基因型分析

摘要： 对177份小麦种质资源的低分子量麦谷蛋白的基因型进行分析,筛选优质亲本材料并为其利用提供依据,利用文献报道的Glu-A3、Glu-B3基因座位的相关基因特异标记,通过PCR方法检测其在177份参试研究材料的分布。结果表明,扩增到目标条带的157份参试材料中,在Glu-A3位点,携带Glu-A3d基因的材料占28.7%,携带Glu-A3e基因的材料仅有云麦20号、云南778、78鉴-35等6份,占3.8%;在Glu-B3位点,携带Glu-B3基因的材料105份,占66.9%,带有Glu-B3g和Glu-B3i基因的材料各为22份,各占14.4%;带有Glu-B3c和Glu-B3h基因的材料分别为3份和14份,分别占1.9%和8.9%;携带Glu-B3j基因的1B/1R易位系50份,占31.8%。筛选出具有优质LMW-GS组合的材料共6份,其中Glu-A3d+Glu-B3g的巧家3号、墨依和中作813等3份;带有Glu-A3d+Glu-B3i组合的滇802-87、云麦33号;带有Glu-B3g+Glu-B3i组合的绵阳11号。再根据文献报道的结果,筛选出同时具有优质高、低分子量麦谷蛋白基因组合的材料4份,带有1、17+18、5+12、A3d基因组合的材料滇832-63和昆7808,带有1、17+18、5+12、B3g基因组合的楚麦9024,带有13+16、5+12、B3g基因组合的滇801,以上10份资源可作为云南小麦品质育种重点利用的材料。

摘要： 治疗药物监测(Therapeutic Drug Monitoring,TDM)通过定量测定和解释血药浓度以优化药物治疗。TDM着眼于药代动力学的个体差异,使个体化药物治疗成为可能。在精神病学和神经病学领域中,有可能明显获益于TDM的主要患者群体包括少年儿童、孕妇、老年患者、智障患者、药物滥用者、涉法精神病患者、已知或怀疑药代动力学异常的患者以及合并躯体疾病影响药代动力学的患者。常规剂量下治疗无效,用药依从性难以判断,药物耐受性不佳,以及可能存在药代动力学方面的药物-药物相互作用等情况都是治疗药物监测的典型指征。然而,只有将TDM充分整合到临床治疗过程中,才能发挥其优化药物治疗的潜在优势。为了向临床医生和实验室提供有效的TDM信息,神经精神药理学与药物精神病学协会(Arbeitsgemeinschaft für Neuropsychopharmakologie und Pharmakopsychiatrie,AGNP)的TDM专家组在2004年发表了第一版《精神科治疗药物监测指南》。2011年进行了更新之后,现在再次更新。遵循新版指南,可能会改善神经精神药物治疗的效果,加快很多患者的康复,并降低医疗费用。

摘要： 当前猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在我国各地区仍然广泛流行,且基因型多变,给养猪业造成了巨大的经济损失。为初步调查河北邢台及周边地区PRRSV流行情况及基因型分布特点,研究于2022年1—6月从河北省8个地区共采集315份疑似感染猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)病猪组织样品,采用实时荧光定量RT-PCR检测技术检测组织样品中是否存在PRRSV核酸,其后采用PRRSV基因分型检测试剂盒对部分PRRSV毒株进行基因型分析。结果发现,315份样品中有58份为PRRSV阳性,平均检出率为18.41%,不同地区检出率存在差异,其中以石家庄最高(30.90%,17/55),张家口检出率最低(7.7%,1/13),进一步对28个阳性毒株进行基因分型,可见高致病性毒株和美洲经典株占比较高,分别为42.86%(12/28)和35.71%(10/28),且检测到少量NADC30-like和NADC34-like毒株,所占比例分别为17.86%(5/28)和3.57%(1/28)。以上研究结果表明,当前河北省PRRSV流行情况仍然较为严峻,且基因型繁多,需引起重视。

