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液相芯片

液相芯片的相关文献在2005年到2022年内共计768篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、肿瘤学、临床医学 等领域,其中期刊论文121篇、会议论文9篇、专利文献529567篇;相关期刊84种,包括江苏预防医学、现代医院、现代生物医学进展等; 相关会议7种,包括上海市畜牧兽医学会2011年学术年会、中国畜牧兽医学会2009学术年会、第四届全国解剖与临床学术研讨会等;液相芯片的相关文献由1149位作者贡献,包括许嘉森、吴诗扬、刘志明等。

液相芯片—发文量

期刊论文>

论文:121 占比:0.02%

会议论文>

论文:9 占比:0.00%

专利文献>

论文:529567 占比:99.98%

总计:529697篇

液相芯片—发文趋势图

液相芯片

-研究学者

  • 许嘉森
  • 吴诗扬
  • 刘志明
  • 何嘉英
  • 秦会娟
  • 杨惠夷
  • 余刚
  • 朱泽尧
  • 曾涛
  • 郭婧
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

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作者

    • 丁向东; 王楚端; 张勤
    • 摘要: 基因组选择已成为动植物育种的革命性技术,在我国猪育种工作中也逐渐开展,但我国猪基因组选择实施情况并不乐观。本文针对我国猪基因组选择育种实践中存在的问题和痛点,利用自主知识产权的液相芯片优势,提出了“先低后高,先多后少”的基因组育种新策略,通过具体案例,比较了新策略与传统的基因组选择策略和常规育种的优势,新策略成本降低,基因组育种效率提升,且更容易实施。本研究结果有助于基因组选择技术在我国猪育种领域的推广。
    • 董慧
    • 摘要: 目的研究氟西汀对慢性不可预见性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)抑郁大鼠血清趋化因子表达水平的影响。方法CUMS结合孤养构建抑郁大鼠。以旷场实验、糖水偏好实验、体重、皮质酮水平评估建模结果。Luminex液相芯片分析技术检测血清趋化因子CCL2、CCL5、CCL11、CXCL10、CX3CL1的表达水平。结果与健康大鼠相比,抑郁大鼠血清中炎性趋化因子CCL2、CCL5、CXCL10含量显著升高,CX3CL1表达水平显著降低,CCL11无显著性变化。氟西汀的干预可明显改善大鼠抑郁样行为,同时显著调节血清中CCL2、CXCL10的含量。结论趋化因子与抑郁的发生及治疗转归相关,氟西汀可能通过调节趋化因子的表达发挥抗抑郁作用。
    • 杜文琪; 夏立叶; 李桂梅; 单虎
    • 摘要: 【目的】实现A型塞内卡病毒(Seneca virus A,SVA)VP1蛋白在大肠杆菌中的高效可溶性表达,以建立SVA抗体液相芯片技术检测方法。【方法】根据GenBank收录的SVA VP1基因序列(登录号:KY747514.1),基于大肠杆菌的密码子偏好性优化合成VP1基因,克隆到pCold TF载体,构建重组质粒pCold TF-VP1。将重组质粒pCold TF-VP1转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,进行IPTG诱导表达。通过优化诱导时间及IPTG浓度得出最佳诱导表达条件。采用His标签镍柱纯化VP1重组蛋白,将纯化后的SVA VP1蛋白与荧光微球进行偶联,偶联好的微球与阴阳性血清反应,利用Luminex 200系统上机检测背景及阴阳性血清的中值荧光强度(MFI),从而判断阴阳性,以用于猪血清中SVA抗体的检测。【结果】重组质粒pCold TF-VP1成功转入大肠杆菌BL21感受态细胞,并以可溶性蛋白形式表达。经诱导表达在约82 ku处出现阳性条带。当重组菌株诱导条件为16°C、IPTG终浓度为1.2 mmol/L、诱导时间为3 h时,VP1蛋白表达量最高;经Western blotting分析,可在82 ku处出现明显条带。将VP1蛋白与荧光微球偶联,阴性对照(背景)的平均荧光值为17(2000),证明SVA VP1蛋白与微球偶联成功,偶联成功的荧光微球可用于检测猪血清中SVA抗体的检测。【结论】本研究在大肠杆菌中成功表达并纯化了SVA VP1蛋白,初步建立了SVA抗体液相芯片检测方法,为后续研究奠定了基础。
