氨基酸残基

摘要： 修复酶能特异性识别受损DNA,碱基与氨基酸残基间的堆叠作用是特异性识别的重要因素,遗憾的是目前没有精准的模型进行模拟.本文工作的最大贡献是在ABEEM极化力场基础上添加堆叠作用函数,调节相关π键位点参数,精准模拟受损腺嘌呤与氨基酸残基间的堆积作用.选取4种受损腺嘌呤与4种芳香族氨基酸残基堆积二聚体作为模型分子.以从头算的几何结构、电荷及堆叠能为基准,调节ABEEM极化力场参数,建立模型.ABEEM极化力场的模拟结果与从头算结果具有高度的一致性,可应用于DNA与酶作用体系的动力学模拟.为修复酶特异性识别受损DNA提供理论基础.

摘要： 当今世界,肿瘤已经成为危害人类健康的头号杀手。机体发生肿瘤时,肿瘤细胞可以凭借多种方式逃避机体免疫系统的监控、攻击而继续生长,实现肿瘤的免疫逃逸。而如何克服这种免疫逃逸一直是生物科学研究的热点之一。程序性死亡蛋白1(programmed cell death protein1,PD-1),是由基因PDCD1编码,288个氨基酸残基组成的Ⅰ型跨膜蛋白。

摘要： 为揭示芝麻7S蛋白源的降血压与抗氧化双活性肽QCKH的构效关系、与血管紧张素转换酶(angioten-sin I-converting enzyme,ACE)作用机理、理化特性,采用比较分子相似性指数分析法(comparative molecular simi-larity indices analysis,CoMSIA)研究构效关系,利用分子拼接揭示QCKH与人体ACE的作用位点,并预测其体内吸收代谢特性,评价外部因素对其活性的影响.结果显示:QCKH的降压性与抗氧化性分别与His4和Cys2有关,氢键与电荷极性是影响活性的主要因素.QCKH通过与ACE的活性口袋S1(Ala354、Tyr523),S2(Gln281、His353、Lys511、His513、Tyr520),活性中心Zn2+及其四面体配位中His387和Glu411发生作用,影响ACE空间结构,引起抑制.ADMET预测QCKH可以经口吸收,不影响体内正常的代谢,安全性高.QCKH在酸性与中性条件下活性稳定,在60°C下也能保持稳定,然而对紫外敏感.研究结果为QCKH的结构修饰与应用研究提供了理论参考.

摘要： 发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场,该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置,通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应;通过氢键拟合函数kHB描绘了氢键键能.应用量子化学方法,对G与氨基酸残基体系从氢键、几何结构及电荷分布3个方面展开计算及分析,并以其为基准,确定参数发展了适用于G与氨基酸残基氢键体系的ABEEMσπPFF.采用3种不同力场模拟目标分子的结构和性质.模拟结果表明,发展的ABEEMσπPFF与量子化学方法具有最好的一致性,可用于模拟生物大分子体系.

摘要： 目的 探讨高血压合并心力衰竭患者BNP检测的应用价值,以便为高血压合并心力衰竭的临床治疗和BNP检测提供临床诊断依据.方法 选取2016年1月～2018年1月本院收治的患有高血压合并心力衰竭的102例患者作为研究对象,均抽取所有疑似患者的静脉血进行BNP检测(全化学发光法分析仪),分析检测结果.并予以相应药物治疗.结果 实验组的血浆BNP浓度明显高于对照组,两组对比有差异(P<0.05);血浆BNP浓度与心功能分级关系成正比,级别越高血浆BNP浓度越高;单纯心力衰竭、高血压的血浆BNP浓度与两者合并症两两相比均有统计学差异(P<0.05).结论 血浆BNP浓度是心功能的重要指标,对高血压、心力衰竭及两者合并症的诊断、病情评价与治疗均有极高的参照价值.

摘要： 以同步荧光法研究了298,310,318 K下硝苯地平(NDP)与胃蛋白酶(PEP)的荧光基团酪氨酸残基(P-Tyr)、色氨酸残基(P-Trp)之间的相互作用.表明药物以动态猝灭的方式猝灭P-Tyr、P-Trp的荧光,结合位点数n为1,主要作用力是疏水作用.310 K时NDP与PEP氨基酸残基反应的荧光猝灭比率份数P-Trp 53.43％>P-Tyr 46.57％,结合位置更靠近P-Trp,NDP与蛋白结合率P-Tyr:69.43％ ～87.15％,P-Trp:73.64％ ～90.60％,分别建立了结合模型.且Hill系数nH约为1,该结合与后继配体无协同作用.结合距离r都小于7 nm,则NDP与P-Tyr、P-Trp之间都存在非辐射能量转移.

