基因复制

摘要： 腺苷酸激酶(ADK)是广泛分布于动植物体内维持细胞能量动态平衡的关键酶,在调控植物生长发育和逆境应答等过程中发挥重要功能。基于紫花苜蓿(Medicago sativa)基因组数据,在全基因组水平对ADK基因进行鉴定,通过生物信息学方法分析了MsADK基因的理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用原件、系统进化关系、蛋白二级和三级结构,以及在不同组织和非生物胁迫下的表达模式。结果表明,紫花苜蓿MsADK家族有10个成员,分布于7条染色体上,3对基因为片段复制;编码区序列长度627~1515 bp,平均长度为768 bp;外显子数目以3~6个居多;蛋白表现为亲水性,亚细胞定位多样,主要位于细胞质;系统进化分析表明MsADK在不同物种间高度保守,与豆科植物亲缘关系更近;顺式作用元件的预测结果表明,MsADK启动子区存在许多与激素、胁迫和光响应有关的反应元件。在不同组织和非生物胁迫下的表达模式表明,MsADK基因在茎中的表达丰度更高;在脱落酸(ABA)、干旱和盐胁迫条件下,除MsADK1、MsADK3和MsADK8上调表达外,其余基因随着胁迫时间的延长均下调表达。但是在低温胁迫下,除MsADK2、MsADK5下调表达外,其他成员均上调表达。研究结果表明,MsADK基因在不同胁迫条件下,存在正向和负向两种调控模式。研究结果将为基于ADK基因遗传改良紫花苜蓿提供候选基因和理论依据。

摘要： 转录因子是一类能够通过与基因特异性序列进行结合,从而调控基因转录与表达的蛋白质,对细胞的生物学活性具有重要的调节作用.RHR(Rel-homology region,RHR)转录因子家族属于IF(immunoglobulin fold)转录因子超家族最主要的成员,其成员含有保守的Rel结构域和IPT(immunoglobulin-like fold)结构域.作为古老的转录因子家族,RHR家族成员随着物种演化,通过基因的复制、突变和沉默,不断分化出新型同源基因的同时也伴随着基因的丢失.自然选择导致了各家族成员不同的进化速率,并且在一些功能结构域上展现出了特殊的进化机制.然而,目前有关RHR家族起源和分化的综述比较少见.本文综述了RHR家族各成员的分布、分类、功能及家族进化等方面的研究成果,以期为研究整个转录因子家族的演化机制和物种之间的进化关系提供参考和新的思路.

摘要： CYP2D酶在药物代谢及有毒物质的解毒过程中起重要作用,而认识和了解CYP2D亚家族基因的适应性进化有助于理解CYP2D酶对有毒物质的作用机制.研究表明,CYP2D亚家族基因在进化过程中具有谱系特异性扩张现象.此外,基因复制、基因转换以及选择压力对基因的进化具有一定的影响,但对不同谱系产生的影响程度不同.本文从CYP2D亚家族基因的结构、功能及其进化机制等方面进行综述,以期为理解CYP2D亚家族基因的适应性进化提供理论依据.

摘要： 采用基于有限理性的进化博弈分析框架,对企业是否参加环境污染责任保险的行为逻辑进行研究.研究发现,企业个体是否参保的决定因素是参保后的比较预期收益及忧虑成本,而企业参保的比例除受个体因素的影响外,还受初始参保水平的影响.因此,可对企业的环境污染责任事故实施更为严厉的处罚,可对企业是否参保环境污染责任保险实施差别处罚措施,还可对企业参保实施更为灵活的发展策略.

摘要： 2019年9月17日,《自然—通讯》在线发表“IAS1000(1000种入侵物种基因组计划)”的首个合作成果。多国科学家联合从基因复制和突变两个角度,揭示了苹果蠹蛾在全球入侵过程中的寄主适应性进化和抗药性分子机制,为苹果蠹蛾的综合治理提供了新思路与新方法。

摘要： 2019年9月17日,《自然—通讯》在线发表"IAS1000 (1000种入侵物种基因组计划)"的首个合作成果,多国科学家联合从基因复制和突变两个角度,揭示了苹果蠹蛾在全球入侵过程中的寄主适应性进化和抗药性分子机制,为苹果蠹蛾的综合治理提供了新思路与新方法。

摘要： CONSTANS(CO)是植物响应光周期调节的重要基因和监测日照长度的重要元件,可将光信号和生物钟信号转变为开花信号,激活下游基因(FT)的表达,从而诱导植物开花.选取14个已被测序的物种,采用生物信息学手段,从外显子-内含子结构、 基因重复、 基因差异表达等方面开展CO基因家族研究.结果表明:14个物种共鉴定到159个CO家族成员,CO基因常以多拷贝的形式存在,多数含2～4个外显子,在进化过程中表现出多样性.CO家族重复基因的扩张与基因组重复相关.CO在水稻Oryza sativa根、 旗叶、 花和种子中均有表达,花芽到花的转变过程中OsCO3的表达量上升,而OsCO7下降,说明水稻CO家族成员之间存在功能差异.

