物种进化

摘要： 从数据库中检索出CG13551基因氨基酸序列信息,生理生化分析显示:SK_(66)蛋白含有107个氨基酸残基,分子量约11948.3Da,理论等电点为8.96。该蛋白中,甘氨酸(Gly)含量最高,为14.0%;其次为谷氨酸(Glu)和丙氨酸(Ala),分别为11.2%和9.3%。SK_(66)蛋白是一个亲水蛋白质但不是一个分泌蛋白。SK_(66)蛋白不存在跨膜结构域。蛋白质二级结构包括57.96%α-螺旋、10.28%β-折叠、β-转角以及31.78%无规则卷曲等构象。进化树显示,主要分成两类,较为高等的动物分为第一类,包括人、小鼠、河豚;而较为低等的动物归为一类,包括斑马鱼、果蝇。这与物种的进化程度相一致。

摘要： 国务院日前批复同意在北京设立国家植物园。国家植物园未来也将作为科学研究、科普教育和展览展示的中心,学生和普通人都可以在这里看到丰富的植物,了解科学家如何通过植物研究物种进化、生命起源、物种种间关系,直观看到药材、粮食和水果品种的改良,园林花卉的开发等。国家植物园一个很重要的功能是科学研究和教育。那么,走进植物世界,会给孩子带来哪些不一样的自然教育呢?

摘要： 国务院日前批复同意在北京设立国家植物园。国家植物园未来也将作为科学研究、科普教育和展览展示的中心,学生和普通人都可以在这里看到丰富的植物,了解科学家如何通过植物研究物种进化、生命起源、物种种间关系,直观看到药材、粮食和水果品种的改良,园林花卉的开发等。

摘要： 2022年3月3日,上海交通大学医学院李乾研究员团队在分子进化生物学国际知名期刊Molecular Biology and Evolution上发表了题为Evolution of brain-expressed biogenic amine receptors into olfactory trace amine-associated receptors的研究论文。研究人员系统深入地解析了一类嗅觉受体家族——痕量胺相关受体(trace amine-associated receptor,TAAR)的进化起源、进化历史以及识别配体的共进化过程,并系统刻画了TAAR这一嗅觉受体及其配体在物种进化进程中的全景图,为理解感觉系统的其他受体/通道家族及其配体的共进化提供了新视角。

摘要： 群体感应是一种细菌细胞间的通讯过程,细菌通过测量细胞外自诱导剂浓度从而感知群体细胞密度变化。群体感应使细菌能够在两种基因表达模式下转换:在低细胞密度时有利于个体发展,而在高细胞密度时则有利于群体发展。目前主要有7种群体感应通路,分别以oligopeptides、AHL(Acylated Homoserine Lactones)、AI-2(Autoinducer-2)、CAI-1(Cholera Autoinducer-1)、PQS(Pseudomonas Quinolone Signal)、AI-3(Autoinducer-3)以及DSF(Diffusible Signal Factor)作为各群体感应通路的信号分子;其中oligopeptides存在于革兰氏阳性细菌中,其余6种信号分子存在于革兰氏阴性细菌中。弧菌是导致人类感染和水产品污染的主要病原菌,传统的抗生素治疗弧菌感染具有很强的选择压力,导致越来越多耐药弧菌出现。面对愈发严峻的弧菌耐药性问题,目前群体感应淬灭被认为是治疗弧菌感染的重要替代手段之一,因而有必要调查弧菌属细菌不同群体感应通路的分布情况,为针对弧菌的群体感应淬灭剂研发提供重要参考信息。通过比较基因组学分析,发现全基因组测序的46株弧菌存在AHL、AI-2以及CAI-1这3种信号分子通路,其中5株弧菌均含有上述3种信号分子通路,共有30株弧菌只含有AI-2和CAI-1两种信号分子通路;而46株弧菌都不存在PQS、AI-3以及DSF群体感应通路。此外,弧菌群体感应通路的分布与物种进化有关,含有同种群体感应信号分子通路的弧菌,其亲缘关系较近,说明该通路的基因进化自它们的共同祖先。本研究表明开发针对弧菌的群体感应淬灭剂应以AI-2和CAI-1两种信号分子介导的通路作为靶点。

