耐药表型

摘要： 为了调查石河子地区绵羊肠道正常菌群大肠杆菌对β-内酰胺类抗生素耐药表型和耐药基因的携带情况,本研究采用常规细菌分离方法结合16S rRNA检测方法分离鉴定绵羊源羊肠道正常大肠杆菌,利用K-B纸片扩散法和PCR分析分离株对β-内酰胺类5种临床常用抗菌药的耐药表型及SHV、CTX-M-1、CTX-M-2、CTX-M-9、TEM 5种耐药基因的携带情况.结果显示,100株绵羊源大肠杆菌对青霉素耐药率为100％,对头孢拉丁和阿莫西林等药物的耐药率在80％ ～90％ 之间,对头孢唑林和头孢他啶耐药率为1％;CTX-M-1和TEM耐药基因的检出率分别为100％和98％,未检测到SHV、CTX-M-2、CTX-M-9基因.结果表明石河子地区绵羊源羊肠道正常大肠杆菌对β-内酰胺类药物具有一定水平的耐药性,耐药基因主要以TEM和CTX-M-1为主.

摘要： 目的分析永康地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)耐药表型及分子分型,以期为本地区临床CRKP抗感染治疗和院内感染防控提供依据。方法从永康市第一人民医院2017年1月至2019年12月332例住院患者中分离获得非重复CRKP菌株332株,分析菌株的患者性别、年龄、标本、科室来源分布以及对抗菌药物的敏感性试验结果。随机选取30株CRKP菌株,采用改良Hodge试验、头孢他啶/阿维巴坦纸片扩散法、PCR法检测其耐药表型及基因型,采用多位点序列分型技术检测其分子分型。结果332株CRKP菌株主要来自男性(占72.0%)、>60岁(占74.1%)的患者;标本来源主要为痰液(占70.2%);科室来源主要为ICU(占50.6%)。CRKP菌株对复方新诺明的敏感性最高(71.9%),对亚胺培南的敏感性最低(1.2%)。30株CRKP菌株改良Hodge试验阳性率为90.0%;对头孢他啶/阿维巴坦的体外敏感性为96.7%;耐药基因型为bla_(NDM-1)仅1株,bla_(KPC-2)29株;分子分型为ST11型28株(占93.3%)。结论CRKP是永康地区感染性疾病的重要病原菌,对多数抗菌药物具有高度耐药性,流行株为ST11型,应积极采取有效措施来预防CRKP传播。

摘要： 目的分析结核分枝杆菌药敏试验结果,为掌握结核分枝杆菌耐药特点及实施合理的抗结核治疗提供科学依据。方法对2017~2019年东莞市第六人民医院肺结核住院患者痰样本进行结核分枝杆菌培养及药敏试验。结果共检出3827株结核分枝杆菌,总耐药率为30.73%,2017年、2018年、2019年耐药率依次为31.83%、30.00%、30.33%,三者之间无显著差异(P>0.05)。三年间除PTO外8种抗结核药物耐药率无明显变化(P>0.05)。男女结核总检出率分别是35.39%(2677/7564)、31.45%(1150/3657),男性结核检出率高于女性。结核耐药率在男性与女性分别是31.12%(833/2677)、29.83%(343/1150),结核耐药率男女之间并无明显差异(P>0.05)。耐药率在各年龄组间无明显差异(P>0.05)。3827株结核分枝杆菌含109株耐药表型,单一药物耐药率由高到低分别是:链霉素、异烟肼、氧氟沙星、乙胺丁醇、利福平、丙硫异烟肼、对氨基水杨酸、卷曲霉素和卡那霉素,其中链霉素耐药率达37.76%。MDR-TB、pre-XDR-TB共122例,占耐药结核比例分别是6.38%、4.00%。MDR耐药表型13种,其中INH+RFP+SM+EMB、INH+RFP+SM、INH+RFP三种耐药表型人数依次是24、20、13例,合计占MDR总列数的76%。PRE-XDR含10种耐药表型,其中INH+RFP+OFX+SM+EMB和INH+RFP+OFX+SM耐药表型占比达55.32%。结论2017年~2019年东莞市结核耐药水平趋于稳定,可能是以原发性耐药为主,与年龄、性别等因素无关;耐药表型呈现复杂性和多样性。