摘要： CONSTANS(CO)是植物响应光周期调节的重要基因和监测日照长度的重要元件,可将光信号和生物钟信号转变为开花信号,激活下游基因(FT)的表达,从而诱导植物开花。选取14个已被测序的物种,采用生物信息学手段,从外显子-内含子结构、基因重复、基因差异表达等方面开展CO基因家族研究。结果表明:14个物种共鉴定到159个CO家族成员,CO基因常以多拷贝的形式存在,多数含2~4个外显子,在进化过程中表现出多样性。CO家族重复基因的扩张与基因组重复相关。CO在水稻Oryza sativa根、旗叶、花和种子中均有表达,花芽到花的转变过程中OsCO3的表达量上升,而OsCO7下降,说明水稻CO家族成员之间存在功能差异。

摘要： 物种基因组成是一个高度动态的进化过程,其中相对较近起源的种系和物种特异性基因会持续整合到包含古老基因的原始基因网络中.新基因在塑造基因组结构中发挥重要作用,能提高物种适应性.基因复制和新基因的从头起源是产生新基因及改变基因家族大小的2种方式.目前,大豆(Glycine max)基因起源时间与进化模式的相互联系很大程度上还未被探索.该研究选择19种具有代表性的被子植物基因组,分析基因含量动态性与大豆基因起源之间的潜在联系.采用基因出现法,研究显示约58.7％的大豆基因能追溯到大约1.5亿年前,同时有21.7％的基因为最近起源的orphan基因.研究结果表明,与新基因相比,古老基因受到更强的负选择压并且更加保守.此外,古老基因的表达水平更高且更可能发生选择性剪切.此外,具有不同拷贝数的基因在上述特征中也具有明显差异.研究结果有助于认识不同年龄基因的进化模式.

摘要： 皱瘤海鞘(Styela plicata)在中国南海有广泛分布,具有多种药理活性作用.之前周等的实验研究提示皱瘤海鞘乙醇提取物能显著抑制2型单纯疱疹病毒(herpes simplex viruses type 2,HSV-2)作用.本实验主要对皱瘤海鞘抗HSV-2的作用机制进一步研究,为其开发利用提供依据.

摘要： 本文着重研究了龙柴方抗鸭HBV(DHBV)的作用，以及停药后龙柴方对DHBV的影响。结果表明，中药复方龙柴方具有抗DHBV的作用，并且具有抗DHBV-DNA复制反弹的效果。三个剂量组中低剂量组效果最好，这有可能与高、中剂量组对鸭肝产生了药物副反应有关，需待进一步的研究证实。本研究为龙柴方的进一步深入研究分子药理机制以及临床应用提供了实验基础。

摘要： 本文着重研究了龙柴方抗鸭HBV(DHBV)的作用，以及停药后龙柴方对DHBV的影响。结果表明，中药复方龙柴方具有抗DHBV的作用，并且具有抗DHBV-DNA复制反弹的效果。三个剂量组中低剂量组效果最好，这有可能与高、中剂量组对鸭肝产生了药物副反应有关，需待进一步的研究证实。本研究为龙柴方的进一步深入研究分子药理机制以及临床应用提供了实验基础。

摘要： 本文着重研究了龙柴方抗鸭HBV(DHBV)的作用，以及停药后龙柴方对DHBV的影响。结果表明，中药复方龙柴方具有抗DHBV的作用，并且具有抗DHBV-DNA复制反弹的效果。三个剂量组中低剂量组效果最好，这有可能与高、中剂量组对鸭肝产生了药物副反应有关，需待进一步的研究证实。本研究为龙柴方的进一步深入研究分子药理机制以及临床应用提供了实验基础。

摘要： 本文着重研究了龙柴方抗鸭HBV(DHBV)的作用，以及停药后龙柴方对DHBV的影响。结果表明，中药复方龙柴方具有抗DHBV的作用，并且具有抗DHBV-DNA复制反弹的效果。三个剂量组中低剂量组效果最好，这有可能与高、中剂量组对鸭肝产生了药物副反应有关，需待进一步的研究证实。本研究为龙柴方的进一步深入研究分子药理机制以及临床应用提供了实验基础。

