PFGE

摘要： 目的:对贵阳市2015年至2020年33株食源性沙门氏菌进行血清分型和PFGE分子分型,评价不同血清型沙门菌的亲缘性,为贵阳市沙门菌感染的防控提供参考数据。方法:对目标沙门氏菌进行血清凝集确定其血清型,并使用脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)进行分子分型。结果:血清分型共分出5种血清型,其中优势血清型为鼠伤寒沙门(46%)与德尔卑沙门(21%)。分子分型33株菌株中4株分型失败,剩余29株共获得24种带型,相似性达100%的有4组(有一组为不同年份肠炎沙门),鼠伤寒优势带型为P15(25%),德尔卑沙门氏菌优势带型为P20(33.3%)。结论:本实验沙门菌PFGE分型总体呈多态性,不同年份肠炎沙门分型一致提示存在污染源清除不彻底问题。

摘要： 目的对一起由沙门氏菌污染鸡爪引起的食物中毒进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型溯源和耐药分析,为查明这起食物中毒的源头及临床治疗提供相关理论依据。方法对6例患者进行流行病学调查,采集可疑食品和患者粪便等标本,根据国家标准进行实验室检测,经增菌后挑取可疑菌落进行生化鉴定,对检出的7株沙门氏菌株采用标准诊断血清进行血清凝集试验,菌株DNA经限制性内切酶XbaⅠ酶切后进行PFGE分子分型,所得结果用BioNumerics软件进行聚类分析,最后利用微量肉汤稀释法对7株沙门氏菌株进行耐药性检测。结果6例患者均有不同程度的腹痛、腹泻和发热等症状;从鸡爪中检出沙门氏菌1株,患者粪便标本中检出沙门氏菌6株,通过生化仪鉴定和血清凝集试验显示7株沙门氏菌的血清型同为福尔斯布特尔血清型,PFGE显示7株沙门氏菌株同源性为100.0%,药敏结果显示这7株菌株均对四环素类药物(四环素、米诺环素)、大环内酯类药物(阿奇霉素)耐药。结论该起群体性腹泻、发热、腹痛事件为一起由沙门氏菌引起的食物中毒事件。有关部门应加大对食品安全知识的宣传普及,提高大众的食品安全意识;大众食用购买的熟食前应尽量加热处理后再食用,这是预防沙门氏菌食物中毒的重要措施;同时,建议监管部门加强对食品小作坊、饭店等生产经营场所的监管,预防类似事件的发生。

摘要： 目的了解福建省北部地区鼠类钩端螺旋体(钩体)感染状况及分子特征。方法对捕获的鼠类进行信息登记,采集鼠肾进行PCR检测,确定其感染状况。EMJH培养基用于鼠肾标本的钩端螺旋体菌株分离。应用MAT方法对分离株进行血清群鉴定。分别采用16S rRNA、MLST和PFGE的方法对分离株进行分子分型。结果共捕获鼠类227只,检出感染钩端螺旋体的鼠类27只,检出率为11.89%,野栖鼠检出率高于家栖鼠,雄性鼠检出率高于雌性鼠。共分离到4株钩端螺旋体分离株,分离率为1.76%(4/227)。血清学分群显示4株分离株均为黄疸出血群。基因种分型显示4株分离株均为Leptospira interrogans。MLST分型将4株分离株分为2个ST型,PC29、PC30为ST1型,JY19、JY37为ST17型。4株分离株呈现2种PFGE带型,其中,PC29、PC30与黄疸出血群参考株带型一致,JY19、JY37与波摩那群带型具有较高相似度,聚类关系相对较近。结论福建省北部地区的鼠类中存在钩端螺旋体感染。黄疸出血群和Leptospira interrogans分别为福建省北部地区钩端螺旋体的优势血清群和优势基因种,具有不止一种的ST型和PFGE带型,且ST型与PFGE带型呈现地域差异。

