SPARC

摘要： 宏基因组序列组装在计算和内存上面临着巨大挑战.SpaRC(Spark Reads Clustering)是基于Apache Spark的宏基因组序列片段聚类算法,为来自下一代测序技术的数十亿测序片段聚类提供了一种可扩展的解决方案.但是,SpaRC算法参数的设置是一项非常具有挑战性的工作.SpaRC算法拥有许多对算法性能有着很大影响的超参数,选择合适的超参数集对于充分发挥SpaRC算法的性能来说是至关重要的.为了提高SpaRC算法的性能,探索了一种基于树状结构Parzen估计方法(Tree Parzen Estimator,TPE)的超参数优化方法,其能够利用先验知识高效地调节参数,并通过减少计算任务加速寻找最优参数,达到最佳聚类效果,从而避免昂贵的参数探索.对长序列片段(PacBio)和短序列片段(CAMI2)进行实验,结果表明,该方法在改善SpaRC算法性能方面有着良好的效果.

摘要： 目的:运用微阵列和生物信息学分析来揭示与甲状腺乳头状癌(PTC)预后不良有关的基因.方法:选取2016年9月～2018年9月期间入住湖南省人民医院乳甲外科并确诊为甲状腺乳头状癌患者的癌组织和对应癌旁组织对进行基因表达谱分析和差异表达基因的筛选;采用DAVID软件对差异基因行GO功能富集分析和信号通路富集(KEGG)分析,采用STRING数据库对筛选出的差异基因进行蛋白互作网络分析;利用TCGA数据库平台,采用Kaplan-Meier分析方法进行生存分析.结果:甲状腺乳头状癌组织中共筛选出差异表达的基因364个,差异表达的LncRNA 228个.GO分析结果显示:甲状腺乳头状癌差异基因在生物过程中主要富集于"负增长调节".在分子功能中显著富集于"蛋白酶结合".在细胞组成中,差异基因主要富集在"细胞外小体".KEGG信号通路分析提示矿物吸收、胃酸分泌及TGF-β信号通路与甲状腺乳头状癌相关.PPI网络显示GAC前15位核心基因.基于TCGA数据库的生存分析发现FN1、SMAD9与甲状腺乳头状癌的预后负相关,SPARC、TGFβR1的表达与PTC预后正相关.结论:FN1、SMAD9、SPARC、TGFβR1可能作为PTC靶向治疗的潜在分子靶点.

摘要： 目的 观察黄瓜籽总皂苷提取物(cucumber seed saponins,CSS)对小鼠成骨细胞MC3T3-E1增殖、分化和矿化的影响,以及与骨质疏松相关的SPARC、OPG/RANKL/RANK信号通路的作用.方法 通过MTT实验、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性检测、茜素红染色,考察不同浓度CSS对MC3T3-E1细胞增殖、分化及矿化的影响;采用RT-PCR方法检测SPARC、OPG/RANKL mRNA表达水平;Western blot检测SPARC、OPG/RANKL的蛋白表达量.结果 与阳性对照组相比,CSS能明显促进MC3T3-E1细胞增殖(P<0.05),CSS高、中剂量组能明显提高MC3T3-E1细胞ALP活性及钙化结节数量(P<0.05);与空白组相比,CSS不同剂量组均明显上调SPARC、OPG/RANKL mRNA及蛋白表达水平(P<0.05).结论 黄瓜籽总皂苷能够促进成骨细胞MC3T3-E1的增殖、分化及矿化能力,并通过上调SPARC、OPG/RANKL的表达水平提高MC3T3-E1细胞的成骨能力.

