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蛋白相互作用

蛋白相互作用的相关文献在1995年到2023年内共计339篇,主要集中在基础医学、分子生物学、生物化学 等领域,其中期刊论文196篇、会议论文2篇、专利文献166154篇;相关期刊133种,包括生物技术通报、生物技术通讯、微生物学报等; 相关会议2种,包括中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十次学术研讨会暨中国病理生理学会动物病理生理专业委员会第十九次学术研讨会、第18次全国干扰素及细胞因子学术会议等;蛋白相互作用的相关文献由1180位作者贡献,包括俞汝勤、楚霞、蒋健晖等。

蛋白相互作用—发文量

期刊论文>

论文:196 占比:0.12%

会议论文>

论文:2 占比:0.00%

专利文献>

论文:166154 占比:99.88%

总计:166352篇

蛋白相互作用—发文趋势图

蛋白相互作用

-研究学者

  • 俞汝勤
  • 楚霞
  • 蒋健晖
  • 沈国励
  • 尹兑荣
  • 易犁
  • 吴战
  • G·A·弗琳
  • H·U·斯蒂尔兹
  • M·斯坦克瓦
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 张强; 杜鹏程; 满春蕊; 孙倩
    • 摘要: 目的采用网络药理学方法研究银杏叶治疗心绞痛(angina pectoris,AP)的生物机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选银杏叶的化学活性成分,收集作用靶标;采用CTD、TTD、Drugbank、OMIM和Gene Cards数据库检索AP相关靶点。采用Cytoscape软件构建成分-靶点-疾病网络图,利用STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络图,并对相关靶点进行GO功能富集分析、KEGG信号通路分析。结果筛选后获得银杏叶有效成分30个,治疗AP的潜在靶点基因111个。有效成分槲皮素、山柰素、阿魏酸等,主要作用于PIK3CG、MAPK14、NOS3、AKT1等关键靶点,通过流体剪切应力动脉粥样硬化、PI3K-Akt、MAPK、钙信号通路等通路,发挥抗炎、抗氧化、抗凋亡、调节离子通道等功能治疗AP。结论利用中药"多成分-多靶点-多通路"的特点,探究银杏叶治疗AP的潜在作用机制,为银杏叶治疗AP以至扩大适应证的后续科学研究及临床应用提供了一定参考。
    • 武静桥; 吴玉姝; 范真玮; 姚景丽; 何敬文; 陈婷; 赵微; 骆紫冰; 张东超; 金天明
    • 摘要: 通过生物学信息方法筛选和分析肝癌组织与癌旁组织中的差异表达基因(DEGs),为肝癌早期预防、诊断以及治疗的靶点筛选提供参考。利用Rstudio中Limma包筛选出肝细胞癌(HCC)肝癌组织与癌旁组织的DEGs;Metascpape对DEGs进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;STRING数据库构建PPI网络后,利用Cytoscape软件进行可视化并筛选关键基因,将筛选的关键基因利用GEPIA分析癌旁组织与肝癌组织中的基因表达及随肿瘤分期变化情况;Kalpan Meier-Plotter对关键基因的生存曲线进行分析;两芯片筛选出453个共有的DEGs,其中,上调基因149个,下调基因304个。上调DEGs主要富集在细胞分裂、细胞周期G1/S相变、细胞周期的正调控、DNA复制等生物过程;下调DEGs主要富集在一元羧酸代谢过程、有机酸分解过程、环氧酶P450途径、辅酶代谢过程等生物过程。通过对肝癌相关芯片数据的生物学信息分析发现,BUB1、AURKB、CDC20、CCNB1、CDCA8、CDK1、CCNB2、BUB1B、KIF2C等9个上调关键基因均与HCC预后不良相关,可能是肝癌发生发展的潜在靶点。
    • 张涛; 安云; 尹露; 陈霄; 闫慧新; 马书杰; 严隽陶
