基因表达调控,肿瘤

摘要： 目的 通过生物信息学方法挖掘与卵巢上皮性癌(卵巢癌)耐药相关的可作为竞争性内源RNA (ceRNA)的长链非编码RNA (lncRNA),并进行临床验证.方法 (1)挖掘与卵巢癌相关的lncRNA并构建ceRNA调控网络:综合应用文本挖掘、数据预测和网络构建等生物信息学方法,建立与卵巢癌耐药相关的潜在ceRNA调控网络,即lncRNA-微小RNA(miRNA)-mRNA调控网络.(2)临床验证:收集2008年6月至2016年10月在广西医科大学附属肿瘤医院行肿瘤细胞减灭术的卵巢癌患者共95例,其中铂类药物耐药患者54例(耐药组),铂类药物敏感患者41例(敏感组),采用实时荧光定量PCR技术检测两组卵巢癌组织中lncRNA的表达,分析lncRNA表达对卵巢癌患者预后的影响,并分析lncRNA表达对卵巢癌耐药的诊断效能.结果 (1)文本挖掘初步筛选出25个与卵巢癌发生、发展相关的差异表达lncRNA;亚细胞定位分析发现,有8个lncRNA存在于细胞质中;通过进一步数据挖掘、共线文献分析,预测其中的两个lncRNA分子[即生长阻滞特异性转录因子5(GAS5)和HOXC基因座转录因子(HOTAIR)]可作为关键ceRNA分子;构建ceRNA调控网络,GAS5与miRNA(即miR139-5p、miR-24-3p)及mRNA[即乳腺癌易感基因1(BRCA1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、表皮生长因子受体(EGFR)、B细胞淋巴瘤2基因(BCL-2)、细胞癌基因(FOS)、H-Ras蛋白(HRAS)]组成ceRNA调控网络,HOTAIR与miRNA(即miR-30a-5p)及mRNA[即磷酸肌醇3激酶调控亚基2(PIK3R2)、TP53、丝蛋白(VIM)]组成ceRNA调控网络.(2)实时荧光定量PCR技术检测显示,与敏感组(设为1.0)比较,耐药组卵巢癌组织中GAS5的表达水平为2.1±1.6, HOTAIR的表达水平为3.5±1.9,两组分别比较,差异均有统计学意义(P=0.011,P＜0.01);Cox回归模型多因素分析显示,GAS5、HOTAIR表达为影响卵巢癌患者无病进展生存率和总生存率的独立危险因素(P＜0.05).GAS5与HOTAIR联合检测诊断卵巢癌的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUG)为0.871,显著高于GAS5单独检测和HOTAIR单独检测(AUC分别为0.678、0.863),分别比较,差异均有统计学意义(P均＜0.05).结论 GAS5与HOTAIR高表达与卵巢癌耐药密切相关,可作为卵巢癌化疗反应的潜在预测指标;GAS5与HOTAIR联合检测对卵巢癌患者具有一定的诊断效能.这种利用ceRNA调控网络预测关键分子的方法,为卵巢癌的诊断和治疗提供了新的思路.

摘要： 目的 探讨细胞增殖抑制基因(HSG)、增殖细胞核抗原(Ki67)组织表达与宫颈癌新辅助化疗治疗效果的相关性.方法 选取2017年1月至2019年7月广东省第二人民医院收治的180例经临床确诊的宫颈癌患者作为研究对象,采用随机数字表法分为观察组和对照组,每组90例.对照组采用传统手术治疗和放疗;观察组实施收治治疗、放疗及新辅助化疗.统计比较两组治疗前后HSG、Ki67水平变化、临床疗效及不良反应发生率情况.结果 观察组术后3周及术后6周HSG阳性表达率高于对照组,而Ki67阳性表达率低于对照组(P＜0.05).观察组疾病控制率(DCR)高于对照组(P＜0.05).结论 宫颈患部HSG表达率与宫颈癌患者的康复情况呈正相关,而Ki67表达水平与宫颈癌患者DCR呈负相关.评估HSG及Ki67指标变化对宫颈癌新辅助化疗结果的评价具有重要的指导价值.