摘要： 【目的】试验旨在对新疆某规模牛场患腹泻疾病的犊牛进行病原学鉴定及基因型分析。【方法】采用抗原诊断试剂盒方法对在新疆某牛场随机采集的15份腹泻犊牛粪便样品进行检测,对抗原检测结果为阳性的样品进行反复冻融和过滤处理,然后将样品接种于Marc-145细胞进行病毒的分离和传代。对分离毒株进行间接免疫荧光试验(IFA)和负染电镜观察进一步确定病原。对分离株的VP6和VP7基因进行PCR扩增测序,并对其进行基因相似性比对和进化树分析。【结果】抗原诊断试剂盒结果显示,3份粪便样品呈牛轮状病毒(Bovine rotavirus, BRV)抗原阳性。将阳性粪便样品分别接种于Marc-145细胞,仅有1份样品连续盲传至第9代出现明显的细胞病变效应(CPE)。IFA结果显示,接种该分离株的Marc-145细胞有亮绿色荧光,对照组未见荧光。电镜观察可见约65 nm的圆形病毒粒子,并命名为XJ-2022株。经PCR扩增获得VP6和VP7基因的目的条带,长度分别为1 356和342 bp。基因相似性比对和遗传进化分析表明,VP6基因与人源A群轮状病毒参考株DB2015-066(LC367318.1)相似性最高且遗传进化亲缘关系最近;VP7基因与牛源G10轮状病毒参考株XJX2(MN937506.1)相似性最高,遗传进化亲缘关系最近,确定该分离株为A群G10型轮状病毒。【结论】试验成功分离到基因型为A群G10型BRV XJ-2022株,该毒株为新疆地区首次发现的多宿主来源的基因重配病毒。

摘要： 为了掌握长春地区梅花鹿毕氏肠微孢子虫(Enterocyfozoon bieneusi)的感染率及基因型种类的分布情况,探究其在人与动物之间传播的源由,本研究于2018年12月-2019年12月期间采集长春地区8个养殖场共计538份梅花鹿粪便样品进行毕氏肠微孢子虫的流行病学调查及基因型分析,经PCR鉴定,测序分析、序列拼接比对以及系统进化分析.试验结果表明,长春地区梅花鹿毕氏肠微孢子虫的感染率为17.84％(96/538),不同养殖场的感染率为0?47.96％;研究共发现14种基因型(BEB6、EbpC、Ⅰ、JLD-Ⅲ、JLD-Ⅸ、JLD-ⅩⅤ、JLD-ⅩⅥ、JLD-ⅩⅦ、JLD-ⅩⅧ、JLD-ⅪⅩ、JLD-ⅩⅩ、JLD-ⅩⅪ、JLD-ⅩⅫ、和JLD-ⅩⅩⅢ),其中BEB6为优势基因型.应用多位点序列分型(MLST)方法,选择MS1、MS3、MS4以及MS7位点对毕氏肠微孢子虫阳性样本进行多态性和群体遗传结构分析,结果显示,在96份阳性样品中,共有16份阳性分离株在至少2个位点同时扩增成功,形成10个多位点基因型(multilocus genotypes,MLGs),相同的基因型之间存在不同亚型,表明长春地区梅花鹿毕氏肠微孢子虫具有丰富的遗传多样性.本研究应用分子生物学方法对长春地区梅花鹿毕氏肠微孢子虫的流行病情况及基因型进行分析,研究结果不仅为梅花鹿毕氏肠微孢子虫防控提供科学依据,也为防控毕氏微孢子虫在人和动物间的传播提供基础数据,对保障公共卫生与健康意义重大.

摘要： 为研究SNP分子标记鉴定玉米杂交种纯度的方法,选用甘肃省推广的6份玉米杂交种为试验材料,通过应用SNP分子标记的KASP技术鉴定玉米杂交种的基因型和纯度,试验结果为95.83％-98.96％之间,说明SNP分子标记KASP技术结果可靠,实现了高效率、高灵活性、简便快捷、低成本的技术优势,可以作为玉米杂交种纯度检测的新方法,并在今后基于SNP标记的玉米品种分子鉴定中发挥越来越重要的作用,能够有效为我省乡村振兴战略背景下玉米制种品种质量监测技术研究提供技术参考.

摘要： 为研究SNP分子标记鉴定玉米杂交种纯度的方法,选用甘肃省推广的6份玉米杂交种为试验材料,通过应用SNP分子标记的KASP技术鉴定玉米杂交种的基因型和纯度,试验结果为95.83%-98.96%之间,说明SNP分子标记KASP技术结果可靠,实现了高效率、高灵活性、简便快捷、低成本的技术优势,可以作为玉米杂交种纯度检测的新方法,并在今后基于SNP标记的玉米品种分子鉴定中发挥越来越重要的作用,能够有效为我省乡村振兴战略背景下玉米制种品种质量监测技术研究提供技术参考。