摘要： 为了明确鼠尾草属部分观赏植物的花粉形态特征,探究其中的进化程度及亲缘关系的远近,通过扫描电镜对5种鼠尾草(玫瑰鼠尾草、墨西哥鼠尾草、樱桃鼠尾草、凤梨鼠尾草和一串红展望薰衣草紫)的花粉形态进行观察并根据花粉的极轴长、赤道轴长、萌发沟宽主成分得分进行聚类分析.结果表明,5种鼠尾草属植物的花粉均为单粒形式存在,花粉的极轴长在65.70～120.71μm,跨度较大,花粉粒最大的为一串红展望薰衣草紫,最小的为墨西哥鼠尾草;5种花粉的P/E值在1.15～1.23,均属于长球形花粉.鼠尾草属植物花粉具有6条萌发沟,外壁纹饰为大网套小网纹饰或3套网纹饰,网眼形状多为不规则多边形,网脊较粗.根据花粉表面纹饰及花粉体积大小的演化规律判定,一串红展望薰衣草紫与其他4种亲缘关系较远,进化程度高,而墨西哥鼠尾草等为较为原始的种.在遗传距离2.0处,鼠尾草的5个品种被划分为3类,其中玫瑰鼠尾草、凤梨鼠尾草、樱桃鼠尾草聚为一类,墨西哥鼠尾草与一串红展望薰衣草紫各自聚为一类.

摘要： 随手从书架上抽出一本暗红色的书,书名叫《尼安德特人》。尼安德特人被认为是独立于现代人的另一个“人类分支”,曾经存在于40多万年前,并在大约4万年前消失。我也不知道自己为什么会翻开这本书。我对物种进化和分子生物学都没什么兴趣,或许只是抱着一丝好奇,想看看研究这个领域的专家们都在干什么。

摘要： DNA是大自然的伟大发明。每个DNA分子都如同一座图书馆,记载着流传了数十亿年的海量信息。代代相传的DNA是遗传的纽带,它结构的细微变化也为物种进化提供了源动力。地球上几乎所有生物都在DNA的指导下发育,DNA中的基因能告诉细胞怎样制造蛋白质,何时分裂长大。

摘要： 纵深阅读:每当求偶季节到来,恐龙们不用提醒就会自然相聚在一起。雄恐龙会为了交配而相互争斗,雌恐龙则会坐等胜利者的出现并与其交配,在争斗中落败的雄恐龙只能伤心地离开。求偶中的恐龙可不管对方长得漂亮还是帅气,只要是竞争中的获胜者,就算是丑八怪也会得到雌恐龙的芳心。在恐龙的世界里,强者的基因才能得以延续,这是物种进化中的自然淘汰。

摘要： [目的]本文旨在对前酪氨酸脱水酶(ADT)基因家族进行鉴定,分析其进化过程、基因结构、保守功能域、共线性关系和表达特性,并对梨ADT在石细胞形成过程中的功能进行初步验证。[方法]基于已公布的20个物种全基因组数据,采用BLASTp和Hmmer结合的方法进行成员鉴定,通过多种生物信息学手段分析序列。利用转录组数据和RT-qPCR检测梨ADT成员在果实发育中各个阶段的表达模式。利用农杆菌介导的瞬时转化法在梨幼果中过量表达PbADT1基因,通过间苯三酚染色观察幼果石细胞团分布,并测定木质素含量及其通路基因的表达量。[结果]在20个物种中共鉴定了113个ADT家族成员。通过系统进化树将家族成员分为4个亚组,6个水生藻类中都仅有1个ADT基因被鉴定,随后进化出的陆生植物中ADT基因家族均得到了不同程度的扩张。梨果实发育的转录组数据表明,多个ADT基因的高水平表达集中在花后35 d,RT-qPCR的结果证实了这一点。PbADT1的瞬时过量表达使梨幼果石细胞和木质素含量增加,并提高了木质素关键合成酶的表达水平。[结论]ADT基因在植物从水生向陆生进化的过程中得到了大量扩张,其蛋白水解酶生成的苯丙氨酸是合成木质素和形成维管束的底物基础。梨石细胞在幼果发育期大量形成,ADT在梨中的表达模式表明该基因家族可能调控果实石细胞的形成,PbADT1在梨果实中的瞬时过量表达使木质素含量升高、石细胞扩散加剧,表明ADT基因的过表达可能通过提高关键合成酶的表达水平对梨石细胞的形成产生影响。

摘要： 本文从遗传学角度讨论了物种进化、生物多样性以及鱼类育种三者之间的内在联系;从渔业可持续发展的角度分析了物种灭绝对生物多样性的影响和鱼类育种对生物多样性的贡献;从选择育种、杂交育种、倍性育种、航天育种、细胞工程育种以及基因工程育种等几个方面简要综述了鱼类育种技术的发展;探讨了鱼类种质检测与品种筛选技术以及鱼类育种的发展前景.