摘要： 目的 分析CC趋化因子受体7(CCR7)蛋白在肝细胞癌中的表达及临床意义.方法 选取2016年1月至2017年6月南阳市第一人民医院收治的52例肝细胞癌患者作为研究对象,对肝细胞癌组织及配对癌旁组织的CCR7表达水平进行测定,以及对CCR7表达与预后的关系及临床病理特征进行分析.结果 ①52例患者肝细胞癌组织中,CCR7阳性率高于配对癌旁组织(65.38％ vs.26.92％) (P＜0.05).②CCR7表达与性别、年龄、肝功能分级、肝硬化及乙肝病史无关(P＞0.05),而与甲胎蛋白(AFP)水平、包膜完整有关(P＜0.05).③CCR7高表达组中1年生存率及无复发率低于低表达组,差异无统计学意义(P＞0.05).CCR7高表达组3年生存率及无复发率低于低表达组,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 CCR7的表达在肝细胞癌组织中明显升高,与AFP水平、包膜完整密切相关,其对患者3年生存率及复发率具有重要的评估价值.

摘要： [目的]探讨食管癌组织中miR-133表达对其癌细胞生长的影响.[方法]采用RT-PCR法检测miR-133在食管癌组织中的表达.利用脂质体Lipofectamine 2000将miR-133 mimics、anti-miR-133及其分别相应的对照转入食管癌细胞中,RT-PCR检测miR-133的表达,MTT法检测细胞增殖能力,Western blot检测细胞中EGFR蛋白的表达.[结果]miR-133在食管癌组织中的相对表达量(0.33±0.08)显著低于其癌旁正常组织(1.15±0.18).miR-133过表达显著抑制了食管癌细胞的生长,而miR-133的下调显著增强了肿瘤细胞的生长.同时,miR-133的过表达抑制了EGFR mRNA和蛋白的表达,miR-133的下调显著增强了EGFR mRNA和蛋白的表达.EGFR的过表达逆转了miR-133对食管癌细胞生长的抑制效应.[结论]miR-133通过调控EGFR的表达进而抑制食管癌细胞的生长.

摘要： cqvip:长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类转录本长度超过200个核苷酸的非编码RNA,因其缺乏开放性阅读框而不具备或只具备有限的编码蛋白质能力[1-3]。越来越多的证据表明,lncRNAs不仅参与诸多生物学过程,同时还在微小RNA(miRNA)前体剪接、转录干扰、转录后调控和染色质修饰等多个方面发挥作用[4-7]。此外,lncRNAs被发现在人体多种恶性肿瘤中呈现异常表达并调控肿瘤的发生和发展[8-9]。癌症易感性基因15(cancer susceptibility 15,CASC15),又名CANT、LINC00340或lnc-SOX4-1,是一个定位于染色体6p22.3的lncRNA。目前,有研究表明CASC15不仅在白血病和心肌肥厚等疾病中发挥重要作用[10-11],还在多种恶性肿瘤中表达异常,在肿瘤的诊断、治疗和患者预后评估等方面有着潜在应用前景。本文就CASC15在肿瘤发生和发展中的调控作用及机制作一综述如下。

摘要： [目的]基于GEO和TCGA数据库中的食管鳞状细胞癌的转录组数据,利用生物信息学方法筛选和鉴定食管鳞状细胞癌的关键枢纽基因.[方法]下载GEO中食管鳞状细胞癌数据集GSE17351和TCGA中的食管鳞状细胞癌RNA-seq数据,利用R软件Limma程序包筛选差异表达基因;利用ClusterProfiler程序包对差异基因进行GO分析和KEGG信号通路富集;利用STRING工具分析差异基因编码蛋白之间的相互作用网络并用Cytoscape软件进行可视化展示;利用Cytoscape的Cytohubba插件分析关键枢纽基因;利用K-Mplotter分析关键枢纽基因的预后价值.[结果]通过GEO和TCGA筛选共得到167个共同差异表达基因;差异基因主要与核分裂、ATPase活性和DNA解旋酶活性等GO过程相关,且显著富集于DNA细胞周期、DNA复制、错配修复、卵母细胞减数分裂、ECM-受体相互作用、p53及Wnt等信号通路;一共筛选得到10个关键枢纽基因,其中BUB1、MAD2L1、NUF2、KIF18A、CENPK、CENPN、CENPQ和SPC25等8个基因与食管鳞状细胞癌患者的预后呈显著负相关.[结论]本研究经筛选得到了10个食管鳞状细胞癌关键枢纽基因,其中8个与预后相关,为食管鳞状细胞癌的分子机制研究和预后判断提供了潜在的靶点.

