基因差异

摘要： 本文以2014年和2019年为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫的COI基因为研究对象,拼接获取8个样品COI基因的初始序列和剪切序列,利用初始序列和剪切序列分别分析比较为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫COI基因在2019年和2014年之间的差异,以此验证序列长度与基因差异的相关性。结果表明:2014年和2019年为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫COI基因序列的碱基含量方面,剪切序列和初始序列获得碱基含量不一致,但差异较小;碱基相似度方面,剪切序列分析所得COI基因的碱基相似度较初始序列变大,但不同样品间的相似度差异规律没有变化。综上所述,云斑白条天牛不同样品COI基因的碱基序列剪切成统一长度后,碱基含量及序列相似度都会发生改变,但变化的幅度较小,对定性分析的结果影响不大,是否需要将碱基序列剪切统一,可根据研究需要自行判断。

摘要： 男女有别的基础在于基因,因为女性比男性多一个X染色体,少一个Y染色体。这一多一少就产生了无数的基因差异,也导致了男女在生命、健康和疾病方面的差别。曰前,英国《柳叶刀》杂志列出了一系列疾病的男女差异,比如阿尔茨海默病(老年痴呆症)导致的死亡案例中,女性是男性的两倍以上。此外,在患病率上,约66%的阿尔茨海默病患者是女性,只有三成多的患者是男性。这种老年性疾病在女性身上体现得较多,原因是女性一般比男性长寿,男性未待此病发作就去世了。

摘要： 精准用药源自我国确立的精准医疗新战略,是一种围绕基因分析针对患者本人定制的用药优化管理方法。人类个体是有差异的,其差异约95%都是由基因决定的,过去医生会根据病症给出药方对患者进行治疗,但由于基因差异,往往导致一种药物对不同的人的疗效出现天壤之别。而精准用药可通过基因检测手段,分析出患者对各种常见药物成分的耐受情况,最大限度规避因药致病的风险。

摘要： 病毒是一种奇异的寄生生命,为了生存,它们必须经历三个阶段:1.与宿主接触:2.感染宿主,在其体内复制;3.传播给其他人。病毒的一生都在不断尝试感染它遇到的一切物种,但通常都会以失败告终。因为不同物种间的基因差异都很大,病毒无法适应新细胞的环境。

摘要： 男女有别的基础在于基因,因为女性比男性多一个X染色体,少一个Y染色体。这一多一少就产生了无数的基因差异,也导致了男女在生命、健康和疾病方面的差别,有的很细微,有的差异则是天壤之别。基因差异导致的两性差异首先体现在药物的安全和效果上。2001年美国一项报告指出,1997年至2000年退市的10个药品中,有8个都是因为“对女性的危害高于对男性的危害”。

摘要： 瘦肉精是一类化合物的统称,能抑制动物脂肪生成,促进瘦肉生长,包括盐酸克仑特罗、莱克多巴胺、沙丁胺醇等许多种。其中,盐酸克仑特罗对人体的危害明确,为大多数国家所禁止。莱克多巴胺则是在我国被禁止,在美国都被允许使用。实验测定表明,人类不同种族的基因差异不超过0.1%。美国在化学、生物、医学、制药领域都处于世界顶端,既然美国不禁止莱克多巴胺,世界各国似乎也没有必要禁止。但事实是中国、欧盟、俄罗斯都禁止了。

摘要： 习惯纠错转基因食品?别再误认了美人指葡萄别看到可怕的外形就觉得人家是转基因。这个葡萄品种叫美人指,是原产日本的杂交品种,是地地道道的纯天然水果哦。圣女西红柿其实,小西红柿(又称圣女西红柿)是自古就有的西红柿品种,个头小是天生的基因差异,并不是转基因的结果。