摘要： 采用拉曼光谱技术研究冻藏过程中草鱼鱼糜蛋白结构和氨基酸残基微环境的变化.草鱼鱼糜经-18°C冻藏处理2周和8周后进行拉曼光谱扫描,得到光谱数据;对酰胺Ⅲ区及C-C、S-S、C-H伸缩振动谱带进行解析,对比I850/I30强度变化,同时对酰胺Ⅰ区蛋白质二级结构进行定量分析.结果表明:冻藏过程中草鱼鱼糜蛋白质主链构象由有序向无序发展,α-螺旋结构从新鲜状态的34.31％下降到冻藏8周后的15.33％,无规卷曲相对含量从13.47％上升到30.89％;新鲜、冻藏2周和冻藏8周的鱼糜蛋白I850/I830分别为1.81、1.89和1.99,鱼糜加工过程使酪氨酸残基暴露在多肽链表面,冻藏引起暴露更加彻底;部分二硫键构象在冻藏初期(2周内)基本完成由反式-扭式-反式向扭式-扭式-反式转变;2 900 cm-1附近C-H伸缩振动的拉曼峰减弱,芳香族氨基酸侧链疏水作用力增强.冻藏过程中鱼糜蛋白的结构逐渐疏散无序,氨基酸残基微环境发生改变.

摘要： 共价药物以其对靶蛋白的高抑制率而在临床中广泛使用,并逐渐引起药学家的重视.本文总结4种不同类型的共价结合位点,被“酸性氨基酸-碱性氨基酸-丝氨酸/苏氨酸”三元体结构活化的丝氨酸/苏氨酸残基是共价药物的潜在共价结合位点,活性口袋附近半胱氨酸巯基同样是潜在的亲核基团,这2类氨基酸残基都能共价结合药物中的亲电基团.因此这些活性结合位点的发现是研发共价键药物的关键,尤其适合于具有新骨架和新结构的海洋天然产物的药物研发.

摘要： 日前，中科院微生物所高福院士团队与清华大学颜宁课题组合作，首次报导了人类胆固醇转运体NPC1，以及NPC1与埃博拉病毒表面融合蛋白复合物的冷冻电镜结构，为深入理解NPC1介导的胆固醇转运和埃博拉病毒入侵提供了重要线索。相关成果发布于《细胞》。NPC1是位于内吞体和溶酶体上的一个多次跨膜蛋白，由1278个氨基酸残基组成，包含13次跨膜螺旋，具有3个大的腔内结构域。NPC1在体内主要负责胆固醇转运，其氨基酸突变可能会导致“尼曼一皮克病”，表现为儿童神经发育迟缓，认知障碍或失聪，严重时会导致儿童夭折。

摘要： 目的:采用毛细管区带电泳法(CZE)研究人趋化素样因子1 C端活性多肽CKLF1-C19/C27与肝素的相互作用，并进一步研究CKLF1-C19与肝素相互作用的关键氨基酸残基结合位点。rn 方法:在pH 7.2的Tris-醋酸缓冲溶液中，CKLF1-C27/CKLF1-C19/CKLF1-C19pm/CKLF1-C19km与肝素于37°C以不同比率混合温育20min后进样，分离在6min内完成。rn 结果:CKLF1-C19和CKLF1-C27与肝素均发生了相互作用,证实了最初的推断。通过Scatchard分析计算，得到CKLF1-C19和CKLF1-C27与肝的结合常数分别为(3.38±0.49)×105mol·L-1和(1.10±0.02)×105mol·L～。同时证明，CKLF1-C19肽链上的赖氨酸残基在相互作用的过程中发挥了重要作用，脯氨酸残基也会影响CKLF1-C19和肝素间的结合。rn 结论:本实验采用的毛细管区带电泳法研究CKLF1-C19和CKLF1-C27与肝素相互作用的方法快速、准确、可靠。为进一步探讨CKLF1-C19和CKLF1-C27在体内的活性及其生物学意义打下了基础。

摘要： 中度嗜盐菌系由一大类依赖NaCl才能生长的异源微生物组成,能适应很宽的盐浓度范围。由于具有独特的代谢机制和环境适应机制,这类微生物已引起学术界越来越广泛的关注。Halobacillus dabanensis D-8T(CGMCC1.3704T)是一株分离自新疆达坂盐湖的革兰氏阳性中度嗜盐菌,能在很宽的pH(pH5-11)和NaCl浓度(0.1-4.3M)存在的条件下生长,由此推测,H.dabanensis D-8T可能具有较高的Na+/H+逆向转运蛋白活性。本文介绍了H.abanensis菌株Na+/ H+逆向转运蛋白基因的克隆与功能鉴定，分析了NaH的C末端亲水域的功能特性，阐述了NhaH若干氨基酸残基的定点突变及其突变体的功能特性，浅谈了初级钠泵基因的克隆与功能特性研究。