摘要： 人乳头瘤病毒(HPV)16的E6E7早期多顺反子转录本经剪切后形成至少四种剪切体：全长E6、E6*Ⅰ、E6*Ⅱ和E6^E7,在E6和E7癌基因的表达中起重要作用.然而,其表达调控目前知之甚少,微小RNA(miRNA)是否参与可变剪切不得而知.本研究中，发现该位点位于E6基因开放读码框，且恰与HPV16 E6E7转录本的5‘可变剪切位点重叠。利用Siha细胞，证实高水平的miR-875和miR-3144可致全长E6含量下降，而其他剪切体E6*含量上升，同时导致表皮生长因子受体(EGFR)、E6和E7癌蛋白表达下降，伴随Rb及P53蛋白升高。进一步预测出miR-875与EGFR存在一个靶向位点，并发现SiHa细胞中屏蔽EGFR后，miR-875和miR-3144所致的E6*水平升高失败，而未剪切E6则仍下降，提示miR-875和miR-3144同时通过直接靶向作用和EGFR通路，调控E6/E6*平衡比例，从而抑制病毒癌基因E6和E7表达。进一步系统发生学进化分析发现，miR-875在EGFR中的靶位点在北方真兽类中高度保守。因此，研究提供了两条可能在物种进化进程晚期出现的肿瘤抑制性人类miRNA。

摘要： 长久以来，我们只知道人类有处女膜，而文献资料介绍，处女膜在许多哺乳动物中都有，这是物种进化和生存适应的需要。本文介绍了在对家鸡进行人工授精时，发现文昌鸡也有处女膜的过程，指出鸡也有处女膜。

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征.近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系.本文还根据我国不同地理环境,选择了16个最具代表性的地方犬种,每个品种5-12个左右的无关个体,同时还挑选了3头野生亚洲灰狼,利用170K高密度SNP芯片,对这些样本进行了全基因组扫描.同时合并456头西方犬170K的SNP分型数据,进行系统性的中西方犬遗传进化比较.

摘要： 论文首先综述了已有的昆虫入侵机制和共生关系与生物入侵的关系，进而指出关于入侵昆虫的入侵理论较少。接着，综述从昆虫-共生微生物、昆虫-寄主植物-共生微生物和昆虫-寄主植物-共生微生物-同域其他生物三个层次论证了虫菌共生入侵的潜在机制。文章的主体部分从生态和进化两个方面解析了虫菌共生入侵机制;提出了虫菌共生入侵学说的理论框架，建立了虫菌共生入侵学说。虫菌共生入侵学说为入侵种的风险评估和预测预报、入侵种的检验检疫和传播途径以及入侵种的综合防治提供新的思路，为后续研发关键控制技术奠定了坚实的理论基础。

摘要： 本发明公开了一种基于人工光照种植技术的植物种植技术进化方法，通过构建可异地重现环境资源要素的人工光照种植环境，不同的种植业者通过在这个人工光照种植环境中自发地调整环境资源要素及记录调整要素，并得到某个植物品种的多种生长状况，以生长状况为依据筛选该植物品种的种植优选对象，使用大数据技术和人工智能归纳种植优选对象所对应的环境资源要素，种植业者可通过重现种植优选对象所对应的环境资源要素去进化该植物品种的种植技术。

摘要： 本发明提供了一种基于物种保护策略的多模态多目标差分进化优化方法，首先随机初始化一个种群，之后将种群在决策空间划分为不同的子种群，随后从每个子种群中确定要保留至下个迭代的最优个体，最后将所选的最优个体在新的个体生成后替换掉种群中较差的个体。此外，使用一种差分进化的变体进行新个体生成的操作，提升种群的多样性。实验表明所提算法相较于其他算法在求解多模态多目标问题在决策空间有着更好的效果，在寻找距离最短地点的实际问题中相比传统进化算法能够找到分布更好的最优地点。

摘要： 本发明公开了一种基于人工光照种植技术的植物种植技术进化方法，通过构建可异地重现环境资源要素的人工光照种植环境，不同的种植业者通过在这个人工光照种植环境中自发地调整环境资源要素及记录调整要素，并得到某个植物品种的多种生长状况，以生长状况为依据筛选该植物品种的种植优选对象，使用大数据技术和人工智能归纳种植优选对象所对应的环境资源要素，种植业者可通过重现种植优选对象所对应的环境资源要素去进化该植物品种的种植技术。

摘要： 本发明公开一种基于鸟类物种进化机制的路径优化方法，包括：随机生成若干条可行路径，每一条路径对应一只鸟类的染色体，每一个节点对应染色体上的一个基因，基因长度为路径长度，基因顺序为路径节点顺序；确定经过可行路径所需的花费作为适应性函数；根据经过每条可行路径花费的多少对可行路径进行排序，并对其进行分类；计算利用多夫多妻制类的可行路径的数目，并重新随机生成一定比例的新可行路径，替代属于多夫多妻制类的可行路径；各条可行路径按照其所属鸟类物种进化方式进行繁殖重构，完成繁殖重构后，比较父代个体与子代个体的路径长度，保留花费少的可行路径；重复迭代到达设定的迭代次数阈值，获取若干条可行路径；对获取的可行路径中选取花费最少的路径作为优选路径。

