致泻性大肠埃希菌

摘要： 目的了解北京市朝阳区门诊腹泻患者致泻性大肠埃希菌(diarrheogenic Escherichia coli,DEC)耐药特征。方法采用微量肉汤稀释法对分离自2014-2019年142株DEC进行药物敏感试验,根据2017版美国临床和实验室标准化协会(CLSI)的相关标准获得敏感(S)、中度敏感(I)和耐药(R)的结果及进行产超广谱β-内酰胺酶(extendedspectrum β-lactamases,ESBLs)菌株及产碳青霉烯酶菌株的确认。应用PCR及测序方法检测ESBLs基因及碳青霉烯酶基因。结果142株DEC对四环素耐药率最高,为54.23%,对氨苄西林、萘啶酸和复方磺胺甲噁唑的耐药率分别为50.70%、43.66%和42.25%,对三代头孢耐药率为23.94%~5.63%,对美罗培南耐药率为0.70%,对亚胺培南全部敏感。其中多重耐药菌株81株(57.04%),产ESBLs菌株32株(22.53%)。142株DEC携带的ESBLs耐药基因主要是bla_(TEM)(61.27%)、bla_(CTX-M-1)组(2.82%)和bla_(CTX-M-9)组(9.15%),bla_(CTX-M-9)组中CTX-M-14为北京地区产ESBLs耐药表型的主要耐药基因。美罗培南耐药菌株耐药基因为bla_(IMP)。结论北京市朝阳区门诊腹泻患者体内DEC耐药性较为严重,应对其进行持续监测,为制订相应防控策略提供依据。

摘要： 目的了解安徽地区临床分离致泻性大肠埃希菌(DEC)的耐药状况、基因同源性及主要基因型。方法采用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验,采用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型进行基因型检测和同源性分析。结果268株DEC中,57.1%为多重耐药菌,其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)118株,肠毒素性大肠埃希菌(ETEC)98株,肠致病性大肠埃希菌(EPEC)47株,3种病理类型菌株对常用抗菌药物的耐药率分别为:氨苄西林83.9%、73.5%、78.7%,萘啶酸65.3%、75.5%、34.0%,头孢唑林53.4%、35.7%、34.0%,四环素61.0%、31.6%、74.5%,复方磺胺甲口恶唑63.6%、23.5%、46.8%,氨苄西林/舒巴坦28.0%、9.2%、29.8%,庆大霉素34.7%、7.1%、34.0%,氯霉素22.9%、5.1%、21.3%,环丙沙星18.6%、4.1%、14.9%;2株EAEC和1株ETEC对亚胺培南耐药。55株EAEC分为35个ST型,优势基因型是ST10(14.5%);55株ETEC分为14个ST型,优势基因型是ST48(32.7%)和ST218(16.4%);15株EPEC分为12个ST型,优势基因型是ST28(13.3%)、ST517(13.3%)和ST2088(13.3%)。微进化树分析结果显示:55株ETEC中,马鞍山市分别有5、3、2、2株菌100%同源,合肥市有5株菌100%同源;55株EAEC中,阜阳市、滁州市各有2株菌100%同源;15株EPEC中,有2组2株菌100%同源,分离自马鞍山市。50株EAEC PFGE同源性聚类分析结果为:100%同源有2株,分离自蚌埠市,其余菌株同源性均在90%以下;21株EPEC的基因同源性均在75%以下;30株ETEC、3株肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)和5株ETEC+aEAEC的基因同源性达97.6%、93.6%各2株,其余菌株同源性都在90%以下。结论本研究发现安徽省临床分离的DEC耐药情况较严重,其中EAEC的耐药率高于EPEC和ETEC,ETEC的耐药率在各致病型中最低。分子分型检测发现本地区临床分离的DEC基因型较分散,在各致病型中,ETEC的基因型相对集中。微进化树分析提示ETEC存在地区同源性感染。在分子分型技术上,MLST能区分出优势基因型和聚集性,优于PFGE分型。

摘要： 大肠埃希菌作为人和温血动物肠道的共生菌群成员,通常情况下对人不致病,但一些获得特殊毒力因子的大肠埃希菌能引起感染性腹泻和肠外疾病,能够引起肠道感染的大肠埃希菌称为致泻 性 大 肠 埃 希 菌 [diarrheagenic Escherichia coli(E.coli).

