相互作用蛋白

摘要： 目的:鉴定肝癌相关抗原KTN1相互作用蛋白,旨在筛选出与KTN1相结合的重要蛋白,为进一步研究KTN1在肝细胞癌(HCC)中发挥生物学功能的机制提供实验依据。方法:选取HCC细胞株Huh7、HepG2和正常肝细胞株WRL68为实验对象。RIPA法提取各组细胞的总蛋白,考马斯亮蓝染色鉴定蛋白质提取效果,Co-IP实验下拉KTN1蛋白结合蛋白并用Western blotting和蛋白质银染鉴定下拉效果。利用label-free技术对下拉蛋白质进行鉴定,采用ProteinPilot软件分析质谱的结果,采用Skyline软件对蛋白质进行定性和定量分析。利用生物信息学数据库对富集的蛋白质进行GO功能注释和KEGG通路注释分析。结果:考马斯亮蓝染色显示3种细胞的蛋白条带清晰可见。Western blotting和蛋白质银染鉴定Co-IP实验下拉的蛋白中可见KTN1蛋白条带,各组Co-IP富集后均可见10个以上的条带,而阴性对照IgG的泳道则没有蛋白条带或者极少的蛋白条带。Label-free技术共鉴定出29种KTN1结合蛋白,其中H2B1L、IGHG2、VSXL2、RS18、H32、SHRM3、CALL5、SIK3等8种蛋白仅在HCC细胞系Huh7样本中检出。GO分析显示Huh7细胞株中下拉20种KTN1结合蛋白富集于14个生物过程、11个细胞组分和7种分子功能。KEGG通路注释显示这20种蛋白主要富集于Alcoholism和Systemic lupus erythematosus两个通路。结论:在肝细胞癌株Huh7中鉴定出了20种KTN1蛋白结合蛋白,其中H2B1L、IGHG2、VSXL2可能共同参与了KTN1在HCC中的生物学作用。

摘要： 目的 我们前期通过串联亲和偶联蛋白质组学技术成功地筛选出胃癌细胞SGC7901中与TXNDC5相互作用的蛋白质,在这些蛋白质中除去功能意义较为明确的蛋白,TXNIP、PRDX2、PDCD4和ADIPOR1可能在肿瘤发生发展中具有一定作用,但其具体分子作用机制尚不清楚。本研究进一步验证在胃癌组织和细胞中TXNDC5蛋白与上述蛋白的关键相互作用。方法 以pcDNA3.1为基础构建pcDNA3.1-TXNDC5真核表达载体,并以此载体瞬时转染人胃癌SGC7901细胞,RT-PCR法及Western blotting法检测TXNDC5蛋白表达。采用免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP)法验证TXNDC5高表达细胞系中其与TXNIP、PRDX2、PDCD4、ADIPOR1的相互作用。取人胃腺癌新鲜手术标本提取总蛋白,采用Western blotting法检测TXNDC5蛋白表达,选取确认为TXNDC5高表达的胃癌组织总蛋白采用Co-IP验证TXNDC5与TXNIP、PRDX2、PDCD4、ADIPOR1的相互作用。结果 通过Co-IP法验证,TXNDC5高表达胃癌细胞系中,TXNDC5与TXNIP、PRDX2、PDCD4存在相互作用;TXNDC5高表达胃癌组织中,TXNDC5与TXNIP、PDCD4存在相互作用。结论 本研究通过Co-IP技术成功地验证了胃癌细胞和组织中TXNDC5与TXNIP、PDCD4存在相互作用,提示TXNDC5在胃癌中的促癌分子机制可能通过与TXNIP和PDCD4相互作用影响其相关信号通路有关。

