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蛋白质组过滤进化分类方法及其系统

摘要

本发明公开了一种蛋白质组过滤进化分类方法及其系统,所述方法包括:原始数据获取步骤,获取所要进行分类的物种的基因组数据和蛋白质组数据(S110);预测步骤,基于所述基因组数据,预测基因组序列中的横向转移基因(S120);过滤步骤,基于蛋白质组数据和横向转移基因,在蛋白质组中过滤掉与横向转移基因对应的蛋白质序列(S130);计算步骤,用过滤后的蛋白质组序列计算物种间进化距离(S140);以及推断步骤,利用物种间的进化距离推断物种间的系统发生关系(S150)。根据本发明,可以排除在推断生物系统发生过程时存在的由横向基因转移所引起的干扰信息,从而可以使推断出的生物系统发生过程更加准确,为生物进化分类提供更加可靠的分类依据。

著录项

  • 公开/公告号CN101840467B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2012-07-04

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院研究生院;

    申请/专利号CN201010154839.2

  • 发明设计人 王嵬;段红军;

    申请日2010-04-20

  • 分类号

  • 代理机构北京市商泰律师事务所;

  • 代理人麻吉凤

  • 地址 100049 北京市石景山区玉泉路甲19号

  • 入库时间 2022-08-23 09:10:40

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2016-06-15

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):G06F 19/14 授权公告日:20120704 终止日期:20150420 申请日:20100420

    专利权的终止

  • 2012-07-04

    授权

    授权

  • 2010-11-10

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/00 申请日:20100420

    实质审查的生效

  • 2010-09-22

    公开

    公开

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