摘要： 鰤诺卡菌(Nocardia seriolae)是严重危害大口黑鲈的病原菌,为了解四川大口黑鲈主养区N.seriolae的耐药性与耐药基因流行情况,从四川大口黑鲈主养区分离鉴定N.seriolae 20株。采用微量肉汤稀释法测定分离菌株的耐药表型,发现20株N.seriola对多西环素、替米考星、庆大霉素等敏感率为100%,对青霉素、头孢噻呋、头孢西丁等药物的耐药率为100%,对恩诺沙星、磺胺异恶唑、氟苯尼考耐药率分别为45%、40%和20%,其中10株菌表现出多重耐药性,且不同区域的分离株耐药表型存在差异。超高通量荧光定量PCR法检测分离菌中6类78种耐药基因分布情况,结果显示,6类耐药基因均可在20株分离菌中检出,其中tetA、tetG、tetS、aacC、blaTEM、floR、acrA、acrB的检出率达100%,其他耐药基因检出率介于5%~95%,且存在地区与菌株差异,表明四川大口黑鲈N.seriolae具有进一步进化为多重耐药的潜在风险。

摘要： 目的研究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)耐药表型检测的价值。方法对2018-2021年该院分离的450株肺炎克雷伯菌(KP)进行分析,统计分离情况,分析KP的耐碳青霉烯类表型,同时选取替加环素、美罗培南、亚胺培南等药物进行药敏试验;并对CRKP进行耐药表型分析,进而对比常见耐药表型的耐药及分布情况。结果450株KP对亚胺培南、美罗培南、厄他培南的耐药率分别为6.00%、6.00%、7.78%,其中CRKP共36株。同源性分析显示,36株CRKP中出现3种主要克隆型,有11株为ST11型,7株为ST2305型,5株为ST2390型,总体以≥15岁人群感染为主,住院时间较长,痰液标本培养获得居多,主要分布于ICU、肺病科、老年病科。其中ST11型、ST2305型、ST2390型3种优势菌株对替加环素的耐药率均低于20%,对磺胺类药物的耐药率均低于65%,但ST11型菌株对喹诺酮类药物的耐药率高于90%,ST2305型对氨基糖苷类药物的耐药率高于85%。结论耐药表型检测适合CRKP流行病学调查,结合常规药敏试验,能有效预防和控制CRKP的播散。

摘要： 目的分析小儿肛周和阑尾脓肿标本分离病原菌构成及其主要病原菌的耐药性和耐药表型。方法收集2019年至2020年儿外科住院患者肛周和阑尾脓肿培养阳性的非重复标本。菌株鉴定应用质谱仪,药敏试验采用Vitek 2 Compact全自动微生物药敏仪,纸片扩散法(K-B法)作为药敏试验的补充。应用WHONET5.6软件和卡方检验进行数据分析。结果小儿肛周和阑尾脓肿共收集非重复分离病原菌分别为112株和132株。肛周脓肿分离革兰氏阳性菌30株(26.8%),革兰氏阴性菌82株(73.2%);阑尾脓肿分离革兰氏阳性菌12株(9.1%),革兰氏阴性菌120株(90.9%)。肛周脓肿分离主要病原菌为肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌;阑尾脓肿分离主要病原菌为大肠埃希菌和铜绿假单胞菌。肛周脓肿分离肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌ESBLs检出率占各自菌种的5.3%(2/38)、41.7%(15/36),金黄色葡萄球菌β-内酰胺酶检出率为100%(28/28),未检出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA);阑尾脓肿分离大肠埃希菌ESBLs检出率为54.1%(42/78),耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)检出率为1.3%(1/78),铜绿假单胞菌(26株)均为敏感菌株。结论小儿肛周和阑尾脓肿分离病原菌以革兰氏阴性菌为主,菌种类型不一,对抗菌药物的耐药程度不同,临床医师应重视病原学检测,并根据药敏试验结果选择抗菌药物,以减少耐药菌的产生。