    • 摘要: 目的通过使用生物信息学方法分析老年骨骼肌减少症(sarcopenia)关键基因的差异表达。方法使用GEO数据库下载骨骼肌减少症患者股外侧肌肉样本的芯片数据,使用生物信息学方法筛选差异表达基因(DEGs),通过David在线数据库对DEGs进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,然后通过String11.0在线数据库构建分析蛋白质之间的相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape v3.6.1及其插件MCODE分析PPI网络的中心节点蛋白质,筛选出骨骼肌减少症发生过程中的关键基因。结果通过对GSE1428数据集的分析,筛选出1001个DEGs,其中上调19个,下调982个;这些基因主要涉及配体的外在凋亡信号通路、内在凋亡信号通路的负调控、信号转导、肽基酪氨酸磷酸化、上皮细胞迁移的正调控、蛋白激酶B活性的激活等生物学进程;KEGG通路分析发现DEGs主要集中在癌症通路、调节干细胞多能性的信号通路、HIF-1信号通路、Rap1信号通路等;通过对蛋白质PPI网络分析后确定SRC、VEGFA、JUN、UBC、CASP3、CYCS、IGF1、KRAS、F2、IL-4为关键基因。结论所筛选的关键基因可能成为诊断骨骼肌减少症的标志物或潜在治疗靶点,并为该病的发病机制研究提供了新的理论依据。
    • 李霓; 韩江雪; 姜新海; 许艳妮; 司书毅
    • 摘要: 目的 利用荧光偏振方法建立体外低密度脂蛋白受体的诱导型降解因子(IDOL)/低密度脂蛋白受体(LDLR)的蛋白相互作用评价体系。方法 通过PCR扩增获得人IDOL蛋白全长cDNA,并与pET-30a(+)原核表达质粒进行重组,转化至大肠杆菌系统进行表达并纯化。将FITC荧光标记的LDLR多肽片段与His-IDOL共同孵育,利用荧光偏振方法,分别对多肽浓度、蛋白浓度以及反应时间进行优化,建立体外IDOL/LDLR的蛋白相互作用评价体系。结果 将pET-30a-IDOL重组质粒进行大肠杆菌原核表达,获得人全长IDOL蛋白。将His-IDOL重组蛋白进行His Trap柱亲和纯化,并与FITC-LDLR进行反应,最终确定500 nmol/L FITC-LDLR和2μmol/L His-IDOL于25°C、100 r/min振荡、避光孵育1 h为IDOL/LDLR相互作用最适反应体系。结论 利用荧光偏振方法成功构建了IDOL/LDLR蛋白相互作用评价体系,该体系为基于IDOL/LDLR相互作用的抗动脉粥样硬化的小分子抑制剂的开发和评价提供了实验基础。
    • 段志强; 谢玲玲; 陈佳琪; 唐宏; 王燕碧; 赵采芹; 赵佳福
    • 摘要: 新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)是单股负链不分节段的RNA病毒,其基因组大小约为15.2 kb,编码6种结构蛋白和2种非结构蛋白。由于NDV基因组较小,不能编码病毒复制需要的所有蛋白,因此必须借助宿主蛋白来完成NDV的生活周期。M蛋白是一种非糖基化膜相关蛋白,在抑制宿主细胞基因转录、调节病毒基因组复制和转录、促进子代病毒粒子组装和出芽等方面具有重要作用。目前,国内外在M蛋白与NDV毒力和复制的关系,以及以M蛋白为核心的病毒样颗粒形成和利用方面取得了较大的研究进展,但是对M蛋白与宿主蛋白相互作用以及M蛋白如何调控NDV的复制研究进展相对缓慢。鉴于M蛋白在NDV复制中的重要作用,本文主要从M蛋白的结构特征和细胞内定位特征,以及M蛋白与宿主蛋白相互作用的功能研究方面进行综述,以期为更好地认识和研究M蛋白在NDV复制和致病性中的作用提供参考。
    • 林丽华; 钱锋; 吴秀珍; 马菲菲; 黄绍娥; 卓德祥
    • 摘要: 目的:酵母双杂交技术筛选和验证人白细胞、淋巴组织、人胎肝、人胎脑、人肾、人脾cDNA混合文库中和乙肝病毒全S蛋白反式激活蛋白1(CSTP1)相互作用蛋白,以进一步探讨CSTP1的生物学功能。方法:以CSTP1为诱饵蛋白,应用酵母双杂交实验对人白细胞、淋巴组织、人胎肝、人胎脑、人肾、人脾cDNA混合文库进行筛选,用DNA测序进行分析。免疫共沉淀实验验证CSTP1和靶蛋白相互作用。结果:酵母双杂交实验和免疫共沉淀实验筛选并验证RAN结合蛋白9(RANBP9)和蛋白酶体26S非ATP酶调节亚基7(PSMD7)两种蛋白与CSTP1存在相互作用。结论:本研究应用酵母双杂交实验和免疫共沉淀实验筛选得到2个和CSTP1相互作用蛋白,为进一步深入研究CSTP1生物学功能提供线索。
    • 张迪迪; 顾宇轩; 孙霄麟; 张丽娜
