翻译后修饰

摘要： 空气污染严重损害国人健康,而污染空气中所包含的PM2.5细颗粒物严重损害呼吸和循环系统功能。长期暴露于PM2.5环境中可以诱导气道炎症和气道高反应,但是机制不明确。空军军医大学西京医院王琼和基础医学院马恒团队合作研究发现,NF-κB家族成员p65的翻译后修饰在PM2.5诱导的气道炎症和支气管高反应性中具有重要作用。该研究发现在支气管组织中组蛋白去乙酰化酶SIRT2可调节p65的乙酰化和磷酸化修饰,通过非经典通路调控NF-κB信号通路活性。

摘要： 精氨酸甲基化是哺乳动物体内组蛋白翻译后修饰的重要组成部分,并由蛋白质精氨酸甲基转移酶(protein arginine methyltransferases, PRMTs)负责催化调控。蛋白质精氨酸甲基转移酶1 (PRMT1)是PRMTs家族中第一个被发现的成员,并参与了细胞信号传导、基因转录调节、RNA代谢、DNA损伤修复及蛋白质相互作用等多种细胞生理活动过程。PRMT1的失调和异常通常会导致包括炎症、退行性疾病和癌症等多种疾病的发生。因此通过抑制PRMT1能够达到治疗相关疾病的效果。本文主要介绍PRMT1在癌症中的作用及其抑制剂的研究进展,为以PRMT1为靶点的药物研发提供思路。

摘要： 前言烟曲霉是一种常见的机会性致病真菌,其孢子漂浮在空气中,人体每天吸入上百个孢子,免疫功能正常人群可通过自身免疫清除吸入的孢子,而在免疫抑制患者中常引起曲霉病[1-2],曲霉病分为非侵袭性和侵袭性两大类,其中侵袭性肺曲霉病为严重的感染类型,死亡率可高达50%~100%[3]。唑类药物为侵袭性肺曲霉病的临床一线用药,但近年来全球陆续报道烟曲霉对唑类抗真菌药物的耐药率逐年递增。荷兰一项基于1994—2016年的烟曲霉唑类耐药趋势研究共收集4268株菌株,结果显示唑类耐药率高达4.2%(179/4268),且近5年明显呈递增趋势[4]。

摘要： 脂肪酸合成酶(FASN)是机体合成内源性脂肪酸的必需酶,其终产物软脂酸是细胞膜构成的主要成分,同时能为组织和细胞提供能量,对机体内糖脂代谢有非常关键的作用。FASN是一种与糖脂代谢紊乱密切相关的多种疾病(如肥胖、2型糖尿病、非酒精性脂肪肝、肿瘤)的治疗靶点。近年来,探索表观遗传学(如DNA甲基化、组蛋白修饰、翻译后修饰、微RNA调控)对FASN表达和蛋白水平影响的研究较多,深入研究FASN表观遗传修饰的调节机制,有助于改善机体糖脂代谢及防治相关疾病。

摘要： 翻译后修饰是指多肽或蛋白质在翻译后所经历的共同加工过程,近年研究发现,程序性细胞死亡蛋白配体1(PD-L1)的翻译后存在多种修饰形式,例如糖基化、泛素化、磷酸化、甲基化、棕榈酰化和乙酰化等。翻译后修饰可通过影响PD-L1的蛋白质稳定性,促进PD-L1介导的肿瘤免疫逃逸,阻断PD-L1与程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)的结合,增强自身免疫细胞对肿瘤细胞的杀伤功能,在PD-L1蛋白稳定性、易位和蛋白—蛋白相互作用中发挥重要作用,翻译后修饰的异常改变直接影响PD-L1介导的免疫抵抗。鉴于翻译后修饰机制通常是药物抑制肿瘤的治疗靶点,靶向PD-L1翻译后修饰可能是一种增强抗肿瘤免疫反应的新策略。