摘要： 目的了解镇江地区哨点医院食源性疾病病原体的构成和流行病学特征。方法收集2017—2019年镇江市4家哨点医院食源性疾病患者的粪便标本,进行沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻性大肠埃希菌和诺如病毒5种病原体的检测。结果3年共检测1828份粪便标本,185份检出阳性病原体,阳性率10.12%;检出4种病原体,未检出致泻性大肠埃希菌,诺如病毒阳性率最高(5.42%),其次为沙门菌(2.68%)、副溶血性弧菌(1.70%)和志贺菌(0.33%)。一季度阳性率最高,为22.95%,不同季度阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=15.44,P<0.05)。诺如病毒一季度阳性率最高(19.67%),沙门菌、副溶血性弧菌三季度阳性率最高(分别为3.73%、3.73%),3种病原体不同季度阳性率差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为49.21、11.24、36.72,P值均<0.05);监测点所在市(区)阳性率为5.04%~15.05%,差异有统计学意义(χ^(2)=42.59,P<0.05)。诺如病毒以5~14岁组阳性率最高(10.11%),不同年龄组阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=18.54,P<0.05)。不同职业中,学生阳性检出率最高(13.85%),差异有统计学意义(χ^(2)=16.61,P<0.05)。结论镇江地区食源性疾病的主要病原体为诺如病毒,具有明显的时间、地区和人群特征。

摘要： 目的 分析2016-2019年嘉兴市食源性疾病病原体监测结果,为预防食源性疾病提供依据.方法 通过嘉兴市7家哨点医院收集2016-2019年嘉兴市食源性疾病监测资料,描述性分析不同年龄、发病时间和可疑食品暴露史病例的病原体检出情况.结果 2016-2019年嘉兴市共采集食源性疾病病例标本9 779份,检出阳性病原体1 224份,检出率为12.52％.其中副溶血性弧菌、沙门菌、志贺菌、诺如病毒和致泻性大肠埃希菌检出率分别为3.52％、2.98％、0.07％、8.87％和6.63％.诺如病毒和致泻性大肠埃希菌检出率均呈逐年下降趋势(P＜0.05),副溶血性弧菌和沙门菌检出率均呈逐年上升趋势(P＜0.05).诺如病毒在3月和11月检出率较高,分别为24.56％和12.03％;副溶血性弧菌、沙门菌和致泻性大肠埃希菌在6-9月检出率较高,为5.06％～10.14％;志贺菌全年检出率均较低.5～＜18岁病例诺如病毒检出率较高,为12.07％;≥18岁病例副溶血性弧菌检出率较高,均＞3.50％;1～＜5岁病例沙门菌检出率较高,为9.14％.可疑食物暴露史以水产动物及其制品为主,267份占21.81％;其次为肉与肉制品,198份占16.17％.结论 2016-2019年嘉兴市诺如病毒和致泻性大肠埃希菌检出率均呈逐年下降趋势,副溶血性弧菌和沙门菌检出率均呈逐年上升趋势;夏季应重点监测婴幼儿沙门菌感染和成年人副溶血性弧菌感染情况,冬春季应重点监测儿童诺如病毒感染情况,并加强水产动物及其制品、肉与肉制品等可疑食品的主动监测.

摘要： 目的 了解北京市顺义区2015年～2019年感染性腹泻病原菌谱构成、流行特征,为本地区感染性腹泻的防控提供依据.方法 选取2015年～2019年北京市顺义区3家哨点医院以呕吐或腹泻等消化道症状为主诉就诊的肠道门诊病例为研究对象,采集粪便标本,开展志贺菌、沙门菌、致泻性大肠埃希菌、副溶血弧菌和霍乱弧菌、弯曲菌等病原菌检测,分析其时间、年龄分布以及采样时间和患者临床表现等对标本阳性检出率的影响.结果 2015年～2019年共检测样本1856份,总阳性率为28.83％,其中双重、多重感染阳性率为2.10％;2016年～2018年感染性腹泻病原菌谱中副溶血性弧菌所占比例最大,分别为9.16％、9.49％、9.78％;2015年和2019年致泻性大肠埃希菌所占比例最大,为6.82％和12.71％;肠道致病菌的人群分布主要集中在11～50岁,其中41～50岁年龄段阳性率最高(35.68％);病原菌的检出具有季节性,6～10月份检出率较高,8月份达到高峰;采样时间早的标本阳性检出率较高(χ2=6.476,P0.05).结论 2015年～2019年北京市顺义区细菌性腹泻病原菌谱构成存在一定差异,季节性特征明显,检出阳性率影响因素复杂.持续开展感染性腹泻监测病例细菌性病原谱监测工作对感染性腹泻防控具有重要意义.