摘要： 【目的】了解广东省部分规模化猪场引起猪传染性胸膜肺炎(PCP)的病原菌猪传染性胸膜肺炎放线杆菌(APP)的耐药表型和耐药基因携带情况,并分析比较其相关性,为有效防控该病提供理论依据。【方法】将2019-2021年从广东省不同地区规模化猪场采集的疑似猪传染性胸膜肺炎病死猪病料通过病原分离培养、革兰氏染色、生化试验、PCR扩增等方法进行病原菌分离鉴定和测序分析,随后对分离株进行药敏试验并通过PCR检测其耐药基因,确定其耐药表型和耐药基因的携带率,分析比较两者的一致性。【结果】分离菌需在含有血清和NAD的培养板中生长;革兰氏染色结果显示分离菌为红色,可判定为革兰氏阴性细菌,通过生化试验、PCR结果及测序分析确定分离到20株APP,且没有表现出明显的地域特性。所有菌株均呈现多重耐药且约50%菌株呈8重及以上耐药;其中对四环素类、磺胺类、氯霉素类和大环内酯类药物耐药率较高,分别为77.5%、65.0%、55.0%和48.8%;进一步分析发现,分离菌主要对四环素、磺胺异噁唑、氟苯尼考和林可霉素等抗菌药物耐药,而对头孢唑啉(先锋Ⅴ)和阿奇霉素敏感。23种主要耐药基因中共检测到bla、aph(2″)-Ⅰb、sul1、sul2、sul3、tetA、tetB、tetM、tetO、tetR和floR这11种耐药基因,携带率分别为85%、85%、50%、60%、75%、30%、100%、85%、100%、70%和80%;未检测到喹诺酮类、大环内酯类和林可胺类相关耐药基因。【结论】从广东省猪群中分离到的APP表现出广泛耐药性,且为多重耐药,耐药基因与耐药表型基本一致,表明耐药基因的携带是细菌对抗菌药物产生耐药的主要原因之一,但也可能存在其他未检测的耐药基因,或存在新的耐药机制。

摘要： 为调查石河子市牛源大肠杆菌对β-内酰胺类药物的耐药表型和耐药基因携带情况,采集健康牛群粪便,采用常规细菌分离鉴定方法并结合16S rRNA PCR检测方法进行分离鉴定;参考Clermont方法对分离菌株进行系统分子分群,采用PCR方法检测分离菌株的β-内酰胺类耐药基因bla_(CTX-M)、bla_(OXA)、bla_(SHV)和bla_(TEM)携带情况,通过K-B纸片法测定分离菌株耐药表型。结果显示:分离鉴定出100株牛肠道大肠杆菌分属于A、B1、C和F群;分离株对头孢唑林和阿莫西林的耐药率在50%以上,对氨苄西林、头孢氨苄与头孢吡肟的耐药率均在5%以下,所有分离株对头孢吡肟敏感;5株分离菌株检测到bla_(SHV)基因片段,1株检测到bla_(CTX-M)基因片段,所有菌株均未检测到bla_(OXA)和bla_(TEM)基因片段。结果表明,石河子市牛源正常大肠杆菌已少部分携带耐药基因,且对部分β内酰胺类药物产生了耐药性。结果提示,应加快减抗政策的实施。

摘要： 为了解泰安市部分地区宠物源沙门菌的感染情况、耐药表型与产超广谱β内酰胺酶(Extended-SpectrumΒ-Lactamases,ESBLs)等耐药基因的携带情况。在泰安市3家宠物医院采集84份犬、猫的肛拭子样品进行沙门菌的分离培养,分别使用微生物质谱鉴定和PCR方法鉴定沙门菌;使用血清凝集试验对分离株进行沙门菌的血清型鉴定;同时检测分离株对14种抗生素的敏感性;采用双纸片协同法对沙门菌进行产ESBLs初筛和确证实验,并检测了4类常用抗生素的18种耐药基因。本研究共分离到2株来自健康犬的沙门菌,且均为肠炎沙门菌,犬源沙门菌的分离率为3.45%(2/58)。2株沙门菌均只对红霉素具有耐药性。其中1株菌检测到β-内酰胺类中的blaCTX-M基因,氨基糖苷类中的aaC4基因,喹诺酮类中的aac(6')-Ib-cr,qnrA,oqxA基因。本研究从84份犬、猫样品中分离到2株肠炎沙门菌,看似表观健康的犬,存在沙门菌感染情况,提示需要重视宠物来源人兽共患病原菌所带来的的潜在风险。

摘要： 目的分析2018-2021年南山区食物中毒样品中分离的肠炎沙门氏菌(Salmonella Enteritidis S.Enteritidis)与布利丹沙门氏菌(Salmonella Blegdam.S.Blegdam),从遗传特征和耐药性角度了解细菌间的亲缘进化关系和耐药特征、为食源性疾病暴发溯源和临床诊治提供参考依据。方法分别对33株沙门氏菌采用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)与全基因组序列方法(Whole genome sequencing,WGS)分析,同时测定30种药物的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)。结果33株菌分为8个PFGE型别,MLST型均为ST11型。全基因组k-mer系统发生树可见9簇。氨苄西林(AMP)、头孢唑啉(CFZ)、萘啶酸(NAL)、磺胺异噁唑(Sul)4种抗菌药物的检出率较高,均大于50%。20株菌对3类以上的药物耐药(60.60%),属于多重耐药,7株菌产ESBL酶。15株菌的耐药基因与耐药表型完全符合。结论2018-2021年,南山区由沙门氏菌引起的食物中毒事件中,沙门氏菌的总体遗传距离较近,但与数据库中其它肠炎沙门氏菌遗传距离较远,自成一簇。本研究中的沙门氏菌多重耐药现象严重,需加强对多重耐药株的监控及抗菌药物使用的监管。