摘要： 目的 分析SRXN1 (sulfiredoxin 1,SRXN1)在老年结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者中的功能,筛选与其相互作用的蛋白。方法 利用生信网站,对老年CRC患者中SRXN1的表达情况和SRXN1与肿瘤信号通路的相关性进行分析。采用免疫共沉淀及质谱分析方法,鉴定SRXN1在CRC细胞中的相互作用蛋白。结果 生信分析发现老年CRC患者中SRXN1的mRNA水平升高(61~80岁,P=1.62E-12;81~100岁,P=1.72E-05),并且与预后不良密切相关。SRXN1在CRC中与多种肿瘤信号通路存在相关性。采用质谱分析筛选出可能与SRXN1相结合的新的蛋白75个,其中7个为CTLH (carboxy-terminal to LisH) E3泛素连接酶复合体的构成亚基。结论 SRXN1在老年患者CRC发生发展中发挥重要作用,可能是潜在的抗肿瘤分子靶标,并且可能与CTLH复合物存在较为紧密的功能联系。本研究为进一步阐明SRXN1在CRC中的功能提供参考,为老年CRC患者的靶向治疗提供科学依据。

摘要： 目的 筛选并分析硫氧还蛋白5(TXNDC5)在胃癌细胞中的关键相互作用蛋白分子.方法 以pcDNA3.1为基础构建pcDNA3.1-TXNDC5-FLAG真核表达载体,并以此载体瞬时转染人胃癌细胞系SGC7901,RT-PCR法及Western blotting法检测TXNDC5融合蛋白表达.采用串联亲和纯化技术收集胃癌细胞内TXNDC5相互作用蛋白分子进行电泳分离及ESI-Q-TOF串联质谱分析鉴定TXNDC5相互作用蛋白质.结果 构建的pcDNA3.1-TXNDC5-FLAG真核表达载体经DNA序列测定完全正确,转染胃癌细胞后RT-PCR法及Western blotting法可检测到TXNDC5分子表达.经串联亲和纯化及蛋白质组学分析,通过NCBI蛋白质数据库检索比对,筛选出TXNDIP等16个蛋白分子.结论 本研究通过串联亲和偶联蛋白质组学技术成功的筛选出胃癌细胞SGC7901中与TXNDC5相互作用的蛋白质,并进行了初步分析,提出了TXNDC5可能的分子作用机制,为进一步研究打下基础.

摘要： 目的 初步探讨C1orf194基因内Ile122Asn突变导致常染色体显性遗传腓骨肌萎缩症(CMT)的分子机制.方法 通过PCR克隆构建人野生C1orf194基因和携带Ile122Asn突变的C1orf194基因,分别导入人神经母细胞瘤(SH-SY5Y)细胞内进行表达,通过稳定同位素标记氨基酸免疫沉淀分析和液相色谱确定候选相互作用蛋白,通过免疫印迹分别确定与野生c1orf194蛋白或突变c1orf194蛋白相互作用的蛋白.结果 在SH-SY5Y细胞内野生c1orf194蛋白与TBA1C、AACT及HSPA4L等3种蛋白存在相互作用,携带Ile122Asn突变的c1orf194蛋白则失去与这3种蛋白的相互作用.结论 C1orf194基因内的Ile122Asn突变影响c1orf194蛋白与相互作用蛋白的结合,或许影响其调控的分子路径,使患者表现为常染色体显性遗传腓骨肌萎缩症,这对进一步研究c1orf194蛋白功能有重要意义.

摘要： 目的 采用RNA干扰技术下调DJ-1基因在肺鳞癌细胞HTB-182中的表达,采用串联亲和纯化质谱(TAP-MS)技术寻找DJ-1在HTB-182细胞系中的相互作用蛋白.方法 构建靶向DJ-1基因siRNA慢病毒载体,感染HTB-182细胞(DJ-1 siRNA组),并设立慢病毒载体对照组(Control siRNA组)及空白对照组,采用Western blot法检测DJ-1蛋白表达水平,建立内源性的DJ-1蛋白表达沉默的si-DJ-1-HTB-182细胞.设计DJ-1的特异性引物,构建带有链霉素结合肽标签(SBP)、钙调蛋白结合肽标签(CBP)的DJ-1表达质粒pNTAP-DJ-1,用脂质体稳定转染细胞系DJ-1 siRNA HTB-182,G418筛选阳性克隆,Western blot进行验证,TAP-MS技术寻找DJ-1的相互作用蛋白.结果 DJ-1 siRNA干扰组中DJ-1的蛋白质表达明显低于空质粒(NC)组和空白对照(BC)组(P＜0.05);成功构建了稳定表达pNTAP-DJ-1质粒的HTB-182细胞系;TAP-MS筛选到DJ-1相互作用的三个蛋白质:细胞角蛋白1(Keratin 1)、细胞角蛋白10(Keratin 10)和NADPH氧化酶活化蛋白P47(P47 Px).结论 Keratin 1、Keratin 10和P47 Px可能是DJ-1蛋白的相互作用蛋白.

