相互作用能

摘要： 对贵州某电解铝厂产生的阳极炭渣进行了成分分析,并利用浮选法对阳极炭渣中的有用组分进行了分离。采用单因素试验研究了浮选工艺条件对浮选效果的影响,结果表明,在矿浆质量分数为30%、捕收剂用量为300 g/t、起泡剂用量为100 g/t的条件下浮选效果较好,并在此条件下进行了1粗2精开路试验,得到了精炭C品位为89.92%、C回收率为80.46%,尾矿C品位为1.38%的分选指标。利用分子模拟软件Forcite模块计算柴油(二苯并噻吩、甲基萘和十二烷)、水与石墨间的相互作用能,发现柴油对石墨有较好的捕收性。

摘要： 目的研究导电油墨保护剂去除机理,为降低烧结所需能量、实现印刷电子的精准烧结提供参考依据。方法通过分子动力学(MD)方法建立导电油墨中常使用的羧酸类小分子保护剂和聚合物保护剂模型,计算保护剂与银表面的相互作用能。结果模拟计算结果表明,相互作用能大小主要与保护剂分子的相对分子质量、所含的官能团种类及其数量相关。保护剂的相对分子质量越大,与银表面之间的相互作用能绝对值越大,烧结后处理需要的能量越高;同时通过偶数碳羧酸保护剂与银表面的相互作用能拟合出线性曲线,可预测不同偶数碳链羧酸保护剂与银表面相互作用能。通过在铜版纸、聚酰亚胺(PI)薄膜2种柔性基材上进行近红外烧结实验可以明确,在导电油墨烧结过程中存在去除保护剂和致密化2个阶段,且2个阶段同步交叉进行,烧结温度越高,烧结进程越快。结论揭示了导电油墨保护剂去除机理,有助于在配制导电油墨时选择合适的保护剂,实现精准烧结,节约能源。

摘要： 采用密度泛函理论方法,系统研究了1-乙基-3-甲基咪唑离子([C_(2)MIM]^(+))在三种不同管径的碳纳米管中的稳定结构、相互作用能和分子轨道性质.研究表明,随着碳纳米管管径的增加,[C_(2)MIM]^(+)在碳纳米管内的稳定结构从居中的位置越发靠近碳纳米管的管壁,其与碳纳米管的结合能也从-45.52 kcal/mol降低到-39.45 kcal/mol.通过分析[C_(2)MIM]^(+)在不同尺寸碳纳米管中的分子轨道排布,发现研究体系的HOMO轨道和LUMO轨道主要是局域在碳纳米管上,电子跃迁表现为π→π^(*),表明[C_(2)MIM]^(+)与碳纳米管之间为弱的范德华作用.本研究为理解离子液体与碳纳米管之间的相互作用提供了重要的理论基础.

摘要： 为了研究电厂烟气代替二氧化碳和氮气注入井下进行采空区防灭火的可行性,通过自主设计的煤大样量吸附试验装置,在离柳矿区四矿采集煤样,研究常温常压环境中采空区煤吸附电厂烟气规律;试验结果证明:煤在常温常压条件下吸附二氧化碳量比氮气量大很多,常温常压下,1 kg煤吸附二氧化碳量约有0.48 cm^(3)~1.17cm^(3),而1 kg煤吸附氮气量仅有0.04 m^(3)~0.23 cm^(3)。

摘要： 在国家“双碳”战略背景下,利用CO_(2)提高油田采收率是封存CO_(2)的重要手段,但液态CO_(2)的安全储存、输送仍存在挑战,其中杂质气体对液态CO_(2)热力学物性的影响非常大。对现场取样的CO_(2)进行分析,确定了常见的7种杂质气体,并利用HYSYS、分子动力学模拟方法对含杂质CO_(2)的物性变化进行模拟计算,绘制物性版图并将其与纯CO_(2)的物性进行比较。研究表明,7种杂质均能使CO_(2)相图的气液共存两相区范围扩大,但不同杂质使气液共存两相区范围的扩大幅度不同;杂质主要通过泡点线的变化扩大气液共存两相区,而对露点线的变化影响不大;在含C_(2)H_(6)、C_(3)H_(8)、C_(2)H_(4)杂质的CO_(2)混合气体中静电势能占据主导作用,因此相比于含H_(2)、CO_(2)、CH_(4)、羰基硫(OCS)的混合气体,其宏观物性受温度、压力波动的影响较小。