摘要： 本文对一起疑似食物中毒事件中所采集的样本进行病原学检测分析,希望能够为预防食物中毒提供科学依据.应用全自动医用PCR分析系统对22种常见胃肠道感染相关病原体进行快速筛检,以实时荧光定量PCR技术进行毒力基因检测,并利用传统方法对病原菌进行分离培养.检测数据显示,35份样本的22种常见胃肠道感染相关病原体检测结果为检出致病性大肠埃希菌(EPEC);10份样本经实时荧光定量PCR技术检出EPEC毒力基因escV和内参基因uidA;经传统培养分离方法,最终从6份粪便样本中分离出目标菌EPEC.因此得出结论,综合流行病学调查、临床症状和实验室检验结果,推断出这是一起由携带EPEC的食堂工作人员通过污染食物导致学生感染发病的突发公共卫生事件.建议各级卫生监督部门加强对餐饮行业及其从业人员的监督检查力度,避免类似食物中毒事件的发生,进而保障人民的身体健康.

摘要： 目的:了解上海市虹口区致泻性大肠埃希菌耐药状况并对其进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究.方法:药敏实验按照CLSI推荐的MIC法进行24种抗生素的耐药性分析;PFGE实验参照PulseNet PFGE实验方法.结果:致泻性大肠埃希氏菌对美罗培南(MEM)等抗生素完全敏感;对氨苄西林(AMP)、四环素(TET)耐药率高分别为70%和60%,对头孢烯类抗生素(CTX、CEC、CFX、CAZ)基本敏感,对80株菌株做了PFGE分子分型检测,在2017年出现2株ETEC菌株100%的聚类和2019年出现了2株EAEC菌株100%的聚类.PFGE分型结果表明本区致泻性大肠埃希菌呈高度多态性.结论:虹口区引起致泻性大肠埃希菌对多种抗生素耐药、有一些是多重耐药且PFGE带型呈高度多态性.

摘要： 目的 了解北京市顺义区腹泻病例中致泻性大肠埃希菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)的流行特征,为顺义区DEC引起的腹泻防控工作提供科学依据.方法 收集2013至2018年北京市顺义区2家哨点医院肠道门诊腹泻患者临床和流行病学资料,采集粪便标本进行DEC检测,数据采用SPSS 25.0和Excel 2010进行流行病学分析.结果 2068例腹泻监测病例中检出DEC 182例(8.80％),检出率由高到低依次为肠产毒性大肠埃希菌(enterotoxigenic E.coli,ETEC)(111例,5.37％)、肠致病性大肠埃希菌(enteropathogenic E.coli,EPEC)(45例,2.18％)、肠集聚性大肠埃希菌(enteroaggregative E.coli,EAEC)(27例,1.31％)(各类型DEC检出数相加大于阳性例数是由于混合感染者分别计算到各类型引起),且不同户籍、不同性别、不同年龄的检出率差异无统计学意义.DEC的季节性发病特征明显,各菌型的流行高峰均在夏季,主要表现为ETEC(χ2=76.591,P<0.001)和EAEC(χ2=10.204,P<0.05);本市患者EPEC(χ2=12.243,P<0.001)和EAEC(χ2=7.947,P<0.01)阳性检出率高;不同年龄EAEC检出率差异有统计学意义(χ2=17.171,P<0.05).发热、恶心、腹痛、脱水症状对DEC检出率无影响,但无呕吐症状病例DEC检出率高(χ2=7.099,P<0.01),主要体现为ETEC(χ2=15.073,P<0.001);伴发热与无发热组EAEC检出率差异有统计学意义(χ2=4.951,P<0.05).结论 北京市顺义区DEC流行的优势菌型主要为ETEC、EPEC和EAEC,季节性发病特征明显,夏季应加强DEC引起腹泻的防控工作.

摘要： 本发明提供了多重PCR检测六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌用引物组，其中，该引物组包括SEQ ID NO.1‑29所示的引物，本发明还提供了六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌的检测方法和试剂盒。通过上述技术方案，本发明为六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌的快速、准确筛查提供了完备的技术手段，能实现食物中毒事件发生后和疫情暴发后的六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌快速筛检与鉴定，为合理恰当处置疫情提供可靠的依据。

摘要： 本发明涉及生物工程领域，尤其涉及含有特异性分子靶标的致泻大肠埃希氏菌标准参考菌株及其检测和应用。本发明的致泻大肠埃希氏菌(菌株编号为：PY009‑2、3025B1)，具有标准的大肠埃希氏菌菌体显微形态和生理生化特征，可用于检验大肠埃希氏菌特征和验证显色平板的准确性。菌株携带毒力基因具有典型代表性，且具有特异性分子标记，遗传进化方面有特殊意义，能反映中国地区遗传背景，可作为参考菌株用于科学研究。

摘要： 本发明提供了检测致泻性大肠埃希氏菌的核酸组合及其检测试剂盒与应用，属于检验检疫技术领域。本发明提供的检测致泻性大肠埃希氏菌的核酸组合，能够高效的准确的鉴定出各型大肠埃希氏菌，能避免误检的发生；将上述核酸组合应用于制备致泻性大肠埃希氏菌的检测试剂盒，能方便检测致泻性大肠埃希氏菌，该检测试剂盒操作简单、方便、灵敏、快捷、成本低、通量高且肉眼可视的检测方法具有非常广的应用市场及非常好的应用价值。