摘要： 目的探究2018—2020年平顶山市新华区手足口患儿EV71、CoxA16和其他肠道病毒感染情况及基因型状况。方法选择平顶山市新华区疾病预防控制中心2018年7月至2020年12月收治的104例手足口病患儿作为研究对象,通过患儿粪便及肛拭子标本对患儿病毒核酸进行检测,观察患儿肠道病毒病原学构成情况及分析患儿EV71病毒及CoxA16病毒VP1基因中各基因型同源性,并记录手足口病患儿临床症状表现及外周血白细胞水平。结果104例手足口病阳性样本中,EV71病毒感染54例(51.92%),CoxA16病毒感染7例(6.73%),其他肠道病毒感染43例(41.35%),EV71病毒感染比例高于CoxA16病毒感染比例,差异有统计学意义(P0.05)。结论手足口病患儿中EV71病毒感染比例相比于CoxA16病毒感染比例更高;且CoxA16及EV71 VP1基因序列均存在高同源性的病毒株;但各病毒株感染后临床症状表现几乎一致。

摘要： 目的 探究2018—2020年平顶山市新华区手足口患儿EV71、CoxA16和其他肠道病毒感染情况及基因型状况.方法 选择平顶山市新华区疾病预防控制中心2018年7月至2020年12月收治的104例手足口病患儿作为研究对象,通过患儿粪便及肛拭子标本对患儿病毒核酸进行检测,观察患儿肠道病毒病原学构成情况及分析患儿EV71病毒及CoxA16病毒VP1基因中各基因型同源性,并记录手足口病患儿临床症状表现及外周血白细胞水平.结果 104例手足口病阳性样本中,EV71病毒感染54例(51.92％),CoxA16病毒感染7例(6.73％),其他肠道病毒感染43例(41.35％),EV71病毒感染比例高于CoxA16病毒感染比例,差异有统计学意义(P0.05).结论 手足口病患儿中EV71病毒感染比例相比于CoxA16病毒感染比例更高;且CoxA16及EV71 VP1基因序列均存在高同源性的病毒株;但各病毒株感染后临床症状表现几乎一致.

摘要： 目的:分析血液学分析指标正常的地中海贫血基因型.方法:对我院2019年4月—2021年6月期间的970例地贫基因检测,地贫基因异常者249例(25.36％),并分析结果.结果:α地贫135例(13.91％),β地贫104例(10.72％),αβ复合型地贫10例(1.03％);α地贫患者的基因类型主要是--SEA/αα73/135例(54.07％)、α3.7/αα43/135例(31.85％)、--SEA/-α4.27/135例(5.18％)、427T>C 12/135例(8.88％);β地贫的基因类型主要是:124-127delTTCT 38/104例(36.53％)、52A>T 25/104例(24.03％)、316-197C>T 19/104例(18.26％);α地贫复合β地贫:-α4.2/αα复合52A>T 3/249例(1.20％)、79G>A复合--SEA/αα3/249例(1.20％)、--SEA/αα复合124-127delTTCT 2/249例(0.80％)、52A>T复合--SEA/αα2/249例(0.80％).结论:在我国地贫高发区,云南是其中之一,要高度重视血液学分析指标正常的地贫基因检测.

摘要： 许氏平鲉，属于鲉形目、平鲉科、平鲉属，又名黑鲪，俗称黑鱼，刺毛等，广泛分布于我国渤海、黄海和东海近海岩礁地带，日本和朝鲜沿岸也均有分布。本研究从许氏平鲉淋巴囊中病毒肿瘤中分离到该病毒基因组DNA，通过PCR扩增，克隆测序获得了MCP基因DNA序列，预测了MCP蛋白质的二级结构、三级结构和功能结构域，以淋巴囊肿病毒MCP基因序列为分子标记，研究了淋巴囊肿病毒许氏平鲉分离株(LCDV-ss)与29种虹彩病毒分离株之间的系统关系，并分析确定了LCDV-ss的基因型。

摘要： 目的:鉴定结核分枝杆菌多重感染的存在.方法:在山东省胸科医院2011年1月到2013年11月的临床患者中,挑选同一患者存在2个或2个以上分离株,且一线药物(利福平、异烟肼、链霉素、乙胺丁醇)药敏结果耐药表型不同的作为研究对象.利用VNTR方法,对46例患者共103个分离株进行基因型分析.结果:46例患者中,8例患者的分离株存在不同基因型.结论:本研究中存在多重感染现象,了解多重感染对于药敏结果的判断和治疗方案的评价有非常重要的意义,临床医师应该引起足够的重视.