摘要： 为提高空间复杂电离环境下星载嵌入式系统的可靠性,提出一种容错启动系统设计方法.该启动方法利用SPARC V8架构处理器(AT697)的异常处理陷阱机制,将EDAC和三模冗余两种方法结合起来,确保星载嵌入式系统在空间复杂环境下实现容错启动和运行.该系统将BOOT(引导)区域和主程序区域备份三份存储于EEPROM中.在启动阶段,利用AT697的EDAC功能对BOOT区域进行检查和纠错,当遇一位翻转时直接纠正;当遇到多位翻转时记录出错地址并进入特定陷阱,在陷阱通过三取二仅对翻转位进行纠正,不必对整个代码进行三取二对比,从而提高系统的启动速度和可靠性.该设计适用于信息存储系统,可为星载嵌入式容错启动设计提供参考.

摘要： 铜是生物体内不可缺少的金属元素,在机体的生物化学中起着至关重要的作用,人体内大多数铜离子都是与蛋白质相结合的.本文总结了铜离子及铜结合蛋白在癌症中的作用以及铜结合蛋白与癌症的关系,并讨论其增强铂类化疗药物的作用.我们特别关注铜结合蛋白如细胞运动介质1(MEMO1)、赖氨酰氧化酶(LOX)、LOX样蛋白和富含半胱氨酸的分泌蛋白(SPARC)如何从分子水平调节化疗药物.由于铜在癌症侵袭、迁移过程具有重要作用,故铜结合蛋白可能成为癌症防治的新靶点.%Copper is an indispensable metal ion in every organism. It plays a vital part in the process of biochemistry in each organism. Most of the copper ions in the body are protein-bound. This review summarized the roles the copper ions and copper-binding proteins play in cancer development, and the relationship between copper-binding protein and cancer. The roles were also discussed of copper-binding protein in enhancing efficiency of platinum-based chemotherapy. Especially, in this article, we also discussed how copper-binding proteins like mediator of ErbB2-driven cell motility 1 (MEMO1), lysyl oxidase (LOX), LOX-like proteins and secreted protein acidic and rich in cysteine (SPARC) regulate chemotherapeutic drugs at the molecular level therapy. Considering the importance of copper in the process of tumor invasion and metastasis, a further understanding of the function of copper-binding proteins may provide new targets for cancer control.

摘要： 航天器在轨运行的修复手段主要是软件的在轨修复.SPARC平台是我国航天领域应用最广泛的处理器架构设计.针对SPARC平台的航天器软件在轨修复问题,提出一种基于二次链接的方式生成在轨软件修复注入码的方法,解决在轨修复注入码重定位的问题.通过地面遥控注入,利用航天器在轨软件预埋的钩子函数,实现在轨函数模块的动态替换及恢复,大大提升SPARC平台软件的在轨修复能力.通过多个在轨航天器的实际工程应用,证明该方法是可行的和有效的,且具有良好的工程应用价值.

摘要： 目的 探讨血清SPARC及瓣膜功能与经导管介入术和开胸术开胸修补术及镶嵌分别治疗室间隔缺损患儿的关联性.方法 以2014年5月至2016年5月收治的136例室间隔缺损患儿为研究对象,根据随机原则分成对照组和研究组,每组68例.对照组患者采取开胸术治疗,而研究组患者采取介入术治疗.比较2组患者治疗方法对血清标志物SPARC以及心脏瓣膜的影响.结果 研究组与对照组的治疗总成功率差异无统计学意义( P >0.05),手术时间、体外循环时间、输血总量、术后机械通气时间、术后住院时间组间比较差异有统计学意义( P 0.05). However there were significant differences in operation time, the time of cardiopulmonary bypass, the total blood transfusion volume, postoperative mechanical ventilation time and postoperative hospital stay between two groups (P<0.05). Moreover there were significant differences in the expression levels of SPARC expression in serum between two groups (P <0.05). No abnormal valve regurgitation and other valve dysfunction were observed in both groups, but the valve damage and functional abnormalities in study grouop were significantly more than those in control group (P<0.05). Conclusion As compared with thoracotomy, transcatheter interventional operation can more effectively improve SPARC of patients with ventricular septal defect,moreover, its effects on valve function are more obvious.