摘要： 目的 通过激活自噬来研究相互作用蛋白(SVIP)对四氯化碳(CCl4)诱导的肝纤维化的关键作用.方法 用图像实验室软件Bio-Rad进行密度分析,用GraphPad进行统计分析.荧光显微镜检测脂滴和自噬体,进行图像采集和图像分析.结果 在HepG2细胞中,SVIP可以激活自噬,但饥饿不能在体外和体内增加SVIP的表达.此外,与自噬活性和脂滴体积一致的SVIP表达在体内和体外用CCl4处理的肝纤维化进展期间首先增加然后减少.以及可以保护HepG2细胞免受CCl4的毒性,这可以通过饥饿来增强.最后,饥饿使大鼠肝脏中的SVIP和自噬保持在高的水平,显著延迟了肝纤维化的进展.可能SVIP的保护作用与核因子相关因子2(Nrf2)和转录因子EB(TFEB)有关.结论 SVIP的表达与CCl4形成过程中的自噬水平密切相关,且诱导肝纤维化.SVIP能诱导自噬和延缓肝纤维化.研究SVIP激活自噬的分子机制具有十分重要的意义,为今后抗纤维化提供了新的理论依据.

摘要： 2019年12月10日,北京大学基础医学院的张宏权教授团队在Cell Reports上在线发表题为“Kindlin-2 inhibits Hippo signaling pathway via promoting degradation of MOB1”的研究论文,该研究发现整合素相互作用蛋白Kindlin-2能够通过促进MOB1的降解抑制Hippo信号通路,进而延缓肾纤维化的疾病进程。

摘要： [目的]HSP60是热休克蛋白中重要的一员,在昆虫先天性免疫过程中起重要作用,同时也是昆虫生长发育的必要因子.前期研究证明家蚕BmHSP60参与家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)入侵细胞过程,本研究通过鉴定BmHSP60相互作用蛋白,为其在家蚕先天性免疫中作用机制研究打下基础.[方法]利用免疫共沉淀和银联-质谱分析技术(LC-MS/MS),首先构建BmHSP60过表达载体并融合Flag标签,转染到家蚕细胞中48 h后,收集蛋白,进行免疫共沉淀,用Flag抗体孵育磁珠调取相互作用蛋白,银染处理后,能够检测到明显的差异条带,把差异条带切胶保存在-80°C,然后质谱分析差异条带的多肽;根据质谱结果和差异条带的大小与NCBI数据库进行比对,筛选到候选相互作用蛋白.最后,构建候选相互作用蛋白的克隆载体并融合HA标签,分别和BmHSP60表达载体共转到家蚕细胞,免疫共沉淀和荧光共定位验证BmHSP60和候选蛋白之间的相互作用.并通过Mito-Tracker-Green分析BmHSP60候选相互作用蛋白与线粒体的共定位.[结果]免疫共沉淀银染结果显示BmHSP60相互作用蛋白在110、90、75、60和35 kD附近有5条明显的差异条带,将这5条条带混成蛋白池进行质谱分析,通过银联-质谱分析结果和家蚕基因组数据库以及NCBI数据库进行比对分析共鉴定到32个差异蛋白,根据多肽数量和蛋白分子量的大小共筛选到5个相互作用候选蛋白与银染结果差异条带一致,分别为ADP/ATP trans locase (ANT)、Actin、Alpha-tubulin、Elongat ion factor 1-a lpha (EF1a)和HSP90.构建BmHSP60候选相互作用蛋白克隆表达载体并融合HA标签,与BmHSP60共同转染到家蚕细胞,免疫共沉淀immunoprecipitated(IP)用a-Flag抗体孵育,immunoblotting (IB)再用a-Flag抗体孵育,均能够检测到BmHSP60表达.而IB用a-HA抗体孵育显示只有BmANT和BmHSP90能够检测到相应的条带,而Alpha-tubulin和EF1a与BmHSP60没有检测到相应的条带,说明只有BmANT和BmHSP90与BmHSP60具有直接的相互作用,而Alpha-tubulin和EF1α与BmHSP60没有相互作用.通过荧光共定位进一步分析表明BmANT和BmHSP90能够与BmHSP60共定位在细胞质中.线粒体标记物Mito-Tracker-Green共定位结果显示BmHSP60、BmANT和BmHSP90均能够与线粒体共定位到一起.[结论]鉴定到家蚕热休克蛋白BmHSP60能够与BmANT和BmHSP90相互作用,并共定位于线粒体,可用于研究BmHSP60在家蚕抗病毒免疫中的作用机制.