摘要： 恶性肿瘤是常见的严重威胁人类生命和影响人类生活质量的重大疾病之一。探索肿瘤细胞中普遍存在但又异于正常细胞的生物学特性,并针对该特性进行特异性干预,是提高肿瘤治疗疗效的关键。肿瘤细胞代谢的改变是肿瘤的重要特征之一,其与肿瘤的发生发展互为因果。随着对肿瘤代谢分子生物学基础研究的深入,越来越多的证据表明,代谢过程的改变包括但不局限于代谢酶自身的突变或代谢调控蛋白的活性变化,均可导致肿瘤细胞的代谢重编程,使肿瘤细胞具有特征性的代谢模式。翻译后修饰是细胞内的特定化学基团从一个蛋白传递到另一个蛋白的反应,是细胞信号转导的重要环节。肿瘤细胞通过翻译后修饰介导原癌基因的激活和/或抑癌基因的抑制,弱化细胞周期调节和增强增殖生长信号,促使肿瘤发生和快速发展。肿瘤细胞如何通过翻译后修饰介导代谢重编程,为肿瘤快速增殖提供代谢优势,翻译后修饰所调控的代谢特征是否能够成为预测肿瘤发生发展的生物标志物并成为靶向治疗肿瘤的新靶点,正成为近年来的研究热点领域。为了进一步了解这一领域的研究进展,本文集中介绍了近年来不同类型的翻译后修饰参与肿瘤代谢重要途径重编程的主要研究成果。

摘要： 微管是构成细胞骨架的重要元素,具有调节细胞形态、驱动有丝分裂、为细胞内运输提供平台、介导细胞运动的作用。近年来,微管作用于心血管疾病的研究逐渐深入,其机制与微管蛋白翻译后修饰(如乙酰化、去酪氨酸化)及微管运输系统相关。微管的稳态失调参与了心肌梗死、动脉粥样硬化、心律失常等心血管疾病的病理过程。靶向微管的治疗或可成为心血管疾病新的治疗策略。因此,阐明微管的生物学功能与心血管疾病的关系对心血管疾病的防治具有重要意义,这将为心血管疾病靶向微管治疗提供新思路。

摘要： 缝隙连接蛋白(connexin,Cx)是一个多基因编码的跨膜蛋白家族,能够在细胞膜上组成缝隙连接通道(gap junction,GJ)和半通道(hemichannel,HC),介导细胞之间、细胞质与细胞外环境之间的通讯功能,或在细胞质中通过羧基端与其他蛋白分子相互作用,参与肿瘤细胞增殖、凋亡、坏死、侵袭、转移、耐药和干细胞特性等过程。Cx在许多肿瘤细胞中常出现细胞质或细胞核等异常亚细胞定位并参与肿瘤的发生发展。翻译后修饰(包括磷酸化、泛素化、乙酰化等)是影响Cx亚细胞定位的重要因素。该文从Cx的分类、功能及其亚细胞定位与肿瘤发生发展的关系以及翻译后修饰对Cx亚细胞定位的重要影响进行综述,以期为Cx作为抗肿瘤药物治疗的潜在靶点提供新的思路。

摘要： 作为糖酵解的副产物,乳酸长期以来被认为是一种代谢废物。肿瘤细胞中瓦博格效应的发现使研究人员重新审视乳酸,并先后阐明乳酸在充当燃料和信号分子、促进血管生成以及抑制肿瘤免疫细胞等方面的关键作用,然而乳酸调控上述生物学功能的分子机制还不明确。细胞生命活动产生的数千种代谢小分子不仅仅是蛋白质(酶)催化的产物,同时也能够反过来通过共价修饰的方式影响蛋白质的功能。2019年末和2020年初,有两个研究组独立报道了以乳酸为底物的一种新型蛋白质翻译后修饰——蛋白质乳酸化,并揭示了乳酸化是乳酸对细胞生命活动进行调节的一种重要手段。本文简要描述了乳酸化的发现过程,总结了乳酸化的潜在“写入者”和“擦除者”、多种生物体中蛋白质乳酸化图谱概况以及乳酸化在不同生理和病理过程中调节作用的最新研究进展,并展望了未来蛋白质乳酸化研究的关键问题和科学意义。