摘要： 技术转移是促进区域协调发展和创新资源高效配置的重要手段.专利转让是中国技术转移交易市场的主要部分,其背后的机制还没有得到充分解释.论文利用已有的遗传距离测算方法和广受认可的汉族人口基因数据,尝试从基因差异的角度探索跨地区专利转让的机制.通过挖掘国家知识产权局专利检索平台的专利转让数据,并结合其他经济地理数据,对遗传距离是否会影响省际间专利转让进行计量考察.借鉴“同性相斥异性相吸”的理论,从技术市场竞争角度建构了研究模型.通过2001-2005年省级面板数据进行计量回归检验,结果发现,遗传距离越远,反而更容易发生跨地区专利转让.在平均水平上,2个地区间基因差异每扩大1个标准差,专利转让数就会提高9.8％.结果 经过了若干稳健性检验,并对其中的空间差异性作了分析.研究揭示了基因多样性对于人类社会的意义,并启示现实政策应该放宽迁徙和落户限制,鼓励跨地区的交流与融合.

摘要： 本文从全国7个省市1 200多份可疑猪瘟病料中分离出9个猪瘟病毒(HCV)野毒株，编号分别为HCV-01-09。将9株野毒分别通过PK15细胞传6代，剥其毒价，并提纯做电镜观察，结果表明：毒价范围在10-2～10-7　TCID50，电镜观察均可清晰地见到直径为25～70nm，略呈圆形的病毒颗粒，具有较完整的囊膜和纤突结构。从9株野毒中选取5株经猪瘟阴性猪各传3～4代，测其毒力、病原性，致死性，结果表明：各毒株在传代由其上述生物学特性上有变化和差别。用猪瘟兔化弱毒疫苗分别对这5株野毒僦免疫保护相关性试验，结果证明：攻毒后的疫苗接种猪100％保护，而攻毒对照猪100％死亡，且对照猪在攻毒1周后便出现猪瘟野毒感染，而免疫猪在整个睨察期均未见到野毒感染．用不同剂量的猪瘟兔化弱毒细胞活疫苗分别接种不同妊娠期的怀孕母猪，从母猪所产0～14日仔猪体内均未分离到猪瘟兔化弱毒，表明猪瘟免化弱毒不通过胎盘垂直感染仔猪。将猪瘟野毒株、石门系强毒株、兔化弱毒株及1 982年分离的郑州野毒等毒株进行主要抗原编码基因差异研究，结果表明：猪瘟病毒可分为2个基因组6个基因亚组，HCV～02、03、06、07等4个野毒株与国内的C株，石门强毒株，国外的c株、日本GPE株，ALD株，意大利Brescia株均属同一基因组，而HCV-08株及郑州株等2个野毒与法国的Alfor株同属另一个基因组。

摘要： 用RAPD技术对一个辣椒杂种一代及其亲本的基因差异进行了研究,结果表明:几乎所有的引物扩增出的杂种一代的RAPD产物和两亲本或亲本之一没有明显差异,但引物OPG-08扩增出双亲具有但F消失的DNA片段.这揭示出,在形成F的双亲杂交后的受精过程中基因可能发生变异.

摘要： 人类结核已经存在数千年之久,无一个国家能幸免于难,尤其是第三国家.人们在感染结核病的同时也能感染艾滋病.这给人类的健康带来了巨大的挑战.现阶段,预防结核病的唯一方法就是接种BCG——减毒牛型结核分枝杆菌活疫苗.该疫苗是在1908年,由Leon Calmette和Camile Guerin将一株牛型结核分枝杆菌强毒株经历13年230次传代培养,使其毒力发生变异,成为对人无致病性,而保持了良好的免疫原性的菌株.本文主要是探讨结核分枝杆菌,牛型结核分枝杆菌和卡介苗之间的基因的差异.为卡介苗的改良和结核病的检测提供有益借鉴.对结核分枝杆菌，牛型结核分枝杆菌和卡介苗的基因差异进行简单分析，可以用于设计合理的、有效的、明确的活的弱毒型的结核分枝杆菌疫苗。可以用来改良卡介苗，替换卡介苗的有缺陷的基因，生产可以潜在的编码保护性抗原，并没有可能再次恢复毒性的卡介苗。认识到结核杆菌和卡介苗之间的基因差异，也可以为诊断出卡介苗免疫和结核杆菌感染间之间区别奠定理论基础。