摘要： 目的 研究非肌肉型肌球蛋白 MYH9 对食管癌细胞运动能力的影响,鉴定其尾部结构域( tail domain , TD )的相互作用蛋白.方法 利用 siRNA 在食管癌 KYSE5 1 0 细胞中敲降 MYH9 , Transwell 实验检测细胞侵袭和迁移能力,划痕实验检测细胞划痕愈合能力.构建MYH9 尾部结构域重组质粒 pGEX-KG-MYH9 ( TD ) ,诱导表达并亲和纯化 GST-MYH9 ( TD )融合蛋白.采用 GST pull-down 联合液相色谱-串联质谱技术,对 MYH9 尾部结构域相互作用蛋白进行鉴定分析.利用 clusterProfiler R 语言数据处理包对质谱分析发现的蛋白编码基因进行功能注释,利用免疫共沉淀( Co-immunoprecipitation , Co-IP ) 技术进一步鉴定.结果 敲降MYH9 显著抑制食管癌的细胞侵袭迁移( P <0. 001)和划痕愈合.质谱鉴定结果显示,食管癌 KYSE5 1 0 细胞中存在7 2 个潜在的与 MYH9 尾部结构域相互作用的蛋白. GO 富集分析结果显示,潜在的相互作用蛋白涉及多种生物学过程,包括 JAK-STAT 信号通路、细胞黏附调控、 NIK/NF-κB 信号通路、细胞周期检验点、膜脂筏形成、 DNA 转录起始、 mRNA 加工等. Co-IP 结果证实, PSIP1 和 BRG1 与 MYH9 存在相互作用.结论 MYH9 促进食管癌细胞侵袭运动,其尾部结构域介导多种与细胞运动相关蛋白的相互作用.%Objective This paper aims to study the effect of MYH9 on the motility of esophage-al squamous cell carcinoma ( ESCC ) cells , and to identify the interaction protein of the tail domain ( TD ) of MYH9 . Methods MYH9 was knocked down by siRNA in ESCC KYSE5 1 0 cells , and the ability of cell invasion and migration was detected by transwell assay , besides the ability of cell wound healing was detected by wound healing assay . The recombinant plasmid pGEX-KG-MYH9 ( TD ) was constructed to induce the expression and affinity purification of GST-MYH9 ( TD ) fusion protein . MYH9 ( TD ) interac-tion proteins were identified and analyzed by GST pull-down combined with liquid chromatography-tandem mass spectrometry ( LC-MS/MS ) . ClusterProfiler R language data processing package was used for func- tional annotation of potential interacting proteins . Furthermore , Co-immunoprecipitation ( Co-IP ) was ex-ploited to verify the interaction of MYH9 and its interacting proteins . Results MYH9 knockdown signifi-cantly inhibited the invasion and migration ( P <0 . 0 0 1 ) and wound healing of ESCC cells . A total of 7 2 potential interacting proteins were identified in KYSE5 1 0 cells by MS . Gene Oncology ( GO ) enrichment analysis revealed that potential interacting proteins were involved in a variety of biological processes , inclu-ding the JAK-STAT signaling pathway , cell adhesion regulation , NIK/NF-κB signaling pathway , cell cy-cle checkpoints , lipid raft formation , DNA transcription initiation , and mRNA processing , etc . Co-IP re-sults confirmed that PSIP1 and BRG1 interacted with MYH9 . Conclusion MYH9 promotes the motility of ESCC cells , and MYH9 tail domain mediates the interaction of various motion-related proteins .