摘要： 精氨酰蛋白转移酶(Arginyltransferase,ATE1)是后生动物和真菌中唯一已知的催化翻译后精氨酰化的酶,可通过介导蛋白质精氨酰化,维持细胞的生理过程,在多种生物学功能中起着关键作用。ATE1的失调被证明与心血管异常、癌症和神经退行性疾病等有关。本文就ATE1的结构功能及其与疾病的相关性等方面作一综述。

摘要： 蛋白质翻译后修饰是指在细胞生命活动过程中,特定氨基酸残基的侧链共价地连接新的化学基团或小蛋白质,以及主链共价键在水解酶切的作用下发生断裂.翻译后修饰的时空特异性极大地丰富了蛋白质组的多样性,并在调节蛋白质的稳定性与功能上起到了极为重要的作用,从而参与细胞的各项生化和生理过程.最近,围绕翻译后修饰,针对赖氨酸修饰的底物位点构建了数据资源CPLM,针对磷酸化相关的蛋白激酶和磷酸酶构建了数据资源EKPD,系统分析了小鼠睾丸中的磷酸化调控。蛋白质磷酸化是另外一种重要的翻译后修饰，参与了几乎所有的生物学过程。磷酸化由复杂的蛋白激酶和磷酸酶可逆地调节。通过计算预测重构了位点特异性激酶底物调控网络，并获得了精子发生相关蛋白质的子网络。对网络的分析结果发现包括MAPK,CDK2和CDC2在内的激酶拥有显著多的底物位点，这表明这些激酶应该有很高的活性并在精子发生过程中非常重要。

摘要： 利用二甲基化轻、重同位素标记，建立了一种简单、快速的两步标记的策略，可以实现组蛋白翻译后修饰的鉴定和定量分析。首先，利用重同位素试剂对组蛋白中游离的赖氨酸进行封闭，这一衍生可以和体内的二甲基化修饰很好的区分，Trypsin酶解肽段后，利用质谱分析，可以实现对同一位点各种修饰与未修饰的相对定量。然后利用轻、重同位素试剂对酶解肽段N端分别进行第二次标记，可以实现对不同样品间赖氨酸位点各修饰的相对定量。

摘要： 氟固相萃取技术是一类在有机合成中被广泛使用的目标分子分离手段,该技术的基本流程是首先在目标分子上衍生一定长度的氟烷烃链,使其带上氟标签,然后利用高氟化固相材料通过氟-氟相互作用分离纯化目标分子.由于氟标签和质谱良好的兼容性,近年来,这一技术开始被应用到各类基于生物质谱的组学研究中(如蛋白质组、翻译后修饰蛋白质组、代谢组等).不同于一般的标签富集技术（如生物素标签、组氨酸标签等），氟标签不仅有着庞大的标签试剂备选库，能够被应用于各类目标物的分析；同时，氟标签的疏水性还有利于提高目标分析物在质谱过程中的离子化效率，提升其质谱信号；除此之外，由于氟烷烃结构简单且稳定，不会在生物质谱常用的串级碎裂方式中解离，因此氟标签不会产生大量不规则且难以预测的串级质谱碎片，有利于通过串级质谱对目标物的结构进行分析。由于氟-氟相互作用能够耐受较高的盐浓度，氟固相萃取又采用低有机相上样液和高有机相洗脱液，因此利用这一技术对目标物的分离富集也有利于样品在质谱分析前的脱盐。