摘要： 禽流感(AI)是由正粘病毒科、流感病毒属的A型禽流感病毒(AIV)引起的一种禽类感染和(或)疾病综合征.1878年在意大利首次暴发以来,给世界各国的养禽业造成巨大经济损失.根据禽流感病毒对易感鸡致病性的差异,可将AI分为高致病性AI(HPAI)和低致病性AI(LPAI).本研究从分子生物学的角度来了解各毒株之间HA基因的差异和变异情况，进而为该亚型禽流感病毒预防及疫苗毒的选择提供理论依据。

摘要： 目的：观察腮腺炎病毒S79株疫苗各代病毒的蛋白基因在传代过程中是否发生变化，对比S79株疫苗主代病毒(S79-1-3)、蚀斑纯化病毒(S79-1-P7-3③)及ME(Enders株)病毒的基因差异。rn 方法：S79株疫苗主代病毒及蚀斑纯化病毒在CEC上连续传递12代，观察每代病毒培养特性及高变区SH基因序列，又选择其中的CEC 5、6、10、15代，以及在鸡胚尿囊腔中传代的ME株病毒，测定各个主要基因序列(N，NS1/P，M，F及HN基因)，对核苷酸序列和它相应的氨基酸序列以及基因差异进行计算机分析。rn 结果: S79株疫苗主代病毒及其蚀斑纯化病毒在鸡胚细胞上连续传递12代，其培养特性，致细胞病变(CPE)及病毒滴度基本稳定。S79株疫苗主代病毒及其蚀斑纯化病毒与ME株病毒同属A基因型。S79株疫苗各个代次之间高变区SH基因未见突变。S79株的5，6、10及15代病毒在各个主要基因区域有散在基因的有意义突变，比例极低。S79-1-3中不同亚株之间的比例可能会随传代而发生变化，比较认为经过蚀斑纯化的S79-1-P7-3③株在传代中较S79-1-3株更为稳定。rn 结论: S79株疫苗与文献报道的JL2株十分相似，经连续传代总体的核苷酸差异不超过0.5％。S79-1-3主代病毒在药典规定代次范围内甚为稳定。但经纯化的各代S79病毒则更为稳定，从分子水平上提示其在CEC15代内都可作为工作代毒种使用。

摘要： 为探明雪兔和家兔Corin基因上的差异,用PCR方法克隆出雪兔Corin基因启动子,并对雪兔、家兔基因启动子序列进行了比对分析、结果显示,成功克隆并拼接出1841bp的Corin基因启动子序列;雪兔Corin基因启动子序列比家兔相应基因缺失了1194个碱基;雪兔这段序列有两个CpG岛且家兔相应基因未发现CpG岛;雪兔Corin基因启动子预测到一些家兔的相应位置没有预测到转录因子.

摘要： 为探明雪兔和家兔Corin基因上的差异,用PCR方法克隆出雪兔Corin基因启动子,并对雪兔、家兔基因启动子序列进行了比对分析、结果显示,成功克隆并拼接出1841bp的Corin基因启动子序列;雪兔Corin基因启动子序列比家兔相应基因缺失了1194个碱基;雪兔这段序列有两个CpG岛且家兔相应基因未发现CpG岛;雪兔Corin基因启动子预测到一些家兔的相应位置没有预测到转录因子.

摘要： 为探明雪兔和家兔Corin基因上的差异,用PCR方法克隆出雪兔Corin基因启动子,并对雪兔、家兔基因启动子序列进行了比对分析、结果显示,成功克隆并拼接出1841bp的Corin基因启动子序列;雪兔Corin基因启动子序列比家兔相应基因缺失了1194个碱基;雪兔这段序列有两个CpG岛且家兔相应基因未发现CpG岛;雪兔Corin基因启动子预测到一些家兔的相应位置没有预测到转录因子.

