技术十分有限。蛋白质原位激活的“功能获得型”方法具有高灵敏度和时间分辨率,但对于绝大多数蛋白质来说,目前还缺乏这类原位激活的技术手段。

摘要： 目的: 通过蛋白质组技术鉴定针刺抗哮喘血清中差异蛋白,明确针刺抗哮喘效应的物质基础。rn 方法: 采用蛋白质双向电泳技术,对针刺抗哮喘血清进行蛋白质组份差异分析,并对差异蛋白质点进行质谱鉴定。rn 结果:rn ①双向电泳显示,与其它组相比,ADX_Acup组血清与哮喘针刺组血清有一个明显深染的蛋白点（MW=44.1kD,PI=5.1）,质谱结果为60S核糖体蛋白L13或假想蛋白FLJ32191。rn ②双向电泳显示,与其它组相比,ADX_Acup组血清有两个高峰度蛋白点（MW=39.8kD,PI=4.9和MW=39.5kD,PI=5.0）,质谱分析表明依次为锌指蛋白208、甲状腺激素受体相关蛋白。rn ③双向电泳显示,ADX_Acup组血清中有两个明显区别于其他组的特有蛋白点（MW=17.3kD,PI<4.5和16.9kD,PI<4.5）.质谱分析表明依次为亲环蛋白A、锌指蛋白91。rn 结论: 针刺治疗哮喘,是整体调整的多靶点效应,并与免疫调节、基因表达、蛋白质合等密切相关,针刺应答蛋白质功能有待深入研究。

摘要： 环境应答蛋白研究的常用方法有:ELISA、Westernblot和dotblot.使用这些方法的先决条件是采用不同层析和基因工程制备高纯度的抗原和抗体.高通量、高灵敏度和规模化的双向凝胶电泳-质谱是目前最流行和较可靠的技术平台;酵母双杂交技术已被用于研究蛋白质连锁群和蛋白质功能网络系统,且分别发表于Nature与Science.生物信息学方法在蛋白质组学研究领域亦得到有效的利用,其中突出的代表是Eisenberg等联合采用系统发育分布图(phylogeneticprofiles)法、Rosettastone法和基因邻居法,成功地建立了酵母SIR(沉默信息调节子,silencinginformationregulator)作用网络和酵母朊病毒(prion)功能连锁网络.研究蛋白质空间结构的方法有X射线衍射和核磁共振方法;研究蛋白质功能的方法有:蛋白质合成的抑制和激活剂、抗原和抗体的微注射、knockout或knockin、转基因动物等.总之,蛋白质的研究方法要远比基因研究复杂得多和更为重要,而且在劳动卫生与环境卫生学的研究中具有重要的理论意义和潜在的实用价值.

摘要： 本发明涉及与粉碎或切断洋葱等植物时发生催泪成分的生成有关的表现出将1－丙烯次磺酸转变为催泪成分的作用的蛋白质或多肽、编码该蛋白质或多肽的DNA(催泪成分合成酶基因)、使用用于属于葱属植物的催泪成分合成酶基因分离的引物以及使用该引物分离该基因的方法、含有上述DNA的重组载体、包含含有上述DNA的重组载体的转化体、对用含有上述DNA的重组载体转化的宿主细胞进行培养制造具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽的方法、具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽、以及具有抑制具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽的mRNA翻译的功能的核酸分子。

摘要： 本发明具有如下步骤：(a)将微凹版与基板重迭的步骤，所述微凹版是由微小凹部构成，于所述微小凹部内具有核酸与无细胞蛋白质合成系统；(b)在所述微小凹部内，根据所述核酸，进行转录反应与蛋白质或胜肽合成反应；(c)将在所述微小凹部内合成的所述蛋白质或胜肽固定在所述基板上。

摘要： 本发明具有如下步骤：(a)于由具有特定开口形状的微小凹部构成的微凹版中，于所述微小凹部内准备核酸与无细胞蛋白质合成系统的步骤；(b)以与在所述微小凹部中合成的下述蛋白质或胜肽相接触的方式将基板与所述微凹版重迭的步骤；(c)于所述微小凹部内，使用所述无细胞蛋白质合成系统，由所述核酸来合成蛋白质或胜肽，并将所述蛋白质或胜肽沿着所述微小凹部所具有的特定开口形状固定在所述基板上的步骤。