摘要： 肠球菌属细菌广泛分布于土壤、水和食物中，以前认为肠球菌是对人类和动物无害的共栖菌，现已证实肠球菌可引起多种危及生命的感染。肠球菌对现有的大多数抗菌药物有天然耐药(如青霉素、头孢类抗菌药物)，使其不易从感染部位清除。而其对四环素的耐药机制主要有2种：外排泵主动外排的机制以及合成核糖体保护蛋白(RPPS)从而将四环素从30S亚基释放的机制。其中最主要的RPPS是产生tetM和tetO基因。本实验采用常规微生物学手段，检测肠球菌分离株对四环素的耐药表型，并对tetM基因进行检测，以明确肠球菌分离株对四环素耐药表型和耐药基因型之间的关系，并进一步了解其耐药机制。实验结果表明，7株分离株中有5株耐四环素，5株表型阳性耐药菌株中有4株检测到了tetM基因，基因型阳性的菌株表型均为阳性，基因型相对表型阳性的检出率为66．6％(4／6)。

摘要： 目的：越来越多的证据显示microRNA(miRNAs)的调节异常与恶性肿瘤的转归息息相关.本研究意在探讨miR-650参与调控肺腺癌细胞多西他赛耐药的分子机制和临床意义. 方法：实时定量PCR法用于检测肺腺癌组织和细胞中miR-650的表达;免疫印迹法和免疫组织化学法用以检测体内外ING4表达;运用MTT和克隆形成实验评估化疗药物敏感性变化;流式细胞技术、Hoechst染色和caspase-3活性检测被用于验证细胞凋亡率;荧光素酶活性实验被用于验证miR-650下游靶基因;所有数据均通过统计学分析. 结果：miR-650在肺腺癌组织中的表达显著高于癌旁组织.高表达的miR-650作为独立预后因素,与淋巴结转移,临床晚期和肺腺癌病人预后不良密切联系.深入研究证实miR-650在肺腺癌中与以多西他赛为主化疗的疗效反应亦有关.沉默miR-650能促进体外化疗敏感性增加,上调miR-650诱导体内外化疗抵抗增强.此外,抑制miR-650激活了caspase-3依赖的凋亡途径,它可能与Bcl-2/Bax的比值降低有关.进一步研究提示生长抑制因子4(ING4)为miR-650的直接靶基因,下调或上调ING4的表达能够在人肺腺癌多西他赛耐药细胞和亲本细胞中,部分逆转由miR-650单链抑制物和化学模拟物调控引起的效应.ING4在对多西他赛敏感的肺腺癌组织中高表达,它与miR-650的表达呈现负相关. 结论：miR-650作为新型人肺腺癌预后指标,对以多西他赛为主的化疗方案敏感性和疗效评价提供了一定的靶向依据.

摘要： 本试验旨在调查不同地域采集的不同菌种，对喹诺酮类药物(Quinolones)的耐药表型和质粒介导的喹诺酮耐药基因qnrD的分子流行情况，并对qnrD基因进行克隆，原核表达。2006～2009年从四川、河南等地分离到的大肠杆菌(141株)，沙门氏菌(31株)，肺炎克雷伯氏菌(46株)，奇异变形杆菌(20株)，共238株，采用微量稀释法测定试验菌株对环丙沙星(CIP)等四种喹诺酮类药物的MIC值;运用PCR方法调查qnrD基因的流行、分布情况;将qnrD基因定向克隆到表达载体DET-30b(+)中，转化大肠杆菌感受态BL21(DE3)，经IPTG诱导阳性菌，通过SDS-PAGE检测qnrD基因的表达。试验菌株的总耐药率分别为：沙门氏菌(88．41％)，奇异变形杆菌(82．65％)，肺炎克雷伯氏茵(78.36％)，大肠杆菌(60．25％);qnrD基因的检出率分别为大肠杆菌(42．19％)，沙门氏菌(28．57％)，肺炎克雷伯氏菌(28．57％)，奇异变形杆菌(20．37％);SDS-PAGE分析表明，重组载体pET-qnrD可成功的在大肠杆菌中表达qnrD蛋白。本研究首次报道了qnrD基因在不同细菌中的流行情况，首次在大肠杆菌，肺炎克雷伯氏菌中发现了qnrD基因，对qnrD基因进行原核表达为后续试验提供了基础材料。

