BRAF基因

摘要： 目的探讨超声、血清学和BRAF基因检测3种检查方法单独以及联合应用时,对鉴别根据甲状腺影像报告和数据系统(Thyroid Imaging Reporting and Data System,TI-RADS)中已经被报告为TI-RADS 4类结节良恶性的诊断价值。方法回顾性分析经锦州医科大学附属第一医院超声医学科检查报告为TI-RADS 4类结节的102例患者,并对这102例患者均进行血清学及BRAF基因检测。根据手术病理及穿刺病理结果将患者分为良性组和恶性组,评估使用不同诊断方法对鉴别甲状腺TI-RADS 4类结节良恶性的诊断效能。结果超声检查结果提示恶性组的图像表现为低回声、内部存在钙化、边界模糊、形态不规则的患者数目多于良性组(P<0.05);恶性组促甲状腺素(TSH)的检验值高于良性组(P<0.05);恶性组BRAF基因产生突变的占比明显多于良性组(P<0.05)。联合使用超声、血清学及BRAF基因检测3种检查技术的准确度(98.04%)、灵敏度(97.22%)、特异度(100.00%)及诊断效能(0.926)均高于应用一种检查技术(P<0.05)。结论联合应用超声、血清学及BRAF基因检测方法对于鉴别TI-RADS 4类甲状腺结节的良恶性更具有临床价值。

摘要： 目的 探讨甲状腺细针穿刺(fine needle aspiration, FNA)样本的BRAF V600E基因突变检测在甲状腺结节术前风险分层管理中的应用价值。方法 收集甲状腺结节患者手术前经超声引导下细针穿刺(ultrasound guided fine needle aspiration, US-FNA)样本141例(155个结节),用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,Q-PCR)方法检测FNA样本的BRAF V600E突变情况,同时对US-FNA样本行液基细胞薄层制片、细胞病理学诊断;以术后病理诊断结果为金标准,比较FNA样本BRAF V600E突变检测与术后病理诊断的一致性,并分析FNA样本BRAF V600E突变检测和细胞学检查两种方法在甲状腺结节术前风险分层管理中的优劣。结果 141例(155个结节)术前FNA样本BRAF V600E突变检测结果显示BRAF V600E突变阳性率为79.4%(123/155);与术后病理诊断结果比较,FNA样本BRAF V600E突变检测对甲状腺乳头状癌诊断敏感性87.9%、特异性100%、阳性预测值100%、阴性预测值45.2%、准确性89%。FNA细胞学检查对其诊断的敏感性87.9%、特异性78.6%、阳性预测值97.6%、阴性预测值39.3%、准确性87%。BRAF V600E突变检测联合FNA细胞学检查对甲状腺结节良恶性诊断的敏感性94.3%,与单一FNA样本BRAF V600E突变检测和细胞学检查方法的敏感性比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 甲状腺FNA样本BRAF V600E突变检测联合细胞学检查可作为第一推荐纳入甲状腺结节风险分层管理措施中。

摘要： 1病例患者,女,55岁。患者因"彩超发现双侧甲状腺肿物两年余"入院,行甲状腺细胞学穿刺结果示:(右侧甲状腺)少许细胞有异型,恶性待排。超声结果示:甲状腺左侧可见3×3×3 mm和右侧2×2×3 mm的包块。降钙素40.9 pg/m L(0~18 pg/m L),血清促甲状腺素5.14 u IU/m L(0.27~4.20 uIU/)。既往无个人辐射暴露史和甲状腺癌家族史。

摘要： 甲状腺乳头状癌(papillary carcinoma of the thyroid,PTC)是最常见的甲状腺分化型肿瘤,其发生主要与BRAF、RAS、RET、TERT等癌基因的突变密切相关。不同癌基因的改变可能会导致PTC出现不同的生物学行为和肿瘤生长模式,呈现出不同的超声特征。近年来,随着分子生物学技术的发展,许多研究者尝试探索PTC分子标志物与超声特征的相关性。充分了解PTC分子标志物与超声特征之间的关联,可以在有创操作前更好地评估PTC患者的总体风险和可能存在的分子特征,这将有助于PTC的个性化评估,对于合理制订患者后续的诊疗方案至关重要。

摘要： 近年来,结直肠癌(CRC)的治疗取得了很大的进展,CRC患者整体生存率较前有了明显的提高,但raf鼠肉瘤滤过性病毒致癌基因同源体B1(BRAF)突变型CRC的疗效仍不尽如人意,BRAF突变患者较差的药物反应及预后仍是临床上的一大难题,至今BRAF突变型结直肠癌(BRAFmt CRC)的治疗方案仍未有明确定论,但近年来相关临床试验的开展为该类患者带来了更多治疗方案的选择及更好的疗效。