摘要： 目的:考察玉米须水提物对肥胖2型糖尿病模型大鼠肌肉组织及肝脏富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(SPARC)的影响,探讨玉米须的降糖机制.方法:采用链脲佐菌素联合高脂饲料建立糖尿病大鼠模型,将大鼠分为正常组、模型组和给药组,给药4周后分别取大鼠小腿肌肉组织及肝脏,分别采用RT-PCR和Westem-blot技术检测肌肉和肝脏组织中SPARC基因和目的蛋白的表达.结果:SPARC在糖尿病模型大鼠肌肉组织和肝脏中呈现高表达(P＜0.05),而与模型组相比,给药组肌肉组织和肝脏SPARC基因和蛋白表达水平显著下降(P＜0.05).结论:玉米须的降糖机制之一可能与其能够抑制糖尿病大鼠肌肉组织和肝脏SPARC基因和蛋白的表达相关.

摘要： 目的 研究TGF-β2对人晶状体上皮细胞酸性富含胱氨酸分泌型蛋白(SPARC)表达的影响,以期为白内障的发病机制提供确切的理论依据.方法 用终浓度为10 ng/ml的TGF-β2培养HLECs-B3细胞,连续培养0 h、6 h、16 h、24 h.0 h细胞为对照组,6 h、16 h和24 h细胞为实验组.细胞免疫荧光法检测SPARC表达水平变化,Western blotting检测SPARC表达量的变化.结果 细胞免疫荧光法检测结果显示,随着TGF-β2培养细胞时间的延长,SPARC表达的荧光逐渐增多增强,各实验组细胞SPARC表达的荧光均较对照组增多增强.Western blot法检测结果显示,随着TGF-β2培养细胞时间的延长,SPARC表达量逐渐增加,各实验组细胞SPARC表达量均较对照组明显增加,各实验组与对照组SPARC表达量的差异均具有统计学意义(P<0.05).结论 TGF-β2诱导人晶状体上皮细胞SPARC表达增加.

摘要： 目的 通过检测富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(SPARC)、Notch-1在乳腺癌组织中的表达水平,分析二者表达与疾病状态及临床预后之间的关系,为患者个体化治疗提供依据.方法 选取潍坊市人民医院肿瘤内科就诊的70名乳腺癌患者及20名乳腺良性疾病患者为研究对象,采用免疫组化法检测组织中SPARC、Notch-1的表达,分析二者的表达与患者年龄、TNM分期、肿物大小、腋窝淋巴结转移情况、雌激素受体(ER)、孕酮受体(PR)、人表皮生长因子受体-2(Her-2)、Ki-67指数及其预后的关系.结果 乳腺癌组织SPARC、Notch-1表达率明显高于乳腺良性组织(P0.05);Notch-1表达与TNM分期、腋窝淋巴结转移、Her-2、Ki-67有关(P0.05);Cox比例风险回归模型分析显示TNM分期、淋巴结转移、Her-2为复发的危险因子;TNM分期、淋巴结转移、组织学分级为死亡的危险因子.结论 SPARC、Notch-1在乳腺癌组织中的表达率明显高于乳腺良性肿瘤,且二者表达存在相关性;二者表达与患者TNM分期、腋窝淋巴结转移等临床病例指标相关,而与乳腺癌患者总生存率、复发及预后无显著关系.

摘要： SPARC是开放的体系结构,研究该体系结构对研制自主CPU有重大意义.本文首先讨论了SPARC体系结构的基本特点,并从从寄存器组织的角度研究SPARC体系结构,重点分析了延迟分支转移和寄存器窗口的特点.

摘要： SPARC是开放的体系结构,研究该体系结构对研制自主CPU有重大意义.本文首先讨论了SPARC体系结构的基本特点,并从从寄存器组织的角度研究SPARC体系结构,重点分析了延迟分支转移和寄存器窗口的特点.

摘要： SPARC是开放的体系结构,研究该体系结构对研制自主CPU有重大意义.本文首先讨论了SPARC体系结构的基本特点,并从从寄存器组织的角度研究SPARC体系结构,重点分析了延迟分支转移和寄存器窗口的特点.