摘要： 本文构建带StrepⅡ/FLAG串联亲和标签的重组赖氨酰氧化酶(Lysyl oxidase,LOX)蛋白慢病毒表达载体并在乳腺癌MDA-MB-231细胞中表达,利用StrepⅡ/FLAG标签纯化富集LOX的复合体,经LC-MS/MS进行蛋白鉴定,结果用于生物信息学分析和进一步研究LOX及其相互作用蛋白质在乳腺癌中的功能.研究表明，GV303/LOX-SF的构建，使带SF融合标签的LOX蛋白在MDA-MB-231中的成功表达及纯化，在鉴定到的425个蛋白，分析结果提示LOX所在的功能类共有20个，质谱中的蛋白大部分与Cancer、InfectiousDisease、Hematological Disease、Immunological Disease等疾病相关。鉴定到的蛋白可信度排前的参与mTOR Signaling、Remodeling of Epithelial AdherensJunctions、Actin Cytoskeleton Signaling信号通路，提示LOX与肿瘤细胞的侵袭和转移有关。质谱蛋白相互之间的作用依据分子功能划分成16个网络，其中LOX直接参与了数据库中之一的功能网络。另外同质谱鉴定到的蛋白进行匹配，为筛选和研究赖氨酰氧化酶及其相互作用蛋白在乳腺癌细胞系内的功能奠定了实验基础。

摘要： 近年来中国肾细胞癌的发病率呈明显上升趋势,由于新发病例中约有30％的患者会发生复发和转移,而这部分患者5年生存率低于10％,寻找影响肾细胞癌的预后因素及探索肾细胞癌复发和转移的机制十分必要.Kindlin-2作为一种含有FERM结构域的整合素相互作用蛋白,在肿瘤发展演进过程中发挥了重要作用.本研究的目的是研究Kindlin-2在肾细胞癌进展过程中是否发挥作用及其可能的机制,从而为可能的临床靶向药物的开发提供理论依据.研究结果表明，Kindlin-2的阳性表达与透明细胞肾细胞癌的分级和转移密切相关。Kindlin-2能够促进肾细胞癌细胞的迁移和侵袭能力。其机制可能是通过Kindlin-2促进MMP-2和MMP-9的表达和活性，而不是通过上皮间质转化过程。

摘要： 目的：运用RNA亲和捕捉系统从人肝细胞cDNA噬菌体文库中筛选与丙型肝炎病毒负链3'UTR RNA相互作用的宿主蛋白。rn 方法：通过体外转录方法获得HCV(1b型)负链3'UTRRNA，与生物素化的寡聚核苷酸杂交后偶联于链酶亲和素磁珠上，与人肝细胞cDNA噬菌体文库通过亲和捕捉、扩增的过程反复筛选与HCV负链YUTR RNA特异性结合的重组噬菌体，对筛选后得到的噬菌体进行序列测定和BL,AST基因同源性分析。rn 结果：经过七轮筛选后，噬菌体文库高度富集，阳性克隆经过序列测定和基因同源性分析后，得到两种可与HCV负链3'UTRRNA相互作用的蛋白。rn 结论：利用RNA亲和捕捉系统，以与链酶亲和素磁珠偶联的RNA为固相基质，从17噬菌体展示cDNA文库中筛选相互作用蛋白是一种快速、高效、特异性好的靶蛋白筛选方法。本研究为揭示宿主蛋白与HCVRNA的相互作用，进一步阐明HCV复制机制提供了实验依据。

摘要： AsE246是一种参与紫云英共生固氮的结瘤素基因，编码脂类转运蛋白(lipidtransfer protein，LTP)类似物，与非豆科植物LTP的同源性比较高，而与豆科植物的LTP同源性较小，在接种根瘤菌第九天后开始表达，属于根瘤特异性表达基因。

摘要： 目的：应用酵母双杂交系统筛选与新基因Collectrin相互作用的蛋白,为该基因的功能研究提供线索。rn 方法：构建Collectrin的真核表达载体Collectrin-pGBKT7／c-myc,转化酵母茵AHl09,Western Blot证实蛋白表达,进行毒性和自激活检验,与转化了成人肾脏cDNA文库的酵母茵Y187接合,筛选与Collectrin相互作用的蛋白。rn 结果：Collectrin蛋白能在酵母中正常表达,对酵母细胞无毒性,不存在自激活现象。共筛选到5个与细胞代谢有关的蛋白。rn 结论：Colliec-trin可能通过与细胞内某些酶类相互作用而影响细胞代谢,酵母双杂交结果为新基因Collectrin的功能研究提供了重要线索。