摘要： 目的探讨核糖体合成调控因子1(RRS1)对乳腺癌细胞阿霉素抗性的影响。方法通过Western blot方法检测MCF-7和耐阿霉素MCF-7/ADR细胞中RRS1的表达;构建携带绿色荧光蛋白的shRRS1慢病毒和阴性对照慢病毒,分别感染MCF-7/ADR细胞(实验组与对照组),荧光显微镜下观察慢病毒转染效率,采用Wes-tern blot检测实验组和对照组细胞中RRS1的表达量,确定沉默效率;采用CCK8法检测实验组和对照组细胞对阿霉素的敏感性差异;采用流式细胞术分析实验组和对照组细胞内阿霉素累积量的差异;采用平板克隆实验、流式细胞术检测实验组和对照组细胞增殖和凋亡情况。结果MCF-7/ADR细胞中RRS1的表达量明显高于MCF-7细胞(t=13.05,P<0.05);与对照组相比,实验组细胞中RRS1蛋白表达水平明显降低,阿霉素对MCF-7/ADR细胞的IC50值明显降低,细胞内阿霉素的累积量明显升高,细胞增殖能力明显降低,凋亡率明显升高(t=2.87~122.40,P<0.05)。结论RRS1在耐阿霉素乳腺癌MCF-7/ADR细胞中高表达,沉默RRS1表达可显著抑制细胞增殖及诱导细胞凋亡,降低MCF-7/ADR细胞对阿霉素的抗性。

摘要： 目的 探讨核糖体合成调控因子1(RRS1)对乳腺癌细胞阿霉素抗性的影响.方法 通过Western blot方法检测MCF-7和耐阿霉素MCF-7/ADR细胞中RRS1的表达;构建携带绿色荧光蛋白的shRRS1慢病毒和阴性对照慢病毒,分别感染MCF-7/ADR细胞(实验组与对照组),荧光显微镜下观察慢病毒转染效率,采用Wes-tern blot检测实验组和对照组细胞中RRS1的表达量,确定沉默效率;采用CCK8法检测实验组和对照组细胞对阿霉素的敏感性差异;采用流式细胞术分析实验组和对照组细胞内阿霉素累积量的差异;采用平板克隆实验、流式细胞术检测实验组和对照组细胞增殖和凋亡情况.结果 MCF-7/ADR细胞中RRS1的表达量明显高于MCF-7细胞(t=13.05,P＜0.05);与对照组相比,实验组细胞中RRS1蛋白表达水平明显降低,阿霉素对MCF-7/ADR细胞的IC50值明显降低,细胞内阿霉素的累积量明显升高,细胞增殖能力明显降低,凋亡率明显升高(t=2.87～122.40,P＜0.05).结论 RRS1在耐阿霉素乳腺癌MCF-7/ADR细胞中高表达,沉默RRS1表达可显著抑制细胞增殖及诱导细胞凋亡,降低MCF-7/ADR细胞对阿霉素的抗性.

摘要： 竞争性内源RNA(CeRNA)是纵横交错的调控网络,该网络可介导恶性肿瘤细胞表型,包括增殖和抑制、自噬、无限生长、诱导血管生成和血管生成拟态、免疫逃逸等.了解CeRNA介导恶性肿瘤表型调控及其功能,有望为恶性肿瘤提供新的诊断标志物和治疗靶点.

