整合子

摘要： 为了解猪源肠外致病性大肠杆菌在河南地区的流行及耐药性,本试验于2016—2018年从河南省61家猪场送检的发病猪中,采集肺脏等病料,进行大肠杆菌的分离与鉴定,并用微量稀释法测定分离菌株的耐药性,采取PCR法检测分离菌株中氟苯尼考耐药基因(floR)、Ⅰ类整合酶基因的携带情况,通过Ⅰ类整合子基因盒可变区序列的BLAST比对,分析其耐药基因携带情况。结果显示,经细菌分离共获得17株肠外致病性大肠杆菌,检出率为27.86%(17/61);分离菌株对氨苄西林、磺胺甲噁唑、四环素、氟苯尼考和氯霉素等药物耐药率为100%,对多黏菌素耐药率为41.18%,分离菌株均呈多重耐药;在分离菌株中,floR、Ⅰ类整合子携带率均为100%,Ⅰ类整合子基因盒主要携带dfrA17-aadA5、aadA22-aadA23-aadA25、dfrA12、dfrA12-aadA2和floR等类型耐药基因谱。本试验结果表明河南地区猪源肠外致病性大肠杆菌具有一定的流行性,且耐药问题十分严重,极易导致临床上治疗失败,应引起重视。

摘要： 目的及时掌握辽宁地区沙门菌整合子的分布以及对常用抗菌药物的耐药情况,获取沙门菌整合子与耐药性的相关性,从而为临床用药及治疗提供指导。方法本文对来源于食品以及病患的149株沙门菌,利用PCR扩增的方法,进行整合子类别的筛选,并将扩增的整合子基因盒进行基因测序,同时通过药敏板测定(耐药性实验)对沙门菌与15种临床常用抗菌药物的耐药相关性进行研究。结果149株沙门菌中未发现第II类、第III类整合子,检出第I类整合子的菌株50株,I类整合子阳性率为33.6%。50株整合子阳性菌株中25株携带耐药基因盒,片段范围从1500~1800 bp。测序结果表明,其中22株整合子携带dfrA17-aadA5基因盒,2株携带dfrA12-aadA2基因盒,1株首次检出罕见耐药基因盒linG。根据整合子携带情况不同,对15种抗菌药物的耐药率进行对比分析,结果显示整合子阳性菌对9种抗菌药物的耐药率显著高于整合子阴性菌(P<0.01),分别为氨苄西林、四环素、氯霉素、头孢噻肟、头孢唑林、庆大霉素、复方磺胺甲恶唑、阿奇霉素和环丙沙星。辽宁地区沙门菌多重耐药率达50.3%。结论I类整合子在沙门菌中分布广泛,抗性基因表型与耐药结果相一致,整合子的携带与沙门菌多重耐药率高度相关。沙门菌对亚胺培南和头孢西丁保持高敏感率,可以用于对常规抗菌药物耐药的沙门菌的治疗。

摘要： 目的了解临床分离鲍曼不动杆菌(AB)的耐药状况,以及生物被膜相关基因和整合子的分布情况,探讨泛耐药鲍曼不动杆菌(XDR-AB)生物被膜相关基因及整合子与耐药性的关系。方法2019—2020年成都某医院临床标本分离的59株AB,采用微量肉汤法检测17种抗菌药物对AB的最低抑菌浓度(MIC),聚合酶链反应(PCR)法扩增17个生物被膜相关基因及Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类整合酶基因,同时对Ⅰ类整合酶阳性菌株可变区进行扩增和测序。结果59株AB对米诺环素耐药率为1.69%,对亚胺培南、美罗培南耐药率分别为67.80%、71.19%,对其他抗菌药物的耐药率为59.32%~84.75%。59株AB中XDR-AB 40株(67.80%),多重耐药菌株(MDR-AB)5株(8.47%),敏感菌株14株(23.73%)。59株AB 17种生物被膜相关基因中,6种生物被膜相关基因bfmR、bfmS、csuC、csuD、csuE、pgaD检出率为100%,其他11种生物被膜相关基因检出率为74.58%~98.31%。XDR-AB 4种生物被膜相关基因abaI、epsA、pglC、ompA检出率分别为100%、95.00%、87.50%、100%,高于敏感AB的64.29%、7.14%、42.86%、50.00%(均P<0.05)。intI-1整合酶基因检出率:AB为66.10%(39/59),XDR-AB为90.00%(36/40),敏感AB菌株未检出。39株Ⅰ类整合酶阳性菌株38株检测到Ⅰ类整合子可变区,其中XDR-AB 35株,MDR-AB 3株。结论AB中XDR-AB检出率高,推测XDR-AB携带的生物被膜相关基因abaI、epsA、pglC、ompA及Ⅰ类整合子与耐药性密切相关。