摘要： 炎症反应在机体天然免疫和获得性免疫中有重要作用.NLRP3介导的炎症小体通过激活caspase-1,促进白介素-18(IL-18)、白介素1β(IL-1β)等细胞因子的分泌介导炎症病理的发生.发现高致病蓝耳病病毒(HP-PRRSV)感染猪肺泡巨噬细胞(PAM)后能形成NLRP3介导的炎症小体,激活caspase-1和增强IL-1β的分泌,但HP-PRRSV如何激活炎症反应小体的形成机制还不是很清楚.rn 在本研究中，发现PRRSV的RNA能激活NLRP3炎症小体。利用抗猪斑点样蛋白ASC 的单克隆抗体做免疫沉淀并用质谱分析免疫沉淀蛋白，发现DDX19是HP-PRRSV介导NLRP3炎症小体的一个新的组分，参与NLRP3炎症小体的形成。DDX19与NLRP3相互作用，不与ASC和caspase-1作用。深入的研究发现，DDX19还是一个RNA结合蛋白，能与PolyI:C和PRRSV的RNA结合。进一步研究发现，DDX19能识别PRRSV的RNA，可能通过NLRP3激活caspase-1，促进IL-1β的分泌。令人感兴趣的是，发现DDX19与PRRSV的NSP2和NSP10相互作用，直接参与PRRSV复制复合体的形成。利用siRNA敲低和过表达试验，发现DDX19的蛋白水平与PRRSV的复制相关。根据以上试验结果，认为DDX19A参与PRRSV复制并在NLRP3介导的炎症反应中有重要的作用。

摘要： 炎症反应在机体天然免疫和获得性免疫中有重要作用.NLRP3介导的炎症小体通过激活caspase-1,促进白介素-18(IL-18)、白介素1β(IL-1β)等细胞因子的分泌介导炎症病理的发生.发现高致病蓝耳病病毒(HP-PRRSV)感染猪肺泡巨噬细胞(PAM)后能形成NLRP3介导的炎症小体,激活caspase-1和增强IL-1β的分泌,但HP-PRRSV如何激活炎症反应小体的形成机制还不是很清楚.rn 在本研究中，发现PRRSV的RNA能激活NLRP3炎症小体。利用抗猪斑点样蛋白ASC 的单克隆抗体做免疫沉淀并用质谱分析免疫沉淀蛋白，发现DDX19是HP-PRRSV介导NLRP3炎症小体的一个新的组分，参与NLRP3炎症小体的形成。DDX19与NLRP3相互作用，不与ASC和caspase-1作用。深入的研究发现，DDX19还是一个RNA结合蛋白，能与PolyI:C和PRRSV的RNA结合。进一步研究发现，DDX19能识别PRRSV的RNA，可能通过NLRP3激活caspase-1，促进IL-1β的分泌。令人感兴趣的是，发现DDX19与PRRSV的NSP2和NSP10相互作用，直接参与PRRSV复制复合体的形成。利用siRNA敲低和过表达试验，发现DDX19的蛋白水平与PRRSV的复制相关。根据以上试验结果，认为DDX19A参与PRRSV复制并在NLRP3介导的炎症反应中有重要的作用。

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摘要： 炎症反应在机体天然免疫和获得性免疫中有重要作用.NLRP3介导的炎症小体通过激活caspase-1,促进白介素-18(IL-18)、白介素1β(IL-1β)等细胞因子的分泌介导炎症病理的发生.发现高致病蓝耳病病毒(HP-PRRSV)感染猪肺泡巨噬细胞(PAM)后能形成NLRP3介导的炎症小体,激活caspase-1和增强IL-1β的分泌,但HP-PRRSV如何激活炎症反应小体的形成机制还不是很清楚.rn 在本研究中，发现PRRSV的RNA能激活NLRP3炎症小体。利用抗猪斑点样蛋白ASC 的单克隆抗体做免疫沉淀并用质谱分析免疫沉淀蛋白，发现DDX19是HP-PRRSV介导NLRP3炎症小体的一个新的组分，参与NLRP3炎症小体的形成。DDX19与NLRP3相互作用，不与ASC和caspase-1作用。深入的研究发现，DDX19还是一个RNA结合蛋白，能与PolyI:C和PRRSV的RNA结合。进一步研究发现，DDX19能识别PRRSV的RNA，可能通过NLRP3激活caspase-1，促进IL-1β的分泌。令人感兴趣的是，发现DDX19与PRRSV的NSP2和NSP10相互作用，直接参与PRRSV复制复合体的形成。利用siRNA敲低和过表达试验，发现DDX19的蛋白水平与PRRSV的复制相关。根据以上试验结果，认为DDX19A参与PRRSV复制并在NLRP3介导的炎症反应中有重要的作用。