摘要： 运用分子模拟的方法分别计算了甲基异丁基酮、甲基异丙基酮、甲基丙基酮、甲基戊烯酮与苯酚、邻苯二酚的相互作用能,结果表明甲基戊烯酮与正戊醇协同脱除酚类物质的能力最强.采用Aspen plus建立萃取塔模拟进行验证,废水中含苯酚3834 mg?L-1、邻苯二酚2665 mg?L-1;甲基戊烯酮与正戊醇质量比为6:4、萃取级数为2,质量相比10.51:1时便可使总酚浓度降至300 mg?L-1以下;为进一步降低总酚浓度,确定萃取级数为4、质量相比12.92:1(体积比10.85:1)的条件下可将废水中总酚浓度降至50 mg?L-1以下;苯酚、邻苯二酚的脱除率分别为99.94％、98.21％,显著提高了多元酚的萃取效果.

摘要： 分子的相互作用在分子动力学模拟过程中起着关键的作用.受限于计算资源,大分子的长时间尺度的相互作用能无法通过量化计算实现.本文采用一种深度学习框架-深度张量神经网络来预测三个有机分子相关体系中量化精度的相互作用能.其中,分子的几何结构和原子类型作为网络的输入用于预测相互作用能.通过分层生成的数据集合实现了网络中隐层参数的优化和训练.相互作用能的预测结果显示,深度张量神经网络可以在较短的时间内,在1kcal/mol的平均绝对误差的范围内准确预测分子间的相互作用能.这一过程提高了计算效率,并为计算相互作用能提供了可靠的计算框架.

摘要： 利用分子模拟技术研究了电场和温度对纳米SiO2改性绝缘油中水分子扩散行为的影响。结果表明:电场会使水分子发生极化,使得水分子由原本的无序排列变为沿着电场方向的有序排列。因此,电场的加入减弱了水分子的布朗运动,降低了水分子在油中的扩散能力;而且电场的加入增强了水分子与油介质之间的静电作用力,其数值是无电场作用下的2~3倍,这也是电场作用下两者间相互作用能增大的主要原因。此外,在电场的作用下,模型的自由体积分数减小,温度对模型中O原子和H原子之间氢键的影响减弱。

摘要： 本工作采用X射线衍射(XRD)分析方法,研究了在不同柠檬酸钠掺量下半水石膏在蒸压时不同晶面的结晶习性.运用Materials Studio 2017软件进行分子动力学模拟,研究了柠檬酸钠吸附在半水石膏晶体不同晶面的结晶习性.基于等温等容系统(NVT)对柠檬酸钠吸附于半水石膏晶体不同晶面的最低能运动轨迹进行模拟,研究了半水石膏晶体不同晶面的力学性能.XRD分析结果表明:柠檬酸钠的掺量为0.06％(质量分数,下同)时,半水石膏晶体的(200)晶面、(020)晶面和(400)晶面衍射峰强度最高,即晶面发育较好.分子动力学模拟结果表明:从柠檬酸根离子与半水石膏晶面距离来看,(200)晶面和(400)晶面是柠檬酸根离子与Ca2+的主要结合位点;相互作用能从小到大的顺序为ΔE(400)<ΔE(200)<ΔE(111)<ΔE(204)<ΔE(020),则柠檬酸钠更易于与半水石膏晶体的(200)晶面、(400)晶面作用,从而抑制半水石膏晶体在C轴方向上生长;从弹性模量(E)、体模量(K)和剪切模量(G)等力学性能的参数可知,柠檬酸根离子与(200)晶面和(111)晶面上钙离子之间主要有较强的结合力,即柠檬酸根离子易于吸附在C轴方向的晶面上.柠檬酸根离子使半水石膏晶体在垂直于C轴方向上的尺寸变大,对半水石膏晶体在C轴方向上的强度的影响显著.试验所得的晶面分析结果与模型研究的结果具有互证性.