摘要： 采用PCR技术扩增得到Klebsiella pneumoniae XJPD-Li的甘油脱水酶dhaBCE连接到表达载体PET-28a(+)上，获得重组质粒PET-28a(+)-dhaBCE，并将其转化到大肠杆菌BL21(DE3)中诱导表达。序列分析结果表明:片段长度为2693bp，α亚基1668bp,β亚基585bp, γ亚基426bp，分别编码555, 194和141个氨基酸，计算分子量分别为60541Da, 21268Da和16068Da。测序片段与GenBank中报道的K.pneumoniae甘油脱水酶编码基因相似性为99.41%，氨基酸相似性为99.33%。氨基酸残基的存在可能与酶的高温和偏碱环境的耐受性有关。同时，探讨了氨基酸残基对于甘油脱水酶结构与功能的影响。

摘要： 目的：了解广州株(GZ)O157：H7携带毒力基因特点。rn 方法:采用PCR方法扩增目的基因，TA克隆、测序和进行序列分析。rn 结果:本文报道广州株(GZ)0157：H7 pO157质粒溶血素基因(hly C、A、B、D)，志贺样毒素2(stx2)stx2基因序列。测序结果表明：hlyA基因的长度为2997bp，编码999个氮基酸残基，hlyA基因与AB011549、AF074613的同源性为100％；与X86087、AB032930的同源性分别为99.6％和98.5％。GZ株hlyB基因的长度为2121bp，编码706个氨基酸残基，与AB011549、X86087、AF074613的同源性为100％；与AB032930的同源性为99.3％。GZ株hiyC基因的长度为492bp，编码163个氨基酸残基，与AB011549、AJ243564的同源性为100％；与AB032930、X86087和X80891的同源性分别为98.2％、99.6％和99.4％。GZ株hlyD基因的长度为1440bp，编码479个氨基酸残基，与AB011549、AF074613的同源性为100％；与AB032930和X86087的同源性分别为99％和99.7％。GZ株stx2A基因的长度为960bp，编码319个氨基酸残基，与AF548456、AF548457和AY652745的同源性为99.1％。GZ株stx2B基因的长度为270bp，编码89个氨基酸残基，与AF548456、AF548457和AY652745的同源性为95.9％。rn 结论:本文对广州株(GZ)O157：H7进行了毒力基因序列分析，了解其基因特点。

摘要： 目的：克隆抗人红细胞H抗原非凝集型杂交瘤细胞株2E8中的单克隆抗体重链、轻链可变区基因. 方法：从单克隆抗体细胞株2E8中提取总RNA,采用RT-PCR与5'RACE两种不同的方法克隆抗体的可变区基因,并对其进行了初步的分析. 结果：RT-PCR与5'RACE法克隆的重链可变区基因分别为351bp和349bp,属于鼠抗体可变区重链基因家族Ⅰ(B)亚群,轻链可变区基因分别为339bp和336bp,属于鼠抗体可变区轻链基因家族Ⅰ亚群.RT-PCR与5'RACE法克隆的可变区基因所推导的氨基酸残基的比对,发现两者之间在骨架区存在若干氨基酸残基的差异,重链可变区与轻链可变区分别有6个和4个氨基酸残基的差异。

摘要： 本发明提供一种通式(II)所示的光学活性(S或R)-β-氨基酸以及通式(III)所示的光学活性(R或S)-β-氨基酸酯的制造方法，其特征在于，在水解酶的存在下，在有机溶剂中，使水与通式(I)所示的外消旋混合物β-氨基酸酯的一种对映体进行选择性反应，

摘要： 本发明涉及包含编码富含脯氨酸/丙氨酸的氨基酸重复序列的低重复核苷酸序列的核酸分子。编码的多肽包含形成无规卷曲的重复氨基酸序列。包含所述低重复核苷酸序列的核酸分子还可以包含编码生物学或药理学活性蛋白的核苷酸序列。此外，本发明提供了鉴定包含所述低重复核苷酸序列的所述核酸分子的选择手段和方法。本发明还涉及制备所述核酸分子的方法。本文还提供了使用本文提供的核酸分子来制备编码的多肽或具有编码的多肽的药物缀合物的方法。所述药物缀合物可以包含生物学或药理学活性蛋白或小分子药物。本文还提供了包含此类核酸分子的载体和宿主。