摘要： 为了进一步研究奶牛乳房炎源性金黄色葡萄球菌的耐药机制,对一株mecA基因缺失的金黄色葡萄球菌进行体外青霉素诱导,观察不同诱导代次金黄色葡萄球菌的耐药性及表型的变化,并分析耐药亚群的生长曲线。试验表明,随着诱导代次的增加,金黄色葡萄球菌对β-内酰胺类抗菌药物的耐药性逐渐增强,对各浓度青霉素的耐药亚群比例升高,表型观察发现诱导菌菌体变小,胞质浓缩,细胞壁疏松、增厚,有的胞浆内出现空泡。本研究对金黄色葡萄球菌进行了成功的体外青霉素诱导,并分析了诱导前后的耐药性、细菌表型及耐药亚群变化,为金黄色葡萄球菌耐药机制和表型变化的研究奠定了基础,为临床上奶牛乳房炎的防治提供了依据。

摘要： 新生儿感染性肺炎是新生儿常见病，发病快，潜伏期短，是新生儿死亡的重要原因，正确诊疗及使用抗生素非常重要。而目前临床使用抗生素不规范的现象非常严重，因此探寻新生儿感染性肺炎的病原菌分布特点和耐药性规律，指导临床合理使用抗生素很有必要。本文现将4436例新生儿感染性肺炎的痰培养及药敏结果进行分析。

摘要： 本试验旨在研究异源大肠杆菌对氟喹诺酮类药物(fluoroquinolones，FQs)的耐药表型和质粒介导FQs耐药基因(PMQR)的特征。2006-2008年从四川、河南等地的规模化猪场、医院及野生动物园分离的141异源大肠杆菌，采用K-B纸片法检测其对奈啶酸(NA)等六种FQs的耐药表型，并运用PCR方法检测PMQR基因：qnrA、qnrB、qnrS、aac(6')-Ib-cr、qepA和qnrD。结果表明：试验菌株对各药物的耐药率分别为：萘啶酸(58.93％)、诺氟沙星(56.25％)、氧氟沙星(54.46％)、恩诺沙星(53.57％)、左旋氧氟沙星(51.79％)和环丙沙星(51.77％)。其中，猪源及野生动物源菌株以对萘啶酸耐药为主，耐药率分别为72.22％和12.50％;人源菌株以对诺氟沙星耐药为主，耐药率为74.29％。PCR检测结果表明，PMQR基因的检出率由高到低依次为aac(6')-Ib-cr(49.65％)、qnrD(23.40％)、qnrS(22.70％)、qnrB(21.28％)、qrtrA(14.89％)及qepA(8.51％)。猪源菌株中aac(6’)-Ib-cr和qnrD检出率高，分别为69.57％和43.47％。aac(6')-Ib-cr和qnrS在人源菌株中分布较普遍，检出率分别为54.29％和37.14％。qnrA、qnrB和qepA在野生动物源菌株中均有一定检出率，分别为4.17％、8.33％和4.17％。本研究首次对不同来源大肠杆菌中六种PMQR基因进行调查研究，为大肠杆菌耐药性的防控提供参考依据。

摘要： 本试验旨在调查不同地域采集的不同菌种，对喹诺酮类药物(Quinolones)的耐药表型和质粒介导的喹诺酮耐药基因qnrD的分子流行情况，并对qnrD基因进行克隆，原核表达。2006～2009年从四川、河南等地分离到的大肠杆菌(141株)，沙门氏菌(31株)，肺炎克雷伯氏菌(46株)，肠球菌(50株)，奇异变形杆菌(20株)，共288株，采用微量稀释法测定试验菌株对环丙沙星(CIP)等四种喹诺酮类药物的MIC值;运用PCR方法调查qnrD基因的流行、分布情况;将qnrD基因定向克隆到表达载体pET-30b(+)中，转化大肠杆菌感受态BL21(DE3)，经IPTG诱导阳性菌，通过SDS-PAGE检测qnrD基因的表达。试验菌株的总耐药率分别为：沙门氏菌(88.41％)，奇异变形杆菌(82.65％)，肺炎克雷伯氏菌(78.36％)，肠球菌(72.81％)，大肠杆菌(60.25％);qnrD基因的检出率分别为沙门氏菌(64.51％)，肠球菌(38.00％)，大肠杆菌(23.40％)，肺炎克雷伯氏菌(6.52％)，奇异变形杆菌(0％);SDS-PAGE分析表明，重组载体pET-qnrD可成功的在大肠杆菌中表达qnrD蛋白。本研究首次报道了qnrD基因在不同细菌中的流行情况，首次在肠球菌，大肠杆菌，肺炎克雷伯氏菌中发现了qnrD基因，对qnrD基因进行原核表达为后续试验提供了基础材料。