摘要： 为了研究泡沫沥青油水混合过程,采用分子模拟的方法,建立沥青和水的分子模型。根据不同用水量的泡沫沥青分子建立油水分离模型,模拟计算了泡沫沥青在不同用水量下各组分的扩散系数、水和沥青之间相互作用能。结果表明:水分子的加入使混合过程中沥青各组分的扩散系数有增大的趋势,当发泡用水量到3%时,沥青各组分的扩散系数升高最明显;在泡沫沥青中,基质沥青和水分子之间为排斥作用,水分子越多排斥作用越明显;发泡用水量为3%和4%的泡沫沥青油水混合后水分子均匀分布在晶胞中,发泡更加均匀。

摘要： 在MP4理论水平,使用Counterpoisc技术及基函数加入键函数(BF)的方法得到了精确的Kr-He相互作用能,D=-2.485mrV(95﹪的实验值).研究了在Kr-He轴线中点附近,键函数中心的不同取值变化对体系相互作用能计算值的影响.研究结果表明,键函数的中心在Kr-He轴线中点附近0.1nm的区间及在过中点垂直高度在±0.08nm之间,Kr-He结合能计算值的变化很小.

摘要： 该文旨在弄清静电场中的自能和相互作用能的概念，找出两者的区别与联系，以及处理一些计算静电场能量中所遇到的问题。

摘要： 蠕变性能是高温钛合金设计的一个重要指标.钛合金中添加适量Si元素可以提高其蠕变性能,同时添加其它合金元素X如Zr、Mo、W等其提高效果更加显著.Si-X在钛合金中的相互作用是理解Si-X协同作用提高钛合金蠕变性能的基础.本工作采用第一原理方法系统的研究了第4、5、6周期过渡族金属以及3-6周期简单金属与Si在α和β钛合金中的相互作用能.结果表明:在α-Ti合金中,合金原子外层d电子数目Nd=4、5、6时,合金原子与Si强相互吸引;在β-Ti中,除了d电子数少于Ti的合金原子,其它的合金原子与Si原子相互排斥.计算结果与实验对比发现:与Si相互吸引的合金原子可提高钛合金的蠕变性能,且与Si强相互吸引的合金原子对钛合金蠕变性能的提高更加显著.

摘要： 颗粒荷电模型的选取是对其作用规律进行研究的基础,过去往往选取点电荷模型来研究荷电颗粒。本文通过对颗粒荷电机制的分析,认为颗粒所带的外来电荷应视为一种不均匀分布电荷。同时,给出颗粒荷电不均匀程度的定量表示和比较方法,计算其产生的电势。应用偶极子近似方法计算两个球形不均匀荷电颗粒的相互作用能,并通过不均匀模型和点电荷模型的相互作用能之比讨论两个颗粒的相互作用。

摘要： 本文首次建立声子和电子的量子算符代数理论,由此得到纳米颗粒中电子和声子的相互作用能.结果表明,电子和声子的相互作用能与声子和电子的量子尺寸均有关.

摘要： 本文首次建立光子和原子的量子算符代数理论,由此得到光与纳米颗粒的相互作用能.结果表明,光与纳米颗粒的相互作用能与光子和原子的量子尺寸均有关.