    • 邱奥; 张梓鹏; 王雪; 罗文学; 王贵江; 丁向东
    • 摘要: 本研究收集了1267头大白猪的生长性能测定记录和800头大白猪的繁殖记录,并用猪50K固相芯片(Geneseek)及基于靶向捕获测序技术的猪50K液相芯片(液相50K)进行基因型分型,比较2款芯片基因组选择的准确性。采用一步法模型,估计达百公斤体重日龄、百公斤活体背膘厚和总产仔数3个性状的基因组育种值。本研究探究不同参考群体规模对基因组选择的影响,生长性状设置500和10002个参考群体规模,繁殖性状设置400和7002个参考群体规模。结果表明,液相50K与Geneseek芯片具有很好的兼容性,液相50K在2个生长性状的基因组选择准确性比Geneseek平均高出1.7%,对总产仔数的基因组选择准确性略高于Geneseek,但提升幅度较小。2款芯片的并集使标记数增加到62039个SNP,基因组选择准确性比单款芯片平均提升2.9%。无论是单款芯片还是2款芯片并集,随着参考群体规模扩大,基因组选择准确性明显上升。本研究表明液相芯片技术能够用于基因组选择且有优势,研究结果可为我国猪分子育种提供参考。
    • 陈宇; 邱奥; 张梓鹏; 都鹤鹤; 白俊艳; 王贵江; 罗文学; 倪俊卿; 李凯; 丁向东
    • 摘要: 旨在探究低密度液相芯片在生产实践中的实用性,降低育种成本。本试验选用了3761头约160日龄,110kg左右健康大白猪,随机抽取100头大白猪,根据10K芯片标记信息,从50K芯片中抽取标记生成10K芯片,作为填充群体。再从剩余群体中,分别随机抽取800、2000、3600个个体作为参考群体,使用Beagle4.1软件对100头填充群体进行基因型填充至50K芯片,重复10次,以基因型一致性和基因型相关系数来评价基因型填充的准确性。结果表明,10K和50K芯片平均连锁不平衡(r^(2))程度为0.227和0.258,相差不大。最小等位基因频率(MAF)为0.05是基因型填充准确性的拐点,剔除掉MAF<0.05标记后,填充准确性明显升高。填充准确性随参考群体规模增大而上升,参考群由800头扩大到3600头,填充准确性从0.90提高到0.95,10次重复的标准差也从0.006下降到0.002。对于较小的参考群体规模,染色体基因型填充准确性波动较大,随着参考群体规模增大,每条染色体填充准确性相差不大。本研究结果表明,猪液相芯片从10K填充到50K是可行的,可以大规模用于基因组选择,降低基因组选择育种成本。
    • 黄忠荣; 张风荣; 费娅绯; 林颖峥; 张强; 李健; 王艳
    • 摘要: 为建立快速高通量检测实验动物质量相关布鲁菌、沙门菌、弓形虫3种病原体的方法,根据其序列设计引物及探针,探针经修饰后与荧光编码微球偶联,将偶联后的探针与PCR产物杂交反应,通过液相芯片检测仪(Luminex200)检测荧光信号,分析实验动物感染布鲁菌、沙门菌和弓形虫的情况.结果显示:初步建立了可同时检测布鲁菌、沙门菌和弓形虫的液相芯片检测方法,可特异地检测出3种目标病原的基因荧光信号,未检测出其他相关病原基因荧光信号;检测灵敏度达50拷贝/反应.本研究所建立的液相芯片检测方法可快速检测3种实验动物相关重要人兽共患病原体,对公共安全卫生保障、进出境实验动物检疫具有重要意义.
    • 邓任堂; 许红丽; 孔桂兴; 赖丽莎; 揭育帮; 陈梅莲; 付文金