摘要： 目的:分析鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BRAF)V600E突变与甲状腺乳头状癌(PTC)颈部淋巴结转移及超声征象的相关性。方法:回顾性分析2020年7月至2021年12月在本院进行手术的323例PTC患者,根据术后病理切片检测是否有BRAF.V600E突变,分为BRAF.V600E突变组和BRAF.V600E无突变组。比较两组间临床病理特征及肿瘤病灶超声特征是否存在显著差异,并分析BRAF.V600E突变与颈部淋巴结转移的相关性。结果:323例PTC中292例存在BRAF.V600E突变(90.4%)。两组患者年龄、性别组成及被膜侵袭方面差异均无统计学意义(P>0.05),BRAF.V600E突变与PTC颈部淋巴结转移无相关性(r=0.038,P=0.498)。无突变组中结节微钙化发生比例显著(80.6%)高于BRAF.V600E突变组(57.9%),有差异(P=0.014)。两组结节数、大小、边缘、纵横比及内部回声方面差异无统计学意义(P>0.05)。PTC患者BRAF.V600E突变与病灶内微钙化具有弱负相关性(r=-0.137)。结论:BRAF.V600E突变与PTC超声特征微钙化具有弱负相关性,与颈部淋巴结转移无.相关性。

摘要： 目的 探讨超声造影(CEUS)联合BRAF基因突变对中国甲状腺影像报告与数据系统(C-TIRADS)4类甲状腺良恶性结节的鉴别诊断价值。方法 选取我院行CEUS检查并经手术病理证实的甲状腺结节患者126例(共126个结节),术后均行BRAF基因突变检测;其中C-TIRADS 4A类52个,C-TIRADS 4B类36个,C-TIRADS 4C类38个。比较各分类甲状腺结节CEUS特征和BRAF基因突变情况的差异;分析C-TIRADS 4类甲状腺恶性结节CEUS特征与BRAF基因突变的相关性。绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估CEUS特征、BRAF基因突变单独及联合诊断C-TIRADS 4类甲状腺恶性结节的效能。结果 C-TIRADS 4B、4C类甲状腺结节低增强(66.67%、73.68%)、不均匀增强(94.44%、89.47%)、向心性增强(97.22%、89.47%)占比均高于C-TIRADS 4A类,差异均有统计学意义(均P<0.05)。126个甲状腺结节中58个发生BRAF基因突变,发生率为46.03%。C-TIRADS 4B、4C类甲状腺结节BRAF基因突变阳性占比高于C-TIRADS 4A类,差异有统计学意义(P<0.05)。C-TIRADS 4类甲状腺恶性结节的CEUS特征(低增强、不均匀增强、向心性增强)与BRAF基因突变阳性呈显著正相关(r=0.793、0.872、0.895,均P<0.05)。ROC曲线分析显示,CEUS特征联合BRAF基因突变诊断C-TIRADS 4类甲状腺恶性结节的曲线下面积(0.973)、敏感性(100%)、特异性(94.60%)均较其单独诊断效能高。结论 CEUS联合BRAF基因突变有助于提高对C-TIRADS 4类甲状腺良恶性结节的鉴别诊断价值。

摘要： 心-面-皮肤(cardio-facio-cutaneous,CFC)综合征是一种极其罕见的常染色体显性遗传病.患者的主要特征为颅面部畸形、心脏畸形、皮肤异常、语言和运动发育迟缓、胃肠道功能障碍、智力障碍及癫痫.本例患儿具有典型的CFC综合征面容以及发育迟滞.二代测序技术结果显示:患儿BRAF(NM_004333.5)基因14号外显子上存在1个突变位点c.1741A>G(p.Asn581Asp)(杂合),其父母均未发现上述变异,该变异可能为新生突变.本病尚没有特效的治疗方法.

摘要： cqvip:甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是甲状腺癌中最常见的类型,约占甲状腺癌的90%[1]。虽然目前绝大多数PTC预后较好,但仍有30%的PTC患者术后出现反复复发及远处转移[2]。Kimura等[3]研究发现70%的PTC可能存在分子改变,包括编码受体酪氨酸激酶RET、神经营养受体酪氨酸激酶-1(NTRK1)基因,以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路的两个细胞内效应基因RAS和BRAF。