摘要： 铜绿假单胞菌(PAE)广泛存在周围环境及人的皮肤、呼吸道和消化道等部位，该菌繁殖能力强，生长条件要求低，对许多抗菌药物有天然耐药性，易引起交叉感染，给临床治疗带来困难。为了提高该菌的治愈率，避免临床滥用抗菌药物，因此本文对从临床感染标本中分离的92株PAE进行了其耐药机制和多种抗菌药物联合作用的体外抗菌活性检测，为临床治疗PAE感染提供帮助。

摘要： 目的：明确质粒介导喹诺酮耐药新基因qnrS的结构及其生物学功能。rn 方法：采用接合实验、酶切、克隆等方法，由临床菌株携带的质粒中获取可引起耐药的酶切片段；通过生物信息学分析，预测酶切片段中潜在的耐药基因开放读码框(ORF)；针对预测到的ORF起始密码子作定点突变，比较突变前后耐药表型的变化以及与接合子、转化子间耐药表型的差异，确定耐药基因的结构及功能。rn 结果：①通过接合实验由奇异变形杆菌临床株获得可引起细菌对喹诺酮类敏感性下降的质粒pHS10，经酶切、克隆获得一插入片段为4.4kb的质粒亚克隆pHS11；②生物信息学分析显示，该片段中一ORF与qnrA、qnrS核苷酸序列一致性达60％，氨基酸序列也具有Qnr蛋白保守的五肽重复特征，提示存在一种新的qnr基因(根据国际公认的命名原则，现命名为qnrC)，在qnrC基因上游发现一个新的插入序列ISPmil，属IS3家族的IS51组成员，包含2个ORF，编码融合蛋白OrfAB；③qnrS基因含有ATG、TTG和ATT等3个潜在的起始密码子，通过对3个潜在起始密码子的定点突变及功能分析，证实TTG为起始密码子，编码QnrC含221个氨基酸，功能与已知Qnr相似。rn 结论：qnrC基因由666个核苷酸(含终止密码子)构成的新基因，编码一221个氨基酸构成的五肽重复蛋白，可介导对喹诺酮类药物的低水平耐药；其周边存在与基因转移相关的的插入序列及转座酶编码基因，具有不同细菌间传播的潜能。

摘要： 目的：rn 探讨结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其与耐药的关系.rn 方法：rn 2007年我国开展全国结核病耐药基线调查,调查覆盖除香港、澳门和台湾地区外的全国31省(自治区、直辖市),含70个调查点.本研究对来自基线调查的3861例涂阳结核病患者的分枝杆菌进行分析,采用比例法进行药物敏感性试验,以间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)，对结核病患者的分离菌株进行基因分型.Epi Info 3.5.1(美国CDC)建立数据库,SAS 9.1软件进行统计学分析,以卡方检验分析不同变量之间的关系,以P＜0.05为有统计学意义.rn 结果：rn 北京基因型菌株在我国广泛流行,总流行率63.97％(2470/3861).感染北京基因型菌株与年龄(＜30岁vs≥60岁:OR=0.9604,95％CI=0.7995～1.1536;30～岁vs ≥60岁:OR=1.0620,95％CI=0.9071～1.2434,x2=0.3885,Ptrend=0.6977)、 性别(OR=1.1526,95％CI =0.9973～1.3321,x2=3.7024,P=0.0543)无关;北京基因型菌株与抗结核药物INH(OR=0.9020,95％CI=0.766～1.0619,x2=1.5356,P=0.2153)、RFP(OR=1.0017,95％CI=0.8166～1.2288,x2=0.0003,P=0.9868)、Sm (OR=0.9406, 95％CI=0.8139～1.08711, x2=0.6869,P=0.4072)、EMB(OR=0.9222, 95％CI=0.7205～1.1804,x2=0.4140,P=0.5199)、Ofx(OR=0.9624, 95％CI=0.6923～1.3378,x2=0.0520,P=0.8196)和Km(OR=1.1666,95％CI=0.7624～1.7852,x2=0.5049,P=0.4774)任何耐药均无关联; 与单耐INH(OR=0.9955,95％CI=0.7206～1.3753,x2=0.0007,P=0.9783)、RFP(OR=0.9615,95％CI=0.4880～1.8944, x2=0.0129,P=0.9096)、EMB(OR=0.5533, 95％CI=0.2023～1.5136,x2=1.3675,P=0.2422)、Ofx (OR=0.8445, 95％CI=0.3965～1.7984,x2=0.1926,P=0.6608)、Km(OR=1.7779,95％CI=0.4440～7.1203,x2=0.6791,P=0.4099)也均无关联;与耐多药(MDR) (OR=0.9884,95％CI=0.7594～1.2284,x2=0.0 110,P=0.9166)和广泛耐药(XDR) (OR=1.1502,95％CI=0.5372～2.4626,x2=0.1300,P=0.7185)均无显著性关联.rn 结论：rn 我国是北京基因型菌株的高流行区,感染北京基因型菌株与年龄、性别无关,北京基因型菌株与耐药无关.