摘要： 目的对一起空肠弯曲菌所致的食源性疾病暴发事件进行流行病学及溯源分析。方法对突发事件进行现场流行病学调查,采集粪便样本、环境涂抹样本、食品样本等进行快速PCR检测和病原菌分离。对分离菌株进行PFGE分子分型和全基因组测序分析,并进行药敏试验。结果从7份病例样本和2份环境涂抹样本中分离出空肠弯曲菌。PFGE分析和cgMLST聚类结果表明其中3份病例样本和环境涂抹样本(蒸柜容器把手涂抹)分离的菌株克隆聚集成簇,ST型别为ST11105;另2份病例样本和环境涂抹样本(刀具砧板涂抹)分离的菌株属同一克隆株,ST型别为ST2031。还有2份病例样本分离的菌株ST型为ST11106和ST7533。药敏结果表明,分离株对四环素类和喹诺酮类耐药率较高,分别为77.8%、55.6%。基因组测序结果发现最多的耐药基因为bla OXA-193,gyrA、tet(O),其中gyrA基因86位点发生T-I突变。分离株共获得168个毒力基因,涉及多种致病机理。结论采用快速PCR法、PFGE分子分型技术、全基因组测序技术等可对突发事件进行快速、准确的溯源分析。

摘要： 目的分析河南省腹泻病例粪便标本中产超广谱β内酰胺酶(ESBLs)的鼠伤寒沙门菌单相变异株耐药情况,并研究其分子学特征。方法对河南省腹泻粪便中分离的124株鼠伤寒沙门菌单相变异株沙门菌,通过肉汤稀释法进行抗生素敏感性试验并筛选产ESBLs菌株;PCR方法检测β-内酰胺酶编码基因携带情况,采用质粒接合试验分析耐药基因的水平转移情况,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行亲缘关系分析。结果124株鼠伤寒沙门菌单相变异株沙门菌耐药严重,其中有16株为产ESBLs菌株。16株产ESBLs菌株均携带CTX-M型耐药基因,并检测出OXA型和TEM型耐药基因;其中9株菌可将CTX-M基因通过质粒转移到大肠埃希菌J53,药敏分析发现其他抗生素的耐药性可以发生共转移。16株产ESBLs鼠伤寒沙门菌单相变异株沙门菌经XbaⅠ酶切后共分为14种带型,无明显的优势带型。结论检出产ESBLs的鼠伤寒沙门菌单相变异株沙门菌基因型具有多样性,耐药基因可通过接合性质粒在不同菌属间播散。

摘要： 目的 调查分析本地区血流感染中分离耐甲氧西林溶血葡萄球菌(MRSH)的药物敏感性、葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型及分子流行病学特征.方法 收集2013年1月1日-2014年12月31日湖南省20家三甲医院血流感染患者的MRSH 78株,采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验;PCR扩增mecA基因及SCCmec基因;脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测MRSH的同源性.结果 78株MRSH中,96.1％的菌株存在mecA基因,MRSH对红霉素、左氧氟沙星和克林霉素的耐药率分别为94.9％、80.7％和53.8％,2株对利奈唑胺耐药,1株对替考拉宁耐药,没有菌株对万古霉素耐药.SCCmec可分型为50％(39/78),不可分型为50％(39/78).39株可分型菌株中,单个SCCmec类型以Ⅰ型为主(18/39,46.1％),混合型SCCmec类型以Ⅰ+Ⅱ型为主(12/39,30.8％).PFGE带型整体较为分散,但有6组菌株间存在100％同源性.结论 本地区血流感染中MRSH的耐药形势严峻;在SCCmec可分型的菌株中,以Ⅰ型SCCmec为主,SCCmec多样且不同SCCmec型别之间的耐药性存在差异;本地区MRSH以散发为主,但存在院间及院内交叉感染的可能性,应加强对其监测,减少MRSH的进一步传播.