    • 摘要: 目的 建立一种可同时、快速检测2型糖尿病患者降糖药相关药物基因多态性的液相芯片检测系统.方法 根据7个目的基因的rs号,在Genbank中查找其靶位点附近碱基序列(目的基因包括磺脲类受体1,转录因子7类似物2,胰岛素受体底物1,过氧化物酶体增殖物激活受体γ,有机阳离子转运蛋白与多药和有毒化合物排出家族,有机阴离子转运蛋白家族成员1B1等),以PrimerPlex软件设计等位基因特异性引物,Primer6.0软件设计含检测位点的PCR引物,通过多重PCR扩增,等位基因特异性引物延伸(ASPE),MagPlex~Tag微球杂交,液相芯片系统Luminex 200检测荧光信号,确定基因型,优化反应体系并以5份代表性标本进行方法学评价.收集2019年1月~12月东莞市厚街医院新诊2型糖尿病患者血液样本115例,采用建立的系统检测上述7个靶位点,并随机选取25例与测序结果比较.结果 7个目标基因经PCR扩增,产物电泳成像后清楚可见7条目标条带,无非特异性条带;经优化ASPE杂交条件,选择退火温度55°C,Biotion~dCTP浓度与dCTP浓度的比值为3:1,37°C孵育45 min时检测效果最佳;临床样本检测结果显示:纯合子荧光强度中位值(median fluorescence intensity,MFI)比率均>0.9或<0.1,杂合子MFI比率在0.4~0.6之间.纯合子MFI比率批内批间CV在0.9%~3.3%和2.1%~4.6%,而杂合子则在2.9%~7.3%和5.2%~11.2%;DNA最低检测限为0.75ng;25例样本的检测结果与测序结果完全一致,准确度100%.结论 该研究成功建立了一种新的液相芯片检测系统,高效便捷,能同时检测7个目的基因型,满足临床的需求.
    • 仇汝龙; 阮智杨; 胡波; 魏后军; 范志宇; 宋艳华; 陈萌萌; 徐为中; 王芳
    • 摘要: 为建立小反刍兽疫病毒(PPRV)、西尼罗病毒(WNV)、裂谷热病毒(RVFV)和南非型口蹄疫病毒(SAT FMDV)的高通量液相芯片检测方法,根据GenBank上公布的PPRV的N蛋白基因序列、WNV的E蛋白基因序列、RVFV的S片段基因序列和FMDV的5′UTR区基因序列,并基于各基因保守区设计相应的引物和探针.通过对多重PCR的上游、下游引物比例、杂交温度、杂交时间进行条件优化,并验证检测方法的特异性和敏感性.敏感性试验显示,该方法对于PPRV、WNV、RVFV以及FMDV 4种病毒最低检出量分别为5.78×103、2.15×103、2.98×105、9.54×104 copies/μL.本研究建立的高通量液相芯片检测方法能够同时快速地检测4种外来病病毒,具有良好的特异性、敏感性和稳定性,对于流行病学调查和防范外来动物疫病具有重要的意义.
    • 梅明珠; 高小博; 翁文川; 曹永长; 刘志玲; 吴晓薇; 段燕喻; 陈茹
    • 摘要: 根据GenBank中反刍动物、禽、猪和鱼线粒体DNA序列,分别设计特异性引物和探针,建立同时检测反刍动物、禽、鱼三大类物种和猪成分的四重液相芯片方法,并对其特异性、敏感性和重复试验稳定性进行验证评估。结果显示该方法能够准确检出鉴别4种目标物种,与非目标物种无交叉反应;对DNA模板检测低限可达到0.01~0.05 ng;组间检测变异系数小于20%。应用该方法检测195份饲料和肉类食品,有37份样品检出结果与标注信息不一致,经与现行标准方法比对,两者检测结果一致。研究结果表明,所建立的四重液相芯片方法特异性强、稳定性好,检测灵敏度高,能够精准检出饲料等加工产品中反刍动物、禽、猪和鱼成分。
    • 肖静; 杨舒; 闻琦; 陈子恩; 陈嘉童; 王徐飞; 陈文莉; 龙飞; 彭涛
    • 摘要: 目的 筛查与肝癌(HCC)相关的自身抗体并对其诊断肝癌的临床价值进行初步评估.方法 制备用于自身抗体多重检测的液相芯片,对40例肝炎、32例肝硬化、48例肝癌及30例健康对照组血清进行检测,比较自身抗体IgG水平,筛选与肝癌相关的自身抗体,绘制ROC曲线评估其肝癌的诊断价值,并分析肝癌相关自身抗体与常见生化指标的相关性.结果 肝炎、肝硬化、肝癌组的SSA/Ro、tTG、LC1、PR3、Scl-70、Mi-2、MPO和TIF1-γ自身抗体水平均显著高于正常对照组(P<0.05).ROC曲线显示SSA/Ro、tTG、LC1、PR3、Scl-70、Mi-2和SP100的自身抗体对肝癌诊断的曲线下面积均高于肝癌的标志物AFP.相关性分析显示,肝癌相关自身抗体之间普遍呈正相关性,而与生化指标无显著相关性.结论 筛选到SSA/Ro、tTG、LC1、PR3、Scl-70、Mi-2和SP100自身抗体在肝炎、肝硬化、肝癌中存在异常表达,提示可能与肝癌的发生发展有关.
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