摘要： 在组学层次研究蛋白质翻译后修饰可以在全局、系统的层面理解翻译后修饰调控生物过程的规律.尽管蛋白质组学技术在揭示蛋白质磷酸化、N-糖基化、乙酰化等高丰度翻译后修饰方面已经取得了很好的效果,但是对一些低丰度的翻译后修饰目前还缺少有效的分析方法.蛋白质组学方法分析翻译后修饰涉及修饰蛋白质/肽段的富集、分离、质谱检测及谱图解析等多个环节.低丰度翻译后修饰分析困难往往是由于多个环节缺少方法造成的.针对常规的基于抗体的酪氨酸磷酸化肽段富集策略灵敏度低、重复性差的问题，首次将从SH2结构域蛋白质突变而来的SH2超亲体应用于复杂样品中酪氨酸磷酸化肽段的富集[1]，发现该SH2超亲体对酪氨酸磷酸化肽段的富集能力优于常见的多种商品化酪氨酸磷酸化抗体。将该方法应用于9个细胞系样品中酪氨酸磷酸化蛋白质组分析，共鉴定到了10,030个高可信的酪氨酸磷酸化位点，其中36%的位点为首次鉴定，使酪氨酸磷酸化蛋白质组学的研究达到了一个前所未有的深度和广度。

摘要： 生命科学研究的重心也从基因组学进入后基因组学时代——即蛋白质组学.众多研究表明蛋白质在基因表达以后,还要经过不同程度的修饰(例如磷酸化、糖基化、乙酰化、甲基化、泛素化等)才能发挥所需的功能,这种翻译后修饰过程受到一系列修饰酶和去修饰酶的严格控制,使得在某一瞬间细胞中蛋白质表现出稳定或动态的特定功能.有充足的理由认为,这种经过了特定修饰的蛋白质,更客观地反映了细胞的各种生理以及病理过程.这就催生了一个新的研究领域——翻译后修饰蛋白质组学.然而这一前沿的研究方向,受到了富集材料的严重制约.系统总结了面向糖蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学的聚合物基富集材料，重点论述了智能聚合物材料在这些领域应用的可能性和优越性。

摘要： 在Ser273阻断过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)的磷酸化是抗糖尿病药物靶向PPARγ的关键机制之一.用高通量磷酸化筛选,得出在缺乏作为PPARγ拮抗剂配体的经典激动剂情况下,Gleevec阻断CDK5介导的PPARγ磷酸化.在高脂喂养小鼠中,Gleevec可改善胰岛素敏感性而不引起与其他pPAR靶向药物相关的严重副作用.而且,Gleevec还降低了肝脏中脂肪和葡萄糖生成基因的表达,改善了脂肪组织中的炎症反应.有趣的是，Gleevec增加了白色脂肪组织(WAT)的褐变和能量消耗。总之，Gieevec通过阻断PPARγ磷酸化对糖/脂代谢和能量平衡都有更大的益处。这些数据表明Gleeve。是一种治疗胰岛素抵抗和2型糖尿病的新型药物。

摘要： 蛋白激酶是一类十分重要的蛋白质翻译后修饰催化酶,介导着许多重要蛋白质的磷酸化修饰,在细胞信号级联放大转导、基因表达和酶活性调控等生物学过程中发挥功能。大量的研究证明,在肿瘤的发生发展中,蛋白激酶特别是酪氨酸蛋白激酶发挥着十分重要的作用,而成为许多抗肿瘤药物的靶点。以往人们普遍认为,激酶参与肿瘤的发生发展仅与其异常蛋白质磷酸化修饰活性相关。然而最近的研究发现尽管肿瘤的发生与某些激酶的表达异常显著相关,但仅仅阻断某些激酶活性在大多数肿瘤患者身上并未导致明显的临床效果,暗示激酶这类生物大分子在肿瘤中可能还存在着其它的非磷酸化修饰以及功能表现形式。而这些翻译后修饰含量低、组成复杂、丰度差异大,其检测是生物分析技术面临的挑战。本文以激酶中多种低丰度修饰为目标,将蛋白标签融合技术与Shotgun技术相结合,探索系统研究激酶中各种翻译后修饰的新方法。

摘要： 目的：对赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展进行综述.方法：通过系统的文献调研,以近年来的外文文献为依据描述了赖氨酸甲基转移酶与肿瘤的关系,以及小分子赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展.结果：与结论目前已经涌现出大量的小分子化合物作为赖氨酸甲基转移酶抑制剂,部分已经进入临床前研究或作为抗肿瘤药物进入临床研究.