摘要： 为了解东北地区狐源大肠杆菌的耐药性及其整合子—基因盒系统的流行特征,本研究采用K-B纸片法检测东北地区分离的330株狐源大肠杆菌对6类15种抗菌药物的敏感性;通过PCR检测这些分离菌株中I类整合酶基因(intI1)、II整合酶基因(intI2)和I类、II类整合子基因并测序,采用DNAStar软件分析I类、II类整合子基因携带基因盒的组成方式,根据PCR结果分析整合酶及整合子基因与大肠杆菌耐药表型的相关性。药敏试验结果显示:330株狐源大肠杆菌对β-内酰胺类药物和四环素类药物耐药性较高,耐药菌株均超过80%;其次是对氨基糖苷类药物和磺胺类药物,耐药菌株超过60%;对β-内酰胺类药物亚胺培南、氨基糖苷类药物阿米卡星相对敏感,敏感菌株分别占86.97%(287/330)和83.94%(277/330),且87.88%(290/330)的狐源大肠杆菌表现为多重耐药性。整合酶和整合子基因的检测结果显示,intI1和intI2基因的检出率分别为63.64%(210/330)和15.45%(51/330),且有36株(10.9%)狐源大肠杆菌同时携带intI1和intI2基因。I类整合子基因的检出率为62.86%(207/330),其中33.81%(70/207)I类整合子基因中携带基因盒,其余66.19%(137/207)I类整合子基因中未携带基因盒,为空整合子,且未检出II类整合子基因;70个I类整合子基因的测序结果显示,共检测出10种基因盒,且存在6种不同的基因盒组成方式,其中aadA22基因盒数量最多,达48.57%(34/70),其余基因盒组成分别为dfrA17-aadA5、dfrA27-aadA2、dfrA5、dfrA1-aadA1、dfrA12-orfF-aadA2。且上述整合酶基因(与氨基糖苷类和磺胺类耐药基因相关)及整合子基因(与甲氧苄啶类和氨基糖苷类药物的耐药性相关,但未做甲氧苄啶类的耐药性试验)与狐源大肠杆菌对氨基糖苷类和磺胺类药物的耐药表型基本一致。以70株携带基因盒的I类整合子的狐源大肠杆菌为供体菌,E.coli NK5449株作为受体菌进行接合转移试验,提取接合子质粒并经PCR测序后统计接合率;通过PCR分别检测接合子携带的整合酶和整合子基因,分析接合子中耐药基因的水平转移情况。结果显示,共获得23株接合子,接合率为32.86%(23/70),23株接合子中I类整合酶基因的检出率为34.78%(8/23),I类整合子基因检出率为43.48%(10/23)。上述结果表明,耐药基因具有水平转移的能力,但并不能将全部的耐药基因转移到受体菌中。本研究为东北地区狐源大肠杆菌的风险评估和抗菌药的合理应用提供参考依据。