摘要： 基于波尔兹曼分布,计算了奥氏体中刃型位错处可富集的最大碳原子数目.在奥氏体中,单位长度位错线上富集的碳原子个数随着等温温度的增高和碳原子在基体中浓度的降低而降低.考虑到碳原子和位错的相互作用随该位错处富集碳原子个数的增加而降低,提出了一个用于计算在给定时间内刃型位错处富集碳原子个数的函数。

摘要： 基于波尔兹曼分布,计算了奥氏体中刃型位错处可富集的最大碳原子数目.在奥氏体中,单位长度位错线上富集的碳原子个数随着等温温度的增高和碳原子在基体中浓度的降低而降低.考虑到碳原子和位错的相互作用随该位错处富集碳原子个数的增加而降低,提出了一个用于计算在给定时间内刃型位错处富集碳原子个数的函数。

摘要： 基于波尔兹曼分布,计算了奥氏体中刃型位错处可富集的最大碳原子数目.在奥氏体中,单位长度位错线上富集的碳原子个数随着等温温度的增高和碳原子在基体中浓度的降低而降低.考虑到碳原子和位错的相互作用随该位错处富集碳原子个数的增加而降低,提出了一个用于计算在给定时间内刃型位错处富集碳原子个数的函数。

摘要： 基于波尔兹曼分布,计算了奥氏体中刃型位错处可富集的最大碳原子数目.在奥氏体中,单位长度位错线上富集的碳原子个数随着等温温度的增高和碳原子在基体中浓度的降低而降低.考虑到碳原子和位错的相互作用随该位错处富集碳原子个数的增加而降低,提出了一个用于计算在给定时间内刃型位错处富集碳原子个数的函数。

摘要： 本发明提供了一种蛋白或抗体，其中，在选自所述蛋白的疏水性相互作用位点内的一对疏水性氨基酸之中，一个疏水性氨基酸转化成带有正电荷的物质，而另一个疏水性氨基酸转化成带有负电荷的物质，并且借助所述正电荷和所述负电荷而在所述蛋白的所述疏水性相互作用位点内引入静电相互作用。本发明还提供了一种制备所述蛋白或抗体的方法，以及一种使用所述抗体测量重链与轻链之间的偶合程度的方法。根据本发明的所述蛋白或抗体受到同源二聚体或单体的污染较低，并因此能以高纯度得到异源二聚体。

摘要： 本发明取得化合物结构信息，取得与化合物相互作用的候选蛋白质的候选蛋白质结构信息，使用对接模拟方法来计算候选蛋白质与化合物的结合强度，进行结合强度的综合评价，由此确定出作为预测的结合强度的预测结合强度，确定出作为被预测为与化合物相互作用的候选蛋白质的预测蛋白质，使用结合强度模拟方法来计算相互作用强度，进行相互作用强度的综合评价，由此，确定出作为预测的相互作用强度的预测相互作用强度。

摘要： 相互作用力变化预测装置(100)具备：结合3残基组数据作成部(211)，制作3残基组的结合3残基组数据，该3残基组表示1对氨基酸残基对、与氨基酸残基对中的一个氨基酸残基相邻的1个氨基酸残基；突变后3残基组数据作成部(212)，制作突变后的3残基组的突变后3残基组数据；相互作用分值算出部(213)，参照3残基组表(151)，计算出由结合3残基组数据所示的3残基组的结合相互作用分值和由突变后3残基组数据所示的3残基组的突变后相互作用分值；相互作用力变化预测值算出部(214)，计算出结合相互作用分值和突变后相互作用分值的差分。

摘要： 蛋白质—蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)对于所有生物学过程都至关重要，因此，蛋白质相互作用研究一直是细胞生物学与分子生物学领域的一大研究热点。免疫共沉淀(co-immunoprecipitation，CoIP)是以抗体和抗原之间的特异性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法，是发现和验证PPI最常用、最有效的方法。传统的基于树脂的CoIP步骤复杂、费时费力，难以实现PPI的通量化检测。本发明的核心是：利用重组蛋白的表位标签，在固定了抗标签抗体的玻璃醛基片上进行CoIP，再通过荧光标记的抗体进行相互作用的检测。该方法大大简化了传统CoIP的操作步骤，同时检测样品的通量化大大提高，是一个简便、快速、高通量研究PPI的新型技术平台。