摘要： 由下述氟树脂形成了与蛋白质或包含蛋白质的组合物接触的表面的容器及用于制造蛋白质或包含蛋白质的组合物的器材具有显著的低蛋白质吸附性，其中，所述氟树脂为选自四氟乙烯‑六氟丙烯系共聚物及四氟乙烯‑全氟烷基乙烯基醚系共聚物中的至少1种氟树脂，并且，所述氟树脂的熔点为320°C以下，所述氟树脂中的相对于每1×10

摘要： 本发明提供能减小使用了特异性地结合的物质的测定中的由肝型脂肪酸结合蛋白质引起的测定值的变动幅度的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂、评价该制剂的方法、制作肝型脂肪酸结合蛋白质的校准曲线的方法、以及定量该蛋白质的方法。一种用使用了用10mM的氧化剂在25°C下进行1小时的氧化处理的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂的测定值与使用了未进行上述氧化处理的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂的测定值的比表示的氧化变动系数设定为1.4以下的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂、用于该制剂的肝型脂肪酸结合蛋白质、编码该蛋白质的DNA、由该DNA转化得到的细胞、该蛋白质的制造方法、评价该制剂的方法、抑制使用该制剂的测定中的测定值的变动幅度的方法、制作该蛋白质的校准曲线的方法、以及定量该蛋白质的方法。

摘要： 本发明提供一种糖化蛋白质测定试剂，其至少包含Trinder’s试剂、4‑氨基安替比林、蛋白酶、蛋白酶的稳定剂以及亚铁氰化物，其中，至少Trinder’s试剂包含在含有Trinder’s试剂的部分组合物中，至少4‑氨基安替比林包含在含有4‑氨基安替比林的部分组合物中，蛋白酶的稳定剂是使亚铁氰化物与该蛋白酶的稳定剂混合后的氧化还原电位大于0.058V的稳定剂，氧化还原电位是包含蛋白酶的稳定剂和亚铁氰化物、不包含糖化蛋白质的反应体系的氧化还原电位。

摘要： 本发明提供能够以优异的安全性将蛋白质导入到细胞中的蛋白质导入方法。通过使目标蛋白质承载在由粘土矿物构成的蛋白质导入用载体上并将其添加到细胞中，可以将所述目标蛋白质导入到所述细胞内中。所述粘土矿物优选为层状粘土矿物，可以使用蒙脱石、蛭石、伊利石等。

摘要： 由具有糖蛋白生成抑制活性的序列表中序列1记载的氨基酸序列构成的蛋白质、其变异体蛋白质、由序列表中序列2记载的核苷酸序列组成的DNA、其DNA变异体以及使用上述蛋白质和DNA的糖蛋白异常症(例如囊性纤维化症)的包括基因治疗在内的治疗药。

摘要： 本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置和一种蛋白质功能预测方法及装置，该蛋白质功能预测模型生成方法，包括：获取训练蛋白质的氨基酸序列特征矩阵；基于训练蛋白质的氨基酸序列特征矩阵，获取第一特征矩阵；第一特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸序列中相互作用位点对应；根据第一特征矩阵和第一特征矩阵对应的数据标签训练预先构建的初始模型，得到蛋白质功能预测模型。氨基酸序列特征矩阵包含了训练蛋白质氨基酸序列的深层特征，避免了氨基酸序列表面特征的歧义性，能够更加准确的表达训练蛋白质的功能特征，并且排除了氨基酸序列中与蛋白质相互作用能力无关的氨基酸残基对蛋白质功能预测的干扰，从而提高了预测的准确率和精度。

摘要： 本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置和一种蛋白质功能预测方法及装置，该蛋白质功能预测模型生成方法，包括：获取训练蛋白质的氨基酸序列特征矩阵；基于训练蛋白质的氨基酸序列特征矩阵，获取第一特征矩阵；第一特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸序列中相互作用位点对应；根据第一特征矩阵和第一特征矩阵对应的数据标签训练预先构建的初始模型，得到蛋白质功能预测模型。氨基酸序列特征矩阵包含了训练蛋白质氨基酸序列的深层特征，避免了氨基酸序列表面特征的歧义性，能够更加准确的表达训练蛋白质的功能特征，并且排除了氨基酸序列中与蛋白质相互作用能力无关的氨基酸残基对蛋白质功能预测的干扰，从而提高了预测的准确率和精度。