摘要： 本发明公开了一种重组慢病毒在HIV表型耐药检测中的应用，该重组慢病毒是包装质粒、包膜质粒和转移质粒共转染293FT细胞或293T细胞后得到的包装体；其中，所述包装质粒为psPAX2m‑pol质粒；所述转移质粒为pHAGE‑CMV‑Luc‑IRES‑ZsGreen质粒。该重组慢病毒安全高效毒副作用小成本低，将其应用于HIV表型耐药检测中，能为临床上合理有效地选用抗HIV药物提供重要参考依据。该转移质粒报告基因Luciferase与ZsGreen位于pHAGE‑CMV‑Luc‑IRES‑ZsGreen上，且由CMV启动子控制报告基因Luciferase与ZsGreen的表达，使得HIV‑1抑制剂的抗病毒效果能够简易地通过在倒置荧光显微镜下观察到或通过测定荧光素酶活性而获得，将pol区导入后，多种细胞用具有此转移质粒的重组慢病毒均可进行耐药性检测，通用性强。

摘要： 本发明公开了一种HBV表型耐药检测试剂盒，该试剂盒包括可以置换HBV1.0片段的重组入门载体pcDNA6.2‑HBV1.1‑sapI载体，其碱基序列如SEQ ID No.4所示，和带有分泌性碱性磷酸酶的双表达载体pcDNA5AP‑attR载体，其碱基序列如SEQ ID No.6所示。本发明提供的耐药检测试剂盒主要包括一套基于GatewayTM重组的表达载体系统，该重组系统避免了限制性内切酶位点对克隆地限制，可以快速、正确地将目的片段引入表达载体，并且可利用培养基上清进行化学发光定量检测，不仅灵敏度高而且可以根据标准碱性磷酸酶的对照进行定量和校准，操作简便，稳定。

摘要： 本发明公开了一种重组慢病毒在HIV表型耐药检测中的应用，该重组慢病毒是包装质粒、包膜质粒和转移质粒共转染293FT细胞或293T细胞后得到的包装体；其中，所述包装质粒为psPAX2m-pol质粒；所述转移质粒为pHAGE-CMV-Luc-IRES-ZsGreen质粒。该重组慢病毒安全高效毒副作用小成本低，将其应用于HIV表型耐药检测中，能为临床上合理有效地选用抗HIV药物提供重要参考依据。该转移质粒报告基因Luciferase与ZsGreen位于pHAGE-CMV-Luc-IRES-ZsGreen上，且由CMV启动子控制报告基因Luciferase与ZsGreen的表达，使得HIV-1抑制剂的抗病毒效果能够简易地通过在倒置荧光显微镜下观察到或通过测定荧光素酶活性而获得，将pol区导入后，多种细胞用具有此转移质粒的重组慢病毒均可进行耐药性检测，通用性强。

摘要： 本申请涉及一种基于机器学习技术筛选细菌耐药表型相关重要特征基因的方法，该方法针对细菌抗生素耐药表型，基于BGWAS思想搜集公共平台上目标细菌基因组或者现行收集测序组装后得到的大样本量菌株基因组数据及其对应的抗生素药物药敏测试结果，使用机器学习方法进行基因型与耐药表型两者间关联分析，以筛选出与耐药表型相关的重要特征基因(非核心耐药基因)，同时得到重要特征基因的权重系数，最后使用ROC分析确定各药物相关耐药基因可靠性。