摘要： 目的 探讨线粒体融合蛋白2(MFN2)在子宫内膜癌的表达及其临床意义.方法 利用免疫组织化学法检测MFN2在20例正常子宫内膜(正常子宫内膜组)、33例非典型增生(非典型增生组)和72例子宫内膜癌(子宫内膜癌组)患者石蜡包埋组织中的表达,并分析其与子宫内膜癌临床病理特征及预后的关系.采用qRT-PCR检测正常子宫内膜组(20例)、非典型增生组(23例)和子宫内膜癌组(40例)的新鲜冷冻组织中MFN2 mRNA相对表达量.结果 子宫内膜癌组MFN2蛋白阳性率低于非典型增生组和正常子宫内膜组(P<0.05).qRT-PCR结果提示,子宫内膜癌组MFN2 mRNA相对表达量低于非典型增生组和正常子宫内膜组(P<0.05).不同病理类型、分化程度、FIGO分期及有无淋巴结转移的子宫内膜癌患者MFN2蛋白高表达率比较,差异有统计学意义(P<0.05);而不同年龄、是否绝经及肌层浸润深度的MFN2蛋白高表达率比较,差异无统计学意义(P<0.05).生存分析结果显示,MFN2蛋白低表达子宫内膜癌患者生存时间短于高表达患者(P<0.05).结论 MFN2在子宫内膜癌中的异常表达可能参与肿瘤的发生、发展生物学过程,检测MFN2的表达水平可以为子宫内膜癌的诊断和预后判断提供参考.

摘要： 本发明涉及由缺氧反应元件、E2F及端粒逆转录酶组成的基因表达调控序列，以及大幅改善选择性肿瘤细胞杀伤能力的利用上述基因表达调控序列的基因运载体，尤其，涉及重组腺病毒。并且，本发明涉及包含上述重组腺病毒的药剂学抗肿瘤组合物。本发明的重组腺病毒通过本发明特有的基因表达调控序列来以肿瘤特异性方式调控复制，从而发挥改善选择性肿瘤细胞的杀伤能力或细胞凋亡的效果，尤其，呈现在低氧条件下大幅提高的抗肿瘤效果。并且，通过癌细胞内的重组腺病毒的特异性表达来增加在体内的稳定性，并能够诱导更加改善的抗肿瘤效果。

摘要： 本发明公开了一种高效调控肿瘤细胞表型的光控基因表达装置，该光控基因表达装置包括一基因锚定组件、一转录激活组件和一sgRNA载体以及一报告/效应基因载体，其中基因锚定组件包括SEQ ID NO：4所示的CIBN‑dCas9‑CIBN表达序列，转录激活组件包括SEQ ID NO：7所示的CRY2PHR‑P65表达序列，基因锚定组件的蛋白在sgRNA的引导下与靶序列相结合，在蓝光照射下，CIBN‑dCas9‑CIBN与CRY2PHR‑P65结合激活报告/效应基因表达。本发明的光控基因表达装置能够有效地驱动报告/效应基因在膀胱癌细胞中表达。

摘要： 本发明属于生物医药技术领域，具体提供一种嵌合的肿瘤特异性基因表达调控盒。它包含肿瘤特异性基因启动子、肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区、多克隆位点、基因表达增强子和多聚腺苷酸信号区；肿瘤特异性基因启动子、肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区、基因表达增强子和多聚腺苷酸信号区依次连接，多克隆位点位于肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区和多聚腺苷酸信号区之间，与基因表达增强子相互独立。本发明通过有效调控肿瘤治疗基因的表达使之局限于肿瘤细胞内，显著提高了治疗基因表达的特异性，进而有效提高肿瘤基因治疗的安全性，降低其对正常组织和细胞的损害。

摘要： 本发明涉及由缺氧反应元件、E2F及端粒逆转录酶组成的基因表达调控序列，以及大幅改善选择性肿瘤细胞杀伤能力的利用上述基因表达调控序列的基因运载体，尤其，涉及重组腺病毒。并且，本发明涉及包含上述重组腺病毒的药剂学抗肿瘤组合物。本发明的重组腺病毒通过本发明特有的基因表达调控序列来以肿瘤特异性方式调控复制，从而发挥改善选择性肿瘤细胞的杀伤能力或细胞凋亡的效果，尤其，呈现在低氧条件下大幅提高的抗肿瘤效果。并且，通过癌细胞内的重组腺病毒的特异性表达来增加在体内的稳定性，并能够诱导更加改善的抗肿瘤效果。