摘要： 为探究晋北地区部分养殖场腹泻犊牛中大肠杆菌耐药表型与所携带耐药基因和整合子的关系,本研究采集晋北地区3个规模场腹泻犊牛肛拭子27份进行大肠杆菌分离鉴定,采用K-B法和PCR检测分离株药物敏感性和耐药基因、整合子-基因盒的携带情况,采用SPSS软件进行相关性分析。结果显示,24株大肠杆菌分离株对6类15种常用抗菌药物呈现不同程度的耐药,对β-内酰胺类抗菌药头孢噻肟、头孢唑林和氨苄西林耐药的菌株均达95.83%(23/24),但对氧氟沙星耐药的菌株只占12.50%(3/24);多重耐药菌株占比70.83%(17/24),4重耐药菌株占比最高,为33.33%(8/24);β-内酰胺类、氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、氯霉素类和四环素类耐药基因均有检出,喹诺酮类耐药基因GyrB检出率为100%;Ⅰ类整合子检出率为79.17%,最主要的基因盒排列为dfrA17-aadA5,Ⅱ、Ⅲ类整合子未被检出;耐药基因bla_(TEM)、bla_(CTX-M-1)、sul1、sul2、tetA、tetB、cat与耐药表型符合率均为100%;整合子阳性株的多重耐药表型的发生率极显著高于整合子阴性株(P<0.01)。综上,晋北地区部分养殖场犊牛源大肠杆菌分离株多重耐药情况严重,耐药表型与所携带耐药基因和Ⅰ类整合子密切相关。

摘要： 目的 了解临床中C.freundii的分布和耐药情况,从而为现阶段少见菌种抗菌药物的使用提供针对性的方案。方法 收集97株2016—2021年非重复C.freundii,运用聚合酶链反应(PCR)筛查第1、2、3类整合酶基因(intI1、intI2、intI3),对intI+的C.freundii采用长片段PCR扩增整合子可变区,通过测序确定可变区基因盒种类。结果 97株C.freundii中,21株第1类整合酶阳性,2株第2类整合酶阳性。扩出的可变区中,有8株是dfrA12-aadA2,其中aac(6’)-II-ereA2-aac3-arr-ereA2和aac(6’)-II-ereA2-tnpA-aac3-arr-ereA2携带的基因盒种类最多。结论 C.freundii菌株整合子携带率低于其他肠杆菌科细菌,其可变区耐药基因盒种类多样,该菌目前临床耐药之所以如此严峻,是与其携带的可变区启动子(Pc)密切相关。碳青霉烯类抗生素(CRE)仍然是对多重耐药菌株具有活性的抗生素,但应限制其使用以避免出现耐药性,而第三代头孢类抗生素依然可作为治疗由C.freundii所引起的感染首选药物。

摘要： 目的 收集该院临床分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP),通过研究CRKPⅠ、Ⅱ、Ⅲ类整合子分布情况,碳青霉烯类耐药基因携带情况,以及多位点序列分型(MLST),了解CRKP的耐药情况与流行病学特征。方法 收集、保存临床送检标本中分离的CRKP 45株,采用BD phoenix M50全自动细菌鉴定仪进行药敏试验,并用质谱仪再次进行细菌鉴定。整合子及可变区测定采用PCR扩增,并对阳性菌株可变区进行测序分析及比对;采用改良碳青霉烯灭活试验(mCIM试验)进行表型确认,采用PCR扩增碳青霉烯类耐药基因,以及MLST方法分析其同源性。结果 45株CRKP中检测出Ⅰ类整合子阳性菌株共44株,未检出Ⅱ类及Ⅲ类整合子。有36株菌株成功扩增出可变区。检出3种耐药基因盒,分别为aadA2(34/36)、dfrA1(1/36)、aac(6′)-Ib-cr(1/36)。45株CRKP扩增耐药基因测序结果显示,44株检测到bla基因,未检出bla、bla、bla、bla、bla基因。45株CRKP的优势序列分型(ST)主要为ST11型(43株),其余为ST15型(2株)。结论 该院CRKP以Ⅰ类整合子为主,尚未发现Ⅱ类及Ⅲ类整合子,CRKP对碳青霉烯类药物耐药的主要机制是携带bla基因,应及时采取防控措施,防止CRKP在院内的克隆传播。