摘要： 从新的暴发性丙型肝炎病毒株来源的基因、使用该基因获得的具有高复制效率的HCV复制子RNA、以及用该复制子RNA转染的HCV复制子-复制细胞。通过使用如上所述的HCV复制子RNA和HCV复制子-复制细胞，可以连续大量产生HCV蛋白。

摘要： 本文提供了用于从模板多核苷酸精确测序和检测表观遗传信息的方法和设备。也提供了用于长片段链置换扩增多核苷酸的方法、具有用于多步处理的选择性可渗透屏障的微流体设备，和使用微流体设备进行多核苷酸扩增的方法。

摘要： 本发明提供有效复制含全长HCV基因组序列的RNA的方法和使用细胞培养系统生产含全长HCV复制子RNA或全长HCV基因组RNA的HCV病毒颗粒的方法。此外，本发明涉及生产丙型肝炎病毒颗粒的方法，其包括培养其中导入复制子RNA的细胞，并在培养基中产生病毒颗粒，其中所述复制子RNA包含的核苷酸序列含有基因型2a丙型肝炎病毒的全长基因组RNA序列、至少一种选择标记基因和/或至少一种报告基因以及至少一种IRES序列，或含有基因型2a丙型肝炎病毒的全长基因组RNA。再进一步，本发明还涉及丙型肝炎疫苗和抗丙型肝炎病毒颗粒的抗体。

摘要： 本发明在Ti质粒的左边界(left border，LB)与右边界(right border，RB)序列之间包含基于双生病毒(geminivirus)的复制子(replicon)的用于在T0代植物体的基因组内无需插入复制子即可编辑基因组的重组载体以及包括通过在上述重组载体中插入外源基因来转化植物细胞的步骤的在T0代植物体的基因组内无需插入复制子即可编辑基因组的方法。

摘要： 从新的暴发性丙型肝炎病毒株来源的基因、使用该基因获得的具有高复制效率的HCV复制子RNA、以及用该复制子RNA转染的HCV复制子－复制细胞。通过使用如上所述的HCV复制子RNA和HCV复制子－复制细胞，可以连续大量产生HCV蛋白。

摘要： 提供来自新型的基因型1b的HCV的、自主复制能力优异的亚基因组复制子RNA(核酸)、以及自主复制能力和感染性HCV颗粒产生能力优异的全基因组复制子RNA(核酸)。特别是，提供来自从急性重症丙型肝炎患者体内分离的新型的基因型1b的HCV即NC1株的HCV基因组的亚基因组复制子RNA(核酸)和全基因组复制子RNA(核酸)。

摘要： 本发明公开了研究家蚕基因抑制BmNPV DNA复制相关基因的表达的方法，所述方法包括以下步骤：(1)引物设计根据质粒克隆所需的步骤，设计合成克隆所用引物；(2)重组质粒构建构建重组质粒pFastBacDual‑polyhedrin‑A3‑Bmlipase‑1；(3)重组病毒构建将步骤(2)制得的重组质粒转化E.coli DH10BacΔEGT细胞以构建重组Bacmid；(4)结果验证验证步骤(3)制得的重组Bacmid对BmNPV DNA复制相关基因的影响；验证DBP的表达量变化；EMSA法验证蛋白质与核酸的相互作用；分析缺失Bmlipase‑1结合位点的dbp启动子活性。与现有技术相比，本发明具有以下优点：本发明在构建可表达Bmlipase‑1的重组病毒的基础上，在细胞内分析Bmlipase‑1对病毒复制相关基因的影响，并运用EMSA研究Bmlipase‑1的作用位点，阐明了Bmlipase‑1抑制BmNPV复制增殖的机制。

摘要： 本文提供了用于从模板多核苷酸精确测序和检测表观遗传信息的方法和设备。也提供了用于长片段链置换扩增多核苷酸的方法、具有用于多步处理的选择性可渗透屏障的微流体设备，和使用微流体设备进行多核苷酸扩增的方法。

摘要： 本发明涉及基于A52L基因和B8R基因双缺失的复制型痘苗病毒的艾滋病疫苗，其包含表达人免疫缺陷病毒(HIV)抗原的复制型痘苗病毒，本发明还涉及所述复制型痘苗病毒的构建方法以及使用包含所述复制型痘苗病毒的艾滋病疫苗的免疫接种方案。

摘要： 本发明公开了INTS10基因/蛋白在抑制HBV基因复制或者预防或治疗HBV相关疾病中的用途。由此，使目的细胞例如肝脏细胞或肝癌细胞过表达INTS10基因，能够有效抑制肝脏细胞或肝癌细胞中HBV基因的复制，从而有效预防或治疗HBV相关疾病。