摘要： 目的 研究基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在肠炎沙门菌快速鉴定及同源性分析中的应用效果.方法 对2018年8月～12月嘉兴市第一医院患者大便标本分离出的11株肠炎沙门菌采用MALDI-TOFMS进行鉴定及同源性分析,并与VITEK-2 Compact仪鉴定结果和脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)聚类分析结果进行比较.结果 收集得到的11株菌株经VITEK 2 Compact全自动微生物分析仪鉴定为沙门菌属历时约228 min,而MALDI-TOF MS鉴定只需8 min,差异有统计学意义(P＜0.05).MALDI-TOF MS在聚类相似度为80％时,可以将11株肠炎沙门菌分为2型(MS1型和MS2型),其中MS1型为主要的质谱型,占90.91％.而PFGE在相似度＞95％时,也可以将11株肠炎沙门菌分为2型(E1型和E2型),两种方法分型结果相似度为73％,并不完全相同.结论 MALDI-TOFMS技术用于鉴定肠炎沙门菌,结果快速可靠,血清分型则需借助血清凝集试验.MALDI-TOF MS技术对肠炎沙门菌同源性分析结果与PFGE技术相似度为73％,可以作为肠炎沙门菌同源性分析方法的参考,为疾病防治以及疫情防控提供宝贵的时间差.

摘要： 目的 了解四川省2006-2017年临床分离猪链球菌2型的病原学特征.方法 对2006-2017年四川省临床分离的28株猪链球菌2型进行毒力基因检测、药物敏感性分析、脉冲场凝胶电泳分析(PFGE).结果 28株猪链球菌2型分为2种毒力基因型,1株为cps2J+ /mrp-/sly +/gapdh+ /ef+型别,其余均为cps2J+ /mrp +/sly+/gapdh+ /ef+型别;药敏检测结果显示,28株猪链球菌对第三代、第四代头孢菌素类、碳青霉烯类、青霉素、左氧氟沙星、利奈唑胺、万古霉素、氯霉素、达托霉素均敏感,对四环素均耐药.28株猪链球菌中,仅2株对克林霉素、阿奇霉素、红霉素耐药,其余均敏感.PF-GE分析结果显示,28株猪链球菌呈现6种PFGE图谱,相似性为76％,其中23株是完全相同的图谱,占82.14％;2006-2007年分离的19株菌呈现完全相同的PFGE图谱,2010年后分离的9株呈现出6种PFGE图谱.结论 2006-2017年四川省临床分离猪链球菌2型流行株的毒力基因型主要为高致病性cps 2J +/mrp+/sly+ /gapdh +/ef+型别,对β-内酰胺类药物敏感,2006、2007年不同市区临床分离的猪链球菌2型为统一来源,2010年后分离的菌株PFGE图谱相似度较低.

摘要： 目的 通过中国1980-2019年不同地区小肠结肠炎耶尔森菌的病原学与PFGE分子型别特征分析,为小肠结肠炎耶尔森菌病的防控提供依据.方法 对中国不同区域,不同来源标本分离到的6847株小肠结肠炎耶尔森菌,进行血清型别、生化表型、毒力基因分布研究,对致病性菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析.结果 小肠结肠炎耶尔森菌中致病性菌株2047株、非致病菌4800株.致病性菌株仅存在两种血清型,O∶3占比88.96％(1821/2047)、O∶9占比11.04％(226/2047).18个省市自治区的致病株以O∶3血清型为主,宁夏回族自治区以O∶9血清型为主.非致病菌血清型众多,普遍比致病株具有更多的阳性生化反应.1821株O∶3致病株分为93个PFGE型别,分布于19个省市自治区,其中K6GN11C30021、K6GN11C30012为优势带型(分别占比46.35％、22.5％),75.38％的人源菌株与分离自当地的动物、食品菌株带型一致;226株O∶9致病株共分为14个PFGE型别,分布于8个省市自治区,77.78％人源菌株与分离自当地的动物、食品菌株带型一致.结论 我国小肠结肠炎耶尔森菌分布广泛、宿主众多,致病株仅有两个血清型,非致病株血清型众多、可能比致病株具有更强的生化代谢能力与环境适应力.致病性菌株PFGE优势带型相对集中,地域分布广泛,多数人源菌株与分离自当地的动物、食品菌株带型一致,应警惕通过家畜家禽、食品及外环境等多种来源感染人的风险.

