一种基于宏基因组的人腺病毒分子分型和溯源方法及系统

摘要

本发明公开了一种基于宏基因组的人腺病毒分子分型和溯源方法及系统，其方法包括：构建包含分型层级分类系统的人腺病毒分型数据库，获取人腺病毒的分类单元和完整基因组/标记基因序列，确定人腺病毒每个分类单元的完整基因组/标记基因序列，获取临床样本的宏基因组测序原始数据，对其进行预处理获得目标宏基因组数据，利用预设宏基因组测序数据双重比对注释系统分析目标宏基因组数据，确定所述临床样本是否有目标人腺病毒分类单元，当确定临床样本中有目标人腺病毒分类单元时，确定目标人腺病毒分类单元对应的目标关联特征，生成人腺病毒分型鉴定报告。能够对病毒含量偏低的临床感染样本进行人腺病毒的分类单元(亚型/基因型)分型鉴定。