摘要： 目的:了解海口地区人群地中海贫血基因型分布特点.方法:采用Gap-PCR、PCR-RDB技术检测海口地贫人群3种缺失型、3种非缺失型α-地贫;17种β-地贫.结果:海口地贫以α-地贫为主,α-地贫占总病例63.82％,三种缺失型地贫病例数相对均衡,α-地贫等位基因-SEA/:-α3.7/:-α4.2/=1.49:1.40:1;β-地贫病例占总病例31.74％,检出9种基因型,排前5位的突变位点依次是CD41-42、IVS-Ⅱ-654、-28、CD17、CD71-72,这5类病例占总β-地贫病例的93.55％;α-合并β-地贫病例占较大比重,达4.44％.结论:海南地贫基因型有地域特点,应重视地贫防控。

摘要： 本研究阐述了3q24 -q28部分三体患者的基因型与表型的关系，研究结果也为患儿家族中多次不良生育史及妊娠史查明了原因。国际上虽然已有部分Dup (3q)综合征病例报道，但是由于非同源染色体插入突变导致的部分染色体重复罕有报道。通过研究认为综合利用分子细胞遗传技术，有助于明确复杂遗传综合征的致病突变，有利于获得准确的产前诊断。

摘要： 采集上海及周边地区猪内脏样本，进行猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV-2）病原学检测，并对阳性样本的ORF2序列进行分析和比对，发现发病猪群PCV-2阳性率为39.06%（25/64），健康猪群阳性率为13.51%（5/37），总的阳性率为29.70%（30/101）。30份阳性样本中PCV-2a亚型为2株，检出率为1.98%（2/101），其余28株均为PCV-2b亚型，检出率为27.72%（28/101）。PCV-2的ORF2序列与已登录的ORF2序列的同源性在90.7%~100%。2株PCV-2a株相互间的同源性为99.6%；28株PCV-2b株的同源性在94.4%~100%，PCV-2b株中只有4株与已登录株DQ141322、AY321984和AY484413株同源性关系最近，处于同一分支中，而另外24株与Q151643中国株同源性关系最近且处于同一分支中。研究结果表明上海及周边地区PCV-2感染比较普遍，发病猪场的感染率远高于健康猪场，且感染率比往年有升高，PCV-2在猪场疫病的爆发和传染中起着重要的协同作用；在PCV-2的感染病例中，PCV-2b亚型为感染的优势毒株；绝大多数PCV-2b ORF2片段的同源性与已登录的一株中国株同源性关系密切，在基因进化树上处于同一分支，但是否可以推断其为PCV-2的另一个亚型有待进一步考证。

摘要： 目的：了解海南地区产质粒介导AmpC酶大肠埃希菌基因型特点。方法：收集来自海南地区8所医院2009年度不重复临床分离的大肠埃希菌540株，分别采用纸片扩散法和三维试验进行表型筛选和AmpC酶检测.用接合试验证实酶基因型的转移性，通过PCB检测及序列分析进行质粒AmpC酶基因型确定，用E-Test法对产质粒AmpC酶株进行MIC测定。结果：540株大肠埃希菌中，头孢西丁抑菌环直径≤17mm的占22.8％(123／540)，除五指山市菌株全部对头孢西丁敏感外，其它医院均有对头孢西丁的耐药株。酶提取物三维试验检测阳性的占1.9％(10／540)，以PCR方法对10株三维试验阳性大肠埃希菌进行基因检测。结果6株在约462bp处扩增出条带，经测序和比对结果证实为CMY-2型质粒AmpC酶。10株产AmpC酶大肠埃希菌接合试验有2株接合阳性，接合子均扩增出CMY-2型条带。药敏结果显示6株产质粒AmpC酶大肠埃希菌对三代头孢菌素、氨曲南和含酶抑制剂的敏感性极低，对亚胺培南和美罗培南均敏感。结论：海南地区存在产质粒介导的CMY-2型AmpC酶大肠埃希菌，药敏结果显示对三代头孢菌素耐药率极高，但对亚胺培南和美罗培南均敏感。