摘要： 本发明提供了一种蛋白或抗体，其中，在选自所述蛋白的疏水性相互作用位点内的一对疏水性氨基酸之中，一个疏水性氨基酸转化成带有正电荷的物质，而另一个疏水性氨基酸转化成带有负电荷的物质，并且借助所述正电荷和所述负电荷而在所述蛋白的所述疏水性相互作用位点内引入静电相互作用。本发明还提供了一种制备所述蛋白或抗体的方法，以及一种使用所述抗体测量重链与轻链之间的偶合程度的方法。根据本发明的所述蛋白或抗体受到同源二聚体或单体的污染较低，并因此能以高纯度得到异源二聚体。

摘要： 本发明取得化合物结构信息，取得与化合物相互作用的候选蛋白质的候选蛋白质结构信息，使用对接模拟方法来计算候选蛋白质与化合物的结合强度，进行结合强度的综合评价，由此确定出作为预测的结合强度的预测结合强度，确定出作为被预测为与化合物相互作用的候选蛋白质的预测蛋白质，使用结合强度模拟方法来计算相互作用强度，进行相互作用强度的综合评价，由此，确定出作为预测的相互作用强度的预测相互作用强度。

摘要： 本发明涉及一种基于相互作用能项和机器学习的蛋白‑配体亲和力预测方法，该方法通过分散配体与蛋白口袋的各种相互作用能项到20种氨基酸残基的主侧链上，并用机器学习的方法对PDB库中已知活性的蛋白‑配体相互作用能信息进行训练得到模型，利用所得模型进行配体与蛋白亲和力打分。本发明通过分散相互作用能项，可以充分考虑不同氨基酸残基主侧链对亲和力的影响；利用机器学习进行非线性拟合，有利于处理各个相互作用能之间的关联或耦合作用，从而针对性的减少不同氨基酸结构在亲和力计算过程中带来的误差。利用本发明，更有利于活性分子亲和力的预测，以达到提高预测准确度的目的。

摘要： 考虑界面信息和相互作用能的蛋白质‑DNA结合亲和性预测方法，属于蛋白质‑DNA相互作用与识别预测技术领域。首先构建训练集和测试集，根据实验结合亲和性数据以及复合物结构PDB ID号，取得340个样本，其中36个作为独立测试集，其余作为训练集；然后按以下三个步骤进行：1：对复合物结构进行分类；2：提取复合物特征；3：使用集成回归模型预测复合物结合亲和性。在此过程种，根据DNA结构类型和蛋白质上结合残基占比对复合物进行分类，并针对每种复合物类型提取各自的最优特征组合；除蛋白质和DNA的序列和结构特征外，加入了界面特征和相互作用能特征。

摘要： 本发明公开了含螺环的芴基分子晶体中分子间非共价键弱相互作用能预测模型训练方法，采用分子的偶极矩、分子的正电能、分子间距离、分子的相对取向、分子的最外层电子数、分子的极化率以及分子所含螺环SP3碳个数作为描述符，在与理论计算结果相比较后，证实了其预测结果的可靠性。同时本发明能够有效的提高计算含螺环的芴基分子晶体中分子间非共价键弱相互作用能的效率，并大大减少计算成本，为研究含螺环的芴基分子晶体中分子间非共价键弱相互作用开辟了新的道路。

摘要： 本发明涉及一种基于相互作用能项和机器学习的蛋白‑配体亲和力预测方法，该方法通过分散配体与蛋白口袋的各种相互作用能项到20种氨基酸残基的主侧链上，并用机器学习的方法对PDB库中已知活性的蛋白‑配体相互作用能信息进行训练得到模型，利用所得模型进行配体与蛋白亲和力打分。本发明通过分散相互作用能项，可以充分考虑不同氨基酸残基主侧链对亲和力的影响；利用机器学习进行非线性拟合，有利于处理各个相互作用能之间的关联或耦合作用，从而针对性的减少不同氨基酸结构在亲和力计算过程中带来的误差。利用本发明，更有利于活性分子亲和力的预测，以达到提高预测准确度的目的。