摘要： 为了分析2016年广州市农贸市场所售的鸡肉中科瓦利斯沙门菌(Salmonella corvallis)耐药性及流行特征,参照国标检测方法(GB4789.4-2016),对广州市农贸市场采集的鸡肉样品进行沙门菌分离鉴定和血清学分型,用Kirby-Bauer法进行14种抗菌药物的耐药试验,用PCR方法检测携带的耐药基因,根据沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型试验方案进行分子分型.结果 显示,21株科瓦利斯沙门菌中,对磺胺异噁唑耐药性最高(95.2％),其次为萘啶酸(90.5％)、四环素(66.7％),对环丙沙星的耐药率为19％,多重耐药菌检出率为81％.21株科瓦利斯沙门菌中喹诺酮类耐药决定区(QRDR)基因parC的突变率为100％,其第57位氨基酸苏氨酸突变为丝氨酸(Thr57→Ser),并且在质粒介导的喹诺酮类耐药(PMQR)基因中检出了qnrS、aac(6')-Ib-cr和qnrB,检出率分别为90.5％、23.8％和9.5％.21株科瓦利斯沙门菌经PFGE分型后,结果显示其可分为7个血清型,其中具有1个优势克隆型(11株).研究结果表明,广州市农贸市场鸡肉源科瓦利斯沙门菌分离株呈现耐药模式多样,多重耐药菌株严重,PFGE分子型别呈多态性,有同源菌株存在,提示存在共同来源或者交叉污染,应加强鸡肉中科瓦利斯沙门菌监测,同时为进一步做好食品中沙门菌的防控提供数据支持.

摘要： 目的：研究北京地区2008—2009年沙门菌流行特征及PFGE分子分型，建立北京市沙门菌PFGE分子分型数据库，用于由沙门菌引起的暴发疫情的溯源。rn 方法：对2008—2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌，进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析：利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)，进行分子分型。rn 结果：北京市2008—2009年沙门菌的流行具有明显季节性，6～9月高发：患者年龄多为18～40岁；男性高于女性，2008年和2009年的男女比例分别为1.77:1，1.41:1。137株沙门菌，分属于20种血清型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型，分别占46.7％和17.5％。137株菌有71种PFGE带型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都分别有16种PFGE型别。肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别。rn 结论：北京市沙门菌的PFGE型别较多，呈现多样性。除肠炎沙门菌PFGE分子分型有一定的聚集性外，其它血清型的PFGE型别高度散发，带型之间遗传相似度在20％～90％不等。北京存在着差异明显的多个克隆系，时间及地域分布均无明显规律，因此需要充分利用PFGE的技术优势，系统的开展沙门菌的分子流行病学监测。

摘要： 目的：研究北京地区2008—2009年沙门菌流行特征及PFGE分子分型，建立北京市沙门菌PFGE分子分型数据库，用于由沙门菌引起的暴发疫情的溯源。rn 方法：对2008—2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌，进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析：利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)，进行分子分型。rn 结果：北京市2008—2009年沙门菌的流行具有明显季节性，6～9月高发：患者年龄多为18～40岁；男性高于女性，2008年和2009年的男女比例分别为1.77:1，1.41:1。137株沙门菌，分属于20种血清型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型，分别占46.7％和17.5％。137株菌有71种PFGE带型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都分别有16种PFGE型别。肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别。rn 结论：北京市沙门菌的PFGE型别较多，呈现多样性。除肠炎沙门菌PFGE分子分型有一定的聚集性外，其它血清型的PFGE型别高度散发，带型之间遗传相似度在20％～90％不等。北京存在着差异明显的多个克隆系，时间及地域分布均无明显规律，因此需要充分利用PFGE的技术优势，系统的开展沙门菌的分子流行病学监测。