摘要： 一种耐药表型快速检测药敏平板及耐药表型快速检测方法，用于耐药表型快速检测，在药敏平皿内的M‑H琼脂厚度均匀地铺设为3mm构成tMHA。在tMHA上涂布2.0～3.0麦氏单位菌液后贴药敏纸片，仅需4～6小时的培养，即可根据抑菌环直径判断出是否为相应的耐药表型。本发明公开了一种薄型M‑H药敏平板，可以将细菌耐药表型检测的时间从现有技术最快的16‑24小时缩短到4‑8小时，快速简便地检测细菌耐药表型对及时有效地抗感染治疗有非常重大的临床意义，利于临床的及时治疗和医院感染的防控。

摘要： 本申请涉及生物信息学技术领域，具体涉及一种基于基因测序reads比对的用于检测鉴定耐药基因和预测耐药表型的模型构建方法。本发明结合耐药表型相关重要特征基因，构建实现基于测序read序列直接进行目标病原细菌及其携带的耐药基因的比对检测鉴定,以及耐药表型的预测。

摘要： 一种大肠杆菌β‑内酰胺类获得性耐药表型预测复合工具，解决了现有预测耐药表型的工具一般通过对氨基酸序列进行一系列计算，而且计算需要多软件、多系统平台进行，用户友好度不佳，对于非生物学或非信息学的研究人员来说，现有的方法具有很强的技术壁垒的问题，其包括预处理和预测与识别，所述预处理包括步骤：提取目标耐药基因构件训练集；去除非获得性耐药相关基因；随机过程切割数据；预加重和平稳性控制；LPCC特征系数/灰度关联；本发明结构新颖，构思巧妙，模型构建于R包和JavaWeb网页中，并加入数据库更新策略，提高效用价值。

摘要： 本发明涉及微生物鉴定技术领域，尤其是涉及一种金黄色葡萄球菌耐药表型蛋白质指纹图谱库的构建方法。包括以下步骤：收集金黄色葡萄球菌株，对收集的菌株进行菌种鉴定和药物敏感性试验，得到菌株表型结果；对所收集的菌株进行分子流行病学调查，得到菌株表型结果；对PVL表达出的蛋白质进行质谱检测，得到蛋白质指纹图谱，对PBP2a进行质谱检测，得到蛋白质指纹图谱，通过对比得到的菌株表型结果找到PVL特征峰的位置和PBP2a特征峰的位置；分别建立不同菌株的蛋白质指纹图谱，分别建立PVL特征峰和PBP2a特征峰的蛋白质指纹图谱。本发明成本低、效率高、操作简单，能够将菌种鉴定和药敏表型筛选时间缩短。

摘要： 本发明公开了一种快速检测菌株耐药表型的方法，首先用营养肉汤配制浓度呈梯度变化的抗菌药物稀释液，然后取不同浓度的抗菌药物滴加到质谱仪样品靶板上形成药敏靶板，干燥后备用；用无菌生理盐水配制待检测菌株的标准菌悬液，再用营养肉汤稀释后备用；取稀释后的标准菌悬液依次滴加于制备好的药敏靶板上，形成微滴，然后将其放在湿盒内，置于恒温箱孵育2h～6h，弃药敏靶板上的肉汤；晾干后，再滴加质谱鉴定前处理试剂，结晶后用质谱仪进行微生物鉴定并判读结果。本发明操作简单，耗材少，不依赖于任何耐药机制，可以根据需求包被抗生素及浓度个数，检测快速，结果直观明了，不需要过多的分析，适用范围广。

摘要： 一种耐药表型快速检测药敏平板，用于耐药表型快速检测，在药敏平皿内的M‑H琼脂厚度均匀地铺设为3mm构成tMHA。在tMHA上涂布2.0～3.0麦氏单位菌液后贴药敏纸片，仅需4～6小时的培养，即可根据抑菌环直径判断出是否为相应的耐药表型。本实用新型公开了一种薄型M‑H药敏平板，可以将细菌耐药表型检测的时间从现有技术最快的16‑24小时缩短到4‑8小时，快速简便地检测细菌耐药表型对及时有效地抗感染治疗有非常重大的临床意义，利于临床的及时治疗和医院感染的防控。