摘要： 目的 讨论银离子对大肠埃希菌BL21(DE3)宿主中第一类整合子整合频率的影响.方法 将pUCINT及pACINAD两种重组质粒依次转化大肠埃希菌BL21(DE3),命名为HS2.实验组分别使用含0.3 μg/ml、0.6μg/ml和0.8 μg/ml银离子LB液体培养基,对照组使用普通LB液体培养基,银离子通过硝酸银提供,培养条件为37°C培养24h.菌株培养完成后均用实时聚合酶链反应(qPCR)测定发生重组反应的整合子拷贝数和总的整合子拷贝数,二者比值即为整合频率.同时通过3次独立表型筛选法分析整合频率变化并利用质谱分析菌株蛋白质表达情况.结果 qPCR测定的对照组HS2菌株的整合频率为1.79× 10-5(1.44×10-5,3.13×10-5),实验组中0.3 μg/ml银离子组整合频率为2.07×10-5 (1.49×10-5,2.67×10-5),0.6 μg/ml银离子组为2.25×10-6(1.47×10-6,4.54× 10-6),0.8 μg/ml银离子组为1.69×10-6 (0.22×10-6,3.08×10-6).实验组中0.6 μg/ml银离子组与0.8 μg/ml银离子组整合频率明显低于对照组,差异具有统计学意义(P＜0.01),但0.3 μg/ml银离子组整合频率与对照组比较差异无统计学意义.3次独立表型筛选法测定结果与qPCR结果一致且质谱分析得出经银离子作用的菌株蛋白质表达存在差异.结论 一定浓度的银离子对细菌整合子捕获耐药性基因盒频率存在抑制作用.

摘要： [目的]本文对山东某屠宰场的肉食鸡内脏中的大肠杆菌进行了p-内酰胺类抗生素的耐药性监测和分析.[方法]从屠宰场的肉食鸡中获取内脏样品,处理并筛选得到对β-内酰胺类耐药的大肠杆菌.通过抑菌圈法对细菌耐药性进行分析.提取细菌DNA,进行系统发育亚型分析.检测并鉴定菌株中β-内酰胺酶基因和整合子的结构,并进行了接合转移实验.[结果]检测到对3种及以上的β-内酰胺类药物同时具有耐药性的大肠杆菌占总菌的80％以上.编码A类β-内酰胺酶的blaTEM和blaCTX-M耐药基因存在率较高,分别为86.7％和81％,但仅blaCTX-M与β-内酰胺类药物的耐药性呈现显著相关性.B1和D2亚型的大肠杆菌中β-内酰胺耐药基因的检出率较高,并且显著增强了大肠杆菌对β-内酰胺类药物的耐药性,而A0和A1亚型菌株对p-内酰胺类药物较敏感.尽管整合子在大肠杆菌中普遍存在,但它们伴随β-内酰胺酶基因转移到受体菌的比例很低,说明二者之间的相关性较低.[结论]本文结果显示肉鸡源大肠杆菌对β-内酰胺类药物的耐药程度较高,多重耐药情况普遍存在.本文明确了大肠杆菌中β-内酰胺类抗生素的耐药性与系统发育之间的联系,为肉鸡源大肠杆菌中β-内酰胺耐药性的流行监测提供参考依据.