摘要： 为探明雪兔和家兔Corin基因上的差异,用PCR方法克隆出雪兔Corin基因启动子,并对雪兔、家兔基因启动子序列进行了比对分析、结果显示,成功克隆并拼接出1841bp的Corin基因启动子序列;雪兔Corin基因启动子序列比家兔相应基因缺失了1194个碱基;雪兔这段序列有两个CpG岛且家兔相应基因未发现CpG岛;雪兔Corin基因启动子预测到一些家兔的相应位置没有预测到转录因子.

摘要： 本研究应用基因芯片技术和生物信息学方法，筛选出PHEV感染小鼠大脑皮质后的差异基因和差异miRNA，并对其功能进行分析，初步明确宿主miRNA在病毒感染所致脑损伤过程中的作用，为深人解析PHEV的分子致病机制提供重要的理论依据。PHEV侵袭小鼠大脑皮质后，引起了一系列与病毒致病过程相关miRNA和基因的表达变化，推测其与感染小鼠出现明显的神经症状有关。

摘要： 本发明涉及基于UHPLC‑MS获取转基因和非转基因玉米代谢差异的方法，所述方法采用超高效液相色谱‑高分辨率质谱联用分析平台对玉米叶片提取液进行分析得到玉米叶片代谢轮廓，然后用多变量统计方法区分转基因和非转基因玉米数据，获得对代谢表型差异有重要贡献的化合物。所述方法操作简单，可进行高通量检测，尤其是检测分辨率高，可以消除干扰，实现高效可靠的代谢物信息识别，得到的结果更真实可靠。所述方法可以为深入研究转基因玉米的安全性提供根据。

摘要： 本发明属于数据处理技术领域，公开了一种结合差异化分析和关联规则挖掘全基因组关键基因的方法，首先利用基因名与探针名的对应关系，对多探针进行折叠，接着应用差异化分析方法对处理后的基因进行初步筛选，筛选出显著差异表达的基因；再对差异基因的所有样本依据阈值将其划分为上调和下调两个事务集，并对两个事务集的基因分别作关联规则挖掘，找出排名靠前的规则对应的基因，即关键基因；最后通过生物功能分析验证基因的有效性。本发明综合考虑样本与样本及基因与基因之间的关联，能处理全基因组表达数据，并找出表达突出的关键基因，这对疾病风险预测、复杂疾病的致病机理研究及生物制药技术等都有重要的意义。

摘要： 本发明提供了一种高通量筛选植物基因组等位不平衡表达的杂合变异位点的方法，属于遗传学研究领域，包括以下步骤：1)外源调控因素处理植物材料获得处理样品；2)提取处理样品和对照样品的总RNA，构建链特异性测序文库并进行高通量测序；3)过滤所述原始测序数据获得clean reads；4)将所述clean reads分别与参考基因组进行比对获得比对结果；5)删除比对结果中多余复制读段，将出现INDEL位点周围的序列进行重新比对获得最终比对结果数据；6)将所述最终比对结果数据进行等位位点变异筛选获得等位不平衡表达的杂合变异位点。所述方法解决了在等位水平上解析基因组对外界环境响应的分析难题。

摘要： 本发明涉及基于GC‑MS获取转基因和非转基因玉米代谢差异的方法；所述方法基于气相色谱‑高分辨率质谱联用系统进行玉米叶片代谢轮廓分析，然后用多变量统计方法区分转基因和非转基因玉米数据，并对转基因和非转基因玉米叶片代谢差异进行研究的方法，获取对代谢表型差异有重要贡献的化合物。所述方法更适合快速色谱分析，可以快速可靠地识别、定量和确认更多化合物；更重要的是，其检测分辨率高，保证谱峰扫描点的完整性，不遗漏任何细节，实现高效可靠的代谢物信息识别，得到的结果更真实可靠。所述方法可以为深入研究转基因玉米的安全性提供根据。