    • 摘要: 96序列相似的家庭成员A和B(family with sequence similarity 96 member A and B,FAM96A和FAM96B)是属于MIP18(MMS19-interacting protein of 18 kD)家族的2个高度保守的同源蛋白,MIP18是与有丝分裂纺锤体相关的MMDX(MMS19-MIP18-XPD)复合体的亚基.研究表明,FAM96A和FAM96B在人胃肠道间质瘤、结肠癌、肝癌、胃癌和乳腺癌等多种肿瘤组织中的表达显著降低,提示其可能是作为潜在的抑癌基因参与肿瘤的发生发展,但目前关于FAM96A和FAM96B在肿瘤发生发展过程中的作用机理并不十分清楚.此外,研究发现FAM96A和FAM96B可通过与其他不同的蛋白质相互作用在体内发挥多种不同的功能.因此,就目前对于FAM96A和FAM96B结构和功能的研究所取得的进展进行了回顾与总结,并对其在肿瘤发生发展中的分子机制和相互作用蛋白鉴定的研究前景进行了展望,以期为临床上将FAM96A和FAM96B作为新的肿瘤诊断标志物和治疗靶点奠定基础,并为揭示二者在体内更多的新功能提供依据.
    • 罗淋淋; 牛敬敬; 莫蓓莘; 林丹樱; 刘琳
    • 摘要: 细胞是动植物结构和生命活动的基本单位.细胞过程的一个重要特点就是其生化组分在时空调控上的相互作用关系.然而,利用传统的生化方法(如酵母双杂交系统、pull-down系统等)很难在空间上评估活细胞内分子间的相互作用.光学技术的快速发展,为研究活细胞中生物分子的时空动态提供了新的遗传研究工具,其中荧光共振能量转移-荧光寿命显微成像(FRET-FLIM)技术在实时探测分析活细胞中生物大分子构象变化和分子间动态相互作用过程具有独特的优势,如:实现对活细胞的实时"可视化"研究,同时具有高时空分辨率;检测更加灵敏、结果可信度高;且基于简易的数学运算完成简单快捷的分析程序.介绍FRET-FLIM技术的理论背景知识,对比了该技术与传统蛋白相互作用技术研究的利弊,同时归纳了其在蛋白相互作用、细胞生物学和疾病诊断等方面的最新应用研究进展,最后总结和讨论了FRET-FLIM技术的未来发展趋势,以期能够为揭示活细胞的结构和细胞过程相关研究提供新的见解.
    • 李星; 顾雨香; 任青兮; 陈浩然; 关凯方; 刘海燕; 李启明; 马莺
    • 摘要: 通过测定UHT奶在贮藏过程中蛋白水解,蛋白在胶束相和乳清相的分布,乳蛋白糖基化位点变化,探究乳蛋白在贮藏过程中性质的变化.结果表明贮藏过程中UHT奶中菌落总数增大,纤溶酶含量增大.UHT奶在内外源酶的作用下乳蛋白发生不同程度的水解.热处理导致从胶束表面脱落的κ-CN和乳清蛋白以热诱导聚合物的形式,在贮藏过程中重新结合到胶束表面,从而使胶束粒径增大,牛乳表观黏度增大.贮藏过程中胶束Z eta电位逐渐降低,流动行为指数n逐渐降低,说明牛乳呈现出更明显的剪切变稀能力,暗示胶束结构更加松散.贮藏过程中UHT奶色泽加深,美拉德反应继续进行,其产物半乳糖基赖氨酸和Nε-羧甲基赖氨酸(CML)含量不断增加.
    • 陈奕晨; 王娜; 王文杰
    • 摘要: 目的通过构建淫羊藿有效成分的靶点蛋白相互作用网络和活性成分作用靶点的网络,对靶点相关的通路和功能进行分析,研究淫羊藿抗抑郁的作用机制。方法采用Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology(TCMSP)数据库查询获取淫羊藿主要的活性成分,通过drugbank获取各成分的作用靶点,使用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点的网络,利用GeneCards、OMIM、NCBI等数据库查询抑郁症相关的靶点,然后将淫羊藿的靶点与抑郁症靶点进行映射。使用String数据库和Cytoscape软件绘制靶点蛋白相互作用网络,采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析。结果经过筛选得到淫羊藿的活性成分21个,主要涉及的作用靶点有188个。网络分析结果表明,淫羊藿发挥抗抑郁药效过程中主要涉及毒性物质反应、金属离子反应、细胞外刺激反应、氧化应激反应等生物过程,通过调节PI3K-Akt signaling pathway、TNF signaling pathway、IL-17 signaling pathway等信号通路来发挥抗抑郁作用。结论本研究结果表明淫羊藿抗抑郁具有多成分-多靶点-多途径的特点,为淫羊藿抗抑郁作用机制的研究提供了新的方法、思路和科学的理论指导。
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