摘要： 为探究广西地区猪源奇异变形杆菌的毒力和耐药情况,本研究从不同规模养殖场收集病死猪病料98份,通过分离培养、形态学观察、染色镜检、16S rRNA测序对分离菌进行鉴定;采用微量肉汤稀释法进行药敏试验;PCR检测毒力基因、耐药基因和整合子及其可变区;可变区扩增产物克隆至pMDTM19-T载体进行测序.鉴定结果显示,22株细菌在TSA培养基上弥漫性生长,在SS培养基上形成中心黑色边缘白色的单菌落,镜检为革兰氏阴性短杆菌,变形杆菌属特异性基因(TUF)阳性.16S rRNA测序结果显示,21株分离菌与奇异变形杆菌同源性达99％,1株分离菌与彭氏变形杆菌同源性达99％.药敏结果显示,21株奇异变形杆菌对四环素、多西环素、氨苄西林、磺胺甲噁唑耐药率均为100％,对头孢氨苄、头孢呋辛、头孢噻肟、亚胺培南、卡那霉素耐药率在57.1％以上,所有分离株均为多重耐药菌.PCR结果显示,21株分离菌毒力基因atfA、hpmA、ireA、mr pA、pm fA、rsb、ureC、zapA、ptA检出率均为100％,ucaA检出率为95.2％;ESBLs菌株为blaTEM型、blaCTX型或blaTEM型和blaCTX 型,AmpC菌株均为blaDHA型,携带ESBLs或AmpC基因的菌株比例为57.1％、14.3％,同时携带ESBLs和AmpC基因的菌株比例为 14.3％;qnrA、qnrB、qnrS和aac(6')-Ⅰb-cr 检出率分别为9.5％、0、4.8％和80.1％.21 株分离菌 Ⅰ 类整合子(int Ⅰ 1)阳性率61.9％,检测到9种基因盒阵列(aadA2-linF、estX、dfrA32-ereA-aadA2、drfA5、drfA12-orfF-aadA2、arr3-aac(6')Ⅰ b-cr5、aac(6')Ⅰ b-cr5-blaOXA-1-catB3-aar3、drfA1-orfC 和 aadA2);Ⅱ 类整合子(intⅠ2)阳性率76.2％,检测到1种基因盒阵列(drfA1-sat1-aadA1).本研究结果表明,广西地区猪源奇异变形杆菌毒力高且耐药严重,为后期针对奇异变形杆菌的防治和研究提供数据支持.

摘要： 采用K-B纸片扩散法对61株禽沙门氏菌分离株进行了药敏试验,结果显示所分离的禽沙门氏菌对青霉素、苯唑西林、利福平和万古霉素的耐药率均达到了100％,但对美福仙、诺氟沙星、阿米卡星、卡那霉素、氯霉素、氟苯尼考有较好的敏感性.96.72％沙门氏菌对6种及其以上抗菌药耐药,说明沙门氏菌的多重耐药性比例高.通过PCR方法对59株多重耐药沙氏菌Ⅰ类整合子的5'-CS端、3'-CS端和可变区进行扩增,检测出含基因盒的Ⅰ类整合子的禽沙门氏菌5株(8.5％),其中鸡白痢病沙门氏菌4株,肠炎沙门氏菌1株.序列分析显示核苷酸同源性达到100％,通过NCBI BLAST分析,Ⅰ类整合子的基因盒均含有dfr17和aadA5基因,表明这几株多重耐药沙门氏菌可以耐受磺胺甲基异恶哇、链霉素和甲氧芐氨嘧啶的选择压力.因此,沙门氏菌的多重耐药性比例高,但这些沙门氏菌分离株的多重耐药性与Ⅰ类整合子相关性不高.

摘要： 铜绿假单胞菌(Pseudomonasaemginesa.Pa)为条件致病菌,广泛分布于自然界及健康人的皮肤、肠道和呼吸道.当人体免疫力降低时(如：烧伤、严重复合伤、大手术)或侵入性诊疗(如：气管切开、尿道插管盒肾透析)后,铜绿假单胞菌几乎可以感染人体任何组织.表现为局部化脓性炎症和全身性感染.除了外排系统,外膜通透性障碍等天然耐药机制之外,整合子介导的多重耐药因也是造成铜绿假单胞菌多重耐药的主要原因之一.

摘要： 随着抗生素的广泛使用,细菌在抗生素选择压力作用下,耐药菌株不断产生.细菌多药耐药性的产生导致抗生素的疗效大大降低,可移动遗传元件整合子被认为是导致耐药基因在细菌间水平转移的重要原因.整合子对耐药基因的捕获及表达关系到新耐药菌株的产生与播散,研究整合子传递耐药性的影响因素能够合理指导临床用药,进而减少耐药菌株的产生与播散.基于上述原因,本文综述了SOS反应、自然转化、可变区启动子、基因盒长度、重组位点等因素对整合子传递耐药性的影响.