摘要： 目的：应用酵母双杂交系统筛选与新基因Collectrin相互作用的蛋白,为该基因的功能研究提供线索。rn 方法：构建Collectrin的真核表达载体Collectrin-pGBKT7／c-myc,转化酵母茵AHl09,Western Blot证实蛋白表达,进行毒性和自激活检验,与转化了成人肾脏cDNA文库的酵母茵Y187接合,筛选与Collectrin相互作用的蛋白。rn 结果：Collectrin蛋白能在酵母中正常表达,对酵母细胞无毒性,不存在自激活现象。共筛选到5个与细胞代谢有关的蛋白。rn 结论：Colliec-trin可能通过与细胞内某些酶类相互作用而影响细胞代谢,酵母双杂交结果为新基因Collectrin的功能研究提供了重要线索。

摘要： 目的：应用酵母双杂交系统筛选与新基因Collectrin相互作用的蛋白,为该基因的功能研究提供线索。rn 方法：构建Collectrin的真核表达载体Collectrin-pGBKT7／c-myc,转化酵母茵AHl09,Western Blot证实蛋白表达,进行毒性和自激活检验,与转化了成人肾脏cDNA文库的酵母茵Y187接合,筛选与Collectrin相互作用的蛋白。rn 结果：Collectrin蛋白能在酵母中正常表达,对酵母细胞无毒性,不存在自激活现象。共筛选到5个与细胞代谢有关的蛋白。rn 结论：Colliec-trin可能通过与细胞内某些酶类相互作用而影响细胞代谢,酵母双杂交结果为新基因Collectrin的功能研究提供了重要线索。

摘要： 蛋白质—蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)对于所有生物学过程都至关重要，因此，蛋白质相互作用研究一直是细胞生物学与分子生物学领域的一大研究热点。免疫共沉淀(co-immunoprecipitation，CoIP)是以抗体和抗原之间的特异性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法，是发现和验证PPI最常用、最有效的方法。传统的基于树脂的CoIP步骤复杂、费时费力，难以实现PPI的通量化检测。本发明的核心是：利用重组蛋白的表位标签，在固定了抗标签抗体的玻璃醛基片上进行CoIP，再通过荧光标记的抗体进行相互作用的检测。该方法大大简化了传统CoIP的操作步骤，同时检测样品的通量化大大提高，是一个简便、快速、高通量研究PPI的新型技术平台。

摘要： 本发明提供了一种蛋白或抗体，其中，在选自所述蛋白的疏水性相互作用位点内的一对疏水性氨基酸之中，一个疏水性氨基酸转化成带有正电荷的物质，而另一个疏水性氨基酸转化成带有负电荷的物质，并且借助所述正电荷和所述负电荷而在所述蛋白的所述疏水性相互作用位点内引入静电相互作用。本发明还提供了一种制备所述蛋白或抗体的方法，以及一种使用所述抗体测量重链与轻链之间的偶合程度的方法。根据本发明的所述蛋白或抗体受到同源二聚体或单体的污染较低，并因此能以高纯度得到异源二聚体。

摘要： 本发明公开了一种蛋白－蛋白相互作用的高通量可视化芯片检测方法以及一种蛋白－蛋白相互作用检测试剂盒。该方法为：制备一Flag抗体芯片，然后将含有Flag－诱饵融合蛋白和Myc－猎物融合蛋白的细胞裂解液加入到芯片表面进行免疫共沉淀反应，再经胶体金结合银增强显色技术检测诱饵蛋白和猎物蛋白是否具有相互作用。该试剂盒包括一具有多个分区的醛基玻片，FLAG和c－Myc标签载体和其对应的单抗，链亲和素胶体金，银增强溶液A和B以及基于上述方法的使用说明书。本发明建立的蛋白－蛋白相互作用高通量可视化芯片检测技术将成为蛋白质组学研究中高效有力的工具。