摘要： 本发明提供了一种氨基酸液的制备方法、氨基酸液、氨基酸水溶肥及其应用，涉及农业肥料制造技术领域，所述制备方法，包括以下步骤：(1)将脱脂豆粕用水进行提取，得到大豆蛋白提取液；所述脱脂豆粕与水的质量比为1:(25～35)；(2)将所述步骤(1)得到的大豆蛋白提取液与枯草芽孢杆菌发酵液混合进行发酵，得到氨基酸液；所述枯草芽孢杆菌发酵液的用量占大豆蛋白提取液总体积的5％～10％；所述枯草芽孢杆菌发酵液中的有效活菌数≥2亿/mL。利用本发明的制备方法使得氨基酸的转化率达到45％以上，游离氨基酸含量达到100g/L以上。

摘要： 一种用于制备氨基酸螯合物的方法，其特征在于固体形式的金属氧化物和/或金属碳酸盐和/或金属硫酸盐和/或金属氯化物和/或金属氢氧化物被机械地活化，然后，活化的金属氧化物和/或金属碳酸盐和/或金属氢氧化物和/或金属硫酸盐和/或金属氯化物与固体形式的氨基酸组合在一起，并以固态反应转化为氨基酸螯合物。

摘要： 本发明提供一种通式(II)所示的光学活性(S或R)－β－氨基酸以及通式(III)所示的光学活性(R或S)－β－氨基酸酯的制造方法，其特征在于，在水解酶的存在下，在有机溶剂中，使水与通式(I)所示的外消旋混合物β－氨基酸酯的一种对映体进行选择性反应，式中，R表示可以具有取代基的烷基、烯基、炔基、环烷基、芳烷基、芳基或杂芳基，R

摘要： 本发明涉及包含编码富含脯氨酸/丙氨酸的氨基酸重复序列的低重复核苷酸序列的核酸分子。编码的多肽包含形成无规卷曲的重复氨基酸序列。包含所述低重复核苷酸序列的核酸分子还可以包含编码生物学或药理学活性蛋白的核苷酸序列。此外，本发明提供了鉴定包含所述低重复核苷酸序列的所述核酸分子的选择手段和方法。本发明还涉及制备所述核酸分子的方法。本文还提供了使用本文提供的核酸分子来制备编码的多肽或具有编码的多肽的药物缀合物的方法。所述药物缀合物可以包含生物学或药理学活性蛋白或小分子药物。本文还提供了包含此类核酸分子的载体和宿主。

摘要： 本发明提供了一种氨基酸液的制备方法、氨基酸液、氨基酸水溶肥及其应用，涉及农业肥料制造技术领域，所述制备方法，包括以下步骤：(1)将脱脂豆粕用水进行提取，得到大豆蛋白提取液；所述脱脂豆粕与水的质量比为1:(25～35)；(2)将所述步骤(1)得到的大豆蛋白提取液与枯草芽孢杆菌发酵液混合进行发酵，得到氨基酸液；所述枯草芽孢杆菌发酵液的用量占大豆蛋白提取液总体积的5％～10％；所述枯草芽孢杆菌发酵液中的有效活菌数≥2亿/mL。利用本发明的制备方法使得氨基酸的转化率达到45％以上，游离氨基酸含量达到100g/L以上。

摘要： 本发明公开了非天然氨基酸和包括至少一个非天然氨基酸的多肽，以及制备所述非天然氨基酸和多肽的方法。所述非天然氨基酸本身或作为多肽的一部分可包括多种可能的官能团，但通常具有至少一个芳香族胺基。本发明还进一步公开了经翻译后修饰的非天然氨基酸多肽、实现所述修饰的方法以及纯化所述多肽的方法。所述经修饰非天然氨基酸多肽通常包括至少一个烷基化胺基。另外，本发明公开了使用所述非天然氨基酸多肽和经修饰非天然氨基酸多肽的方法，包括治疗、诊断和其它生物技术用途。

摘要： 包括生长激素和包括至少一种碱性氨基酸残基和至少一种酸性氨基酸残基的肽作为添加剂或缓冲物质的药物制剂对脱酰胺作用,氧化作用和肽键的断裂显示出很高的稳定性。该产品的稳定性允许以冻干的状态或在周围温度中以溶解或重新溶解制剂的形式贮存及其运输。

摘要： 本发明的主要目的在于提供这样结构的化合物：具有氨基酸或寡肽的侧链结合于主链，其是以下的通式(1)所示的化合物：式(1)中，n1～n3、及m1～m6表示规定的整数；Y表示羟基或氨基；E表示N或CH；R表示氨基酸残基或由2～100个氨基酸残基构成的肽残基；L表示氢原子、具有脂质基的基团、具有脂肪酸残基的基团或具有荧光性基团的基团。