摘要： 针对住院儿童大肠杆菌采用KB法对氨基糖苷类药物及其他药物进行敏感性测定,结果显示对12种药物耐药率达30％～75％.并采用PCR方法扩增三种氨基糖苷类耐药基因:其中16S rRNA甲基化酶基因rmtB检出率12％,氨基糖苷乙酰转移酶基因aac(3)-Ⅱ和氨基糖苷类核苷转移酶基因aadA1检出率1.6％.rmtB阳性菌株携带Ⅰ类整合子的检出率66.7％,主要携带了dfrA12+aadA2+orfF、dfrA17+aadA5两种排列形式.

摘要： 为了研究沙门氏菌多重耐药性与Ⅰ型整合子的流行,本文从山东省鸡场分离沙门氏菌,根据Kauffmann-White方法测定其血清型,采用微量稀释法测定了沙门氏菌对19种常用抗菌药物的MIC值,并且采用PCR技术测定了Ⅰ型整合子及其携带的耐药基因盒.结果显示,本次分离得列311株沙门氏菌,包括印地安纳沙门氏菌(133株)和肠炎沙门氏菌(178株)2种血清型.药物敏感性试验表明:分离菌株对磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑、萘啶酸、氨苄西林、四环素、多西环素和甲氯苄啶普遍耐药,菌株多重耐药率为91.0％ (283 /311),99％的分离株对阿米卡星、多黏菌素敏感.PCR测定Ⅰ型整合子结果:Ⅰ型整合子的检出率为65.0％ (202/311),其中多重耐药表型菌株Ⅰ型整合子阳性率为92.6％,202株整合子阳性菌株中有6株的携带基因盒dfr17-aadA5.上述结果表明,Ⅰ型整合子普遍存在于沙门氏菌中,并且与沙门氏菌的多重耐药性密切相关.

摘要： 本试验对临床分离的61株鸭源鸡杆菌菌株进行了三种类型经典整合子的检测与分析，以此来研究在鸭源鸡杆菌中整合子所携带的耐药基因与耐药表型之间的关联。研究结果证明，鸭源鸡杆菌对抗生素的耐药性同Ⅰ类整合子的存在有关，即具有整合子的菌株易产生耐药性，且更易产生多重耐药性。

摘要： 整合子(integron)是一种能识别并俘获外源性可移动基因，是携带编码抗生素耐药基因盒的DNA片断，具有位点特异性的基因重组系统。研究表明，整合子不仅可介导细菌耐药性群聚，导致多重耐药性的产生，而且可以在不同遗传物质和菌种间转移，引起耐药基因高效快速转移。现已确认4类整合子，但在耐药方面起最主要作用的为第1类整合子。肺炎克雷伯菌是医院分离的最常见的革兰阴性杆菌之一，可引起原发性肺炎，肠炎和脑膜炎(婴儿)，泌尿道感染(儿童和成人)及菌血症。近十几年来由该菌引起的免疫低下患者感染或医院感染不断增多，多重耐药菌株也日益日渐增多，治疗该菌引起的感染变得越来越困难，其耐药机制非常复杂。方法用多重聚合酶链反应(mult-PCR)方法检测88株肺炎克雷伯菌临床分离菌株的整合酶基因，对其阳性菌株可变区扩增产物进行测序分析;采用微量稀释法测定14种抗生素对试验菌株的敏感性，对其耐药情况、整合子分布及其结构特征、整合子介导的耐药机制在多重耐药性中的作用进行研究。结果在38株肺炎克雷伯菌DNA上检测到Ⅰ类整合，阳性率43.2％。可变区相关基因盒检测到4种不同片段的PER产物：700bp(8株)、1500 bp(27株)、2200 bp(2株)、2400bp(1株)。1500 bp片段，内部插入氨基糖苷类抗生素的耐药基因(氨基糖苷类核苷转移酶，aadA2)，2200 bp片段内部检出dfrA12-orfF-aadA2基因，2400 bp片段，该整合子内部检出dfrA17-orfF-aadA5。对14种抗生素的MIC用多因素的方差分析整合子阳性菌株与阴性菌株耐药情况比较显示，两组比较差异有统计学意义(P0.05)。结论目前临床分离的肺炎克雷伯菌耐药性强，并广泛存在Ⅰ类整合子。菌株携带基因盒和耐药表型之间有较好的对应关系，基因盒介导了细菌耐药性。耐药基因盒是整合子阳性菌株对氨基糖苷类的主要原因。