摘要： 目的：研究北京地区2008—2009年沙门菌流行特征及PFGE分子分型，建立北京市沙门菌PFGE分子分型数据库，用于由沙门菌引起的暴发疫情的溯源。rn 方法：对2008—2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌，进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析：利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)，进行分子分型。rn 结果：北京市2008—2009年沙门菌的流行具有明显季节性，6～9月高发：患者年龄多为18～40岁；男性高于女性，2008年和2009年的男女比例分别为1.77:1，1.41:1。137株沙门菌，分属于20种血清型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型，分别占46.7％和17.5％。137株菌有71种PFGE带型，其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都分别有16种PFGE型别。肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别。rn 结论：北京市沙门菌的PFGE型别较多，呈现多样性。除肠炎沙门菌PFGE分子分型有一定的聚集性外，其它血清型的PFGE型别高度散发，带型之间遗传相似度在20％～90％不等。北京存在着差异明显的多个克隆系，时间及地域分布均无明显规律，因此需要充分利用PFGE的技术优势，系统的开展沙门菌的分子流行病学监测。

摘要： 本研究从广东A公司下属3个肉鸡分公司、广西B公司4个分公司9个肉鸡群发生跗关节、翅关节肿胀的病鸡肿胀部位，B公司孵化场19日龄死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面，进行病原分离、鉴定，采用K—B法对所分离的菌株进行药敏试验，并应用PFGE方法对所分离菌株进行相关性研究。结果显示：从广东A公司下属3个肉鸡分公司发病肉鸡，广西B公司4个分公司9个发病肉鸡群、B公司孵化场死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面共分离到14株鸡白痢沙门菌;所分离菌株对氨苄西林、奈啶酸、青霉素G、利福平高度耐药，耐药率为100%，对四环素、红霉素耐药率分别高达79%、93%耐药率;从A种鸡场下属3个分场的送检的病鸡所分离到的菌株具有相同的PFGE图谱，从B公司所属4个分公司发病肉鸡群及B公司种鸡场种蛋表面、B公司孵化场19日龄死胚跗关节处所分离菌株具有相同的PFGE图谱，不同公司传染源可能为本公司种鸡。结论：鸡白痢沙门菌能引起雏鸡跗关节、翅关节肿胀;关节型鸡白痢沙门菌为蛋传性病原菌，禽苗在运送到肉鸡饲养场前已经感染或携带病原菌;鸡胚在孵化过程中有可能已感染致病菌。

摘要： 本研究从广东A公司下属3个肉鸡分公司、广西B公司4个分公司9个肉鸡群发生跗关节、翅关节肿胀的病鸡肿胀部位，B公司孵化场19日龄死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面，进行病原分离、鉴定，采用K—B法对所分离的菌株进行药敏试验，并应用PFGE方法对所分离菌株进行相关性研究。结果显示：从广东A公司下属3个肉鸡分公司发病肉鸡，广西B公司4个分公司9个发病肉鸡群、B公司孵化场死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面共分离到14株鸡白痢沙门菌;所分离菌株对氨苄西林、奈啶酸、青霉素G、利福平高度耐药，耐药率为100%，对四环素、红霉素耐药率分别高达79%、93%耐药率;从A种鸡场下属3个分场的送检的病鸡所分离到的菌株具有相同的PFGE图谱，从B公司所属4个分公司发病肉鸡群及B公司种鸡场种蛋表面、B公司孵化场19日龄死胚跗关节处所分离菌株具有相同的PFGE图谱，不同公司传染源可能为本公司种鸡。结论：鸡白痢沙门菌能引起雏鸡跗关节、翅关节肿胀;关节型鸡白痢沙门菌为蛋传性病原菌，禽苗在运送到肉鸡饲养场前已经感染或携带病原菌;鸡胚在孵化过程中有可能已感染致病菌。

