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一种泛基因组的构建方法及其相应的结构变异挖掘方法

摘要

本发明属于基因组数据分析技术领域,具体涉及一种泛基因组的构建方法及其相应的结构变异挖掘方法,通过把基因组比较得到的结构变异放回线性基因组上,同时增加结构变异位点信息文件,构建一种形式上线性化,兼顾多种结构变异形式的高效分析的泛基因组;所述泛基因组不但可以捕获更多全新的,参考基因组未发现的结构变异,而且通过线性化方法结合变异位点信息文件,更好的展示了捕获到的结构变异,使构建的泛基因组更容易理解和分析,更有利于后续应用;本发明构建的泛基因组和二代测序数据进行基因组结构变异分析的方法和流程,并编写了完整的程序代码,实现了基于相对低成本的二代测序数据对结构变异的高效、精准挖掘。

著录项

  • 公开/公告号CN113571131B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-06-14

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广东省农业科学院水稻研究所;

    申请/专利号CN202110903763.7

  • 申请日2021-08-06

  • 分类号G16B20/20;G16B40/00;

  • 代理机构广州专理知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人沈素芹

  • 地址 510640 广东省广州市天河区金颖东一街3号

  • 入库时间 2022-08-23 13:49:57

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-06-14

    授权

    发明专利权授予

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