摘要： 目的：研究临床分离的59株耐头孢西丁大肠埃希菌整合子的分类、结构、及其在介导耐药中的作用。rn 方法：用PCR方法检测整合酶基因，用限制性片段长度多态性技术(RFLP)进行分类，进一步对阳性样本可变区的基因盒序列鉴定分析，采用微量稀释法测定22种抗生素对试验菌株的最低抑菌浓度。rn 结果：整合酶基因阳性率为76%，均为I类整合酶基因；所携带的耐药基因盒绝大多数为aadA和dfr，编码氨基糖苷类、磺胺类抗生素耐药；仅有两株携带β-内酰胺酶耐药基因盒；整合子阳性组抑菌浓度明显高于阴性组，主要在磺胺类药物、四环素、氯霉素、及氨基糖苷类，而两组其它药物比较差异无显著性。rn 结论：I类整合子广泛地存在于头孢西丁耐药的大肠埃希菌中；耐药基因盒是整合子阳性菌株对氨基糖苷类、磺胺类药物及氯霉素耐药的主要原因，但对介导β-内酰胺类耐药方面，不起主要角色。

摘要： 目的：研究产超广谱p-内酰胺酶（ESBLs)大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中Ⅰ类整合子的分布，探讨整台子介导的耐药机制在产ESBLs菌耐药性中的作用。方法：采用PCR检测100株产FSBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌Ⅰ类整合酶基因及blaTEM、blaSHV和blaCTX-M基因，对Ⅰ类整合子阳性进行耐药基因盒检测和测序。

摘要： 从水族馆由于肺部感染发病死亡的瓶鼻海豚肺部进行细菌分离得到一株细菌,PCR扩增其16sRNA并通过测序比对确定此分离细菌为奇异变形杆菌.通过PCR检测该菌株整合子并分析其耐药基因盒携带情况,结果检测得出本次分离得到的奇异变形杆菌Ⅰ类整合子和Ⅱ类整合子阳性,Ⅲ类整合子阴性,并且Ⅰ类整合子和Ⅱ类整合子阳性中分别携带blaCMY-2和aadB耐药基因盒.为日后医疗的合理用药提供了重要的依据.

摘要： 本发明公开了一种含有多个耐药基因盒的中间气单胞菌整合子及其获取方法和应用，该整合子序列如SEQ ID NO.1所示，所述整合子命名为InQST31。以深入研究水产动物源致病菌耐药机制特别是对有关整合子的研究，有利于抗菌药物的合理使用和新抗生素药物的开发，同时，加强抗菌药物在水产养殖过程中的合理应用。属于分子生物学技术及耐药细菌监测领域。

摘要： 本发明公开了一种快速检测细菌整合子的LAMP试剂盒，所述的试剂盒包括：10×LAMP缓冲液；10mM dNTPs；50μM钙黄绿素；8000U/mLBst DNA聚合酶；外引物组(1‑F3、1‑B3；2‑F3、2‑B3；3‑F3、3‑B3)；内引物组(1‑FIP、1‑BIP；2‑FIP、2‑BIP；3‑FIP、3‑BIP)；无菌去离子水。本发明试剂盒具有简便快速、特异性强、灵敏度高的优点，可根据反应结束后颜色的差异，即可进行结果判定，适合现场快速检测。

摘要： 本发明涉及细菌耐药性研究领域，具体是一种用于同时检测细菌中三种整合子相关元件的多重PCR引物及多重PCR检测方法，该多重PCR引物包括利用引物设计软件Primerplex 2.61设计筛选的同时检测1类整合子(Int1)、4类超级整合子(SXT)和1型插入序列共同区(ISCR1)的多重PCR引物组合，利用设计的引物建立多重PCR检测体系，通过对引物体积和退火温度的优化建立了针对三种整合子相关元件的多重PCR检测方法，与现有技术相比，本发明的优点在于：采用本发明建立的多重PCR方法可同时检测细菌中三种整合子相关元件，具有操作简便、快速，特异性强等优点。