摘要： 本研究从广东A公司下属3个肉鸡分公司、广西B公司4个分公司9个肉鸡群发生跗关节、翅关节肿胀的病鸡肿胀部位，B公司孵化场19日龄死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面，进行病原分离、鉴定，采用K—B法对所分离的菌株进行药敏试验，并应用PFGE方法对所分离菌株进行相关性研究。结果显示：从广东A公司下属3个肉鸡分公司发病肉鸡，广西B公司4个分公司9个发病肉鸡群、B公司孵化场死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面共分离到14株鸡白痢沙门菌;所分离菌株对氨苄西林、奈啶酸、青霉素G、利福平高度耐药，耐药率为100%，对四环素、红霉素耐药率分别高达79%、93%耐药率;从A种鸡场下属3个分场的送检的病鸡所分离到的菌株具有相同的PFGE图谱，从B公司所属4个分公司发病肉鸡群及B公司种鸡场种蛋表面、B公司孵化场19日龄死胚跗关节处所分离菌株具有相同的PFGE图谱，不同公司传染源可能为本公司种鸡。结论：鸡白痢沙门菌能引起雏鸡跗关节、翅关节肿胀;关节型鸡白痢沙门菌为蛋传性病原菌，禽苗在运送到肉鸡饲养场前已经感染或携带病原菌;鸡胚在孵化过程中有可能已感染致病菌。

摘要： 本研究从广东A公司下属3个肉鸡分公司、广西B公司4个分公司9个肉鸡群发生跗关节、翅关节肿胀的病鸡肿胀部位，B公司孵化场19日龄死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面，进行病原分离、鉴定，采用K—B法对所分离的菌株进行药敏试验，并应用PFGE方法对所分离菌株进行相关性研究。结果显示：从广东A公司下属3个肉鸡分公司发病肉鸡，广西B公司4个分公司9个发病肉鸡群、B公司孵化场死胚跗关节处、B公司种鸡场种蛋蛋壳表面共分离到14株鸡白痢沙门菌;所分离菌株对氨苄西林、奈啶酸、青霉素G、利福平高度耐药，耐药率为100%，对四环素、红霉素耐药率分别高达79%、93%耐药率;从A种鸡场下属3个分场的送检的病鸡所分离到的菌株具有相同的PFGE图谱，从B公司所属4个分公司发病肉鸡群及B公司种鸡场种蛋表面、B公司孵化场19日龄死胚跗关节处所分离菌株具有相同的PFGE图谱，不同公司传染源可能为本公司种鸡。结论：鸡白痢沙门菌能引起雏鸡跗关节、翅关节肿胀;关节型鸡白痢沙门菌为蛋传性病原菌，禽苗在运送到肉鸡饲养场前已经感染或携带病原菌;鸡胚在孵化过程中有可能已感染致病菌。

摘要： 目的：明确我院甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的流行克隆,并与国际主要的流行克隆进行比较,为及时发现新克隆和控制克隆播散提供依据。方法 综合应用脉冲场凝聚电泳(PFGE)、多位点序列分析(MLST)和SCCmec分型技术,对我院住院患者2001年-2002年分离的60株MRSA进行分子流行病学研究。结果 60株MRSA的PFGE图谱分为5组(A~E),A克隆是我院MRSA最主要的流行克隆,占菌株总数的56.7﹪,其次是B克隆和C克隆,而D克隆和E克隆为散发菌株。随机选取的10株各个克隆的代表菌株MLST分析共有4个类型,ST239、ST239slv、ST59和ST6,其中ST239是最主要的ST类型。此外,60株MRSA均携带Ⅲ型SCCmec。结论 ST239-MRSA-Ⅲ是我院最主要的流行克隆,ST59-MRSA-Ⅲ和ST-MRSA-Ⅲ为散发菌株。

摘要： 目的：明确我院甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的流行克隆,并与国际主要的流行克隆进行比较,为及时发现新克隆和控制克隆播散提供依据。方法 综合应用脉冲场凝聚电泳(PFGE)、多位点序列分析(MLST)和SCCmec分型技术,对我院住院患者2001年-2002年分离的60株MRSA进行分子流行病学研究。结果 60株MRSA的PFGE图谱分为5组(A~E),A克隆是我院MRSA最主要的流行克隆,占菌株总数的56.7﹪,其次是B克隆和C克隆,而D克隆和E克隆为散发菌株。随机选取的10株各个克隆的代表菌株MLST分析共有4个类型,ST239、ST239slv、ST59和ST6,其中ST239是最主要的ST类型。此外,60株MRSA均携带Ⅲ型SCCmec。结论 ST239-MRSA-Ⅲ是我院最主要的流行克隆,ST59-MRSA-Ⅲ和ST-MRSA-Ⅲ为散发菌株。