摘要： 目的·评估BRAF基因突变对肝切除后的结直肠癌肝转移(colorectal cancer liver metastasis,CRLM)患者预后的影响.方法·计算机检索PubMed上10年间的临床研究,起止时间为2010年1月-2020年6月.检索方式为"BRAF"and("colon"or"colorectal"or"rectal"or"rectum")and("metastasis"or"metastatic"or"metastases"or"mets"or"metastasectomy")and("hepatic"or"liver").根据纳入及排除标准筛选文献,并进行质量评价和数据提取.应用RevMan5.4软件进行数据分析,主要结局指标为总生存期(overall survival,OS),次要结局指标为无病生存率(disease-free survival,DFS).结果·最终7篇文献被纳入meta分析,共包含2 722例患者,BRAF突变率为5.77％.7篇文献报道了 CRLM患者行肝切除后,按BRAF基因状态进行分层分析的OS.meta分析结果显示,合并效应量危险比(hazard ratio,HR)=3.04,95％CI2.30～4.01,P=0.000,有统计学意义,说明有BRAF突变的CRLM患者,行肝切除后OS缩短.OS的HR漏斗图基本对称,未发现明显的发表偏倚.3篇文献报道了 CRLM患者行肝切除后,按BRAF基因状态进行分层分析的DFS,共1 237例患者,BRAF的突变率为9.62％.meta分析结果显示,合并效应量HR=2.07,95％CI 1.06～4.03,P=0.03,有统计学意义,说明有BRAF突变的CRLM患者,行肝切除术后DFS缩短.DFS的HR漏斗图不对称,不能确定是否存在发表偏倚,可能与纳入研究的样本量较少有关.结论·BRAF突变是肝切除后的CRLM患者预后不良的生物标志物,与较差的OS相关,而与较差的DFS是否有关仍需更多研究来证实.

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 8％～12％的转移性结直肠癌(colorectal cancer,CRC)患者携带BRAF基因突变,而且其中90％的突变对应于第15号外显子的第1799位胸腺嘧啶突变为腺嘌呤,引起第600个密码子编码谷氨酸,而非缬氨酸,即BRAF V600E突变.BRAF基因发生这一突变后,编码产物活性较野生型增强10倍,继而使得MAPK通路出现异常激活,故在没有细胞因子等刺激因素下仍可促进细胞过度增殖,导致肿瘤的发生.本文将从BRAF突变晚期结直肠癌的化学治疗、靶向治疗及免疫治疗三方面进行综述。

摘要： 强烈的预后标志物,即使在考虑部位的情况下;在BRAF突变型患者中,西妥昔单抗或贝伐珠单抗的生存均较差.

摘要： 强烈的预后标志物,即使在考虑部位的情况下;在BRAF突变型患者中,西妥昔单抗或贝伐珠单抗的生存均较差.

摘要： 强烈的预后标志物,即使在考虑部位的情况下;在BRAF突变型患者中,西妥昔单抗或贝伐珠单抗的生存均较差.

摘要： 强烈的预后标志物,即使在考虑部位的情况下;在BRAF突变型患者中,西妥昔单抗或贝伐珠单抗的生存均较差.

摘要： 本发明提供了一种用于与BRAF基因杂交的DNA探针库，所述DNA探针库包括一个或多个能够与BRAF基因杂交的DNA探针，所述DNA探针包含以下序列：SEQIDNO.1、SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.4、SEQIDNO.5、或SEQIDNO.6。本发明还提供了采用该DNA探针库富集BRAF基因片段的方法。基于此，本发明还提供了一种检测BRAF基因的基因结构突变的方法。采用本发明的方法可以成数千倍地富集得到BRAF基因片段，并可以将其用于下一代测序技术以进行基因结构突变的检测，包括单碱基突变、mRNA缺失或增多、mRNA结构颠换、mRNA剪接变化。

摘要： 本发明提供了一种检测KRAS基因和/或BRAF基因的核苷酸突变位点的方法，包括如下步骤：(1)确定KRAS基因和/或BRAF基因的待测突变位点；(2)根据这些突变位点设计出扩增引物和每个突变位点的延伸引物；(3)PCR扩增；(4)SAP酶处理；(5)延伸反应；(6)采用树脂纯化延伸反应产物；(7)质谱检测，确定被测的KRAS基因和/或BRAF基因目的位点的突变型。采用本发明提供的方法，解决了现有检测方法灵敏度低、准确率有限，以及通量低，成本高的问题。此外，本发明还提供了用于上述方法的特异性引物和引物组合及其用于上述检测方法的用途。

摘要： 本发明涉及一种检测BRAF基因突变的核酸组合物及试剂盒和BRAF基因突变的检测方法。该检测BRAF基因突变的核酸组合物，包括：序列如SEQ ID No.1及SEQ ID No.2所示的第一引物对和序列如SEQ ID No.3所示的第一探针，第一引物对和第一探针用于检测BRAF基因的V600E突变。上述核酸组合物中第一引物对及第一探针对BRAF基因的V600E突变的特异性较高，能够检测BRAF基因的V600E突变，且检测灵敏度较高。