摘要： 蛋白质-蛋白质相互作用(protein－protein interaction，PPI)对于所有生物学过程都至关重要，因此，蛋白质相互作用研究一直是细胞生物学与分子生物学领域的一大研究热点。免疫共沉淀(co－immunoprecipitation，CoIP)是以抗体和抗原之间的特异性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法，是发现和验证PPI最常用、最有效的方法。传统的基于树脂的CoIP步骤复杂、费时费力，难以实现PPI的通量化检测。本发明的核心是：利用重组蛋白的表位标签，在固定了抗标签抗体的玻璃醛基片上进行CoIP，再通过荧光标记的抗体进行相互作用的检测。该方法大大简化了传统CoIP的操作步骤，同时检测样品的通量化大大提高，是一个简便、快速、高通量研究PPI的新型技术平台。

摘要： 本发明提供了一种蛋白或抗体，其中，在选自所述蛋白的疏水性相互作用位点内的一对疏水性氨基酸之中，一个疏水性氨基酸转化成带有正电荷的物质，而另一个疏水性氨基酸转化成带有负电荷的物质，并且借助所述正电荷和所述负电荷而在所述蛋白的所述疏水性相互作用位点内引入静电相互作用。本发明还提供了一种制备所述蛋白或抗体的方法，以及一种使用所述抗体测量重链与轻链之间的偶合程度的方法。根据本发明的所述蛋白或抗体受到同源二聚体或单体的污染较低，并因此能以高纯度得到异源二聚体。

摘要： 本发明的目的是能起层粘连蛋白与巢蛋白之间相互作用(层粘连蛋白/巢蛋白相互作用)抑制剂作用的低分子量肽衍生物,其制备方法,由其制备的药物组合物,以及所述肽衍生物在制备药物和鉴定层粘连蛋白/巢蛋白相互作用抑制剂中的应用。

摘要： 本发明提供了一种应用iTRAQ技术研究弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法，本发明还提供了一种与大脑发育调节蛋白相互作用的蛋白质或多肽、及其应用，本发明通过CoIP和Pulldown实验发现与大脑发育调节蛋白相互作用6个弓形虫蛋白，并进一步针对TgRPS14、TgH4基因进行基因敲除实验和神经行为学验证。本发明提供了的弓形虫慢性感染小鼠脑组织差异表达蛋白质组的方法能快速有效地进行蛋白质组学研究，有利于快速定位到具有研究价值或商业应用价值的检测靶标、防治药物靶点。

摘要： 本发明公开了一种基于蛋白质相互作用网络和蛋白质组学的蛋白质鉴定方法。该方法基于相互作用蛋白质间的存在概率亦相互影响的现象，在鸟枪法蛋白质组学数据上融合蛋白质相互作用网络信息，定义了新的蛋白质鉴定图模型，利用图模型中蛋白质的存在概率及其所获得的邻居蛋白质结点的支持度来调整肽映射到蛋白质的概率，从而调整蛋白质的存在概率。该方法能识别大部分的蛋白质，与其它鉴定方法比较，具有较的高的精确度。为生物学家通过蛋白质组学数据推断和鉴定蛋白质的实验以及进一步研究提供有价值的参考信息。

摘要： 本发明提供了一种融合肽，该融合肽包含至少成分(I)以及成分(II)，其中成分(I)包括运载体肽，成分(II)选自抑制神经元N－甲基－D－天冬氨酸受体(NMDAR)与NMDAR相互作用蛋白的相互作用的肽，其中成分(II)完全由D－对映体氨基酸组成。本发明还提供了发明的药物组合物，该药物组合物包含本发明的融合肽，并提供了用于给予该药物组合物的方法，以及采用本发明的融合肽的试剂盒和应用。

摘要： 本发明通过筛选急性髓系白血病(AML)预后相关之分子标志物，筛选出与AML患者预后密切相关的亨廷顿相互作用蛋白‑1相关蛋白基因(HIP1R)；HIP1R高表达提示AML患者预后不良；HIP1R与AML患者FAB分型和细胞遗传学危险分层具有相关性；HIP1R可能通过PI3K‑AKT,TLR等多种途径参与AML的疾病进程。HIP1R应用在AML的预后研究制剂中。