摘要： 本发明公开了一种基于miRNA序列分析物种进化的方法，属于分子标记技术领域。本发明的具体步骤如下：一、选择人类的若干必需基因；二、找出步骤一人类必需基因对应的miRNA，并获得该miRNA对应的miRNA成熟序列，通过序列比对找出待分析其他物种的相应的miRNA成熟序列，每种待分析物种的miRNA成熟序列至少包括6条；三、按照一定的顺序将步骤二中获得的待分析物种的miRNA成熟序列按照相同的顺序拼接成为长miRNA序列，构成新的分子标记；四、利用新的分子标记序列和进化分析软件，构建分子进化树。本发明的基于miRNA序列分析生物进化的方法，提供了一种对现有生物间进化关系分析方法的补充，也解决了如何利用仅仅有20～25个bp的miRNA序列来分析生物间进化关系的问题。

摘要： 本发明公开了一种时序物种进化的小样本目标检测装置和方法。该装置包括：突变模块，用于针对小样本中基础样本和新样本，分别生成基础候选区域和新候选区域后进行合并，得到合并候选区域；检测器，用于根据合并候选区域，识别小样本中基础样本和新样本。本发明解决了检测样本中基础类别的信息和知识继承性差，缺乏对新类别的非特异性变化的问题，并且产生足够的高质量正样本候选区域，有效优化了小样本目标检测装置的检测性能。

摘要： 本发明公开了一种求解带过道仓储作业优化问题的多物种协同进化方法，属于智能物流与仓储装备领域。本发明在传统仓储的基础上增加了横向过道，并建立了带过道的仓储作业优化模型，并对该模型进行求解。鉴于现有的求解技术存在易早熟、收敛速度慢等缺点，提出基于遗传算法、粒子群算法及人工鱼群算法共同参与的多物种协同进化优化方法，即通过基于学习机制的多物种竞争共生捕食策略，使每个物种适应环境的能力都能得到增强；通过引入变异机制，使全部物种的种群多样性得到协同改善，从而在提高单个物种进化能力的同时，也提高了算法的全局寻优能力及求解效率。本发明不仅提高了整体仓储的作业效率，而且能够促进物流仓储向智能化、绿色化转型升级。

摘要： 本发明公开一种基于鸟类物种进化机制的路径优化方法，包括：随机生成若干条可行路径，每一条路径对应一只鸟类的染色体，每一个节点对应染色体上的一个基因，基因长度为路径长度，基因顺序为路径节点顺序；确定经过可行路径所需的花费作为适应性函数；根据经过每条可行路径花费的多少对可行路径进行排序，并对其进行分类；计算利用多夫多妻制类的可行路径的数目，并重新随机生成一定比例的新可行路径，替代属于多夫多妻制类的可行路径；各条可行路径按照其所属鸟类物种进化方式进行繁殖重构，完成繁殖重构后，比较父代个体与子代个体的路径长度，保留花费少的可行路径；重复迭代到达设定的迭代次数阈值，获取若干条可行路径；对获取的可行路径中选取花费最少的路径作为优选路径。

摘要： 本发明公开了一种基于miRNA序列分析物种进化的方法，属于分子标记技术领域。本发明的具体步骤如下：一、选择人类的若干必需基因；二、找出步骤一人类必需基因对应的miRNA，并获得该miRNA对应的miRNA成熟序列，通过序列比对找出待分析其他物种的相应的miRNA成熟序列，每种待分析物种的miRNA成熟序列至少包括6条；三、按照一定的顺序将步骤二中获得的待分析物种的miRNA成熟序列按照相同的顺序拼接成为长miRNA序列，构成新的分子标记；四、利用新的分子标记序列和进化分析软件，构建分子进化树。本发明的基于miRNA序列分析生物进化的方法，提供了一种对现有生物间进化关系分析方法的补充，也解决了如何利用仅仅有20～25个bp的miRNA序列来分析生物间进化关系的问题。

摘要： 一种根据物种进化原理生产新微生物的方法，它是基于生存力和生存关系是生物体生存的两个不可分割的方面，生存力是内容，生存关系是生存力赖以发展的组织形式，两者相互依赖、相互作用，每一种生存关系都是适应一定生存力的性质和发展要求而产生的，生物社会的演化发展总是从生存力的变化开始，然后引起生存关系的变化，再引起生物体的上层建筑的变化，通过物理方法提高生物个体和每个生物体内部细胞的生存力，就能够改变生物个体和每个生物体内部细胞之间的生存关系，物理方法包括采用超声波连续作用于培养液中的微生物，超声波连续作用于微生物的时间为1小时以上。其目的是提供一种工作效率高，成本低的根据物种进化原理生产新微生物的方法。