摘要： 目的：对赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展进行综述.方法：通过系统的文献调研,以近年来的外文文献为依据描述了赖氨酸甲基转移酶与肿瘤的关系,以及小分子赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展.结果：与结论目前已经涌现出大量的小分子化合物作为赖氨酸甲基转移酶抑制剂,部分已经进入临床前研究或作为抗肿瘤药物进入临床研究.

摘要： 目的：对赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展进行综述.方法：通过系统的文献调研,以近年来的外文文献为依据描述了赖氨酸甲基转移酶与肿瘤的关系,以及小分子赖氨酸甲基转移酶抑制剂的研究进展.结果：与结论目前已经涌现出大量的小分子化合物作为赖氨酸甲基转移酶抑制剂,部分已经进入临床前研究或作为抗肿瘤药物进入临床研究.

摘要： 本发明公开了一种糖蛋白多种电荷异构体翻译后修饰的评价方法。该方法包括以下步骤：1）通过等电聚焦电泳将多种电荷异质体进行分离；2）对多种电荷异质体分离后的条带进行切割并收集；3）收集后的多种异质体分别进行胶内酶切；4）提取胶内酶切后的肽段；5）对提取后的肽段进行质谱分析，确认氧化、脱酰胺、C末端Lys缺失和糖基化等翻译后修饰。本发明的方法克服了多种电荷异构体对翻译后修饰分析的难点，能够精确分析单一电荷糖蛋白的多种翻译后修饰，更有利于对多种电荷异构体相关的多种翻译后修饰进行精确分析，适用于糖蛋白多种电荷异质体翻译后修饰的分析及评价。

摘要： 本发明公开了检测翻译后修饰蛋白质与其配体间相互作用的成套试剂。本发明的成套试剂，由A、B、C和D四种试剂组成；A由名称为R的生物分子和名称为X的蛋白质连接而成；B含有名称为L的生物分子；R与L相同或不同且二者间具有相互作用，R与L相互作用后发生相变；C为由C单体形成的多聚体，C单体由名称为mc的单体、名称为甲的报告基团和名称为YC的生物分子连接得到的分子，大于等于两个的mc能形成多聚体；D由名称为XL的带有修饰的蛋白质和名称为YD的生物分子连接而成；YC与YD间具有相互作用。本发明实现了互作蛋白和配体在相变液滴中的高度富集，将弱互作信号放大，使之易于检测。

摘要： 本发明提供了一种基于组蛋白H3K27位点翻译后修饰的多肽探针，其氨基酸序列结构如下所示，本发明基于组蛋白H3的氨基酸序列，以H3K27位点为中心进行设计，以保护的赖氨基酸为原料，经过非天然氨基酸和多肽的合成，实现了这种多肽探针的合成。本发明发现了与组蛋白H3K27位点乙酰化和巴豆酰化修饰的靶标蛋白STAT3。本发明能提高多肽探针与组蛋白赖氨酸翻译后修饰靶标蛋白的结合，对于寻找组蛋白H3K27翻译后修饰Readers、Writers和Erasers等调控蛋白提供了一种新的思路。

摘要： 提供了用于递送完全人类翻译后修饰的治疗性单克隆抗体及其抗原结合片段的方法和组合物。所述完全人类翻译后修饰的治疗性单克隆抗体可通过基因治疗方法，例如以重组腺相关病毒(rAAV)载体形式递送至适当组织。还提供了制造所述AAV载体的方法、药物组合物和治疗方法。另外，提供了产生作为完全人类翻译后修饰的“生物改良剂”的治疗性抗体的方法。这些完全人类翻译后修饰的治疗性抗体可施用于需要用所述治疗性抗体进行治疗的受试者。