摘要： 本发明涉及一种在肿瘤中表达并参与免疫反应调控的新基因的鉴定和表征，以及其cDNA和相应多肽的克隆和表征。本发明还涉及含有编码该基因的核酸之载体，由该载体转化的细胞，以及诊断方法，和能够直接或间接与本发明的核酸或多肽相互作用之化学或生物物质的筛选方法。本发明进一步涉及用于治疗免疫疾病，特别是自身免疫疾病和肿瘤的化合物。

摘要： 本发明属于生物技术，具体公开了一种调控自杀基因在肝脏肿瘤细胞中特异性表达的操纵系统，包括：(1)由AFP启动子驱动表达的Cre重组酶基因；(2)由SURV启动子驱动表达的自杀基因；所述SURV启动子与所述自杀基因之间插入一段LoxP‑Stop‑LoxP序列，Stop为转录终止序列，LoxP为Cre重组酶的特异性识别序列。本发明利用了AFP启动子在肝癌HepG2细胞里驱动Cre重组酶的表达，Cre重组酶将两个LoxP之间的转录终止序列Stop剪切出去，使得肿瘤特异性的SURV启动子可以直接驱动TK/GCV的表达，特异性诱导肝脏肿瘤细胞凋亡而不损伤体内其他任何别的类型的细胞。

摘要： 本发明公开了一种高效调控肿瘤细胞表型的光控基因表达装置，该光控基因表达装置包括一基因锚定组件、一转录激活组件和一sgRNA载体以及一报告/效应基因载体，其中基因锚定组件包括SEQ ID NO：4所示的CIBN‑dCas9‑CIBN表达序列，转录激活组件包括SEQ ID NO：7所示的CRY2PHR‑P65表达序列，基因锚定组件的蛋白在sgRNA的引导下与靶序列相结合，在蓝光照射下，CIBN‑dCas9‑CIBN与CRY2PHR‑P65结合激活报告/效应基因表达。本发明的光控基因表达装置能够有效地驱动报告/效应基因在膀胱癌细胞中表达。

摘要： 本发明属于生物医药技术领域，具体提供一种嵌合的肿瘤特异性基因表达调控盒。它包含肿瘤特异性基因启动子、肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区、多克隆位点、基因表达增强子和多聚腺苷酸信号区；肿瘤特异性基因启动子、肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区、基因表达增强子和多聚腺苷酸信号区依次连接，多克隆位点位于肿瘤特异性翻译调控元件5’端非翻译区和多聚腺苷酸信号区之间，与基因表达增强子相互独立。本发明通过有效调控肿瘤治疗基因的表达使之局限于肿瘤细胞内，显著提高了治疗基因表达的特异性，进而有效提高肿瘤基因治疗的安全性，降低其对正常组织和细胞的损害。

摘要： 本发明涉及一种靶向抗前列腺肿瘤的表达超抗原基因，具体涉及一种靶向抗前列腺肿瘤的表达超抗原基因的双调控溶瘤腺病毒的制备方法，属基因治疗技术领域。该制备方法运用基因工程技术，将金黄色葡萄球菌肠毒素A基因克隆入溶瘤腺病毒载体中，限制其只在前列腺肿瘤细胞内增殖、表达，达到靶向杀伤前列腺肿瘤细胞的目的，以前列腺特异性抗原启动子和端粒酶逆转录酶启动子来调控肿瘤特异性增殖腺病毒载体，携带金黄色葡萄球菌肠毒素A基因片段，并命名为SG504-SEA，其既具有在肿瘤细胞内特异性增殖能力又具有强大细胞毒T淋巴细胞刺激能力。

摘要： 一种四环素调控蛋白突变体基因及其在调控基因表达和环境检测中的应用，涉及基因工程全菌生物传感器及基因表达调控领域，四环素类抗生素诱导型操纵子基因具有如SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列。该四环素类抗生素诱导型操纵子是野生型四环素调控蛋白TetR的突变子，可直接用于四环素类抗生素诱导型生物传感器的优化构建，用于检测四环素类抗生素含量，检测限高，具有良好的专一性，并且可检测包含四环素在内的八种四环素类抗生素。该四环素类抗生素诱导型操纵子基因还可用于基因表达调控，其对Dox的响应性能提高，低浓度的Dox就可使下游基因表达沉默，尽可能降低药物处理对实验结果的影响，确保实验结果的准确性。