摘要： 本发明提供了一种用于与BRAF基因杂交的DNA探针库，所述DNA探针库包括一个或多个能够与BRAF基因杂交的DNA探针，所述DNA探针包含以下序列：SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、或SEQ ID NO.6。本发明还提供了采用该DNA探针库富集BRAF基因片段的方法。基于此，本发明还提供了一种检测BRAF基因的基因结构突变的方法。采用本发明的方法可以成数千倍地富集得到BRAF基因片段，并可以将其用于下一代测序技术以进行基因结构突变的检测，包括单碱基突变、mRNA缺失或增多、mRNA结构颠换、mRNA剪接变化。

摘要： 本发明涉及一种PIK3CA基因和BRAF基因突变多重检测引物探针及其试剂盒包括检测PIK3CA基因和BRAF基因20号外显子T790M突变的上游引物F‑T790M、下游引物R‑T790M、野生型探针WP‑T790和突变型探针MP‑T790M，检测PIK3CA基因和BRAF基因21号外显子L858R突变的上游引物F‑L858R、下游引物R‑L858R、野生型探针WP‑L858和突变型探针MP‑L858R，以及检测PIK3CA基因和BRAF基因19号外显子片段缺失突变的上游引物F‑E19del、下游引物R‑E19del、野生型探针WP‑E19和突变型探针MP‑E19del。本发明的PIK3CA基因和BRAF基因突变多重检测引物探针及其试剂盒快速高效，标准品的配制简单，检测体系的特异性与灵敏度高，游离DNA的利用率高，准确度高。

摘要： 本发明提供了用于检测KRAS基因和BRAF基因突变的引物组及其应用方法，该引物组，包括下述至少一个用于检测KRAS基因的引物对和用于检测BRAF基因的引物对：用于检测KRAS基因第2号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；用于检测KRAS基因第3号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；用于检测BRAF基因第15号外显子的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。使得基因检测通量提高。

摘要： 一种采用等位基因RNA等温扩增法来快速检测BRAF基因突变的方法，步骤为：细胞裂解处理；RNA的逆转录处理；生成cDNA，并成为RNA扩增模板；通过定期监测荧光信号，来对RNA扩增子进行定量；本发明采用等温反应法，对BRAF的V600E突变位点进行定点特异检测，其中温度等温41°C进行，试验条件温和，反应化合物普通，操作简单，特异性高，仅需要能检测荧光探针的仪器即可。它有一个更高的放大系数，能够在1.5小时之内用2条针对靶向RNA的特异性引物和三个酶，制造出十亿个与目标RNA互补的RNA，通过荧光探针的检测，读出低至0.1％含量的BRAF突变信息，用于肿瘤患者靶向药物的用药指导。

摘要： 本发明提供了一种检测KRAS基因和/或BRAF基因的核苷酸突变位点的方法，包括如下步骤：(1)确定KRAS基因和/或BRAF基因的待测突变位点；(2)根据这些突变位点设计出扩增引物和每个突变位点的延伸引物；(3)PCR扩增；(4)SAP酶处理；(5)延伸反应；(6)采用树脂纯化延伸反应产物；(7)质谱检测，确定被测的KRAS基因和/或BRAF基因目的位点的突变型。采用本发明提供的方法，解决了现有检测方法灵敏度低、准确率有限，以及通量低，成本高的问题。此外，本发明还提供了用于上述方法的特异性引物和引物组合及其用于上述检测方法的用途。

摘要： 本发明涉及分子生物学检测领域，具体涉及一种用于检测BRAF基因突变的引物组合、试剂盒、模型、构建方法及检测方法；包括提取cfDNA样本，基于提取的cfDNA样本，配置用于检测BRAF基因突变的反应体系并相应进行PCR扩增，对扩增产物进行加接头及PCR富集制备测序文库，对测序文库进行定量与质控，采用基因测序仪进行高通量测序，采用生物信息分析软件对测序数据分析，得到cfDNA样本的BRAF基因第12号外显子和第15号外显子特定位点的相关信息，本发明可对BRAF基因第12外显子检出含0.09％的BRAF基因相关位点突变的游离核酸样本，对第15外显子检出含0.05％的BRAF基因相关位点突变的游离核酸样本，可提高BRAF基因相关位点生物临床检测水平，为普及应用奠定基础。

摘要： 本发明公开了一种检测KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变的引物探针组合及其应用。所述引物探针组合包括检测KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变的引物和探针。本发明设计检测KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变的引物探针组合，利用数字PCR对肿瘤中KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因的14种热点突变进行定性检测，具备良好特异性和灵敏度，且操作简便、成本低。