摘要： 一种用于食品微生物污染检测及监控的致泻性大肠埃希氏菌检测试剂盒及其检测方法，所述的试剂盒中，每1mL检测溶液含10mM Tris·Cl、50mM KCl、25mM MgCl2、dNTP各2.5mM、Taq DNA聚合酶5U/μL及用于多重PCR的4对上、下游引物各10μM。本方法采用致泻性大肠杆菌的毒力因子基因检测四种致泻性大肠杆菌，可以检测出致泻性大肠杆菌的同时进行四种类型的区分。检测四种致泻性大肠杆菌的检测下限低于10CFU/mL，灵敏度高。此外，本方法检侧时间比传统方法短，方法更加简捷，可以节省大量的劳力和财力，适合快速检测的要求。

摘要： 本发明属于生物技术、食品检测领域，具体是一种食品病原菌致泻大肠埃希氏菌快速检测试剂盒及方法。为建立一种高效、快速、准确且经济的检测方法，本发明公开了一种基于PCR‑DGGE检测食品病原菌致泻大肠埃希氏菌的试剂盒，包括引物组、DNA片段，PCR缓冲液，STE缓冲液。检测方法具体是以化学合成的食品病原菌致泻大肠埃希氏菌的DNA片段作为待测样品的标准参考，当样品条带与标准条带处于相同位置时，即可确定样品中含有食品病原菌致泻大肠埃希氏菌，本发明方法结果可靠，并且实验速度快、特异性好，灵敏度高，并且可以同时分析多个样品。在实验耗材上，价格低，同时实验技术易普及，操作简单。与一般检测方法相比，为一种高效快速经济便捷的检测方法。

摘要： 本发明提供了多重PCR检测六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌用引物组，其中，该引物组包括SEQ ID NO.1‑29所示的引物，本发明还提供了六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌的检测方法和试剂盒。通过上述技术方案，本发明为六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌的快速、准确筛查提供了完备的技术手段，能实现食物中毒事件发生后和疫情暴发后的六种致泻大肠埃希氏菌和志贺氏菌快速筛检与鉴定，为合理恰当处置疫情提供可靠的依据。

摘要： 本发明公开了一种可应用于多重PCR结合高分辨熔解曲线分析技术单孔检测并分型致泻大肠埃希氏菌方法的多重引物。本发明公开了方法的引物序列及应用，所述引物序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.18所示；所述引物应用于制备检测并对致泻大肠埃希氏菌进行分型的试剂盒中，方法具有高通量、低成本、灵敏度高、特异性强、闭管操作和结果稳定的优势，为致病菌的快速准确分型提供新思路。

摘要： 本发明涉及生物工程领域，尤其涉及含有特异性分子靶标的致泻大肠埃希氏菌标准参考菌株及其检测和应用。本发明的致泻大肠埃希氏菌(菌株编号为：PY009‑2、3025B1)，具有标准的大肠埃希氏菌菌体显微形态和生理生化特征，可用于检验大肠埃希氏菌特征和验证显色平板的准确性。菌株携带毒力基因具有典型代表性，且具有特异性分子标记，遗传进化方面有特殊意义，能反映中国地区遗传背景，可作为参考菌株用于科学研究。

摘要： 本发明涉及不同类型致泻大肠埃希氏菌检测技术，具体公开了一种不同致泻大肠埃希氏菌多通道荧光定量PCR检测技术。通过一次多管多通路的实时荧光定量PCR检测方法，同时在相同的热循环条件下快速的检测多个基因，实现不同类型致泻大肠埃希氏菌的鉴定，操作更加快捷，易于掌握，可直接通过荧光信号实时观测结果。

摘要： 本发明公开了一种多重qPCR快速检测五种致泻大肠埃希氏菌的试剂盒，其包括可分别特异性扩增EPEC或EHEC的eae基因、EPEC或EHEC的escV基因、EPEC的bfpB基因、EHEC的stx1或stx2基因、ETEC的lt、sth或stp基因、EAEC的aggR、astA或pic基因、以及内质控IAC基因的引物探针组。并且，本发明还公开了一种应用上述试剂盒快速检测五种致泻大肠埃希氏菌的方法和应用。本发明实现了十四重实时荧光定量PCR在同一反应管内同时检测食品中五种致泻大肠埃希氏菌的方法，可对这五种DEC国标中的所有特征性基因全部检测，防止漏检以及假阴性现象，具有检测时间短、操作简便、结果易于判读、灵敏度高、特异性好等优点。