摘要： 目的：明确我院甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的流行克隆,并与国际主要的流行克隆进行比较,为及时发现新克隆和控制克隆播散提供依据。方法 综合应用脉冲场凝聚电泳(PFGE)、多位点序列分析(MLST)和SCCmec分型技术,对我院住院患者2001年-2002年分离的60株MRSA进行分子流行病学研究。结果 60株MRSA的PFGE图谱分为5组(A~E),A克隆是我院MRSA最主要的流行克隆,占菌株总数的56.7﹪,其次是B克隆和C克隆,而D克隆和E克隆为散发菌株。随机选取的10株各个克隆的代表菌株MLST分析共有4个类型,ST239、ST239slv、ST59和ST6,其中ST239是最主要的ST类型。此外,60株MRSA均携带Ⅲ型SCCmec。结论 ST239-MRSA-Ⅲ是我院最主要的流行克隆,ST59-MRSA-Ⅲ和ST-MRSA-Ⅲ为散发菌株。

摘要： 本发明公开了一种基于PFGE分析微生物菌株之间的差异基因的方法，采用限制性内切酶对样品基因组进行酶切，酶切后的DNA利用PFGE技术进行分离，对差异条带进行测序比对，得到的序列即为物种间的差异基因。本发明采用脉冲场凝胶电泳系统（PFGE，Pulsed Field Gel Electrophoresis）来寻找不同菌株之间的差异基因，PFGE技术在寻找差异基因方面表现出更高的优越性，此方法操作简单，可行性高，价格低廉。采用本发明所述方法，成功发现了属于同一种属不同亚种的菌株在基因水平上的不同，确立了PFGE技术在寻找同种菌株基因片段差异研究的可行性。

摘要： 本发明公开了一种辣椒或番茄上细菌性疮痂病菌分子分型方法，该方法首次公开了采用特殊限制性内切酶

摘要： 本发明公开了一种基于结核分枝杆菌PFGE法分型中的DNA提取方法，包括将培养的结核分枝杆菌在磨菌管中制成菌悬液，菌悬液进行灭活、离心、沸水加热处理后，再加入溶菌酶，置于plug模具中，凝固成胶栓备用；对胶栓进行多次细胞溶解及水浴震荡后，获得结核分枝杆菌DNA，采用本方法能够方便去除M.tb细胞壁，获得M.tb的DNA；并且能够降低成本，推广性、实用性较强。

摘要： 本发明公开了一种基于PFGE分析微生物菌株之间的差异基因的方法，采用限制性内切酶对样品基因组进行酶切，酶切后的DNA利用PFGE技术进行分离，对差异条带进行测序比对，得到的序列即为物种间的差异基因。本发明采用脉冲场凝胶电泳系统（PFGE，PulsedFieldGelElectrophoresis）来寻找不同菌株之间的差异基因，PFGE技术在寻找差异基因方面表现出更高的优越性，此方法操作简单，可行性高，价格低廉。采用本发明所述方法，成功发现了属于同一种属不同亚种的菌株在基因水平上的不同，确立了PFGE技术在寻找同种菌株基因片段差异研究的可行性。

摘要： 本发明公开了一种辣椒或番茄上细菌性疮痂病菌分子分型方法，该方法首次公开了采用特殊限制性内切酶 Sml I ( Swa I)切胶块内DNA结合脉冲场凝胶电泳方法（PFGE），对辣椒和番茄细菌性疮痂病菌进行分子分型的操作技术。将该病原菌悬液经蛋白酶K处理后制成胶块、酶切后经脉冲场凝胶电泳，获得特异性条带，转换条带信息进行聚类分析，可将辣椒和番茄上的细菌性疮痂病菌有效区分为4个种。本发明方法所使用的内切酶为首次采用，电泳参数为自行优化，可以用于辣椒和番茄细菌性疮痂病菌分类鉴定和遗传多样性研究。