摘要： 从培养特性、生化特性和耐药特性等多方面研究了副猪嗜血杆菌(HPS)上海分离株的生物学特性。各分离株因生存环境差异等原因表现出不同的生化和耐药特性，分离菌株对多种药物完全耐药，并且各菌株耐药性各不同。根据16s rRNA序列设计引物建立了目的条带为821 bp的特异PCR快速检测方法，并对其产物进行测序鉴定与比对分析，结果表明所有分离株的PCR扩增产物序列比对结果与此前报道的HPS的同源性为97.3%～100%。运用ERIC-PCR扩增建立指纹图谱，通过聚类分析以确定其基因型特征，ERIC-PCR将20株菌分为Ⅰ和Ⅱ2个大类群，分离株均属于Ⅰ群A亚群。快速PCR检测方法的建立和基因型研究为上海地区HPS的监控提供了理论基础，并揭示各分离菌株具有一致的遗传进化背景与方向。

摘要： 为了解屠宰生猪中猪圆环病毒2型(PCV-2)的带毒状况及PCV-2的主要基因型,在分析PCV-2分离株基因序列的基础上分别设计了检测PCV-2、PCV2-A和PCV2-B的引物,建立了各自的PCR检测方法.结果表明,建立的PCV-2、PCV2-A、PCV2-B的PCR检测方法,特异性较好,可用于临床病料的检测;通过对临床采集的49分生猪血样的检测发现,PCV-2的阳性率为24.49%,均属于PCV2-B.检测结果表明,当地检测猪群中感染的PCV-2主要为PCV2-B毒株,在该病的防控方面应引起注意.

摘要： 目的：调查2009-2011年深圳市头孢曲松低敏淋病奈瑟菌(淋球菌)流行的基因型和特征.rn 方法；收集2009-2011年深圳市淋球菌296株,采用琼脂稀释法筛选出头孢曲松低敏株(最小抑菌浓度为0.06～0.5μg/ml),用Logistic回归分析方法,分析与头孢曲松低敏淋球菌感染相关的因素;根据1:1抽样原则抽取出高敏对照菌株,与低敏菌株一起进行NG-MAST基因分型和邻接法(neighbor-joining,NJ)进化树分析.rn 结果：在296株淋球菌中,未发现头孢曲松耐药菌株,头孢曲松低敏菌株53株(17.91％).近两个月的抗生素使用史与头孢曲松低敏淋球菌感染相关(OR=3.080,95％CI:1.376～6.894).53株低敏株的NG-MAST分型共得到48个ST型别,由5个成簇的ST(ST1768、ST3927、ST641、ST7076、ST7078 各包含了2株淋球菌)和43个单一的ST构成,其中26个ST型别分别被香港等地报道过.NJ进化树未观察到低敏株单独成簇的情况.rn 结论：深圳地区2009-2011年分离到的296株淋球菌中头孢曲松低敏株的比例较高.深圳市头孢曲松低敏淋球菌菌株的流行可能有其独特的特点.

摘要： 目的：调查2009-2011年深圳市头孢曲松低敏淋病奈瑟菌(淋球菌)流行的基因型和特征.rn 方法；收集2009-2011年深圳市淋球菌296株,采用琼脂稀释法筛选出头孢曲松低敏株(最小抑菌浓度为0.06～0.5μg/ml),用Logistic回归分析方法,分析与头孢曲松低敏淋球菌感染相关的因素;根据1:1抽样原则抽取出高敏对照菌株,与低敏菌株一起进行NG-MAST基因分型和邻接法(neighbor-joining,NJ)进化树分析.rn 结果：在296株淋球菌中,未发现头孢曲松耐药菌株,头孢曲松低敏菌株53株(17.91％).近两个月的抗生素使用史与头孢曲松低敏淋球菌感染相关(OR=3.080,95％CI:1.376～6.894).53株低敏株的NG-MAST分型共得到48个ST型别,由5个成簇的ST(ST1768、ST3927、ST641、ST7076、ST7078 各包含了2株淋球菌)和43个单一的ST构成,其中26个ST型别分别被香港等地报道过.NJ进化树未观察到低敏株单独成簇的情况.rn 结论：深圳地区2009-2011年分离到的296株淋球菌中头孢曲松低敏株的比例较高.深圳市头孢曲松低敏淋球菌菌株的流行可能有其独特的特点.