摘要： 本发明涉及棒状细菌的整合子，特征在于它包含：确保在所说的棒状细菌中有效选择的基因及所说之棒状杆菌之基因组的同源序列，其中所说的序列适于所说的细菌。;当所说的整合子含有编码有用蛋白质的序列时，其特别适于经培养由之转化的棒状细菌来生产蛋白质。

摘要： 本发明公开了一种环境样品I型整合子携带抗生素抗性基因相对丰度分析方法，首先对样品DNA的I型整合子进行PCR扩增，对I型整合子的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳并切胶纯化，而后以该切胶纯化产物为模板进行定量PCR的分析，从而对I型整合子携带的抗生素抗性基因进行检测，并进行基因在I型整合子上相对丰度的分析与比较，从而掌握抗生素抗性基因在I型整合子上的相对丰度特征。以PCR为基础，避免了使用宏基因组测序分析难度大、数据挖潜困难、定量分析程度不足的问题；本发明为环境样品I型整合子抗生素抗性基因的相对丰度分析，提供了新的技术方法和研究方向。

摘要： 一种检测大气环境中一类整合子基因intI1的方法。该方法包括：将已知浓度的整合子基因intI1标准样品稀释至不同浓度，作为模板进行PCR反应提取DNA，以此DNA为模板，利用设计的正向引物和反向引物对此DNA进行定量PCR扩增，并记录循环数；将获得的循环数，根据定量PCR测定目的基因intI1质粒标准样品的标准曲线；运用10倍梯度稀释法，利用已知浓度模板起始拷贝数标准样品做出目的基因的标准曲线；确定大气环境样品中一类整合子基因intI1的循环数，并根据标准曲线计算基因intI1的含量。本发明提供的目的基因引物序列和方法可以对大气环境样品中一类整合子基因intI1进行快速精确定量。

摘要： 本发明公开一种降低畜禽粪便堆肥中抗性基因和I型整合子丰度的方法，包括：1)将畜禽粪便、堆肥调理剂与褐煤，调整C/N比为20～30，含水率为55～60％，2)利用将堆肥原料进行常规高温好氧堆肥28‑42天，即实现降低畜禽粪便堆肥产物中抗性基因和I型整合子丰度。

摘要： 本发明公开了一种含有多个耐药基因盒的中间气单胞菌整合子及其获取方法和应用，该整合子序列如SEQ ID NO.1所示，所述整合子命名为InQST31。以深入研究水产动物源致病菌耐药机制特别是对有关整合子的研究，有利于抗菌药物的合理使用和新抗生素药物的开发，同时，加强抗菌药物在水产养殖过程中的合理应用。属于分子生物学技术及耐药细菌监测领域。

摘要： 本发明公开了一种宏基因组整合子和移动元件的分析方法，其特征在于，包括如下步骤：下机数据整理步骤；构建本地数据库步骤；BLAST比对步骤；注释构建步骤。本发明的有益效果在于：注释的序列量大且速度快：本分析流程将使用线下的数据库，对于非常大的数据集，也能方便的做注释，且注释的速度比在线提交会快许多。注释结果信息完整：本分析流程会自动将注释结果进行分类，汇总，方便用户使用。

摘要： 本发明公开了检测水中铜绿假单胞菌和整合子的引物、试剂盒和方法，该引物的序列和探针序列分别为：上游引物P.AF、下游引物P.AR、探针P.AP、上游引物int1F、下游引物Int1R、探针Int1P。本发明的目的是为了克服现有技术中的不足之处，提供一种引物且组分和配比合理，使用方便，检测快捷，准确，适用于双重ddPCR检测水中铜绿假单胞菌及整合子int1的试剂盒；本发明另一个目的是提供一种采用上述试剂盒检测水中铜绿假单胞菌及整合子int1的方法，该方法操作简便、快速，成本低，检测结果准确。