摘要： 本发明涉及生物信息技术领域，具体涉及一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法。本发明提供一种基因组三维结构差异的鉴定方法，包括在Hi‑C数据的基础上进行差异AB Compartment的鉴定、差异TAD的鉴定和差异Loop的鉴定，利用该方法可实现利用原位Hi‑C数据对动植物进行不同层级的基因组三维结构差异的高效鉴定。本发明提供利用该基因组三维结构差异鉴定方法联合转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法，利用该联合分析方法可实现从基因组三维结构与转录组两个层面进行差异分析，进而实现对动植物功能基因的高效挖掘。

摘要： 本文描述的是用于检测基因失调存在与否的方法和试剂盒，所述基因失调例如缘于基因融合和/或染色体异常，例如易位、插入、倒位和缺失。所述方法、组合物和试剂盒对于检测导致目标基因5’部分相对于所述目标基因3’区域差异表达的突变是有用的。将目标基因5’部分的平均表达与目标基因3’部分的平均表达进行对比以确定基因内差异表达(IDE)。然后可以将所述IDE用于确定受试者或样品中是否存在或不存在失调或特定疾病(或者疾病易感性)。

摘要： 本发明公开了一种通过计算差异等位基因测序深度检测二代测序数据SMN基因拷贝数的方法，通过屏蔽参考基因组SMN2基因第7、8外显子，使所有SMN基因第7、8外显子的测序序列都比对到SMN1上，在SMN1和SMN2基因第7、8外显子差异碱基位置可以计算AD，本发明的技术方案可以消除随机测序错误等因素的影响；另外，本发明的技术方案兼容各种探针捕获测序样本，兼容单样本以及各种数量级样本的SMN拷贝数计算，可用于计算SMN1和SMN2第7、8外显子的各种拷贝数。

摘要： 本发明提供了一种高通量筛选植物基因组等位不平衡表达的杂合变异位点的方法，属于遗传学研究领域，包括以下步骤：1)外源调控因素处理植物材料获得处理样品；2)提取处理样品和对照样品的总RNA，构建链特异性测序文库并进行高通量测序；3)过滤所述原始测序数据获得clean reads；4)将所述clean reads分别与参考基因组进行比对获得比对结果；5)删除比对结果中多余复制读段，将出现INDEL位点周围的序列进行重新比对获得最终比对结果数据；6)将所述最终比对结果数据进行等位位点变异筛选获得等位不平衡表达的杂合变异位点。所述方法解决了在等位水平上解析基因组对外界环境响应的分析难题。

摘要： 本发明涉及基于GC‑MS获取转基因和非转基因玉米代谢差异的方法；所述方法基于气相色谱‑高分辨率质谱联用系统进行玉米叶片代谢轮廓分析，然后用多变量统计方法区分转基因和非转基因玉米数据，并对转基因和非转基因玉米叶片代谢差异进行研究的方法，获取对代谢表型差异有重要贡献的化合物。所述方法更适合快速色谱分析，可以快速可靠地识别、定量和确认更多化合物；更重要的是，其检测分辨率高，保证谱峰扫描点的完整性，不遗漏任何细节，实现高效可靠的代谢物信息识别，得到的结果更真实可靠。所述方法可以为深入研究转基因玉米的安全性提供根据。

摘要： 本发明涉及基于UHPLC‑MS获取转基因和非转基因玉米代谢差异的方法，所述方法采用超高效液相色谱‑高分辨率质谱联用分析平台对玉米叶片提取液进行分析得到玉米叶片代谢轮廓，然后用多变量统计方法区分转基因和非转基因玉米数据，获得对代谢表型差异有重要贡献的化合物。所述方法操作简单，可进行高通量检测，尤其是检测分辨率高，可以消除干扰，实现高效可靠的代谢物信息识别，得到的结果更真实可靠。所述方法可以为深入研究转基因玉米的安全性提供根据。