摘要： 描述了用于将针对人血管内皮生长因子(“hVEGF”)的全人经翻译后修饰的(HuPTM)单克隆抗体(“mAb”)或mAb的抗原结合片段——例如，全人经糖基化的(HuGly)抗hVEGF抗原结合片段——递送到被诊断患有糖尿病性视网膜病变的人类受试者的眼睛中的视网膜/玻璃体液(vitreal humour)的组合物和方法。

摘要： 用于预测蛋白质翻译后修饰位点的深度学习方法,涉及生物信息学领域。包括：从公共数据库上收集带有蛋白质翻译后修饰位点注释的蛋白质序列数据；对收集到的蛋白质序列进行去冗余处理，并删除可信度较低的位点注释信息，得到不同PTM类型的蛋白质序列集合；构建基于深度神经网络的预测模型，提取蛋白质序列的短程耦合信息和长程耦合信息；利用蛋白质序列数据集为每种PTM类型训练一个预测模型；将训练好的预测模型部署到网上得到在线预测系统；用户通过在线预测系统输入蛋白质序列文件，选择需要预测的PTM位点类型，在线系统返回PTM位点的预测结果。可以同时预测多种PTM位点，可为生物医学研究和药物设计提供相关的蛋白质信息。

摘要： 本发明提供物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统包括：通过数据预处理获取翻译后修饰位点及差异物种训练样本；构建出序列特征提取网络并设置分类器及领域类别判别器；语义对抗策略处理所述差异物种训练样样本，以得到样本配对组；使用所述人类翻译后修饰样本训练所述序列特征提取网络及分类器，根据所述样本配对组训练领域类别判别器，以区分输入样本对的组别信息，交替训练序列特征提取网络和领域类别判别器，以使所述序列特征提取网络、所述分类器及所述领域类别判别器学习到领域不变性判别特征空间；评估深度神经网络的性能。解决了预测方式低效、昂贵、耗时、拟合以及预测精度低的技术问题。

摘要： 本发明公开了一种基于多头注意力的蛋白质翻译后修饰预测方法，属于生物信息技术领域，包括如下步骤：预处理带有翻译后修饰标注信息的蛋白质序列，得到合法字符集、第二蛋白质序列数据集和基准数据集；基于合法字符集得到三种词汇表；对第二蛋白质序列数据集中的蛋白质序列样本进行多尺度划分，得到单个氨基酸尺度数据集、二肽尺度数据集和三肽尺度数据集；利用Skip‑gram模型结构对语料库进行训练，得到三种词向量模型；对基准数据集的蛋白质序列片段进行多头注意力模型的标签预测，得到蛋白质序列片段预测结果；本发明通过多尺度词向量全面利用原始蛋白质序列中的多肽组成信息，并降低了对于生物学特征工程的依赖。

摘要： 公开了在单次质谱(MS)运行中量化多个样品的多个质量属性(例如翻译后修饰)的方法，包括在足以消化样品的条件下将两个或更多个样品与消化溶液接触，其中每个样品被单独消化并且消化溶液为不含Tris的缓冲溶液；在足以用特异性串联质量标签(TMT)标记试剂标记消化样品中的每一个内的肽的条件下，使两个或更多个消化样品中的每一个与特异性TMT标记试剂接触；对两个或更多个消化样品中的每一个中的肽进行淬灭标记；将等体积的两个或更多个标记、消化的样品合并成单个组合样品溶液；和通过靶向质谱分析，分析所述单个组合样品溶液，从而允许在单个质谱(MS)运行中量化两个或更多个样品的多个质量属性。

摘要： 携带TP53基因突变和/或p53蛋白翻译后修饰的癌症的治疗。本发明涉及属于细小病毒科原细小病毒属的病毒或这种病毒与化疗药物的组合在治疗癌症中的用途。特别地，该癌症的特征为显示TP53基因突变和/或p53蛋白翻译后修饰。