摘要： SPARC是开放的体系结构,研究该体系结构对研制自主CPU有重大意义.本文首先讨论了SPARC体系结构的基本特点,并从从寄存器组织的角度研究SPARC体系结构,重点分析了延迟分支转移和寄存器窗口的特点.

摘要： SPARC是开放的体系结构,研究该体系结构对研制自主CPU有重大意义.本文首先讨论了SPARC体系结构的基本特点,并从从寄存器组织的角度研究SPARC体系结构,重点分析了延迟分支转移和寄存器窗口的特点.

摘要： 本发明名称一种基于SPARC架构CPU的EtherCAT主站模块，属于以太网控制自动化技术领域。本发明的目的是解决现有的软主站提供的上层结构不能满足日益丰富的用户需求，并且配置过程较慢，效率较低的问题。为解决这些问题，本发明提供一种EtherCAT主站模块，提供定制化的上层接口，采用双口RAM通信，完成下装配置段表的工作，提高了EtherCAT主站模块的配置效率。本发明主要用于工业控制中，作为EtherCAT主站，完成与PLC控制器的通信，接受PLC的控制，周期性地向EtherCAT从站读写数据。

摘要： 本发明公开了一种面向嵌入式SPARC处理器的多工具协同运行调试系统。该系统通过通信单元、同步单元和接口单元三个部件的协同工作，将在电脑上同时运行的多个调试工具与嵌入式SPARC处理器上的硬件调试单元连接起来，实现了在调试嵌入式SPARC处理器程序时多个调试工具之间的无缝切换，解决了由于切换调试工具，必须重新启动嵌入式SPARC处理器执行的程序，导致程序出错现场被破坏、甚至无法再现程序出错现象的问题。该系统能够大幅提高程序调试效率，实现方式灵活，并且提高了调试的可靠性。

摘要： 本发明涉及一种面向SPARC平台的嵌入式软件异常自主处理方法和装置，其中方法包括：确定所述目标软件运行的当前分区；判断所述当前分区是否为底层公共函数运行所在的分区；确定备选状态转换链表；根据所述运行状态分区表，判断所述备选状态转换链表对应的运行分区是否包括所述当前分区，且所述备选状态转换链表对应的跳转条件字段指示的跳转条件能够满足。本发明实施例提供的面向SPARC平台的嵌入式软件异常自主处理方法和装置，实现了异常的自主处理，且时延较小；避免了系统业务中断的情况的发生；同时保存了寄存器组和堆栈内容等运行时信息，也利于后续异常问题的分析和定位。

摘要： 基于SPARC处理器单粒子翻转故障注入的测试系统，包含故障注入测试数据生成模块、故障注入自动化测试执行模块、故障注入自动化输出测试报告模块。本发明解决了SPARC处理器单粒子翻转故障类型繁多、缺乏故障注入的专项测试、缺乏故障注入的精确控制、硬平台测试环境手工操作效率低等缺陷和不足。通过软件仿真故障注入建立模型，对注入的单粒子翻转故障精确的监控和执行序列化操作，具有配置脚本激励灵活、全数字仿真系统建模高速运行、模拟SPARC处理器单粒子故障驱动、动态运行时分析验证等优点。对提升我国航天型号软件可靠性与安全性确认测试与验证具有重要的意义。

摘要： 本发明涉及一种通用的SPARC处理器指令集虚拟化仿真方法，属于虚拟仿真领域。本发明针对SPARCV7、SPARCV8两种指令集版本的处理器，解决SPARC处理器的虚拟化仿真问题。SPARCV7、V8两个版本指令集共计包含130条指令集，通过对130条指令集的仿真，提供SPARC处理器嵌入式处理器软件的运行环境，为SPARC处理器嵌入式处理器软件的开发提供支撑。本发明提出的方案，能够实现SPARC指令架构处理器的指令集仿真，仿真精度高；本发明采用数组、链表等实现寄存器、内存的仿真，能够完成仿真SPARC指令架构处理器。