摘要： 提供一种无需使用花费工夫和费用的特别的矩阵标准品来进行电泳，实现实际的解析对象样品的电泳的同时实现光谱校准的技术。在基因型解析装置中，其特征在于，使用在实际的样品的电泳时所使用的已知的DNA片段信息即分子量标准品和等位基因阶梯来得到基准荧光光谱，对于没有使用等位基因阶梯的毛细管检测分子量标准品的荧光光谱的偏移量，并使用该偏移量使基准荧光光谱偏移来计算荧光光谱，由此进行光谱校准。

摘要： 本申请公开一种DNA芯片(或DNA微阵列)、含有该DNA芯片的基因分型试剂盒及使用该DNA芯片的基因分型方法，在所述DNA芯片上点有与作为子宫颈癌的主要成因和性传播疾病的最常见原因的44种HPV的核酸互补结合的探针。根据本公开，可以检测侵入外生殖器的全部44种HPV，而且可以准确地诊断由超过一种类型的HPV引起的同时感染。HPV基因分型的灵敏性和特异性接近于100%，并且可以快速测试许多个样品。本公开对预测子宫颈癌和癌前期病变是非常有用的。

摘要： 本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法，包括以下步骤：获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息，根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵，获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合信息，以及对应的子代群体分组表型数据，构建子代组合基因型与对应子代表型的统计模型进行关联分析，获取表型与各SNP位点的关联P值；之后区分SNP位点的关联类型，计算是否符合加性或完全显性效应，对候选位点进行筛选；再根据全基因组SNP标记的LD衰减获得强相关标记的平均距离，用于最终标记集合的筛选。

摘要： 本发明属于植物分子辅助育种领域，公开了一种依据植物双亲基因型信息虚拟合成杂种基因型的方法及应用。包括各类作物和野生植物的父、母亲本(包括自交系、无性系、杂交种、农家品种和天然混交群体)基因组信息(包括DNA全序列数据和基因分型数据，包括来自芯片测序平台数据和简易基因组测序平台GBS的数据)，利用生物信息学技术推测或虚拟合成杂交种F1代基因型的方法。解决了在利用全基因组预测技术预测自交系一般配合力、特殊配合力和杂交组合表现型时没有基因型信息可用的问题。

摘要： 提供一种无需使用花费工夫和费用的特别的矩阵标准品来进行电泳，实现实际的解析对象样品的电泳的同时实现光谱校准的技术。在基因型解析装置中，其特征在于，使用在实际的样品的电泳时所使用的已知的DNA片段信息即分子量标准品和等位基因阶梯来得到基准荧光光谱，对于没有使用等位基因阶梯的毛细管检测分子量标准品的荧光光谱的偏移量，并使用该偏移量使基准荧光光谱偏移来计算荧光光谱，由此进行光谱校准。

摘要： 本申请公开一种DNA芯片(或DNA微阵列)、含有该DNA芯片的基因分型试剂盒及使用该DNA芯片的基因分型方法，在所述DNA芯片上点有与作为子宫颈癌的主要成因和性传播疾病的最常见原因的44种HPV的核酸互补结合的探针。根据本公开，可以检测侵入外生殖器的全部44种HPV，而且可以准确地诊断由超过一种类型的HPV引起的同时感染。HPV基因分型的灵敏性和特异性接近于100%，并且可以快速测试许多个样品。本公开对预测子宫颈癌和癌前期病变是非常有用的。

摘要： 本发明涉及一种鉴定HBV基因型的特异性探针，其具有SEQ ID NO：1－8所示的核苷酸序列或其互补核苷酸序列中的至少一种。本发明还提供一种鉴定HBV基因型的方法和试剂盒，该试剂盒包含上述的特异性探针。本发明可对HBV的八种基因型(A－H)进行鉴定，分型设计完备。技术上，较传统方法，流程简单，操作简便，用时短；同时，灵敏性更高，大大降低污染干扰；本发明方法弥补类似发明中特异性不足的特点，从而具备显著的型间差异度和实际可操作性。本试剂盒费用经济，便于推广。

摘要： 本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析算法，包括以下步骤：获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息，根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵，获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合信息，以及对应的子代群体分组表型数据，构建子代组合基因型与对应子代表型的统计模型进行关联分析，获取表型与各SNP位点的关联P值；之后区分SNP位点的关联类型，计算是否符合加性或完全显性效应，对候选位点进行筛选；再根据全基因组SNP标记的LD衰减获得强相关标记的平均距离，用于最终标记集合的筛选。

摘要： 本发明属于检测两种个体混合物中等位基因、基因组和转录物组的方法和基因型分析谱领域。本发明涉及检测胎儿等位基因和胎儿遗传变异的方法和基因型分析谱。本发明的一个实施方案是一种检测胎儿标识符的方法。本发明的另一实施方案是用于检测胎儿等位基因的单核苷酸多态性(SNP)谱。

摘要： 本发明公开了检测两种个体混合物中等位基因、基因组和转录物组的方法和基因型分析谱。