摘要： 本发明涉及一种面向SPARC平台的嵌入式软件异常自主处理方法和装置，其中方法包括：确定所述目标软件运行的当前分区；判断所述当前分区是否为底层公共函数运行所在的分区；确定备选状态转换链表；根据所述运行状态分区表，判断所述备选状态转换链表对应的运行分区是否包括所述当前分区，且所述备选状态转换链表对应的跳转条件字段指示的跳转条件能够满足。本发明实施例提供的面向SPARC平台的嵌入式软件异常自主处理方法和装置，实现了异常的自主处理，且时延较小；避免了系统业务中断的情况的发生；同时保存了寄存器组和堆栈内容等运行时信息，也利于后续异常问题的分析和定位。

摘要： 本发明提供一种基于SPARC架构微控制器的热电偶型模拟量输入模块，所述模块包括：模数转换电路，光耦隔离器，微控制器，存储器，总线控制电路。模数转换电路，用于将热电偶因热电效应产生的电动势模拟量转换为数字量码值；光耦隔离器实现隔离模数转换电路和微控制器；微控制器，用于模数转换器生成的数字量码值转换为热电偶电动势，并根据热电偶分度表或电动势‑温度关系计算式将热电偶电动势转换为所对应的温度数据；存储器，用于存储热电偶分度表或电动势‑温度关系计算式与通道校准数据等信息；总线控制电路，用于将转换所得温度数据通过总线输出。本发明可支持多种冷端补偿获取温度方式，便于根据应用场景选择合适的冷端补偿，以满足实际的温度测量需求。

摘要： 本发明提供一种基于SPARC架构微控制器的热电阻型模拟量输入模块，所述模块包括：模数转换电路，微控制器，存储器，隔离器，总线控制电路。模数转换电路，用于将激励电流流经热电阻形成的电势差模拟量转换为数字量码值；微控制器，用于将模数转换器生成的数字量码值转换为热电阻阻值，并根据热电阻分度表或阻值‑温度关系计算式将热电阻阻值转换为阻值所对应的温度数据；存储器，用于存储热电阻分度表或阻值‑温度关系计算式与通道校准数据等信息；隔离器，用于隔离微控制器和模数转换电路；总线控制电路，用于将转换所得温度数据通过总线输出。本发明可在模块支持较多类型热电阻分度表或阻值‑温度关系计算式的同时占用较少的系统资源。

摘要： 本发明提供一种基于SPARC架构微控制器的事件记录模块，所述模块包括：高速采集电路，高速存储器，微控制器电路，总线控制电路。高速采集电路实时采集开关量信号，根据事件类型定义判断事件是否发生并记录事件发生时刻的时间戳，并将包含事件信息与时间戳的数据发送至高速存储器缓存；高速存储器对高速采集电路发送来的数据进行缓存，并提供给微控制器电路读取；微控制器电路对高速采集电路进行配置，并定期读取高速存储器中的事件信息与时间戳的数据，组合成事件记录数据并发送至总线控制电路；总线控制电路接收微控制器电路发送来的事件记录数据，并通过总线输出至上位系统。本发明可支持多种对时方式，便于根据应用场景选择合适的对时方式，以满足实际的事件记录需求。

摘要： 本发明涉及一种兼容sparcV8架构SOC的单机应用验证系统，其结构由单机应用验证板、激励源、中心控制计算机组成。本发明单机应用验证板，在最大化设计应用验证母板的前提下只更换芯片子板就完成多种芯片的应用验证和针对单芯片的系统集成；对应用验证过程中所需的激励源进行标准化、最大化开发，不仅可以保证单机应用验证系统的重复使用及维护，极大程度的降低应用验证系统开发成本及周期，还能实现基于待验证芯片的系统集成设计和系统模拟；在中心控制计算机上集成成熟模块的应用验证示例，并控制整个验证流程，保证芯片应用验证的高效性和全面性，形成用户开发的通用平台，最大程度发挥验证系统的性能。